|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2814 | VNG6196 | NP4804A | Hut3046 | Hmu3428 | HQ2052A | Hbo1524 | HQ3455A | HVO_2996 | Hbo1525 | Hut1729 | rrnAC2527 | Hmu3005 | VNG0753 | hla1610 | NP1270A |
999 | VNG6196 | 1800 | 812 | 847 | 757 | 702 | 803 | 813 | 876 | 839 | 804 | 891 | 931 | 842 | 836 | 906 |
1716 | NP4804A | 812 | 2899 | 1657 | 1319 | 1354 | 1243 | 1467 | 1478 | 1444 | 1383 | 1418 | 1484 | 1375 | 1305 | 1396 |
1846 | Hut3046 | 847 | 1657 | 2861 | 1426 | 1398 | 1367 | 1639 | 1645 | 1664 | 1436 | 1556 | 1532 | 1516 | 1432 | 1451 |
1679 | Hmu3428 | 757 | 1319 | 1426 | 3010 | 2479 | 1319 | 1608 | 1557 | 1578 | 1319 | 1437 | 1402 | 1297 | 1255 | 1277 |
1644 | HQ2052A | 702 | 1354 | 1398 | 2479 | 2999 | 1292 | 1522 | 1473 | 1495 | 1263 | 1410 | 1404 | 1253 | 1245 | 1277 |
1775 | Hbo1524 | 803 | 1243 | 1367 | 1319 | 1292 | 2795 | 1506 | 1521 | 1509 | 1469 | 1615 | 1644 | 1470 | 1476 | 1542 |
2048 | HQ3455A | 813 | 1467 | 1639 | 1608 | 1522 | 1506 | 2810 | 2187 | 2273 | 1537 | 1679 | 1676 | 1553 | 1436 | 1571 |
2112 | HVO_2996 | 876 | 1478 | 1645 | 1557 | 1473 | 1521 | 2187 | 2820 | 2275 | 1562 | 1775 | 1739 | 1549 | 1535 | 1599 |
2094 | Hbo1525 | 839 | 1444 | 1664 | 1578 | 1495 | 1509 | 2273 | 2275 | 2803 | 1521 | 1707 | 1700 | 1529 | 1487 | 1580 |
1993 | Hut1729 | 804 | 1383 | 1436 | 1319 | 1263 | 1469 | 1537 | 1562 | 1521 | 2938 | 1700 | 1745 | 1886 | 1922 | 1742 |
2174 | rrnAC2527 | 891 | 1418 | 1556 | 1437 | 1410 | 1615 | 1679 | 1775 | 1707 | 1700 | 2909 | 2323 | 1724 | 1768 | 1807 |
2235 | Hmu3005 | 931 | 1484 | 1532 | 1402 | 1404 | 1644 | 1676 | 1739 | 1700 | 1745 | 2323 | 2902 | 1719 | 1809 | 1882 |
1954 | VNG0753 | 842 | 1375 | 1516 | 1297 | 1253 | 1470 | 1553 | 1549 | 1529 | 1886 | 1724 | 1719 | 2871 | 1870 | 1737 |
1882 | hla1610 | 836 | 1305 | 1432 | 1255 | 1245 | 1476 | 1436 | 1535 | 1487 | 1922 | 1768 | 1809 | 1870 | 2835 | 1847 |
1986 | NP1270A | 906 | 1396 | 1451 | 1277 | 1277 | 1542 | 1571 | 1599 | 1580 | 1742 | 1807 | 1882 | 1737 | 1847 | 2791 |
425 symbols consensus -MVEALLVVGILVAVFVGFNIGGSSTGVAFGPAVGSGLLSKLGAAALMTVFALLGGWTVG #oth 134351352.34224..12.1..12.1211..21.13423166.22.1441324.1423. VNG6196 MALSVVF:::VAA:I:::V::::::::::::::T::DA::MRQ:SG::A::V::::F:I: NP4804A ::::::::::VIASL::::::::::::I:W::P::A:IIK:TT::G:::::VF::::::: Hut3046 :::SL::F::LAA:G::::::::::::::W::S::ANVV::T:::::::G:VF::::::: Hmu3428 ::LGTVAI:::V::::::::::::::::::::::::R:VR:TT:G::FVA:GF::A:::: HQ2052A :::IL:A::::I::I:::::::::::::::::::::R:VR:TT:G::FVG::FF:A:::: Hbo1524 :VT:T:VL::LV::::::::::::N:::::::::::RTV::F::GV::GI:::F:::::: HQ3455A ::::V::FI:VG::::::::::::::::::::::::::V:::F::G:::T:::I:A::A: