|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2233 | Hmu2716 | HVO_A0169 | VNG0834 | VNG1726 | Hmu2129 | rrnAC3344 | Hut3038 | NP4912A | hla1337 | HQ2766A | HVO_2495 | Hbo2189 |
874 | Hmu2716 | 2196 | 748 | 669 | 711 | 736 | 837 | 753 | 776 | 691 | 728 | 715 | 757 |
1265 | HVO_A0169 | 748 | 2352 | 1204 | 968 | 1147 | 1085 | 1057 | 1010 | 1015 | 1010 | 1070 | 1038 |
1259 | VNG0834 | 669 | 1204 | 2241 | 949 | 1131 | 980 | 1021 | 1105 | 1059 | 1059 | 1072 | 1020 |
1469 | VNG1726 | 711 | 968 | 949 | 2221 | 1279 | 1163 | 1228 | 1197 | 1215 | 1169 | 1206 | 1159 |
1609 | Hmu2129 | 736 | 1147 | 1131 | 1279 | 2307 | 1546 | 1452 | 1421 | 1278 | 1285 | 1403 | 1350 |
1535 | rrnAC3344 | 837 | 1085 | 980 | 1163 | 1546 | 2253 | 1537 | 1388 | 1248 | 1209 | 1252 | 1193 |
1502 | Hut3038 | 753 | 1057 | 1021 | 1228 | 1452 | 1537 | 2258 | 1382 | 1186 | 1228 | 1241 | 1181 |
1614 | NP4912A | 776 | 1010 | 1105 | 1197 | 1421 | 1388 | 1382 | 2297 | 1375 | 1322 | 1429 | 1353 |
1608 | hla1337 | 691 | 1015 | 1059 | 1215 | 1278 | 1248 | 1186 | 1375 | 2322 | 1472 | 1571 | 1497 |
1622 | HQ2766A | 728 | 1010 | 1059 | 1169 | 1285 | 1209 | 1228 | 1322 | 1472 | 2332 | 1695 | 1682 |
1754 | HVO_2495 | 715 | 1070 | 1072 | 1206 | 1403 | 1252 | 1241 | 1429 | 1571 | 1695 | 2318 | 1740 |
1690 | Hbo2189 | 757 | 1038 | 1020 | 1159 | 1350 | 1193 | 1181 | 1353 | 1497 | 1682 | 1740 | 2330 |
325 symbols consensus MARTASKVRSLVREDAEMRDALETVLDRADD--GEVQWGDVSDELTSGQWGRLIEKGVLV #oth 1434463353126534413513352136254421326.8.141322123....1252212 Hmu2716 ----MDSSLDA::A:DDLAV::SV:::::EAGD:T:A:T:LQGQIDPAE::::LDH::V: HVO_A0169 --MP:DSLET:L-DNPA::E:VSV:VE:SKRGTE:LR:C::N:A:S:::::::::R:::T VNG0834 --MPDTQLA::L-QT:A::E:ASA::EES:ART:DI::D::::AVS:S::::::SA:::T VNG1726 :::::E::Q::::::P::ATI::DL::HD--:::DL::Q::::DVS:::::::L::DI:: Hmu2129 :::::Q::E::AS:GED:T:::A:::AV:EEQ::T:S:A::::D:::::::::::::L:: rrnAC3344 :::::P::ER:AEDGEA:T:::S:::AA:EEN::T:T::::::D::::E::::::S:L:I Hut3038 :P::GE:IDR::A:::S:ET:IQ:::QT:EEQ::T:A::::::::S:::::::::T:L:: NP4912A ::::::::Q:::K:::::EE:::Y::ET::E:::S:S::::::::::::::::::::I:: hla1337 :SKVERR::::::::G:::::V:VI::S:T::::::::I::R::I:::::::::::EI:: HQ2766A :P:IE::::D::AG:DG::A:V:I::::::::::D:K:L::K:::S::R::::::T:::I HVO_2495 :::IE:R::D::GS::D::A:V::::::::::::::E:A::R:::::::::::::::I:: Hbo2189 :V:IEQ:::D::SS:P:::N:V::::E::N::::::K:V::KGDI:::H::::::::::: consensus DAD-EGFVLADPDGVRAGLEDDDSG----------DTDSDD-EDSSWSKYDKLAGVGTVG #oth 333241.523.2434334.375355555431311165362343453.142.141123322 Hmu2716 P:G:DR::VD::TAA:EL:AQR:LD::::::::::GA:::AP:TGG::RA:::::::ALA HVO_A0169 ::AAG::::S:::RIASK:QSR:P:V:::::::::EGG::::A:::::RW:R:GAL:V:V VNG0834 ST::T:::V::::ELA:E:AAHTDAESTE::::::H::APAI:SA::TI:::A:A::AI: VNG1726 EG::T::EVG:::::EE::AP::--:::::::::::G:D:SP:GT:::T::::::::A:: Hmu2129 :::GA::::S::::I:DA:GE:SVEAAAATSG::::S:G::::GVN:TS:::G:ALV::: rrnAC3344 :::G::::ID::::::EA::ES:--::::::::::AAP:::D:G:G:::W:::::L::L: Hut3038 :::GD:::ID:::::HDA::EA---:::::::::::P:AE::D:DG::TW:::::::VIA NP4912A :S:G:::DVD::::::EA:::::LE::::::::::FP:PP::A::::T:W::G:A::S:A hla1337 :G::T::A:::R:AIA:::::::D:DLT:::::::SS:V:TP:TTT:::W::I::IA:L: HQ2766A EGE::::Q:::RAATES:::T:::SDTSTDSNVALE:EV:::DE::::I:::G:::L:I: HVO_2495 :G:::::R:::AGET:::::::T::SGGSSSS:::S::V:T:G:::::::::G:A:V::: Hbo2189 :G:::::E::::EAA:::::NGS::SSVSTSS:::SV:T::LGE::::::::M:::V::: consensus LFAGYSNSPVRNLI-GGTINVVLGPLADLLPFYAVVLVLALATGLYSTLLQANLMDMEKM #oth 2142.47743254211545154.1116553..3211321.46.1231.42132.324251 Hmu2716 :M:S:QLPGG:E:V::QSV:T::::::AQ:::V:TITL::VV:A:A::TIRRR:RSK:R: HVO_A0169 :::::W:AG:::AV:A:ID:::::A::HSI::::::I:::A:::::::VM:DR:K:T:LL VNG0834 :::::W::SIQTT::ASVD:QL:A:VMN::::HI::::::VT::V:::Y::SR:::H:TL VNG1726 AMI:::Y::IK:A:::::::::::::DSIM:::V:I::::VL::::T:I:::::T::::: Hmu2129 :::::MQQD::A:V:::::DI:::::N:VV:::V:I::::IM:::W:::::D::::S:V: rrnAC3344 ::::::LTS::DV:A::V:DI:::::N:M::::V:I::::II::TT::I::D:::::SG: Hut3038 ::L:::MTS:::VV::E:LDLI::::EA:::::V:I::::TL:::W:::::D:::::SG: NP4912A M::::MFDS::EPL:ADAL:LL::::L:::::F:::M::::F:::::::::S::::::V: hla1337 A:V::AVN::::A::A:AFDL:::::LNVV:::V::M:I:::::::::::R:G::::D:: HQ2766A ::V:::WK:L:D::::TVMD:P::::EE::::::::MI:::::::::::::::::N:::: HVO_2495 ::L:::V:E:::V::::VMDAA:::::EM:::::::M::::::::::::::::::::::: Hbo2189 ::FA:WWQ:LQR::::S:M::I::::VEI:::::::MII::::::::::::::::N:::: consensus SAYQERMKDLQERRKAAKERGDDEALDRIQEEQMEAMGDQLGMFKEQFRPMVWIMLLTIP #oth 3421521522241332.2221.121113124..112221131311511...1.111221. Hmu2716 ERLKT::N:VR::LD::RD::::::VE:LRA::Q:L:TR::S:::HML:::A:TV:ISA: HVO_A0169 ERH:A::D::KS::E::::::::D::E::EA:::::::::WSVM:A::::::::::V::: VNG0834 Q::KD::AA:K:::E:::::::::::E:::S:::D:A:::::L::L:::::::::::::: VNG1726 :K:::QAQE::DKMS::::::::A:VE:LR::::::F:::AS:M:::::::::::::::: Hmu2129 GK:::K:Q:::D::E::::::::::::E::Q::::::::::::::A:::::::::::::: rrnAC3344 GDH::K:E::K:::::::::D:Q:::::LE:::::L:T::M::::Q::::::::::VN:: Hut3038 :QH::K:EE:K:::::::::D:Q:E:::::Q::::M::::::A:TK:::::::::::::: NP4912A GK::G:::EI:::::E::::::::::E::::::::::A:N:::::::::::::::::::: hla1337 ::::D::::I:D:::D::::D:Q::::A:::::::::::::::::::::::::::F:::: HQ2766A ::::S:::EI:::::E:::E:::D:::A::D:::D::::::::::::::::::::F:::: HVO_2495 GK:::::::I:Q:Q:D:::::::AE:EK::::::::::::M::::::::::::::F:::: Hbo2189 :::::::::I:K:::E:QKA::::::::::Q:::::::::M::::::::::::::F:::: consensus VFLWMYWAIGGGG-----PAASEQNIVLPLVGEVS-WTAGVLGPMQAWIVWYFLCSMGFT #oth 3.1.131834744454115644588423.33.515316734411533.22..241.2423 Hmu2716 I:::LS:LAVAPA:::::A:IAPTAT:F:ML:RIT::::KLI::LHV:T:::IAT::LSG HVO_A0169 A::::R:KVR::H:::::V::GSAHVI:::::R:G::QDA:F:::P::::::::::FAAR VNG0834 ::::LR:EVR::H:::::LG:::HGM:V::A:H:A::QHAL::::AT::::::V:::ASR VNG1726 :::::::KL:T:T:::::IPQ::L:M::::L::ID:LNG:RVLVFP:::L::MM::FS:S Hmu2129 A::::::M:RD:H:::::IE:A:TVM:::::::::N:QQ:::::L::::L::::::L::S rrnAC3344 L:::L::IVF:A::::::VD::PV-:T::IF:::EA:SNS:A::V:::::::::::LS:: Hut3038 :::::::RVPN--:::::L:SG:FV:IM:FF::I:R:G::T:::WP::LF:::I::LS:: NP4912A ::::::AVV:FR:APL:Y:EIELVPV:M:IA:::D:::H:L:::I:V::::::V:::C:: hla1337 A::::F:V::YR:STAAY:DVAA:ELIV::A:T:T::DT:IV::I:M::::::::::A:: HQ2766A :::::::S::V:ANAE::AQV:LSTL::::::::A:::DS::::I::::::::::::::: HVO_2495 ::::::::::V::GSD:::HIVTE::::::::S:G::KQ::::::::::::::::::::: Hbo2189 A:I:::::::VR:SG:::GHIVL:::::::::K:::::E::::::::::::::::::::: consensus QIIRKALNIQTSPT----------- #oth 2431132223522252111111111 Hmu2716 LT:QRTMDRIGVG:::::::::::: HVO_A0169 :LCQ:L:G:DP:G:DRPDSESTTSS VNG0834 :FLQ:TF:::A:T-::::::::::: VNG1726 N::::::::::T::::::::::::: Hmu2129 :LL:::::V:::::G:::::::::: rrnAC3344 ::::::::VE:T::G:::::::::: Hut3038 ::::::::V::T::::::::::::: NP4912A :VL::::::::T::::::::::::: hla1337 :LVQ:S:::EM::SSS::::::::: HQ2766A :::::S:::DI::SAS::::::::: HVO_2495 :::::S:::DM::SAS::::::::: Hbo2189 :::::S:D:DI::STS:::::::::