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9 genomes BUD0021 16 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1085

rrnAC0836

HVO_1472

HVO_A0183

Hbo0077

Hbo3923

Hmu1324

Hmu1496

Hut0531

Hut1868

hla1776

hla1918

NP1568A

NP2720A

HQ1839A

HQ1871A

Pairwise sequence scores
Consensus score547 hla1918 HVO_A0183 Hbo3923 HQ1839A VNG1085 HVO_1472 HQ1871A Hbo0077 hla1776 rrnAC0836 NP2720A Hut0531 Hmu1324 Hmu1496 Hut1868 NP1568A
171hla1918 667 336 381 398 159 145 147 149 155 159 138 145 135 135 109 186
216HVO_A0183 336 816 424 395 207 192 205 190 185 198 190 193 190 180 188 198
223Hbo3923 381 424 590 511 185 183 204 180 185 174 192 193 190 174 174 215
215HQ1839A 398 395 511 588 179 188 181 173 178 178 184 197 194 172 171 195
382VNG1085 159 207 185 179 536 362 345 361 364 378 372 373 391 209 225 253
470HVO_1472 145 192 183 188 362 534 435 455 421 428 448 436 437 179 262 261
439HQ1871A 147 205 204 181 345 435 531 453 406 411 421 401 407 160 236 256
459Hbo0077 149 190 180 173 361 455 453 523 445 431 447 419 443 185 241 263
443hla1776 155 185 185 178 364 421 406 445 537 442 420 433 464 185 222 269
465rrnAC0836 159 198 174 178 378 428 411 431 442 543 469 481 469 199 244 289
498NP2720A 138 190 192 184 372 448 421 447 420 469 534 493 457 195 270 286
485Hut0531 145 193 193 197 373 436 401 419 433 481 493 541 473 197 268 309
460Hmu1324 135 190 190 194 391 437 407 443 464 469 457 473 556 202 228 256
199Hmu1496 135 180 174 172 209 179 160 185 185 199 195 197 202 621 254 289
294Hut1868 109 188 174 171 225 262 236 241 222 244 270 268 228 254 634 403
305NP1568A 186 198 215 195 253 261 256 263 269 289 286 309 256 289 403 626

115 symbols
consensus       ------------------------------MPKVEITLPDHLEMQIAQLVEQGEFVNREE
#oth            111111111111111111121121221123.1624232114245214111132.123111
hla1918         :::::::::::::::::::MLKSVRPERMR::TF:LN:S:DVYAEFQ::A::-:::SE:Q
HVO_A0183       VSLPTTAHDQTQTAITHTRSLKYVEHERVS::V::VN:::E:LVEFE:::DE-::ISE:Q
Hbo3923         ::::::::::::::::::::::::::::::::I::V::::E:LTEFE:::DE-:::TE:Q
HQ1839A         ::::::::::::::::::::::::::::::::I::V::::E:LSEFE::::E-:::TE:Q
VNG1085         ::::::::::::::::::::::::::::::::T::VNI::QI::::::::::::::S:::
HVO_1472        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:E::::::V:::::::::::D:
HQ1871A         ::::::::::::::::::::::::::::::::N:D:NV:E:::T::::::DKD:::D:::
Hbo0077         ::::::::::::::::::::::::::::::::::N:SV:E::::::::::::::::S:::
hla1776         ::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::V:E::::::::M::::::L::::
rrnAC0836       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::NI:E:::::::::::K:::L::::
NP2720A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::QL:I:E:::::::::::E::::::::
Hut0531         ::::::::::::::::::::::::::::::::E::::I:::::::::::::E:::L::::
Hmu1324         ::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::I:E:::::::::::E:::LT:::
Hmu1496         ::::::::::::::::::::::::::::VN:A:TSVD:::RIVSE:DR:::S::YL:::Q
Hut1868         ::::::::::::::::::::::::::::::::::S:S:::RI:ND:ER::D:::::::DQ
NP1568A         ::::::::::::::::::::::::::::::::E::VS:::RIDSE::R::D::::L:::Q

consensus       AIEELLSTGIRAYKT-----SGPMDD---------AEDPGFEDDGMMGHDDEYVF
#oth            .3.2.122.34.1435443424262222232463553544542343313422221
hla1918         :A:D:IAS::E::NVSIVD:DE:R:E:::::MLDG::NNM:DTAQDP:SLEDDRL
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HQ1839A         :V:D::TM::D::NVNIVDD:Q:G:::::::IIEG::NNL:DTATDP:GLEDDRL
VNG1085         :::Q:::S:::::::::::::::SE:::::::::EDGAGLESEG:::::::::::
HVO_1472        :::D::::::::::::::::::::S::::::::::-::RAY::::::::E:::::
HQ1871A         ::::::::::::F::::::::::::::::::::::-::R-:::::::::E:::::
Hbo0077         :::::::::L::F::::::::::::E:::::::::-D:R-:::::::::E:::::
hla1776         :V::::::::K:F::::::::::R:E:::::::::EDSG::::E:::::E:::::
rrnAC0836       :::D:::::LK::::::::::::Q:E:::::::::D:E::::E::::::::::::
NP2720A         :::::::::L:::::::::::::::::::::::::-::::L:E::::::::::::
Hut0531         :::D:::::LK::::::::::::I:::::::::::E::::L:E::::::::::::
Hmu1324         :::D:::::LK:::::::::::::::::::::::EDDPG::::::::::::::::
Hmu1496         :Y::::TM:LS::GPAEEETEE:GENLFDQNMNDQTDPAARDEG:-----:DFT:
Hut1868         :V::::TM:VS::D:GEDEPEVAAE:DFFSQTVEDQQ::ALH::DP---::G:T:
NP1568A         :V:::::M:VS::APSDSS:DE:A:EDIFTQMTDDQQ::AARE:DPQ:--:::T: