|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2202 | Hbo2839 | HVO_1790 | pNG7294 | pNG7270 | hla1203 | NP3806A | HQ3044A | Hbo2111 | HVO_B0276 | rrnAC0008 | Hmu2339 | Hbo1382 | VNG6293 | pNG7332 | HVO_A0617 | hla1793 | VNG1350 | HVO_1791 | Hbo3149 | HVO_1980 | NP3074A | Hmu1510 | VNG1626 | NP2642A | Hut2728 | rrnAC0516 | HQ2738A | Hbo2149 | HVO_2446 | hla1390 |
868 | Hbo2839 | 2349 | 477 | 563 | 585 | 556 | 476 | 471 | 507 | 549 | 503 | 537 | 618 | 528 | 568 | 847 | 779 | 741 | 809 | 883 | 587 | 609 | 677 | 582 | 682 | 757 | 659 | 681 | 596 | 635 | 651 |
1042 | HVO_1790 | 477 | 2198 | 996 | 756 | 804 | 843 | 819 | 1040 | 886 | 979 | 919 | 753 | 762 | 765 | 741 | 735 | 620 | 662 | 644 | 833 | 896 | 845 | 591 | 756 | 750 | 783 | 746 | 765 | 817 | 811 |
1112 | pNG7294 | 563 | 996 | 2449 | 685 | 856 | 912 | 830 | 985 | 922 | 959 | 898 | 768 | 701 | 719 | 756 | 695 | 640 | 753 | 712 | 812 | 826 | 913 | 734 | 894 | 856 | 808 | 792 | 812 | 875 | 835 |
1166 | pNG7270 | 585 | 756 | 685 | 2416 | 750 | 735 | 691 | 757 | 670 | 657 | 741 | 926 | 873 | 880 | 814 | 723 | 731 | 783 | 825 | 1034 | 827 | 863 | 633 | 852 | 829 | 890 | 873 | 865 | 954 | 882 |
1049 | hla1203 | 556 | 804 | 856 | 750 | 2217 | 732 | 756 | 882 | 887 | 852 | 877 | 699 | 721 | 746 | 782 | 657 | 498 | 700 | 744 | 829 | 944 | 838 | 706 | 782 | 869 | 900 | 824 | 816 | 813 | 857 |
1078 | NP3806A | 476 | 843 | 912 | 735 | 732 | 2259 | 1096 | 1159 | 1184 | 1190 | 1195 | 814 | 691 | 766 | 796 | 715 | 603 | 643 | 742 | 747 | 780 | 831 | 656 | 765 | 781 | 809 | 803 | 796 | 808 | 826 |
1008 | HQ3044A | 471 | 819 | 830 | 691 | 756 | 1096 | 2615 | 1172 | 1191 | 1265 | 1250 | 741 | 666 | 741 | 764 | 675 | 618 | 747 | 780 | 695 | 819 | 774 | 595 | 681 | 775 | 711 | 743 | 722 | 709 | 736 |
1257 | Hbo2111 | 507 | 1040 | 985 | 757 | 882 | 1159 | 1172 | 2404 | 1334 | 1291 | 1335 | 815 | 788 | 784 | 737 | 733 | 626 | 759 | 806 | 789 | 927 | 860 | 693 | 840 | 851 | 830 | 829 | 903 | 883 | 859 |
1141 | HVO_B0276 | 549 | 886 | 922 | 670 | 887 | 1184 | 1191 | 1334 | 2323 | 1411 | 1465 | 751 | 702 | 696 | 772 | 698 | 584 | 696 | 745 | 769 | 860 | 877 | 647 | 800 | 828 | 837 | 776 | 776 | 756 | 805 |
1162 | rrnAC0008 | 503 | 979 | 959 | 657 | 852 | 1190 | 1265 | 1291 | 1411 | 2330 | 1628 | 788 | 681 | 757 | 780 | 751 | 634 | 696 | 756 | 796 | 874 | 855 | 667 | 770 | 851 | 762 | 805 | 781 | 842 | 835 |
1206 | Hmu2339 | 537 | 919 | 898 | 741 | 877 | 1195 | 1250 | 1335 | 1465 | 1628 | 2360 | 758 | 637 | 707 | 788 | 788 | 644 | 729 | 760 | 782 | 860 | 874 | 683 | 809 | 893 | 818 | 813 | 830 | 877 | 899 |
1229 | Hbo1382 | 618 | 753 | 768 | 926 | 699 | 814 | 741 | 815 | 751 | 788 | 758 | 2311 | 1188 | 1201 | 922 | 813 | 740 | 800 | 874 | 882 | 781 | 913 | 760 | 967 | 1016 | 874 | 930 | 987 | 919 | 986 |
1171 | VNG6293 | 528 | 762 | 701 | 873 | 721 | 691 | 666 | 788 | 702 | 681 | 637 | 1188 | 2295 | 1637 | 818 | 741 | 739 | 779 | 790 | 861 | 807 | 801 | 727 | 870 | 916 | 756 | 867 | 853 | 817 | 931 |
