|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 440 | NP0088A | Hut0959 | VNG0765 | rrnAC1309 | NP0668A | Hmu0249 | hla1451 | Hbo2352 | VNG2081 | HQ1378A | rrnAC2799 | Hmu2687 | Hut2470 | Hbo1065 | hla0494 | HVO_0442 |
236 | NP0088A | 446 | 183 | 206 | 179 | 185 | 189 | 180 | 170 | 176 | 213 | 202 | 234 | 209 | 211 | 207 | 195 |
289 | Hut0959 | 183 | 432 | 243 | 264 | 251 | 281 | 243 | 225 | 243 | 257 | 260 | 252 | 253 | 268 | 241 | 244 |
294 | VNG0765 | 206 | 243 | 440 | 304 | 288 | 303 | 289 | 230 | 193 | 241 | 218 | 237 | 247 | 275 | 227 | 261 |
287 | rrnAC1309 | 179 | 264 | 304 | 448 | 272 | 281 | 304 | 268 | 196 | 224 | 223 | 245 | 239 | 257 | 227 | 237 |
312 | NP0668A | 185 | 251 | 288 | 272 | 477 | 294 | 313 | 255 | 196 | 239 | 243 | 247 | 248 | 244 | 221 | 263 |
286 | Hmu0249 | 189 | 281 | 303 | 281 | 294 | 444 | 324 | 245 | 215 | 231 | 231 | 246 | 244 | 263 | 237 | 241 |
310 | hla1451 | 180 | 243 | 289 | 304 | 313 | 324 | 463 | 259 | 213 | 250 | 231 | 230 | 250 | 267 | 247 | 251 |
251 | Hbo2352 | 170 | 225 | 230 | 268 | 255 | 245 | 259 | 437 | 212 | 206 | 214 | 236 | 200 | 227 | 234 | 243 |
284 | VNG2081 | 176 | 243 | 193 | 196 | 196 | 215 | 213 | 212 | 458 | 268 | 278 | 271 | 243 | 280 | 285 | 284 |
339 | HQ1378A | 213 | 257 | 241 | 224 | 239 | 231 | 250 | 206 | 268 | 438 | 317 | 301 | 298 | 325 | 303 | 298 |
333 | rrnAC2799 | 202 | 260 | 218 | 223 | 243 | 231 | 231 | 214 | 278 | 317 | 472 | 366 | 337 | 289 | 308 | 288 |
345 | Hmu2687 | 234 | 252 | 237 | 245 | 247 | 246 | 230 | 236 | 271 | 301 | 366 | 464 | 326 | 301 | 295 | 297 |
346 | Hut2470 | 209 | 253 | 247 | 239 | 248 | 244 | 250 | 200 | 243 | 298 | 337 | 326 | 453 | 291 | 324 | 270 |
339 | Hbo1065 | 211 | 268 | 275 | 257 | 244 | 263 | 267 | 227 | 280 | 325 | 289 | 301 | 291 | 443 | 303 | 314 |
330 | hla0494 | 207 | 241 | 227 | 227 | 221 | 237 | 247 | 234 | 285 | 303 | 308 | 295 | 324 | 303 | 456 | 323 |
337 | HVO_0442 | 195 | 244 | 261 | 237 | 263 | 241 | 251 | 243 | 284 | 298 | 288 | 297 | 270 | 314 | 323 | 423 |
67 symbols consensus --MGFGSYDESEQENQ--DV-DFDDDDGVNTHENDHDGEVEFEF-GASNDELLDRLQDIK #oth 11........1..4415546117324534525446.2.3243171423422.23315322 NP0088A ::::::::::::::::QL:T::DIE:G:QS:LPT-::::::::YDD::SED::ETYERLQ Hut0959 ::::::::::::::::ASGS::I::SES:DVDAT::::D:N::T:N::Q:::::K:::M: VNG0765 MH:::::::::::KD:::S:::T:E:K::SV:::::::::S:DS:E:DSE::I:Q:KS:: rrnAC1309 :::::::::::::KDN::::::A::SE::AV:::::::S:S::T:E:TTSD:V:K:G:M: NP0668A :::::::::::::QD:::N::ET:E:AA::V:::::E::::::::DENE:A:I:::::M: Hmu0249 :::::::::::::KD::::N::I:E:EA::V:N:::::D:S::S:D:DQ:::IG::DEMR hla1451 :::::::::::::KD:::::::T:::NA::V:::::::::TI:G::::T:D:VG::SEM: Hbo2352 ::::::::::::::R:QSN-:ED::AE:IT:::HE:E:S:TV:S:DV:T:A:I:::GEM: VNG2081 :::::::::::::DT:SI:SE:VAAA:EMD:A:HE:::G:DY:I:::::::::::::E:: HQ1378A ::::::::::::::::DFET::LE:::::S:SQS::S::::Y:I:::::::::N::K::: rrnAC2799 :::::::::::::D::EY:T:::E:E::LDAE::A:E:DI:Y:::T::::::::::E::: Hmu2687 :::::::::::::D::EY:T:EY::E::LS:S::E:::D::::::T::::::::::D::: Hut2470 ::::::::::T:::::DL:A::::::::::AA::T:::DL:::::T::::::I:Q:S::: Hbo1065 ::::::::::::::S:DY:Q::L:EN:::A:S::::::::N::N:::::E:::::::E:: hla0494 ::::::::::::::::DL:A:::::::::QAA:EV:E:S:DY:P:::::::::::::E:: HVO_0442 :::::::::::::GD:::N:::::EE:::T:S:EK:E:::D::I:::::::::::::E:: consensus DE----- #oth 3465321 NP0088A G:::::: Hut0959 :-::::: VNG0765 ::::::: rrnAC1309 ::DEE:: NP0668A :DDDDGD Hmu0249 ::E:::: hla1451 :DEDDE: Hbo2352 ::E:::: VNG2081 :QSS::: HQ1378A :N::::: rrnAC2799 :NQNT:: Hmu2687 G:NT::: Hut2470 ENT:::: Hbo1065 :N::::: hla0494 S:ET::: HVO_0442 :::::::