Home |  Text search
[S] (-) COG1992 Uncharacterized conserved protein
9 genomes BUD0046 12 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0247

rrnAC1764

rrnAC1777

HVO_0662

Hbo0866

Hmu0622

Hmu2521

Hut0068

Hut0371

hla0092

NP5168A

HQ1277A

Pairwise sequence scores
Consensus score2183 Hmu2521 rrnAC1764 Hut0068 VNG0247 HQ1277A rrnAC1777 Hmu0622 NP5168A Hut0371 hla0092 HVO_0662 Hbo0866
992Hmu2521 2243 1370 1388 724 719 743 749 692 724 773 759 806
1054rrnAC1764 1370 2399 1530 790 703 831 822 759 840 826 821 835
1002Hut0068 1388 1530 2290 728 684 830 799 728 772 775 740 832
1449VNG0247 724 790 728 2204 1218 1284 1212 1318 1241 1315 1262 1271
1390HQ1277A 719 703 684 1218 2329 1187 1197 1272 1278 1235 1406 1375
1588rrnAC1777 743 831 830 1284 1187 2167 1552 1410 1379 1297 1276 1374
1598Hmu0622 749 822 799 1212 1197 1552 2150 1426 1400 1295 1389 1373
1575NP5168A 692 759 728 1318 1272 1410 1426 2170 1409 1234 1395 1379
1580Hut0371 724 840 772 1241 1278 1379 1400 1409 2187 1275 1373 1460
1553hla0092 773 826 775 1315 1235 1297 1295 1234 1275 2233 1352 1457
1638HVO_0662 759 821 740 1262 1406 1276 1389 1395 1373 1352 2210 1629
1681Hbo0866 806 835 832 1271 1375 1374 1373 1379 1460 1457 1629 2227

338 symbols
consensus       --------------------MRFIEEIVVEEFLPTFRSMLAEDLRDRGLTQSEVADALGI
#oth            1111111111111111111223121.2..131..12.22..53.31112..411.23..1
Hmu2521         ::::::::::::::::::MSLVLPS::::::V::RV:A:::RE:A:E::::QA:::H::V
rrnAC1764       MPVEQSKLLSALRPTFSAMTLQLPS:::::R::::A:A:::TR:DEE:W::Q:I::Q::V
Hut0068         :::::::::::::::::::::::PS::::DR::::A:A:::RE:S::::::Q:I::H::V
VNG0247         :::::::::::::::::::::K::::V:::::::::::L::A:::E:::::H:::EL::V
HQ1277A         :::::::::::::::::::::K::::V::::::::::::::::::::::::H:::E::::
rrnAC1777       :::::::::::::::::::::::::::::DD:::::::L::DA::E::::::::::L:::
Hmu0622         ::::::::::::::::::::V::V:::::D::::::::L:::A::E:D:::::::EL:::
NP5168A         :::::::::::::::::::::K::::L::::::::::TE::GA::E:::::::::GL:::
Hut0371         :::::::::::::::::::::K::::V:::::::::::::::R::::::::L::::Q:::
hla0092         ::::::::::::::::::::V:::::V::D:::::V:::::::::E::F::H::::::::
HVO_0662        :::::::::::::::::::::K:::::::DA::::::AL:::::::::F::::::E::::
Hbo0866         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::F::R::::::::