HVO_2996 :V:::::F::L:::::::::::::::::S::::::::V:G::A::::::G::::::::L: Hbo1525 :V::I:::::L:::A:::::::::::::::::::::::V:::L::G:::A::::::::A: Hut1729 ::::P::::::VITA::AY::::AT::P:::::::A:AIG:V::::::S:SFFV:A::I: rrnAC2527 ::::V:FAL:V:::I:::::::::::::::::::::NT::::S::::::I::MA::LI:: Hmu3005 ::::V:FL::::::I::::::::::::::::::::A:T:::F:::::::I:::A::HF:: VNG0753 ::IS:::G::LV::A:::::V:::T::P:::::::ADA:::PT::G:::::FFI:A::L: hla1610 :::::::L::FV::A:::Y::::AT::P:::::::ADV:::S::::::S::FFI:AG:L: NP1270A :-M:L::L::::::::::Y::::AT:AP:::::::A:V:::VA::::::::F:A::::L: consensus REVVDTLGGDIVP-ASQFTLAASIAVLFFIGLALLISNLFGVPASTSMTAVGAIAGLGLA #oth 34.24311442243777114731131.2.2.522132.6512121..1.1.112212.3. VNG6196 TN:::A::A:FI:::EY:::G:::G::L::::GI::G:VLN:ST:::Q:::A:VVAM:A: NP4804A :N:M:::S:Q:I-:TIEL::S:GV:I::::::GI:AA:I::::VP::::T:::::::::: Hut3046 :K:IK:::::::::EAA:SIE:::V::T::::GM:VA::Y:::V:::::::::::::::: Hmu3428 :N:IA:MSSS:::::A:::PV::V:::::T:AS::::::Y::S:::::::::::V::::: HQ2052A :N:IA:MSSS:::::I:::PI::VI::::T:IS::::::Y::::::::::::::I::::: Hbo1524 :R::T:::S:LII:GDP::V:::VVI:L::::::FV:::::I:::::::::::V::Y::: HQ3455A :::IE:M::Q::::R::::::::V:::::V:I::::::T:::::::::::::::::::V: HVO_2996 ::::AKM::E::::Q:E::::::V:::::V:::::V::T::::::::::::::::::::: Hbo1525 :::IK:M::Q::::Q:E::::::V:::::V:F::::::T:::::::::::::::::::V: Hut1729 ::::::::TEL:TDPTI:S:PV:::::::::G::::G::S:A::::::::::::::::I: rrnAC2527 PA::ES::S:L:-::T::SPLI::V::::::V::FL::VV:::::::::::::::::::: Hmu3005 ::::K:::SG::-:S:E::MLV::V::::::F::FL::VV:::::::::::::M::::I: VNG0753 :R::::::TELLRQPGI:::E:::G:::::::::FVG:YA:::::::::::::::::::: hla1610 QR::T:::E:L:TGGNV:::ET::V::::::G::FVG:FA:::::::::::::::::::: NP1270A ::::::::EG::::GEL:::E:::V::::::F::F:::S:::::::::::::S::::::: consensus TGTLNWAVMGEIVSWWIVAPVIAFWISAVIGRYFYPYLDRRVAIDQSEGPLLTLDRSGSI #oth 534.28633431431.22213221222421...4.3625553446532242483325374 VNG6196 L:V:D:RTV:VVGM::VLSTTL::::C:FV:::::DAIVNLLSFESDD------------ NP4804A :::::YP:IAG:I:::V:T:::G:::GGI::::I::EVN:::Q:KK::::::::::DAAV Hut3046 :Q::::::L:::AV::LI:::VG::LGSIV:::I:::::QYF:LE::::::V:VE:::LV Hmu3428 S::::Q:L:FV:::A:::::LLC:V:GV:V:::V::H:::Y::FTKFDLHFVQ:::::T: HQ2052A :S:::Q:L:FV:L:A:::S:LVCLT:GV:::::M:::V::Y::FTTFDLHFIQ::::NT: Hbo1524 :DR:AVQLIM::::::L:::ILG::L:::V:::V:DDIASV::::R:D:::VI:R:D:VV HQ3455A S::::E:::L:::::::::::L::::C::V:::L:::::A:LKLNR:P:::I:::::::: HVO_2996 N:S:DSR::L::I:::::::::::::C::::::I:::::AWLKL:::P:A:VR:::D:GF Hbo1525 :::::E:::L::I::::::::::::VC::::::V:::::AKLEL:S:P:::VEF:NA:IL Hut1729 S:::DLT:V:::::::::S:::G::::::::::::TH:R:LI::::::::::::::E:GL rrnAC2527 