| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4859 | Hut2075 | rrnAC2314 | VNG0123 | Hmu0242 | HVO_0506 | Hut1963 | HQ1138A | Hbo1038 | NP0006A | hla0440 | Hut0591 | Hmu0256 | hla2411 |
| 3011 | Hut2075 | 4918 | 2759 | 2599 | 2763 | 2663 | 2781 | 2696 | 2686 | 2764 | 2797 | 2373 | 2142 | 2360 |
| 3813 | rrnAC2314 | 2759 | 4822 | 3254 | 3477 | 3455 | 3517 | 3355 | 3469 | 3356 | 3446 | 2459 | 2439 | 2549 |
| 3854 | VNG0123 | 2599 | 3254 | 4853 | 3478 | 3549 | 3474 | 3392 | 3692 | 3347 | 3511 | 2505 | 2241 | 2507 |
| 3955 | Hmu0242 | 2763 | 3477 | 3478 | 4967 | 3545 | 3744 | 3504 | 3714 | 3399 | 3421 | 2519 | 2286 | 2572 |
| 3973 | HVO_0506 | 2663 | 3455 | 3549 | 3545 | 4879 | 3593 | 3470 | 3741 | 3502 | 3590 | 2531 | 2403 | 2578 |
| 3973 | Hut1963 | 2781 | 3517 | 3474 | 3744 | 3593 | 4867 | 3648 | 3872 | 3453 | 3532 | 2569 | 2393 | 2561 |
| 3828 | HQ1138A | 2696 | 3355 | 3392 | 3504 | 3470 | 3648 | 4902 | 3996 | 3386 | 3447 | 2515 | 2389 | 2599 |
| 4087 | Hbo1038 | 2686 | 3469 | 3692 | 3714 | 3741 | 3872 | 3996 | 4923 | 3470 | 3594 | 2501 | 2377 | 2582 |
| 3866 | NP0006A | 2764 | 3356 | 3347 | 3399 | 3502 | 3453 | 3386 | 3470 | 4814 | 3654 | 2526 | 2369 | 2567 |
| 3882 | hla0440 | 2797 | 3446 | 3511 | 3421 | 3590 | 3532 | 3447 | 3594 | 3654 | 4911 | 2617 | 2445 | 2572 |
| 2783 | Hut0591 | 2373 | 2459 | 2505 | 2519 | 2531 | 2569 | 2515 | 2501 | 2526 | 2617 | 4761 | 2347 | 2691 |
| 2641 | Hmu0256 | 2142 | 2439 | 2241 | 2286 | 2403 | 2393 | 2389 | 2377 | 2369 | 2445 | 2347 | 4836 | 2924 |
| 2919 | hla2411 | 2360 | 2549 | 2507 | 2572 | 2578 | 2561 | 2599 | 2582 | 2567 | 2572 | 2691 | 2924 | 5029 |
727 symbols consensus -MMDAP--ADDDDPFEDQRERVDRPMRRLFSEYGRDNTFAFVVGLLASVAARLLDLLPPV #oth 125774227514341154.353231151.176..565654442155112511513.4.12 Hut2075 MSWGFSGGN::A:T::HL::G:::::W::LGN:::GYIPE::L:GV:::V::F:E:I:AL rrnAC2314 ::DFDA::GS:::V:::A::::::::L:::TG::QGHWG::::::CS:IV::M::::::I VNG0123 ::ST::DNEG::::::E::AD::NA:VQ::D:::::HS:QA::AV::::F::V:::A::: Hmu0242 :-::VD:::G:::A:::V::N::H::::::A:::::::G::T::::S:I::::::::::: HVO_0506 :--VS:::ET:::::::::::::N::::::A::::E:::E::::V:::::::V:::M::: Hut1963 :-:SID::L:::EV:::V:D:A::::::::::::GRYS:P::I:FVS:::::I::::::L HQ1138A ::DAV:::::::::::S:::::SN:::::::T:::E:IP:IA::VIS:I:::V::::::: Hbo1038 :-:VT:::::E:::::::::N:EN::::::::::::::::::I:::S::V::::::M::: NP0006A ::A:IA::W:::::::E::ANT:D::G::::A:::PHILPAT::VI::I::::::::::: hla0440 ::SS:E::WE::::::E::DKIEN::K:::LA::::YLPQVS::IF:::F:::::::::L Hut0591 ::STDD::HV:IEYI:RY:DA:EH:LWQ::QR::HGSRRW:L::I:::IGS:FAS:V::: Hmu0256 :---MS::T:EQT::DRY:T:I:::LV:::AD::TSR:RWL:I::V:NLL:QTAS::::: hla2411 :---MA:::::RNA::VY:D:::::LL:::R:::ALEAHWLAI:MA:N:I::VAG:V::: consensus LLGLAIDAIFRGEA-AFS--LPLV--PDAWI----PTDQPGQLWLSVGLIAGAFLLGAGF #oth 3.23.2.12174561714223442111623311111556852242452222332534141 Hut2075 V::V::::L:V:GQ:D:T:::::::::QSV::::::A:E:::F:FA:::VGAVY::S::L rrnAC2314 ::A:::::::LQ:::EYG:::F:I::::::::::::NG:GP::::TA:I::AS:G:::V: VNG0123 :::::::SVIQ:NK:::-::::FL:::QSVV:::::SSK:DR:LFMG:::::S:::::A: Hmu0242 :::V:V:::::NDR:P:A:::GP:::DLSAY::::AS:PES:VI:ASSI:::::I::::: HVO_0506 I::::::::I:Q:T:S:AAGF:VL:::E:::TPYV:ATRD::FL:A::I:VFS:TA::V: Hut1963 ::T:::::::-DDQ:QY::::W:::::QSL::::::KT:SA::::T::I::A:::I:::: HQ1138A ::AV:V::::LD:R:T:::::WF::::A:::::::::::V:::YI::A::::::FGA::: Hbo1038 ::T::V:S::L::R:D::::IW:I::::::L::::::TKL:E:Y::T::::F::FG::A: NP0006A ::::::::V:NDD::::A::MW:I::::::L:::::AEESE::LFV::::G:::V:S::: hla0440 M::I::::V:YED::L::EQI:::IL::::L::::::G:TE:F:FTIAV:GA::GI:::: Hut0591 :::V:L::::-:SE:S:A:::::I:::GTVL:::::NETMD:F:FVIA:M:VFMIGQ:IL Hmu0256 V::T::::L::E:TSEY::::LFL:::R::::::::PGEVA:F::::A::::S:VAT:L: hla2411 V::V::::V:T:TG:PYT::::I:::::::L::::::AG:A:FR:::A::V:S::ITGV: consensus HWIRNWGWNAFAQRIQHAVRTDTYDKMQRLNMDFFADKQTGEMMSILSNDVNRLERFLND #oth 21422323.7111422.5..2111351111425..321....2..1.1..322..5..22 Hut2075 N:VNG:A::R:::HL::E::V::::VV::MR:G::D::::::V::::N::::Q::S::TN rrnAC2314 ::S::::::K:::HV:::::::::ET:::::::::::::::::::V:::::::::K:::: VNG0123 :::::::F:S:S:H:::R::::::::::::::::::T::::::::::::::::::::::: Hmu0242 ::T::::::::::::::::::::::R:::::::::::::::::::V:::::::::::::: HVO_0506 ::L:::::::Y::Q:::D:::::::R::L::::::::::::::::::::::::::::::: Hut1963 ::T::::::T:::N:::N::::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::E HQ1138A ::T:::::::::::V:::::::::NE::::SLS::::::::::::::::::::::::::: Hbo1038 ::T::::::S:::N:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP0006A ::V::::F:::::::::D:::::::A::::E:G:::::::::L:::::::::Q::T:::E hla0440 :::::::F:::::N:::D::::::::::::::E::S:::::::::::::::::::::::: Hut0591 NFV:ASSL:L:SH:VK:E:::A::QR::::D:E::NEV::::L:::::::T:::::::DN Hmu0256 T::YGVSA:F::HGVM:S::S:SFE::L::DAA::D::::::V:::::::SQN::L::DN hla2411 T::YGIAA:N::H:VM::::::SF:R::::D:T::D::::::V::V:N::ASN::V::DN consensus