1198 | pNG7332 | 568 | 765 | 719 | 880 | 746 | 766 | 741 | 784 | 696 | 757 | 707 | 1201 | 1637 | 2288 | 824 | 699 | 733 | 761 | 786 | 846 | 841 | 805 | 723 | 890 | 962 | 840 | 898 | 862 | 843 | 919 |
1245 | HVO_A0617 | 847 | 741 | 756 | 814 | 782 | 796 | 764 | 737 | 772 | 780 | 788 | 922 | 818 | 824 | 2704 | 1013 | 940 | 1099 | 1138 | 886 | 838 | 909 | 838 | 993 | 1004 | 1069 | 909 | 942 | 960 | 981 |
1177 | hla1793 | 779 | 735 | 695 | 723 | 657 | 715 | 675 | 733 | 698 | 751 | 788 | 813 | 741 | 699 | 1013 | 2261 | 911 | 1049 | 1177 | 872 | 836 | 800 | 719 | 885 | 970 | 812 | 856 | 904 | 979 | 903 |
1102 | VNG1350 | 741 | 620 | 640 | 731 | 498 | 603 | 618 | 626 | 584 | 634 | 644 | 740 | 739 | 733 | 940 | 911 | 2295 | 1037 | 1125 | 911 | 697 | 782 | 716 | 903 | 851 | 809 | 814 | 861 | 887 | 923 |
1221 | HVO_1791 | 809 | 662 | 753 | 783 | 700 | 643 | 747 | 759 | 696 | 696 | 729 | 800 | 779 | 761 | 1099 | 1049 | 1037 | 2291 | 1183 | 873 | 801 | 868 | 698 | 992 | 962 | 976 | 893 | 946 | 963 | 990 |
1305 | Hbo3149 | 883 | 644 | 712 | 825 | 744 | 742 | 780 | 806 | 745 | 756 | 760 | 874 | 790 | 786 | 1138 | 1177 | 1125 | 1183 | 2335 | 885 | 818 | 909 | 829 | 960 | 1023 | 1016 | 968 | 1001 | 1024 | 1042 |
1294 | HVO_1980 | 587 | 833 | 812 | 1034 | 829 | 747 | 695 | 789 | 769 | 796 | 782 | 882 | 861 | 846 | 886 | 872 | 911 | 873 | 885 | 2421 | 936 | 905 | 728 | 906 | 924 | 938 | 958 | 963 | 975 | 1057 |
1197 | NP3074A | 609 | 896 | 826 | 827 | 944 | 780 | 819 | 927 | 860 | 874 | 860 | 781 | 807 | 841 | 838 | 836 | 697 | 801 | 818 | 936 | 2129 | 1013 | 770 | 965 | 907 | 891 | 862 | 880 | 925 | 919 |
1287 | Hmu1510 | 677 | 845 | 913 | 863 | 838 | 831 | 774 | 860 | 877 | 855 | 874 | 913 | 801 | 805 | 909 | 800 | 782 | 868 | 909 | 905 | 1013 | 2154 | 907 | 1119 | 1055 | 1180 | 1107 | 1115 | 1119 | 1155 |
1158 | VNG1626 | 582 | 591 | 734 | 633 | 706 | 656 | 595 | 693 | 647 | 667 | 683 | 760 | 727 | 723 | 838 | 719 | 716 | 698 | 829 | 728 | 770 | 907 | 1847 | 989 | 1005 | 1050 | 953 | 1006 | 1007 | 1062 |
1358 | NP2642A | 682 | 756 | 894 | 852 | 782 | 765 | 681 | 840 | 800 | 770 | 809 | 967 | 870 | 890 | 993 | 885 | 903 | 992 | 960 | 906 | 965 | 1119 | 989 | 2249 | 1280 | 1266 | 1218 | 1373 | 1269 | 1275 |
1373 | Hut2728 | 757 | 750 | 856 | 829 | 869 | 781 | 775 | 851 | 828 | 851 | 893 | 1016 | 916 | 962 | 1004 | 970 | 851 | 962 | 1023 | 924 | 907 | 1055 | 1005 | 1280 | 2260 | 1251 | 1312 | 1354 | 1299 | 1329 |
1401 | rrnAC0516 | 659 | 783 | 808 | 890 | 900 | 809 | 711 | 830 | 837 | 762 | 818 | 874 | 756 | 840 | 1069 | 812 | 809 | 976 | 1016 | 938 | 891 | 1180 | 1050 | 1266 | 1251 | 2256 | 1367 | 1408 | 1349 | 1407 |
1373 | HQ2738A | 681 | 746 | 792 | 873 | 824 | 803 | 743 | 829 | 776 | 805 | 813 | 930 | 867 | 898 | 909 | 856 | 814 | 893 | 968 | 958 | 862 | 1107 | 953 | 1218 | 1312 | 1367 | 2262 | 1603 | 1464 | 1463 |
