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9 genomes BUD0048 12 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0359

rrnAC0219

rrnAC2849

HVO_0739

Hbo0794

Hmu0674

Hmu2854

Hut0920

Hut2351

hla0225

NP0850A

HQ1222A

Pairwise sequence scores
Consensus score2010 Hut2351 rrnAC2849 Hmu2854 NP0850A HQ1222A VNG0359 hla0225 HVO_0739 Hbo0794 Hut0920 rrnAC0219 Hmu0674
699Hut2351 1564 741 853 461 345 443 541 558 507 440 529 431
725rrnAC2849 741 1520 922 580 362 498 523 587 459 439 453 452
700Hmu2854 853 922 1499 571 339 503 559 564 466 450 479 454
1299NP0850A 461 580 571 2613 674 956 920 1017 1004 976 895 839
1015HQ1222A 345 362 339 674 2458 765 646 1011 1136 652 636 694
1174VNG0359 443 498 503 956 765 2299 877 908 924 853 849 817
1174hla0225 541 523 559 920 646 877 2488 1200 1148 824 788 732
1426HVO_0739 558 587 564 1017 1011 908 1200 2493 1451 942 953 914
1404Hbo0794 507 459 466 1004 1136 924 1148 1451 2453 927 995 893
1187Hut0920 440 439 450 976 652 853 824 942 927 2175 1007 978
1181rrnAC0219 529 453 479 895 636 849 788 953 995 1007 2757 1309
1171Hmu0674 431 452 454 839 694 817 732 914 893 978 1309 2542

398 symbols
consensus       -------MTSLGEAYEGRRGAGASLRRVLAGLGLFLVGVLLVVVGILLATTPLGASLGLG
#oth            1111111.31.312.657626333311353.744134.5531241253321823887254
Hut2351         VGIDEFG:P::::::DDA:WGDRRP:QIH::IAV::A:A:A:::A:T:V::::SDA:::D
rrnAC2849       ::::::::EN::D::SN::WE:RDP:::V::AT:GG::A:A:::A:::V::::S:VV:AT
Hmu2854         ::::::::E:::D::G:S:WN:RDP:::Y::VV::A::::A::::::IV:::::TL::AD
NP0850A         ::::::::A::T:V:::--:S::G:::LY::VV::G:::V::TT:::I:S:G:::YV:::
HQ1222A         :::::::::::A:T:NSTK:-:P::::LTF::T:::M:SM:::S::GVT::Q:LYATDPA
VNG0359         :::::::::::::::DS-::GE::T:::YL:M:::AA:A:::AG:::AGA:E:LL:R:F:
hla0225         :::::::::::S:::G::GRSEVDP:::YL:V:S:VA:T::L:::LFV:AEVVLP:-:YS
HVO_0739        :::::::::::S:::H:G::-:P::::LSL:F:G::L::::::A::VV:::DVYT:G:AT
Hbo0794         :::::::::::S:::HKGER::PG:Q:L:L:::M::L::::::A::VV:::SVLRGD:MS
Hut0920         :::::::::::TDV:QR:M::V::R:::::::S::AI:LG::A::VV::::GI::T::F:
rrnAC0219       :::::::::::TDV:::EV:RV::R:QQ:V:TA::::::AGL:GA:A::::A::NRY::D
Hmu0674         :::::::::::TDV:::NV:RV::R:QQ:L:SA:::::GSM::GA:A::::NV:VQ-S::

consensus       -LYEARELAGVLAGVGVPAVFLGVFAVLP-ASRRTRAAAAVGAGLALLGVALFQHAYPYQ
#oth            364443422.211.2.2.3322133221.125.45242334.2424361131.653..56
Hut2351         :TVATYRVS::I::::::GT::::V:::::S:::Q:LGV:I:TAV:AG:::::WY:::AH
rrnAC2849       EPHA:EK:G:T:G:L:I::M::S:V:::::S:::EQSGV::::V:C:V:IG:::A::::N
Hmu2854         SAT:SQS:::::::L::::SLAS:VV:::::T::E:VGVLA:TL:CVV::G::AY:::AR
NP0850A         :::::::V::I:G:::L:::L::MLVA::R:A:ELQVGVGA::V:C:I::GM:RRW::VD
HQ1222A         A:TAK:Q:G:::::::::::LV::::I:::SA:L:K::::::T:IS:M::L::D::::C:
VNG0359         :T::S::I::::G:L:I::::V:I:T:::::N:LQ:::::L:S::TV:::M::RI::::K
hla0225         :SG:::R:G:::G:::::L:::::MT:::::D:N::V::I:::AVMC::::::AY:::N:
HVO_0739        ::G:::::G:I:G:I:::::::::L:::::::::::::SLI::SI:V::::::S::::C:
Hbo0794         ::GDV:::G:I:::::::L::::I:T:T::SG:L:K:::I::::I::A:::::W::::C:
Hut0920         :V:G::::::I:::::L::T:V:L:V::::T::L:::TI:I::S:TVFA::::T::::M:
rrnAC0219       :A:A::RV::II::L:L:S:I:::::::::::::I:LT:LG:T:V:AG::G:::SL:::S
Hmu0674         :R:P::::::::::L:L:::L::::::::::::SV:G::I::T:ITAI:::M:::V:::D