GLNSAFRLGVMVVGIAAILFYYNWQLALVTLLPVPLIAGFTYRFVKAIQPKYADVRSSVG #oth 3233541231122112531246.21..2111441.33241133.2552211.43212311 Hut2075 D::AGI:IS:L:::V:SVMVWL:::::I:A::S::VL:VAS:L::QR:G:::GR::R::: rrnAC2314 :::::S:MII::::::TY:::M:::::::A:::::I::V::K::IDV::::::E:::T:: VNG0123 ::::::::S:::LA:GVY::VV:::::VL:M::::I::L::::::N:::::::::::::: Hmu0242 :M::::::S:::L::S::::::::::::L::VI::A::F:::::I::::::::::::::: HVO_0506 :M::F:::F::::A::VV:LS::::::::A::::::::L::WK::DI::::::::::::: Hut1963 :M:AF:::SI::L::SV::::W:::::::::GV::::GF:::K::ET::::::::::::: HQ1138A :M::::::::::I::::::L:W:::::::::SV::::GY:::::::I::::::::::::: Hbo1038 :M::::::::::I::::::L:W:::::I::::V::::GY:::::IQT::::::::::::: NP0006A ::::M::::::::::G:V:L:::::::::A::::::::::::L:::V::::::R:::::: hla0440 :M::L:::S::::::GVL::WI:::::::A:::::I:G::::L:I:I::::::E:::::: Hut0591 MFGESIQ:::LI:::SL:::WF:G:::V:::AVI::A:V:::W:MRLAEER:T:::Q::: Hmu0256 A:MNGV::I:::L:::::::AL:::::::::VAI:::G:::VW:MRV:E:R:EARQ:AMA hla2411 A:QNSA:::::L::::GV:::::HE::V:::SVI::MIL::VW:MR:VE:R:VAQ::V:: consensus DLNSRLENNLGGIQVIKTANTESYESDRVDDVSQDYFDANWDAITTRIKFFPALRLLAGV #oth 63.111..214.2222.3443.82.41..243.631124213215222411.21234213 Hut2075 A::::::::I:::E:V:SYGR::F:R:::EEA:EE:L:::::::::::::::T::IIT:L rrnAC2314 K:::::::::S:::I:::::::P::A:::E:T:E::L:::::::E:::T:::G:::VS:I VNG0123 H:::::::::::::::::S:::R:::::::::::G::::::G:::I:::::::::IIS:: Hmu0242 Q:::::::::::V:::::YS::G::::::E:T:R:::::::G::::::::::G::V:::: HVO_0506 K:::::::::::::::::F:A::H::::::G::M::::::::::N::::::::::I:::I Hut1963 Q::::::::::::::::A::::TF:::::::::E::::::::::G:::::::G::::S:: HQ1138A Q::::::::::::::::S:H::NF:::::::T::E:::S:::::K:::T::::::I:S:: Hbo1038 RV::::::::::::::::S::::F:::::E::::::::::::::G::::::::::VM::: NP0006A TV::::::::::M::::::T::E:::::::A::SE:L:::::::G::::::::::::::L hla0440 KM:::::::::::::::SS:::P::::::::::M:::::::::::::::::::::V:::I Hut0591 ::::::::::N::E:::S::::DH:DK::REH:YQ::RLD:L:LRLNFIYR:G:QA:TSI Hmu0256 :F:T:I::GIT:VILA:VTGS:D::V:::R:A:HGV:ETTM:VLKLSYFYR:GME::::F hla2411 :::TA:::A:A:VELV::SH::AH:::::ETA::Q::ERTMSILRLNYVYR:GME:F::L consensus GFVLTFVVGGLWVLT----GGPPGP--------FTGDLSVGEFVTFILLTQRFIWPMAQF #oth 2143..31..412772121252.43111111111125135.41151223211122.1212 Hut2075 :YMF::L:::Y:L:F::::-:::SVSLAGTTVG:::GMTL:VLTPML:YAR::L:::R:: rrnAC2314 :::V::I::::M:T-:::::QA:::::::::::L:AS::R:Q::A::IY::::V:::::: VNG0123 :::::::I::I::A:::::-:::MF:::::::::S:T:DP:::::::::S:Q:::::::: Hmu0242 :::V::L::::::YS:::::EG:WI:::::::::::T::E::::V::::S:::::::::: HVO_0506 ::S::::::::::IN:::::QG::::::::::::::::EI:::::::::::Q:V::L::: Hut1963 :::V::L::::::F:SQTT:TG:WF:::::::::::K:::::::G::::S:::::::::: HQ1138A ::::::LI::A::::YQQT:QA:LF:::::::::S:S:TP::::G:::F::::::::S:: Hbo1038 ::::::::::V::H:YQTT:SA:LF:::::::::S:A:TP::::G:::F::::::::::: NP0006A :::::::::::::I::::::SG:::::::::::L::::T::T::V:::F::::V::L::: hla0440 :::::::I:::::FQ::::DT::::::::::::::::::::M::V:::Y::::::::::: Hut0591 S:IA::::::V:I:E::::-:::::::::::::L:::::E:TL:I:L:::::LVE:L::M Hmu0256 S:AA::L:::Y:I:F::::-DA:::::::::::L:::::::V::::VFM::::VA:L:EV hla2411 A:AA::A:::Y:LSA::::-::::::::::::::STT:T::T::::V::::Q:VA:L:EV consensus GQIINMYQRAYASAERIFGLMDEPSRIEEDPDADDLAVTD----GRVEYDDVTFGYD--- #oth 121114123.41132.12.1324154253732.54.53631111.7.5131.4.3.5111 Hut2075 :NVV:N:RY:F:A::::V:::EY:GTVDDPD::V::GGV::::::::S:A::::Q:P::: rrnAC2314 ::::::::::::::::V:::::T:G:L::AE::PP::::::::::::A:E::V:S::::: VNG0123 ::::::::::R::S:::::::N:::::::N::::E:V:D::::::G:V::::R::::::: Hmu0242 ::::::::::::::::::::::T::L:::TD::EE::::::::::E::::G:::::GE:: HVO_0506 ::::::::::H::SA:::::::::A:LA:Q:::P::::SE::::::::::::::::G::: Hut1963 ::::::::::H::S::::::::T::::V:::::EP::::::::::H::F::::::::::: HQ1138A ::::::::::::::A:::::::::A::VN::::PA:D:DT:::::T:Q:S::::::E::: Hbo1038 :::::::::::::SA::::::::::::::::N::E:V:D::::::E:V:::::::::::: NP0006A ::::::::::H:::::V:::V::SDGL:ATGE::P::::::::::S::::G:::::-::: hla0440 ::::::::::R::SA:::::::::::LA:::::E::T:G::::::D:V::::S:::-::: Hut0591 ST::DR:ED:R::TK::L:I:NL:VD:QDAE::IE:EAVE:::::H:QF:::::::-::: Hmu0256 SN:VDEV:N:KV::A:V:::A:I:V::TDRE::KR:GDPE:::::::T:E::C:S:PELL hla2411 SN::DQ:EN:K::C::V:::R:I:I::TDGE::I::GGKSSSVA:A::::::S:A:AE:: consensus ---------------------------DDETVVEDISFEVDGGETVALVGPTGAGKSTVL #oth 111111111112222222232233235122532421215232.11111..1..1..1.33 Hut2075 ::::::::::::::::::::::::::EA::AS:D:V::SAEA:DF:G:::::::::T:L: rrnAC2314 ::::::::::::::::::::::::::G:::P:LS:::::A:::::::::::::::::::: VNG0123 :::::::::::::::::::::::::::::DAI::H:D:Q::::D:L:::::::::::::: Hmu0242 :::::::::::TQSVSEQSSGEGTDPA:::VILD:V::T::::D:L:::::::::::::M HVO_0506 ::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::L:::::::G::::I: Hut1963 ::::::::::::::::::::::::::::E::I::::A:::E::D:::::::::::::::M HQ1138A ::::::::::::::::::::::::::T:E:PTIK:::::IP::::L:::::::::::::: Hbo1038 ::::::::::::::::::::::::::::G::I::::::D::::::L:::::::::::::: NP0006A ::::::::::::::::::::::::::::G:::::N:D::A:::::::::::::::::::: hla0440 ::::::::::::::::::::::::::::E::I:S::D:A:E::::L:::::::::::::: Hut0591 :::::::::::::::::::::::::::AEQA:L:::DVD:EP::::G:::::::::T:FV Hmu0256 TDDHGPAVPDDETETDGGFAALDGDEG::DS:I:HV:::AEP:::::F::S:::::::LC hla2411 :::::::::::::::::::NALVDPADA::E:IRNV:::ANP:D::::::::::::::L: consensus KLLLRMYDVDEGAVRIDGQDVRDVTIPSLRRAIGYVSQDTFLFYGTVRENIAYGTFDADD #oth 1..2.1..133.5141..212243336.1.5321..2.2421.2..131.14..413264 Hut2075 :::V:L::PE::EI:V::H:::::SLA:::EHV:::::EPY::H:::A::V:::-I::G: rrnAC2314 ::::::::::S:T::::::N:Q::Q:Q:I:::::::::E:::::::::::::::::::T: VNG0123 ::::::::::A::::V::::ISG::L:::::HV::::::::::::::E:::T:::::::R Hmu0242 :::M:::::ND:::::::::::::::::::D:::::::E::::H::::D:::::S:::T: HVO_0506 :::M::::P:::H:N:::::::::::S:::ES:A::::E:::::::::D::T:::::::: Hut1963 :::::::::::::IE:::T:L::A::::::Q:L:::::E::::::::::::E::::::EK HQ1138A :::::::::::::ITV::T:::EI::::::ES:::::::::M:::::A:::R::::N:SR Hbo1038 :::M::::::::SIE:::T:I:::::::::Q::::::::::M:::::E:::R::::::AQ NP0006A :::::L:::::::I::::::I:SA:PT::::H::::G::::::::::::::::::::::E hla0440 ::::::::::::SI:::::::::::LK::::S::::G:SSY:::::I::::T::::E:T: Hut0591 :::::L:::::::::V::H::::::LS:::NS::::G:EN:::D:::A:::K::A::::R Hmu0256 R::::L::::::R:AV::T:I::LELA:::QHV::::::A:::D::IG:::R::R::ES: hla2411 :::::L:::T:::::V::H:::NL:VE:::SNV:::A:::T::D::IA:::R::R:TGV: consensus ---------------EAVVEAAKAAEAHEFIQNLPDGYDTMVGERGVKLSGGQRQRVAIA #oth 11111111111111123132.123.2.2411631.2111.31..............231. Hut2075 :::::::::::::::DEIR::LSM:G:M::VTE::EEI:::::::::::::::::::::: rrnAC2314 ::::::::::::::::EI:A::E::::DQ:VR::::::::::::::::::::::::I::: VNG0123 :::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::E:::::::::::::::ID:: Hmu0242 ::::::::::::::::EIR:::::::::GY:::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0506 :::::::::::::::::::A:::::::::::S:::E::::K::::::::::::::::S:: Hut1963 :::::::::::::::::::::::M::::R:::::::::::K:::::::::::::::I:L: HQ1138A :::::::::::::::DEIID:::T::::::VM::::::::EI::::::::::::::LS:: Hbo1038 ::::::::::::::::D:::::::::::D:::::::::::EI::::::::::::::LS:: NP0006A :::::::::::::::SDIEA:::::::::::T:::E::E:::::::::::::::::I::: hla0440 ::::::::::::::::E:R:::E::::::::K:::E:::::::::::::::::::::T:: Hut0591 ::::::::::::::::::I::::R:Q:::::T:M:E::::E::::::::::::::::::: Hmu0256 ::::::::::::::::::R:::E:::::::::R:::::::R:::::::::::::::I::: hla2411 