R::::A:L:L::::::L:S:I::::V:G::::::::T:VEWF:VS::::A::DF:::::: Hmu3005 Q:::::EA::::::::L:S::::::V:G::::::::A:VE:F::P:TD:S::A::::::V VNG0753 RDA:DV:::::::I::V:::::G::V:LI::::::AR:H::::MNRT::A::RV::T:A: hla1610 ::::DR::::::AI::::::I:G::V:G:V::::::AI:SW:::EST::S:FVF::::I: NP1270A ::::::VT::Q:::::::::I::::::G:V::::::TINEW:::PD:::----------- consensus PRPRLGPNTTRRELVGTLLVIAIGCYMAFSAGASNVANAVAPLVGN-GSLEMNPGILLGG #oth 174853422382245255312511.2.1112.1..211.2....1434715447212115 VNG6196 -----------TGRFAE:V::G:::::G::T::::::S:::::::S:RQ:::TS:VAI:: NP4804A :K:TF:::::WT::IS:SA:LV::::::::::::::P::A:::::GASG:PDDTA:I:AT Hut3046 :M:::::G::T::F:S:IV:LL:A:::::::::::::::::::::G::L::PG:AVI::T Hmu3428 :::Y:NV:ASPQDI::S::::V:A:::::::::::A:::::::::EG:::TV:Q:V::AV HQ2052A ::LIIN::ASLQDII:SF::VI:::::::::::::A:::::::::SS:::TV:Q:VI:AV Hbo1524 :V:A::AG::P:::T:S:::V::::F::::::::::::::::::::::::S::A::::A: HQ3455A :WI:R::::SN:::GSVC:::I:A::::Y::::::A:::::::::::::VS::I::I:AT HVO_2996 ::::::::::Y::FGS:V::VVVA::::::::::::::::::::::::A::::T:::IA: Hbo1525 :KL:::::::P::AWS:V:::::A::::Y::::::A::::::::::::A:KL:E:::::A Hut1729 :::AP::::S:::I:::VVLV::::L::::S:T::I:::I:::::S:NE:K:::A::::C rrnAC2527 :::G::E:::Q::F:::VV::G:::::G:::::::::::::::::::::::LY:A::::: Hmu3005 :::V::E:::::::I:::::VG:::::::A:::::I:::::::::::N::::T:A::::: VNG0753 :TV:PAE::N::::F:VVT::T:::L::::S:T::I:::I:::::S::VVG:::A::::C hla1610 :K:VP::::::::F::GFV::::::L::::S:T::I:::I::::AL:DNV::T:M::::S NP1270A -N:LR:EG-S:::R::A:V::G:::L::::S::::::::I:::::S::E:S::L::IIAT consensus GAIGLGAFTIARRTLETVGNDLTDLPLLAALVVAVVSATIVTFLSAIGIPASLVVIATMS #oth 31213.211.111.1122.42112111312341453333434522661212122422234 VNG6196 V:::V:::A:GP::M::::E:I:::S:--------------------------------- NP4804A I:::V:G:::::::M:S::GE:S:I::::::F:M:TAS::T:V::WF:::I:::MSTV:T Hut3046 AT::::S:::::::M:S:::GI::::::::M::M:IG:::T:IA::M:::I::ALSTV:T Hmu3428 A:F:::S::::::::::::D:I:E::I::S:I:S::G:SVI:V::YF::::::A:ST:ST HQ2052A ::F:V:GL::::::::M::D:I:E::I::S:I:S:IGG:VI:I::SF::::::A:ST:ST Hbo1524 :::AI::L:::::::::M::E::E:::T::::::T::::L::V::LL:::::F::::::: HQ3455A ::::F::::::::::D:::::::E::I::::::ET:::SVIAI::IL::::::A:S:::C HVO_2996 :::::::::::::::D:::::::Q::I::::I:ET:::SLIS:::::::::::A:S:::C Hbo1525 :::::::::::::::D:::::::E::I::::I:ET:::SLIA:::Y:::::::A:S:::C Hut1729 A:VAV:::::::::M::L:::I:::::T::I::::::S:::IA:::A:V:::F:::::VN rrnAC2527 ::::::::::::::MD:::::::::::V::I:::A:AS::::::::L:::::F:I::::: Hmu3005 ::::::::::::::MD:::::::::::::::L::A::S::::::::L:V:::F:I::::: VNG0753 A:V:V:S::::::::::M:S:I:E:::T::I:::S::::L:I::::::::::F:::::V: hla1610 A:VAV::::::::::D:L:::I:::::T::I:::C::SG::IS:::V:::::F:I::::: NP1270A