consensus       WTGA---AGAPDLTLLTAAVYFFGTITTFWCLFVAVANFKTRNDPGGTVRMEVTRKGETR
#oth            .4234136475421162553124.46233.21.333133241231212233434551242
Hut2351         ::--::::TQHS:AFH::::::::GALAL:FV:ATL::SHV::::H::::LRL::Q::S:
rrnAC2849       ::--:::V:EQT:AFE:TMA::I::CVA::FV:T:M:S:RR::::H:::KL:ISH::::K
Hmu2854         ::--:::GT:QS:AFP:TT:::L:GSLA::FV:T:::GYRI::N:H::::L:LR:E::::
NP0850A         :V:::::S:NTTM::VV::T::A:A:VMT:S::T::::::A::::::::KL:::KG:::K
HQ1222A         :S::VCG::K:::::::V::FS:::MV::::::IG:T:LRATDAESDPFESSQNASAGNQ
VNG0359         :YD::::GA:STE::AFIV::AA:I::::::::T:::T:::::::::::T:T:EQN::::
hla0225         :V:GP:HPELR::::P::GL::V:AA::L:SV::G::::::::::::::T::::H::::K
HVO_0739        ::::TCG::L:::::E:V:::::::V::::::::G:::::::::::::ATVQ::K:::::
Hbo0794         :S:SLCRR:R:::::::VS:::L::L::::::::G::::::::A::::ATV:::K:::::
Hut0920         :P::P:::AN:A:A:T:L:L::V:A:::G::::::I:T::::KS:::AAE:RI:EE:TV:
rrnAC0219       ::--:::SSD:L:A:::GV:::A:IV:::::::ASL:T::::::::::A:::::EE:TI:
Hmu0674         :V--:::TA::L:::A:T::::::VV:I:::::::L:T::::::::::A:::I::Q:TIQ

consensus       VVEVSRD-----------GG-GGIGLFGGDPDGDVETQT---------------GG----
#oth            411446664311111111443123142235423444132232355336534333223111
Hut2351         ::::::::::::::::::--:------------------:::::::::::::::--::::
rrnAC2849       T::::PK:::::::::::--:------------------:::::::::::::::--::::
Hmu2854         T::L::Q:::::::::::--:------------------:::::::::::::::--::::
NP0850A         :::::N:DLR:::::::::TL:::::L::Q:E:::::::NDGSRDRNRNKQATG::AGVG
HQ1222A         SDAT:--:::::::::::--::AF:::TTSR:ETNT:P::::::::::::::SD::T:::
VNG0359         T:::PTTDVETAREALDAE:F::V:V:::VE:PAQ::RA:::::::::::::::--::::
hla0225         ::::D:AQLN::::::::R::::V::L::T:::::::::NR:QEGSGSG:::SGS:S:::
HVO_0739        ::::EKSG::::::::::::L::::FL::T:::::Q:::NQ::STSTASAGATD::A:::
Hbo0794         Y:::E::RSR::::::::::L::::FL::T::::T::::AR:QSQTGQSGTVSD::T:::
Hut0920         L::QAGTNM:::::::::PAV::V:M::T::::::P::::::::::::::::::--::::
rrnAC0219       L::EA:TL::::::::::P:L::::F::Q::::T:::::NR::PGTGTEGAVSD::T::G
Hmu0674         L::EA:SL:::::::::::RF::V::::T:L::E:::::NRETASTGHDGATVT:AT:::