TEGRSAGADAKSEVRDR:I::::::::::::DS::N::::RI:::::::::::::::::: consensus RAILKDPEILVLDEATSDVDTETEMLIQRSLDRLTADRTTFAIAHRLSTIKDADTILVLE #oth .22.31.22111...1.2..11..31.12.115111.....31......131.1312.31 Hut2075 ::::E:::::I::::::H::N:::V::::::ET::::::::::::::::VR:::::::MD rrnAC2314 ::::::::::I:::::::::::::::::::::D::::::::::::::::V::::::::V: VNG0123 :::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::S::::::::::::Q:V::: Hmu0242 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::V::::Q:V::: HVO_0506 :::::::D::::::::::::::::::::::::E::::::::S:::::::::::EQ:V::: Hut1963 ::::::::::::::::::::::::::::::::K::::::::::::::::::::EK:V:I: HQ1138A ::V:R:::::I::::::::::::::::K::IE:::::::::S::::::::::::Q::::D Hbo1038 :::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::S::::::::::::Q:I::: NP0006A ::V::::AV:::::::::::::::L:::::::::::::::::::::::::R::::::::D hla0440 ::V::::DL:I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0591 :TL:QG:A:T:F:::::A::::::L:::Q:I:DVA::::::V:::::::VR:::::::V: Hmu0256 :VV:Q:::::I::::::::::D::QR::A:::A::::::::VV::::::VIG:::::::: hla2411 :VV:Q::A::I::::I:A::::::::::::::E:A::::::V:::::::VT:::LT:::: consensus DGRIVERGTHDDLLAADGLYANLWGVQAGEIDELPEEFIERAAERRARTDAE-------- #oth 2.311...4.32.2553.1..3..31.2.1234114312422641746788464331111 Hut2075 E::V::::::E:::::::::::::S::V::MEA::::::::T:::ERAGTGD:::::::: rrnAC2314 ::::::::S:AE::::::::::::A:::::::::::::V:::IQ:::::::-:::::::: VNG0123 ::E:::::::A:::GDE::::::::::::::::::D:::::::K:Q:TV:DQ:::D:::: Hmu0242 ::SV::::S::::::E::::::::A:::::::::::::VR::T:::SQV:::VG:D:::: HVO_0506 ::::::::A:::::SE:::::H::::::::::Q::D::V::::R:Q:EV::G:::::::: Hut1963 ::::::::::E::::D:::::K::A::::::::::Q:::::::::::Q:ES::::A:::: HQ1138A ::E:::::::T:::G::::::H:::::::::E::::T::Q::TQ:ASQ:SI:TDAA:::: Hbo1038 :::V::::G::::::E:::::H::::::::::::::::::::SR:AS::PV:PESD:::: NP0006A ::E::::::::E:IER:::::H::::::::::S:::A:V:::::::::A:VDG::::::: hla0440 G:E:A::::::E::DNS::::H:::::::::::::Q:::D::Q::T::LVEDAESD:::: Hut0591 :::::::::::::ID:::::::::R::::::GS::A::::E:SQ:V:QQGLD:::::::: Hmu0256 ::EV::::D::T:RQQG:R::E:::A:T:-----------------------:::::::: hla2411 ::GVA:::::::::D::::::K::::::::::::::::V:::H::HVDRAV:RAMEGETV consensus -----DD #oth 1111121 Hut2075 ::::::: rrnAC2314 ::::::: VNG0123 ::::::: Hmu0242 ::::::: HVO_0506 ::::::: Hut1963 ::::::: HQ1138A ::::::: Hbo1038 ::::::: NP0006A ::::::: hla0440 ::::::: Hut0591 :::::GE Hmu0256 :::::SE hla2411 ESETL::