V:V:I:::::::K::D:M:::::E:::T::I::::I:S:ATAA:A:::::::F:I::::: consensus IVGLGWGRAT---RTVTLGDAVRGD-DPE---VSVGALA--A--DAPD----------EV #oth 221211112211115454845464678592226444334245313766433433534365 VNG6196 ----------:::------------:---:::-------::-::----::::::::::-- NP4804A :::I::::::::::P::VS::::R:TGDAE::IVP::ITAKGMEGKAA::::::::::-- Hut3046 ::::::::::::::PA:ATELA:::I:TT:::P::D::::::::ETDE:::::::::::: Hmu3428 :I:::::::S::::AA::KQLATPTPERPDLE:TT:::VTSRVEE::TGPTIGDIARE:E HQ2052A :I:::::::S::::VA::AEL:TPSP:RPDVA::T::::TSRAE:T:SGPTIGDVASG:E Hbo1524 T:::::::E:TRE:SYPVA:PATLAGPTR:::SGIETV:AGR:::SA:::::::::::-- HQ3455A :::::::::::::::::I:::I-:GEK:::::M::N::T:::::ETDT::::::::::S: HVO_2996 :::::::::::::::::::E:LS:GEA:Q::::::N::T::V::ERE::::::::::::: Hbo1525 :::::::::::::::::::E:L-:GKS:::::M::N::::::::ETQE:::::::::::: Hut1729 ::::::::::::::V:KIE:::V::ET:P::::::::::ADD:::::TVGKPELIEDEHD rrnAC2527 :::::::::::::::TS:S:T:Q:E:A:V:::A:::::TTD:::::A:APTVGGKKGTPK Hmu3005 :::::::::::::::T:IS:T:K:E:T:::::::::::T:::::::::APTVGGQAGTPS VNG0753 ::::::::::::::P:SVQS::S::S:VA:::::::G::::::::D:::::::::::EA: hla1610 :::::::::::::::::VKQGIS:EKE:K:::::::::K::::::ETG::::::::::-- NP1270A :::::::::::::::TRAR:::::E:ETN::::::::::::::::EAATVGDTGPESEQS consensus P-----------PIGEESPEDIPSASDLFDPGTTARVIFMQNLVPSLATLAAYAVFRFLP #oth 332232111213431538573446764124173452435424431633345236518755 VNG6196 -:::::::::::---:A::DR--------------------------------------- NP4804A -::::::::::S::::AE:DEVLD:G:::N:RAVIKY:S:WIIG::IS::L::GF::I:: Hut3046 ::::::::::::A:::::G:KLQETG:::::SVVV:FVAFWIIG:TV::AMS::T:VV:: Hmu3428 :AEKPEEVPDVPDV:A:G:A:L-DERS:::::AAK:IVT:WL:T::::IA:S:P::A::L HQ2052A STEKLDEVPGVPD::S:G:A::-DEDS::N:AAAK:IVT:WL:T::::IIGS:P::M::L Hbo1524 -:::::::::::-----TSL:VDEPAT:YR:V::::::::::I::AV::VG::S::SYVE HQ3455A ::::::::::::DV::::SQEL-TNQT:::::::G::::FWL:T::VSAA:S::L:S:M: HVO_2996 ::::::::::::KM:::A:DEL-::Q::::::::G::::FWM:T:::SA::S::L:SAGI Hbo1525 ::::::::::::AM:Q:TET:L-AG:::::::::G::::FWL:T:::SA::S::L:AMS: Hut1729 :::::::::::E:::D:PAQEP:AQ:N::::S:::::LL::::::M:::I:SF:T:EL:F rrnAC2527 :AET:::::::E::::::R::::::::::E:::::::::L::V:::I::::::L:::::: Hmu3005 EKHKQ:::::::::::--:::::K:A:::E:E::::::LT::F::AV::::::L::K:V: VNG0753 ::::::::::::A::::Q:::::::G::::::::V:::A::::::IVG:VS::LA::::: hla1610 -:::::::::::::::GD:S:::::::::N:::S:::VL:::V::L:S:VG:LVT:TL:F NP1270A :::::::::::::::::D:G:::A:::::::K::G:::L:::V::AI:::G:FL::::V: consensus I---- #oth 64342 VNG6196 -:::: NP4804A GVA:: Hut3046 :AGTV Hmu3428 -:::: HQ2052A -:::: Hbo1524 LAAVM HQ3455A L:::: HVO_2996 V:::: Hbo1525 F:::: Hut1729 VV::: rrnAC2527 :A::: Hmu3005 :F::: VNG0753 :WGF: hla1610 QFVW: NP1270A VV:::