consensus       -----------------------------------GA---SSSRQR-PRS-GGP-T-AS-
#oth            212343643445654444454334444422222226666767465576648425678641
Hut2351         :::::::::::::::::::::::::::::::::::--:::------:---:---:-:--:
rrnAC2849       :::::::::::::::::::::::::::::::::::--:::------:---:---:-:--:
Hmu2854         :::::::::::::::::::::::::::::::::::--:::------:---:---:-:--:
NP0850A         SRSSDTRRRTESGSLSPRSSGGSGSPSR:::::::SSSRG::::S:QS::AP::AAD:::
HQ1222A         ::::EAESITSPFDPTAASESSESPRST:::::::QTNASPH:NP:EQ::EPS:VQSKR:
VNG0359         :::::::::::::::::::::::::::::::::::N:SEPKP:A:ST:::QPS:PGG:::
hla0225         ::::ASKSRSPGSAQPAGMSDG:GATAT::::::::IRSPLDEDGGVDVET::SDDQTG:
HVO_0739        ::::STQDITPLDVEPSASPSSDG:::::::::::ADATQ:AGSAGAATNRS:VD:VQ::
Hbo0794         ::::DAASITSPQ:::::::::::::::::::::::TGTQ:Q::S:S:Q:PS::QSQS::
Hut0920         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::NASTE:TSA:QAA:D::ST:IG::
rrnAC0219       QRSNDTRRANSCRRQPTGDTQSDRSTRSNRQSGSGT:TERQ:G::ANT::ST:QQ:T::S
Hmu0674         ::RDDSDAADDGGSPAADRRSADATQTESFDPIADT:TGY:RGL:TE:SAD::EVIEGD:

consensus       ------------------ASD-G-P---G--P----------------GDRYCGNCAHFE
#oth            111111111111111111655767576576657654563333355657425111114313
Hut2351         ::::::::::::::::::---:-:-:::-::-::::::::::::::::-----------D
rrnAC2849       ::::::::::::::::::---:-:-:::-::-::::::::::::::::-----------:
Hmu2854         ::::::::::::::::::---:-:-:::-::-::::::::::::::::-----------:
NP0850A         :::::::::::::::::::T:G:ATDEPSIQTPGDDAEFLDDGPETPSN:::::::T::R
HQ1222A         ::::::::::::::::::P:PTPRSSSARTH:ENEKNTWRSADVDASL::Q:::::::::
VNG0359         ::::::::::::::::::V::G:ATETDISS:LDGSDS:::::RDGPGP:E:::::T::D
hla0225         ::::::::::::::::::PAEPNG:VTP:VS:AARDGP::::::::::::T::::::Q:D
HVO_0739        ::::::::::::::::::TESARS:AGAADH:DADRPA::::::NATV::::::::TY::
Hbo0794         ::::::::::::::::::S:PQSQSQSR:SRSQSERGS:::::SDQTA::T::::::::D
Hut0920         :::::::::::::::::::A:D:EIIESM::-:::::::::::PVRGQP:::::::EQ:N
rrnAC0219       GADQTGPSENTLDPRIAE:GPEAT:SAD:GTATTGRDAITETAVHQGEP:T:::::R:::
Hmu0674         ::::::::::::::::::GTVT:GAAFSNDVLDSTSDG::::DENEDSLEA:::::R:::

consensus       YVRTDDGIRPYCGLHDEVMDDMEA-CDEW-PR------
#oth            .4445444522146342622122323251753442111
Hut2351         :Q:YAAA:-SDG:EDAQ:IREI:SKY::-:--::::::
rrnAC2849       :R:YTQAV:GDG:TT:::IQEL:SRIED-:--::::::
Hmu2854         :SEYKQVV:GDG:ETEQ:IREL:ERV::-:--::::::
NP0850A         :A:::::LV::::::S:A::::D::::K:S:NTK::::
HQ1222A         ::K::S::E:::AA:::L::::VP::E::AS:TD::::
VNG0359         ::D:E::MQ:::::Y::R::::::::EW:EQNSD::::
hla0225         :A::EQ:MQ:::DH:::L::::D:::E::T::::::::
HVO_0739        ::::S::LK:::AA:::M:Q:::::::::F::RRE:::
Hbo0794         ::::::::Q::::Y:E:L::::DP:::::ASKR:::::
Hut0920         :::V::ELE:H:SH:SRYL:::D::::A:ESNSGDQMG
rrnAC0219       ::MQ:GD:E:::SF:G::::::::::SA:VRND:::::
Hmu0674         ::ME:GES::::Q::ERT:::LD:::SS:LE:::::::