1449 | Hbo2149 | 596 | 765 | 812 | 865 | 816 | 796 | 722 | 903 | 776 | 781 | 830 | 987 | 853 | 862 | 942 | 904 | 861 | 946 | 1001 | 963 | 880 | 1115 | 1006 | 1373 | 1354 | 1408 | 1603 | 2361 | 1549 | 1526 |
1462 | HVO_2446 | 635 | 817 | 875 | 954 | 813 | 808 | 709 | 883 | 756 | 842 | 877 | 919 | 817 | 843 | 960 | 979 | 887 | 963 | 1024 | 975 | 925 | 1119 | 1007 | 1269 | 1299 | 1349 | 1464 | 1549 | 2251 | 1543 |
1471 | hla1390 | 651 | 811 | 835 | 882 | 857 | 826 | 736 | 859 | 805 | 835 | 899 | 986 | 931 | 919 | 981 | 903 | 923 | 990 | 1042 | 1057 | 919 | 1155 | 1062 | 1275 | 1329 | 1407 | 1463 | 1526 | 1543 | 2212 |
443 symbols consensus ----------------MSRYR--------------------------------------- #oth 11112212346766699:9:5111111111111111111111111111111111111111 Hbo2839 :::::::::::MVATPRKQF:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1790 ::::::::::::::::V::H:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7294 ::::MLRSAVTERPSIPA:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7270 :::::::::::::MTHST::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1203 ::::::::::::::::V::H:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3806A ::::::::::::::::::LR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3044A ::::::::::::::::::AR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2111 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0276 :::::::::::::::VTATR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0008 :::::::::::::::::ISR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2339 :::::::::::::::VNGSR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1382 ::::::::::::::::-M:H:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6293 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7332 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0617 VVTIRSRAEYYCNRTQA::I:VGGDGTVDAAETVGGAATVGGTDRAAEFAGTAPPPVERS hla1793 :::::::::MNLRTLLSTPES::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG1350 :::::::::MSFRRPTLGETP::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1791 ::::::::::::::MTRTTW:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo3149 ::::::::MSIRTRSDT:NWN::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1980 ::::::::::::VSINTQTN:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP3074A :::::::::::::::::RPL:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1510 ::::::::::::::::::TR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG1626 ::::::::::::::::-----::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP2642A ::::::::::::::::-M:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2728 :::::::::VPQDRTPTV:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0516 ::::::::::::::::-M:F:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ2738A ::::::::::::MRTPVR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2149 ::::::::::::::::VT:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2446 ::::::::::::::::VT:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1390 ::::::::::::::::V::T:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ----N----LGLFVLLAALWGTSFVAIKAGLE-------YF-PPVLFAALRYDIAGVVLL #oth 1111922329863575496316414235434:2122112752334642261463335534 Hbo2839 ::::V::PAGLAI:G:G::::AG:P::DIVV::::::::QL:::LGA:GI::AVS:CIV: HVO_1790 ::::T:::::V:::AA:V:F:::::G:::AIG:::::::SV::::::::F:V:V:A:::: pNG7294 ::::D::::SA::::::V:F:G::::::T::R:::::::EL:::::::G::F:L:A:T:: pNG7270 ::::-::::GL::AA::LI::L::::::T::::::::::SV:::::L::V:H:::A:::: hla1203 :::::::::IV::FT::L:::A:::::EV::D::::::::Y:::::Y::Y:F:L:ALI:V NP3806A ::::A::::I:::AVASLAF:GT:::AR::QV::::::::I:::L::V:I:F:L:AIL:: HQ3044A ::::A::::F:::IAS:V:F:GT::GA::::P::::::::::::LT:V:I:F::GAL::A Hbo2111 ::::S:::::VF:LAAS:FF:GT:::A::::::::::::F::::L::V:Y:F::GAAL:: HVO_B0276 ::::R:::::V::::T:FFF:GT:::A::::D::::::::L:::L::V:::F:::A:L:V rrnAC0008 ::::T::::FA:AAVASV:L:GT::GA::::S::::::::L:::L::V:::F:::A:::: Hmu2339 ::::T:::::VS:AVASV:F:GT:::A::::D::::::::::::L::V:::F:V:S:::I Hbo1382 ::::T::::TAA::F:S:I:::A:::T:V::A:::::::SL:::T::::M:F:::AA::F VNG6293 ::::T::::T:R:L::C:V:::A:M:TDV::A:::::::DL::A:P:::V:F:::AAL:F pNG7332 ::::T::::T:C:L::::I:::A:M:TDV::A:::::::DL::::P:::V:F:::S:L:F HVO_A0617 VVSV:GRVAA::::::GL:::S:::::EV::A::::::::::::LQ:::::FFL::LIV: hla1793 ::::I::::VAA:::::T:::::::::E:::H::::::::::::L:::GV::A:::AIV: VNG1350 ::::T::::TV::L::::I::S::::::I:IA:::::::DV::ALS:::I::S:::LIV: HVO_1791 :::::VPTTPL:::A:::M::::::::EV::::::::::F:::TLS::::::EL::L:M: Hbo3149 ::::-::::AL::IA:SCF::::::::E::::::::::::::::L:::GI::G:::LAI: HVO_1980 ::::T:::::A::ATI:V::::::M::EV::D:::::::AL::::::::::::V:::::F NP3074A :::::::::::::F:::::::F::P::S:::::::::::AL:::L::::::::VG::::: Hmu1510 ::::E::::TF::::::M:::::::::::::::::::::DL::::::::V:::L:::LM: VNG1626 ::::-::::-----------------------:::::::--:----------------MV NP2642A :::::::::TA:::::::V::SA:::::::VGSPDAPGYF:DA::::::V:::::A:LMF Hut2728 :::::::::ATA:LA:G:I::SA::::::::S:::::::A:::::::::::::V:::IV: rrnAC0516 :::::::::AI:::A::IA::SA:T:::::::::::::::::::I::::F:::L::LLM: HQ2738A ::::T::::I:::II::GA::SA:M::::::P::::::::I:::::::::::::::ILM: Hbo2149 :::::::::V:::LF:::V::AA:M::::::GTPSDPGGF:ET::::::I:::V:::LM: HVO_2446 :::::::::V::::V:::V::SA:M::::::::::::::F:::::::::::::V::::M: hla1390 ::::::::::S::LI:::V::SA:M::::::T:::::::::::::::::::::V::::M: consensus GYAAVTT--DRWLPRTRDDWLGVLVGGVFLIAAYHALLFVGQQY--V-TSAVAAIIVSLS #oth 3444779325:75.62562678356527274145343115.2971231343431146337 Hbo2839 A:::A::::::L::K:WREL::IA:I:G:MFGG:Q:G:YM:TT:::::SG:::SVVTTM: HVO_1790 TLV::RG::GY::::::A:A::I:ASAA:VLG:NNVF::L:::H::A::TGA::VMY:IM pNG7294 ::IVF:RPRST::::::G:FV:IGMAAL::::LNNG:::L::GA::T::P:A:SVMYG:N pNG7270 :::LWRG::RSLR:Q:::::SLI:I::TV::G:HF::::L::::::::P:SFG::LL::T hla1203 S:VL::E::ADS:::::G:LAAIGFS:GLSV::NNS::::::::::T:::GI:S:TY::V NP3806A ::::YA:E:GSIR::::G:IG:::AA::LT:GLANG::::::G:::::::::G::LF::V HQ3044A ::::HKLSFEQLR::::G:IIAI:AT:::V:GLTN::I:I::::::I:::G:::::M::N Hbo2111 SVVLYRFPRE:::::::A:IA:I:AA:::A:G:TN::I::::::::::::G:SS::Y::N HVO_B0276 ::VVA:RSRAEL:::SVR:VV:I:AT:::V:GLAN:::::::EH::::S:G:GS::F::N rrnAC0008 ::VV::RSR:EL:::::G:V::I:ST:L:ALGLAN::I:::::S::A:::::::::F::N Hmu2339 :::VA::PREAL:::::G:VV:IVAT:I:A:GLTN:::::::::::A:::::GS:VF::N Hbo1382 :F:FIRS::::LR:TS:TE:YPIIT::MLN:GIH::F::S::A:::IDNA::P:VLLG:I VNG6293 AAVF:SD::ADVY:::M::FVY:::::TLT:G:H::F::T:::::::::GG:::VLLG:V pNG7332 AAL:::G::ALER:Q::::YVY::A::SLM:GVH:VF::T:::::::::G::::VLLG:V HVO_A0617 :::::S::::Y:R:HS:T::TL:G:S:GL::G:H::F:YL::EH::::PG:::::VI::G hla1793 :F:::MS::G:TV::G::E::::A:A:A:V:::::G::Y::ELH::I::G::::VV:::: VNG1350 A:::H:::::::R::G:RE:VLAATV:L:V:GI::GA:YL:EHD::::SAPI:::VI::A HVO_1791 A::CYS::::::R:K:::EL:ATAI:A::I:::::G::YL::EH::::PG:::S::I::: Hbo3149 S::VA:::::::H:SG::E::SAA:A:::I::::::::YI:EM:::::SAS:::VV:::A HVO_1980 ::GLLAA::ED:R::G::E::V:F:::AL::G:HFS:::S::R:::::::G:S::VI::A NP3074A AFL:ARG::AD:R:::GE:A:AI:IA:A::::G-NS:::::::T::::P:G:::::YA:I Hmu1510 A:::A:::::D::::S:A::IA:AISATLV::L:N:F::::ERD:::::::::::LIATN VNG1626 A:::LVA:::D::::S:T::TT:GIAA:LM::::::F::::E:T::T:S::::::V:::: NP2642A A:V:WA::::::R::G:TE::A:A::SA:I::G::::::L::RG::T::::A::V::::: Hut2728 :::::V::::-P::ES:R:LAAII::STL:::G::::::::ELE::T::::T::V::::: rrnAC0516 :::VYA::::Q:V:KS:T::IV:GI::SL::::::IF::::E:G::T::::A:::V:::: HQ2738A :::LAQ::::QPV:Q:QSG:AS:GA:ATLIF:G::::::I:ETDPA:::::A::V::::: Hbo2149 :::VYA::::HPV::G::E:AT:V::S:LIM:G::::::I:ETDPA:::::A::V::::: HVO_2446 A::LYA::::SP:::G:AE:TE:AI:A::::::::::::I:ETDPT:::::A::VT:::: hla1390 A:::YVV:::DPI::G::E:TT:A::ATLI::::::F::I:ESDPA::::::::V::::: consensus PVLTPVFARALLPDERLSALGVVGLLLGLAGVVVVANPDPA---NLLSG-LVGVALVFAA #oth .242252279756975549:675.565135.243238385711276456:6748643462 Hbo2839 ::VAA:V:VPI:GES:-GI:DII:FFV:I:::F:LSQ:SVG::TASV:STAI::G:::LG HVO_1790 ::AS::::VL::D:A:I::VDAA:I::::V::::IVG:E--:::SV:G:GS::Q::IVCS pNG7294 :I:A::::WW::G:-:::W::AL:IGVA:S::ILIVQ:S:S:::TFTDASAI:QL::LG: pNG7270 ::V::A::ST:I:SY:ARPHELI:TVC:FI:::II:::T:-:::GAVG:R:L::::LISS hla1203 :IA:AAV:A:WIGGSD:D:R:GL:VV:AFI::GL::Q:::::::::AG:VTI::G:ISIG NP3806A :IIA:L::AL::S:::V::::A::MGVAAI::GM:VGVS:S::::::AESG::A:::LGG HQ3044A :I::::::AFA:S::PITRR::I:IVA::I::GL::::::S:::AFVG-:TI:LPII:G: Hbo2111 :IM::IL:AF::S:::::RS:AG:M::::V::AL:V:LN:::::D::G:AV::K:::L:: HVO_B0276 :I::::::M:::A:::::TR::L:M:I::L::GL:VGV:::::::::D:EALWKGV::LG rrnAC0008 :I::::::AI::S::::::R:GL:MVI::L::GL:VS:::::::M:::::GI:KLIL::G Hmu2339 :I::::::AV::A:D::::R:SA:MI:::L::GL:VS::::::::::A::GF:K:IL::G Hbo1382 ::I:::LT:LTTSS:::::V:::::V::FT::::I:D:K:E:::A:::SD:M::G::L:S VNG6293 ::V::ALT:LVAT::Q:T:ATA::VM::F::::II:::::T::::IADS:VL::S::L:S pNG7332 ::V::ALTKLASS:DTFT:NTG::VV::F:::::I:D:::::::::::S:TI:I:::::: HVO_A0617 ::::AL::TGI:G:-:I:P:::L:FGF:FL::GL::R:::S:::A:::SDV::::T:LV: hla1793 ::::AT::AL:::N:::GPFEIG:FA::IL::I:I:D:ME::::G:G:SA:L::::A::G VNG1350 :I::AG::SK:HENVTIDGTQAA:::A::::::I::::GS::::GSVD-::G:LL:::L: HVO_1791 :I::A:::SVI:TRGS:GKT:T::::A:F::A:L::D:VS:FSGSSG:AQGLSIV:I:L: Hbo3149 ::::A:::AGI:GQ-P:DKIAG::F:::IV:::I::::::::::::::TN:L:IV::LLS HVO_1980 :::::L::WPM::E:::D:F:FL:V::::::T::I:LAS--:::GSVG:Q:F::L:L:L: NP3074A ::::TAL:AV:::A:P:::RRI::VA:::V::A:I:R:::E:::G:::AQ:::::F:V:: Hmu1510 :I:ATA:S::::::::::TV:T::::::FV::GL:TR::VT:::GG::AE::ASGF:LL: VNG1626 ::::AG::::V::G::::IG:::::G::::::::LS::::S:::::V:STSQ::G::::: NP2642A ::::TA::::::A:::::V::LA:MGV:FL::::LSQ:T:::::DIAASRF--E:::::: Hut2728 ::::AG:::LA::GD:::VA::A::A::F:::::I:Q:::::::R:::SDVI:PL:::G: rrnAC0516 :I::TG::::F::::::TT::I::::V:FL::G:LS::::G::::::NPRT:SLF:::L: HQ2738A :M::TG:::VF::T:::TLV:FF:VV:::I::I:LSS::LQ::::IVG:GAIAKL:I::: Hbo2149 ::::AG::::F::V:::TTF:LA::::::V::AILSD:::N::::::T:GT:AKL:I::: HVO_2446 ::::TG:::L:::S:::TP::::::::::V::A:LSEL::S::::::A:GT:AKL:I:G: hla1390 ::::T:::::F::S:::TLV::::::V::::A::L:A:::S:::::TG:GT:AKL::LL: consensus AASFALGSVLTRRL--DSDLPIETMQAWAMLIGAVLLHVASLAL-GES-LAAITWTPEAL #oth 36461323.335991176754785533.54472236445937471316385859547863 Hbo2839 TTL::V:::TIQLF:::EE::A:SL:G:::VV::G::FFGAA:R:::AVP:LRSLS:L:: HVO_1790 :L:V:F:T::LK:V::GPSIGTLPQT::::AAA::GI:A:::G::::::V:QVA:S::LV pNG7294 ::AV::::::LQ:V::GPQMDSTPLT::::AV::::::::::LV:::PPT:V:GIG::TI pNG7270 :VA::V:A:::E:Y::T:S::LVSL:::MT:L::GI::AV:AG:PS:Q::GTV:VGL:Q: hla1203 VIAV:V:::GL:TV::ETTFSNVALTG::::F::L:I:GF::G::::P:QRLPSTALP:: NP3806A :::A:::T:::::C::EATISSTAQV::GLP:S:::::GM:::V:::::A:::E::LT:I HQ3044A :VVS:::A:VI:WS::TPTMSSAARTV:GVP:A::VT:LLAVMT:::::M:::SV::T:V Hbo2111 :V:G::::::I::A::::T:DSTVRT:::LPVA:::C::S:F:A:::Q:AS:V::::A:: HVO_B0276 :V:G:::T::I:WA:::TS:SSTVRT:::LPVS:A:T:GM:V:S::::::::A::S:T:: rrnAC0008 :::A::::::I:WS::GGG:SSTVRT:::LPVA:A:C:AL:IGM:::::A:TAV:S:T:I Hmu2339 :V:G::::::I:WA:::GE:SSSVRT::GLPL::G:T:AL:R:A:::::VG::::SG::: Hbo1382 :VA::::A:::HGS::K:E::FFSI:::T::::::F::AT:V::PW:::F:GAR::LD:V VNG6293 :FA::VAA:V:HSR::SPS::FLST:::L:AT:::V::::V:V:P:Q::F::A::::S:: pNG7332 :LA::IPA:V:HDT::SPSMSFLAT:::L:A:::AV::LTV:V:P:Q::F:DAS:::S:: HVO_A0617 S:C::::A::::PF::S::I:AR:L::::::F::A::S::GV:T:::::::T:E:SGV:V hla1793 ::A:S::A::L:P:::RT::::AAL:G:::VS::GM:L:GAAL::::::P:::V:NATSI VNG1350 :::::::G:::GK:PGGGG::V:::E:::::::SLA:W:GAAVR:::N:VT:VH:::T:: HVO_1791 :V:::::A::::P:::R::::VQS::::S::G:G::::GWA:VR::::::ST:ELA:VGI Hbo3149 T::::I:G:::EP:::RTS::A:S::::::::::GV:F:GAV:R:::::P:T:E::ST:I HVO_1980 ::AW:F::::VK::::PGNP:VVP::S:M:::::AM:::T:PV::::PG::SVA:::VVV NP3074A :L:V::::::L::R::TPTVGVAP:T::::VV:GL:::AG:FVA:::R:::HA:PSAV:V Hmu1510 :L:I::::::LQ:V::::G:GT:GLV::SNGV::::::AI:G::PN::::GGL:L:A:SV VNG1626 T::::::::::Q:I:::DA:DS:ALE::::VF:::VM::::I:A:::P:-QT:P::A::V NP2642A :LC::::::::::::::T:::::::E::S:AG::L:M:AL:::::::T:VSGAPP:-D:: Hut2728 :CA:::::::::W::::AE:S::A:EG:S:VG::::M::L:::::::::P::VE:::T:: rrnAC0516 :::::::::::::F:::D::E::::E::S::L::::M:GI:FGV:S:::V:DVQ::T::V HQ2738A :TA::::::::::::::AN::::::E::S::G::A:M:GV::L::::::FT::E::T::I Hbo2149 :IC::::::::::I:::A:F:::::E::T::G::::M:IV:VGI:::::VSDV:::G:T: HVO_2446 ::A::::::::::V::::E::::::E::S::L::G:M::::VG::::R:PG:VVLNVQSV hla1390 ::::::::::::AS:::D:::::::E::S::L::L:M:LL:::::::::V:DV::ST::M consensus AALLYLGVVAGAVGFLIYFRLLDRLGPIEINLVSYVVPVVAALGGWLLLGETITPTTVAG #oth 51362244622341165..713685.16263125.26.33224626442559357;246. Hbo2839 GS:::ITLI:::G:Y:L::::VR:V:AT:TT::A:LE:LS:TFVSVVFFDQ:LDE:::I: HVO_1790 ::I::V:MP:T:AAYPV::A::SEA::VRG:::A:AM::::TVT::AF:::AVS:A::L: pNG7294 :SIVAV:IPST::AYA:::G:IN:I::VRA:::A::::IF:::M::V:::SSVSLW:LV: pNG7270 ::IA:::I::S:I:::L::::ISTV:AA:TS:::::::A:T:IS::::::::LG:V:::: hla1203 G:::F:::L:S::AYV:::T:::::::F:::::::::::::TVT:AV::A:PV:AL:I:: NP3806A VS:A:VT:::::::YIA::A:IEEV:ALRSS:IF:AS:L:::::::WF:::A::T::::: HQ3044A I::::V:IGS::IAY:S::A:I:TV:ATRA::LF:LT:::S:::::II:N:S:STL:II: Hbo2111 :::G:V::FS::LA:IA::G:::DV:A:RG:::F:A::I::T:::::::::::SAL::V: HVO_B0276 V::A:V::F::::AY:T::GF::DV:::RG:::F:A::I::T:::TA::::S:STL::V: rrnAC0008 :::::V:IF:::IAYIA::G:::VT:A:QA::IF::::::ST::::A::::A::::A::: Hmu2339 L::G:V::F:::IAYIA::E:::TA:::RA:::F:::::::T::::A::D:::A::A::: Hbo1382 IS:V::::::::G::GL::W:::HI::::AS:LE::I::F::I:::IIR:NA:DTN::I: VNG6293 G::T::S::::VG:::L::::::D:::::MSFIE::I::F:::A:::V::QE:::A::V: pNG7332 ::::::A::::IG:::L::::::Q:::::MSFIE::I:LF:::A:::V::QQV:LA::G: HVO_A0617 GS::::A::S::GA:::::E::GCF::TQ:::IG:LE::S:T:LS:AF::QL:DAV:AL: hla1793 :S:S::TLLS:V:A:::::A:::EV::SQLH::G:AE:::::V:S:A:::SL:EAEAII: VNG1350 :S:A::TL:C::G:::L::V::E:A:AT:::::::LE:IG:SVVA:A:F:DVVS:RAL:: HVO_1791 :SF:::TL:S:::A::L::E:::::::T:L::IG::E::::::MS:V:::HV:DT:ALV: Hbo3149 IS:M::TF:S:V:::::::A:HE:V:AT:::::::LE::::S:A::V:::HVVSS::LV: HVO_1980 ::::F:A:LCS::::IA::V::::I:AV::S::N::T:::::VT::AF:::RLG:V:::: NP3074A VSVV::A:F:S:::YVV::T::E:F::L:::::::::::::T:::IA:::::L:AGM::: Hmu1510 V:IV::A:F:SVI:YFV:::::G:::A:Q::::::AT::F::VT:::::E:::DA:::T: VNG1626 F:VA::S:G:S::::::::::::S:::::::::G::A::F::AV:L:WR::A::TP:IG: NP2642A V::G::A:::S:A:::V::D::G:::A::::::::::::F:::V:V:::::RVDTP:A:: Hut2728 LS:G::SL::S:L:::L::A:::::::V::::::::A::F:::T:F:::::R:DVA:AS: rrnAC0516 L:::::V:::S:L::::::D::E::::::::::::AA:::::AT:L:F:S::P:VY:GV: HQ2738A L::A::A:::S:L:::::::::EQ::A:::::::::A:IF:::A::IF:S:IP:IA::I: Hbo2149 L:VG::S:::S:I:::V::V::E:::AL::::::::A::F:::T:::FR::IP:VY::V: HVO_2446 :::A::SLA:S:L::::::D::A:::::::::::::A::F:::S::AF:S:VP::S::G: hla1390 L::G::SI::SGL::::::D::::::::::::::::A::F::VS:::F:N:A::SN:::: consensus FAVIFAGFALLKREAI-RAELRRLRDRLA------------------------------- #oth .67147..6555787425=877:;:;;=9;;;8::7711111111111111111111111 Hbo2839 :LAVA:::T:IS::TM::HAVA:::ESDTSEVRSSRN::::::::::::::::::::::: HVO_1790 :G::LS::L:VQ::SV:ARFVGLRGSVP:EAE:::::::::::::::::::::::::::: pNG7294 :L:VV:::::IE:VT:::M:::::YR:FEDTSPKQTP::::::::::::::::::::::: pNG7270 ::::VV:::WV:ADVL::SLR::RT:SPSYRPYGPQD::::::::::::::::::::::: hla1203 ::::VV::G::::H:::AD:VP::LS:IGGLF:::::::::::::::::::::::::::: NP3806A :VTVV:::LVIGH:QF:::AF:::A:GRGQATGGYEP::::::::::::::::::::::: HQ3044A :V:::G::LI:GGDS::T:VITHRYPQVRTQWTLLRERVLSTVLSLKSWYSLRAIQSRDK Hbo2111 :G::CL::V::G::T::T:::S:I:RGI:QRAGSGSD::::::::::::::::::::::: HVO_B0276 ::T::T:::V:AT:SL::GTVV:VY:E:GSRVAGLAG::::::::::::::::::::::: rrnAC0008 :LT::T::VV:GS:SV:--DI:A:LPATTDEGDTVSE::::::::::::::::::::::: Hmu2339 :LT::::::V:GSQSVDATAV::RVPG:RPNDPPVRT::::::::::::::::::::::: Hbo1382 :::::V::L:V::ADV::R::V:::E:SRTAASDAD:::::::::::::::::::::::: VNG6293 ::F:LS::LAS:WR:L::LRSVVVTTISSFTGPRDD:::::::::::::::::::::::: pNG7332 :GC:LL::IAA:WT:L:::::::VVEPKTSPPAD:::::::::::::::::::::::::: HVO_A0617 :VS:::::::I::R:L:GELVAGA::GS:E:::::::::::::::::::::::::::::: hla1793 :VA:L:::LV:E:HE::A:YVGVDEPAW:R:::::::::::::::::::::::::::::: VNG1350 ::::::::::V:HRY::G:AV:NTT:DAEL:::::::::::::::::::::::::::::: HVO_1791 :GA::F:::AM:K:TLVSVAVAVR:RVA:::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo3149 :VTV:I::::V::H:::::RILGDVPTT:TGHSYDAD::::::::::::::::::::::: HVO_1980 ::L:L::::FM::D:L:GPLG::FGV:VGLVAPAPAA::::::::::::::::::::::: NP3074A :VL:AS::VVI:ART::AD::G:------::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1510 :L:VLV::L::::D::::E::TA::----::::::::::::::::::::::::::::::: VNG1626 :CIV:T::CV:::R:::A::::A:SE---::::::::::::::::::::::::::::::: NP2642A :LLV::::VII::R::::::IADSYWP--::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2728 :V::LV::V::::D::::ETYVGWLAEAQP:::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0516 :TC:LV::G::::D:L::N:VA:FSGTPNRGE:::::::::::::::::::::::::::: HQ2738A :II::I::T::::D::::D::PQI:QA:N::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2149 :I:::V::L:::::SL::R::P:::RE:KTFGTRE::::::::::::::::::::::::: HVO_2446 ::L::L::V::::G::::R:::YRFGDG:RATD::::::::::::::::::::::::::: hla1390 :LI:CV::::V::A:F::DA::EYGVVG-::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ----------------------- #oth 11111123334334356564642 Hbo2839 ::::::HGD:::::::::::::: HVO_1790 ::::::::::::::::::::::: pNG7294 :::::::::::::::::::PCDD pNG7270 :::::::::DCVVVSGNAYTTRE hla1203 ::::::::::::::::::::::: NP3806A :::::::::::::::::::::SD HQ3044A QTRTKTQTQSQTQSHSHSPSQSD Hbo2111 :::::::SVTGVVGDTPRWSEQD HVO_B0276 ::::::::::::::::GAAPGRD rrnAC0008 :::::::::SLGIADEQRGFESD Hmu2339 :::::::::::::::EPNGFESD Hbo1382 ::::::::::::::::::::::: VNG6293 ::::::::::::::::::::::: pNG7332 ::::::::::::::::::::::: HVO_A0617 ::::::::::::::::::::::: hla1793 ::::::::::::::::::::::: VNG1350 ::::::::::::::::::::::: HVO_1791 ::::::::::::::::::::::: Hbo3149 ::::::::::::::::::::::: HVO_1980 ::::::::::::::DPDGLPADD NP3074A ::::::::::::::::::::::: Hmu1510 ::::::::::::::::::::::: VNG1626 ::::::::::::::::::::::: NP2642A ::::::::::::::::::::::: Hut2728 ::::::::::::::::::::::: rrnAC0516 ::::::::::::::::::::::: HQ2738A ::::::::::::::::::::::: Hbo2149 ::::::::::::::::::::::: HVO_2446 ::::::::::::::::::::::: hla1390 :::::::::::::::::::::::