consensus       SQSAVSKYAHGEVARNERLAADDRVQELVERIADGLATGDMSPVQALVEAEVLIRQLE-D
#oth            1.1...1.33.21435453433524652222314.124.3226131.4.41321131114
Hmu2521         T:A:::T:LD::LD:TGPV:G:P:T:AT::E::A:::S:S:DGYD::A:LLD::AAF:::
rrnAC1764       T:A:::::GS:S:TIE::FR::A:M:QTI::::::::S:E:DEYAV:D:LLA:V:EF:::
Hut0068         T:A:::::VG:D:TLET:FSEEP:LRSA:::::T:F:E:S:DAYE::G:LLGV::AF:::
VNG0247         :::::::::::D:TTDDEI::::::::::::TGS:::::NV:Q::::::::::V:E:STS
HQ1277A         :::::::::::D:S:RDVVVT:ND:KT::DQ:GS::T:::I:R::::::S:::::R:::S
rrnAC1777       ::::::::V::D:::H:D:L:HRGLE:::::L:::::D::::S::::::T::F::E:::Q
Hmu0622         :::::::::::::E:::::LEN::LAA:I:EL:::::S:E:T:::::I:T::VV:E:::Q
NP5168A         :::::::::::::ET:PDI:::::FS:::D:L:::::S:E::R::::::T:::::::::R
Hut0371         :::::::::::::D:::::LE:E:L:::TD:L:::::A::V::::::A::::FV:::::Q
hla0092         :::::::::::D:::HD:IV::E::R:::::VGE:::::E:T::A::A:I:::::R:::E
HVO_0662        ::::::::::::::T:::V:T:P::VD::S:VG::::::::T:::::::::::::::::E
Hbo0866         :::::::::::::S:::T:LE:E::::::::V::::S::::T::::::::::::::F::E

consensus       GDLLAQLHEDAMPALADYDGDLAVHDPDSALRTAERVLSSVRRGLRLLENTSGFAGLIPN
#oth            2141253..33412.53433635111414712751511121.11324.334222.531.1
Hmu2521         RGPICT:::::::::RGLGC::C:RGD:P::A:ERET:AT:::AA:::STAD:M:EA:::
rrnAC1764       RGPICAV::EE::::QGMGC::C:RGT:T:VQAERT:::::::AT:::ADSDFV:DA:::
Hut0068         RGPICEI::EQV::::GLGC::C:RGY:ESVADERA:::A::KAT:::ADE:AM:EYV::
VNG0247         S:I::ER::A:N:::::::::FT:::A::EV:VR:H::::::::V:M::R:::::TQ::A
HQ1277A         :GVI:::::ES::E:EE:::YSRI:::EGG:::S:Q:R::L::A::R:T:IT:::N::::
rrnAC1777       :GV::::::::V:E:G:::DEF:::::::Q::S:::T:A::::::SV::::::::T:::A
Hmu0622         :GT::A:::::V:E::E:G::F:::::::N::E::QT::::::::::::::::::T:::A
NP5168A         :::::R:::::Y:P::::E:P:DI::::GE::MT:::R::::::V:T::::::::::V::
Hut0371         :::::::::ESFSP::EHA:T::I:::E:RV:QS:Q:R:::::::GM:::A::::R:::A
hla0092         :::::D:::E:::::::AEVEF:::::::G::ER::::::::::::T:T:A:::::::::
HVO_0662        ::::SD::::E::E::SH::FRSI:::EGR:::V:Q:R::::::::M:T:::::::::::
Hbo0866         :::::T:::QQ::E:SE:::A:S::::::T:::::::R::::::::T:T:A:::::::::

consensus       VGSNLVECLPDADTIDDVAAVPGRILDVKGRATVPAEPEFGVSEHVAGVLLAARAAGSDA
#oth            ..3.124222215343..111...23133.2351.23....2.42.1521.3.3341534
Hmu2521         ::T:VGTA::E:TDLT::::I::::HAMA::VE::S:::::A:SN:ST:I:::::VDPSI
rrnAC1764       ::M:VGMA::::EDAL:::::::::H:LR::VN::SN::::A::::::TI:::I:VD:SR
Hut0068         ::T:VGMA::HPGDEL::::::::VHAMR::ID:::N::::G:Q:::RTI:::NSVD:SV
VNG0247         ::A:::::T:E:::VE:::G::::V:::M::TEI:::::::::AY::T:::D:::::V::
HQ1277A         ::::::A:::::T:V::::G:::::F:I::D::::GG::::::::::S:::T::EN:FEF
rrnAC1777       ::::::Q:::E::S:E:::::::::::::::::I::D::::::::::SL:::::::::::
Hmu0622         :::::::A:S::TG:E:::G:::::::::::::I:::::::::::::::::::Q:G:A::
NP5168A         :::::::A::E:E::::::G:::::::I::Q:::::D::::::G:::KL::T::E::V::
Hut0371         ::::::::V:::EG::::V:::::::::::::A::GD::::::::::N:::T::RQ::::
hla0092         ::A:VA:::D::R:V:::::::::LV::::::M::G:::::::::::T::::::E::AT:
HVO_0662        :::::::S:::::SV:::::I::::F::::Q::::G:::::::G:::::::S:::::A:V
Hbo0866         :::::A::::EPSG:E::::I::::F::::Q::::SD::::::::::S:::S::E::R:V

consensus       RAALNIRYDDGVVAALEAAGYEPVEFDADAD--TR-EAIRAAFADR---------ADPDV
#oth            4242.24134342341534136532.1125311534642643355544322222166351
Hmu2521         GG:::LAT::ALL::ARERDI::LQ::::Y:::D:S:RL:EQ:ER:G::::::::DV:R:
rrnAC1764       :::::LTT:EAFLD:AQEQ:I::L::::GYE::D:D:RLE:T:RE:G::::::::EV:R:
Hut0068         ::G::LTT:::LL::ARDR:ID:LA:::GY:::D:R:RLES::RE:G:::::::::V:P:
VNG0247         H:::::A:SADT::::AD:::AV:::EPEGEST:DDHH::D:VR:A:::::::::DAV::
HQ1277A         NS:I::C:ETDL:EQ:ST:::KL::::P:::::ADADP:QT::SSIRNNDDVQSDMT:A:
rrnAC1777       ::V::V:::::::T::RD::RTV:::::EES::VE:P:VA::L::D:::::::::PGA::
Hmu0622         S:MV:::::::::DD::::::TT:A:::E:::::E:T::G::LDEC:::::::::P:A::
NP5168A         :::::::::ESI::E:::::::TAA:::E::::LD:A:VQ::I:GS::::::::::SV::
Hut0371         ::T::VA::PS::T::::Q:HVA::::::T:::--:--LD:::EAIDA::::::::AA::
hla0092         :G:V:V::AP:T:E::-:TDHPT::::PERP:::::::VVD:V::AERSGGDSADS:TL:
HVO_0662        N:::::V::A::IED:::::::CI:::P::P:::-:DPV:ELLTA::DL::::::PETF:
Hbo0866         HS:V:::::PDII:S::DS::DAI:::P::P:::-:DP:V::LS::DDL::::::T:TFA

consensus       LYQTGAFGIEPITYVLGPDAPAAARIVRELL-------
#oth            3.12.13.1.114.22153.453257133135544311
Hmu2521         V:HE:::::::::::::ET:ES::QLAV::VAELA:::
rrnAC1764       I:HS:::::::::::F:ES:VE::DLAI:::DAADT::
Hut0068         I:HE:::::::::::F:T::VE:T:FAI::ASDAGDGS
VNG0247         :::::GY:V:::V:::AEN::D:V:MA:G:::::::::
HQ1277A         C:H::GY:V:::I:I:AG::EIIVE::Q:::APEMRG:
rrnAC1777       ::H:::M::::VV:L::D::V:V:ETA::I::::::::
Hmu0622         :::::GM:::::S::I::::S:V:E::::IA:::::::
NP5168A         :::::G::V::VC:L::S::S:VVAA::::C:::::::
Hut0371         :::::G::V:::V::::::::TTVSR:::I:EQV::::
hla0092         ::::::V:V:::V:::A:T:AD::::::G:V:::::::
HVO_0662        V::S:GY:::::::I:::::::V:DV::V:::::::::
Hbo0866         :::S::Y:::A::::::::::TV::A::S::TE:::::