|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 547 | hla1918 | HVO_A0183 | Hbo3923 | HQ1839A | VNG1085 | HVO_1472 | HQ1871A | Hbo0077 | hla1776 | rrnAC0836 | NP2720A | Hut0531 | Hmu1324 | Hmu1496 | Hut1868 | NP1568A |
171 | hla1918 | 667 | 336 | 381 | 398 | 159 | 145 | 147 | 149 | 155 | 159 | 138 | 145 | 135 | 135 | 109 | 186 |
216 | HVO_A0183 | 336 | 816 | 424 | 395 | 207 | 192 | 205 | 190 | 185 | 198 | 190 | 193 | 190 | 180 | 188 | 198 |
223 | Hbo3923 | 381 | 424 | 590 | 511 | 185 | 183 | 204 | 180 | 185 | 174 | 192 | 193 | 190 | 174 | 174 | 215 |
215 | HQ1839A | 398 | 395 | 511 | 588 | 179 | 188 | 181 | 173 | 178 | 178 | 184 | 197 | 194 | 172 | 171 | 195 |
382 | VNG1085 | 159 | 207 | 185 | 179 | 536 | 362 | 345 | 361 | 364 | 378 | 372 | 373 | 391 | 209 | 225 | 253 |
470 | HVO_1472 | 145 | 192 | 183 | 188 | 362 | 534 | 435 | 455 | 421 | 428 | 448 | 436 | 437 | 179 | 262 | 261 |
439 | HQ1871A | 147 | 205 | 204 | 181 | 345 | 435 | 531 | 453 | 406 | 411 | 421 | 401 | 407 | 160 | 236 | 256 |
459 | Hbo0077 | 149 | 190 | 180 | 173 | 361 | 455 | 453 | 523 | 445 | 431 | 447 | 419 | 443 | 185 | 241 | 263 |
443 | hla1776 | 155 | 185 | 185 | 178 | 364 | 421 | 406 | 445 | 537 | 442 | 420 | 433 | 464 | 185 | 222 | 269 |
465 | rrnAC0836 | 159 | 198 | 174 | 178 | 378 | 428 | 411 | 431 | 442 | 543 | 469 | 481 | 469 | 199 | 244 | 289 |
498 | NP2720A | 138 | 190 | 192 | 184 | 372 | 448 | 421 | 447 | 420 | 469 | 534 | 493 | 457 | 195 | 270 | 286 |
485 | Hut0531 | 145 | 193 | 193 | 197 | 373 | 436 | 401 | 419 | 433 | 481 | 493 | 541 | 473 | 197 | 268 | 309 |
460 | Hmu1324 | 135 | 190 | 190 | 194 | 391 | 437 | 407 | 443 | 464 | 469 | 457 | 473 | 556 | 202 | 228 | 256 |
199 | Hmu1496 | 135 | 180 | 174 | 172 | 209 | 179 | 160 | 185 | 185 | 199 | 195 | 197 | 202 | 621 | 254 | 289 |
294 | Hut1868 | 109 | 188 | 174 | 171 | 225 | 262 | 236 | 241 | 222 | 244 | 270 | 268 | 228 | 254 | 634 | 403 |
305 | NP1568A | 186 | 198 | 215 | 195 | 253 | 261 | 256 | 263 | 269 | 289 | 286 | 309 | 256 | 289 | 403 | 626 |
115 symbols consensus ------------------------------MPKVEITLPDHLEMQIAQLVEQGEFVNREE #oth 111111111111111111121121221123.1624232114245214111132.123111 hla1918 :::::::::::::::::::MLKSVRPERMR::TF:LN:S:DVYAEFQ::A::-:::SE:Q HVO_A0183 VSLPTTAHDQTQTAITHTRSLKYVEHERVS::V::VN:::E:LVEFE:::DE-::ISE:Q Hbo3923 ::::::::::::::::::::::::::::::::I::V::::E:LTEFE:::DE-:::TE:Q HQ1839A ::::::::::::::::::::::::::::::::I::V::::E:LSEFE::::E-:::TE:Q VNG1085 ::::::::::::::::::::::::::::::::T::VNI::QI::::::::::::::S::: HVO_1472 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:E::::::V:::::::::::D: HQ1871A ::::::::::::::::::::::::::::::::N:D:NV:E:::T::::::DKD:::D::: Hbo0077 ::::::::::::::::::::::::::::::::::N:SV:E::::::::::::::::S::: hla1776 ::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::V:E::::::::M::::::L:::: rrnAC0836 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::NI:E:::::::::::K:::L:::: NP2720A ::::::::::::::::::::::::::::::::::QL:I:E:::::::::::E:::::::: Hut0531 ::::::::::::::::::::::::::::::::E::::I:::::::::::::E:::L:::: Hmu1324 ::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::I:E:::::::::::E:::LT::: Hmu1496 ::::::::::::::::::::::::::::VN:A:TSVD:::RIVSE:DR:::S::YL:::Q Hut1868 ::::::::::::::::::::::::::::::::::S:S:::RI:ND:ER::D:::::::DQ NP1568A ::::::::::::::::::::::::::::::::E::VS:::RIDSE::R::D::::L:::Q consensus AIEELLSTGIRAYKT-----SGPMDD---------AEDPGFEDDGMMGHDDEYVF #oth .3.2.122.34.1435443424262222232463553544542343313422221 hla1918 :A:D:IAS::E::NVSIVD:DE:R:E:::::MLDG::NNM:DTAQDP:SLEDDRL HVO_A0183 :V:::::M:MD::GAPVDDED:VQS::::::FVQS:QNNL:DTA:DP:GL:DD:L Hbo3923 :V:::::M::D::NVSVVDE:T:G:::::::FMDG::NNL:DTASDP:GINDDRL HQ1839A :V:D::TM::D::NVNIVDD:Q:G:::::::IIEG::NNL:DTATDP:GLEDDRL VNG1085 :::Q:::S:::::::::::::::SE:::::::::EDGAGLESEG::::::::::: HVO_1472 :::D::::::::::::::::::::S::::::::::-::RAY::::::::E::::: HQ1871A ::::::::::::F::::::::::::::::::::::-::R-:::::::::E::::: Hbo0077 :::::::::L::F::::::::::::E:::::::::-D:R-:::::::::E::::: hla1776 :V::::::::K:F::::::::::R:E:::::::::EDSG::::E:::::E::::: rrnAC0836 :::D:::::LK::::::::::::Q:E:::::::::D:E::::E:::::::::::: NP2720A :::::::::L:::::::::::::::::::::::::-::::L:E:::::::::::: Hut0531 :::D:::::LK::::::::::::I:::::::::::E::::L:E:::::::::::: Hmu1324 :::D:::::LK:::::::::::::::::::::::EDDPG:::::::::::::::: Hmu1496 :Y::::TM:LS::GPAEEETEE:GENLFDQNMNDQTDPAARDEG:-----:DFT: Hut1868 :V::::TM:VS::D:GEDEPEVAAE:DFFSQTVEDQQ::ALH::DP---::G:T: NP1568A :V:::::M:VS::APSDSS:DE:A:EDIFTQMTDDQQ::AARE:DPQ:--:::T: