|
Pairwise sequence scores | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2452 | NP4680A | Hut1744 | hla1460 | HQ1670A | HVO_1076 | Hbo0581 | rrnAC1960 | VNG0390 | NP0384A | Hut0366 | rrnAC0633 | Hmu0976 |
1552 | NP4680A | 2677 | 1489 | 1380 | 1344 | 1357 | 1215 | 1354 | 1384 | 1406 | 1296 | 1506 | 1476 |
1829 | Hut1744 | 1489 | 2594 | 1619 | 1557 | 1540 | 1445 | 1505 | 1573 | 1596 | 1524 | 1601 | 1633 |
1946 | hla1460 | 1380 | 1619 | 2455 | 1773 | 1710 | 1624 | 1527 | 1673 | 1649 | 1538 | 1636 | 1707 |
1867 | HQ1670A | 1344 | 1557 | 1773 | 2428 | 1718 | 1701 | 1475 | 1621 | 1606 | 1442 | 1587 | 1671 |
1890 | HVO_1076 | 1357 | 1540 | 1710 | 1718 | 2465 | 1769 | 1532 | 1628 | 1642 | 1529 | 1622 | 1721 |
1789 | Hbo0581 | 1215 | 1445 | 1624 | 1701 | 1769 | 2249 | 1346 | 1466 | 1489 | 1533 | 1506 | 1585 |
1739 | rrnAC1960 | 1354 | 1505 | 1527 | 1475 | 1532 | 1346 | 2418 | 1541 | 1652 | 1474 | 1605 | 1629 |
1925 | VNG0390 | 1384 | 1573 | 1673 | 1621 | 1628 | 1466 | 1541 | 2607 | 1659 | 1586 | 1723 | 1802 |
1984 | NP0384A | 1406 | 1596 | 1649 | 1606 | 1642 | 1489 | 1652 | 1659 | 2420 | 1620 | 1714 | 1823 |
1853 | Hut0366 | 1296 | 1524 | 1538 | 1442 | 1529 | 1533 | 1474 | 1586 | 1620 | 2271 | 1664 | 1745 |
1951 | rrnAC0633 | 1506 | 1601 | 1636 | 1587 | 1622 | 1506 | 1605 | 1723 | 1714 | 1664 | 2539 | 1943 |
2052 | Hmu0976 | 1476 | 1633 | 1707 | 1671 | 1721 | 1585 | 1629 | 1802 | 1823 | 1745 | 1943 | 2430 |
382 symbols consensus -------------MKAVVLAGGYATRLWPITKHRPKMLLPVGDTTVIDRIFEDLEADDRI #oth 111212222212212121111121112112135111.1..2.16..1.521531.413.1 NP4680A ::::::::::::::D:I::::::::::::V:R::::::::L:ER::L::LLAE:::ES:: Hut1744 ::::::::::::::D:::::::F::::::::RN::::F::I::::::::::RE::::::: hla1460 :::::::::::::::::::::::::::::::ET::::F::::EN::::E::::F:::::: HQ1670A ::::::::::::::::::::::::::M:::::D::::F:::::G::::I::Q:::::N:V HVO_1076 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::F:::::Q::::T::::::::::V Hbo0581 :::::::::::::-----------------------:F:::::E::::V::::::E:::: rrnAC1960 ::::::::::::::D:I::::::::::::::RR:::::::::E:::::GVLQS::D:::: VNG0390 MKKDLPDRVDLVG:::::::::::::::::::D::::F:::::S:::::::A:::S:::: NP0384A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::::SA::::E:: Hut0366 :::::::::::::-----------------------::::I::::::::VLGE::S:::: rrnAC0633 MKKNLYSGCLLPD:::I::::::::::::V::N:::::::::E:::::::LGE::E:::: Hmu0976 :::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::I::S::::::LGE::R:::: consensus DEVFVSTNERFADDFEDHLADSPFEKPTLSVEETTEEDEKFGVVGALAQLVDREGI-DDD #oth 42111...23.13413511434412.2511..2143.2..1..21..21.12..42332. NP4680A :D::::::AQ:ETLIRN:::ETD::::QV:::S::G::::L::IA::::::E::AL:::: Hut1744 ED:Y:::::E:::E:RN::::::::::RV::::ARA:::::::::::GE::E::::::S: hla1460 :::::::::::::A:A:Y:T::::K:::::::::V::::::::::::::::E::NV:::: HQ1670A ::::::::::::::::SYIES:SY::::::::D:S::::::::::::E::I:::NV:S:: HVO_1076 S:::::::::::GA::EYIDE:::D:::::::D:S:::::::::::::::I:::EV::E: Hbo0581 S::::::::::EES::EY:S::::::::V:::::V::::::::::::E::I:::NV:EE: rrnAC1960 GTTYL::::A:::E::A:IDEMGY::VQ::::S:AD::::::::::::::I::::::::: VNG0390 :T:Y:::::::::E:RS:::ERS::::Q::::D::D:N:::::M::::::::::S::T:: NP0384A E::Y:::::::::A::Q::::QS::::VV::::::::A:::::::::G:::E:::::::: Hut0366 ED:Y:::::::::::L::I:ETD::::R::::::V::::::::I:::::::::::LA::: rrnAC0633 TD::::::Q:::G::R::I:A:R:::AS:T::::A::::::::::::::::N:::LG:E: Hmu0976 S:::::::::::T:::A:::::SY:::K:T::D:::::::::::::::::::::::T:E: consensus LLVIAGDNLISFDLSEFVDFF--EAKDTPTLAAYDVGSRERAKSYGLV------------ #oth 13.11...21111323.4.3.1136555131......2423.32..12111111111111 NP4680A T::VG:::VLGLS:AR:C:Q:::::HGG:::::::::TPAA:S:::VLETAAPAGQTDGG Hut1744 T::::::::::::I:A:I:A:::::NNG::I::::::DL:S:TQ::VI:::::::::::: hla1460 :I:V::::M::::::D:A::::::S:G::::::::::D:::::::::::::::::::::: HQ1670A :V:V:::::L::::::::::::::S:Q::C::::::::KD::S::::::::::::::::: HVO_1076 :V:::::::::::VGD:::::::YE:NE:C:::::::DK::::A:::::::::::::::: Hbo0581 :I:::::::L:::V::::::::::::R::CI:::::::K::::::::::::::::::::: rrnAC1960 :F::G:::::G::P:::L::::::ER:G:A::::::::::K::::::::::::::::::: VNG0390 :V:::::::::::V:A:::::AADDA:N:AI:::::::Y:::Q::::::::::::::::: NP0384A :::V::::::G::::::I:Y:::QQ:E:AV:::::::D::K::::::::::::::::::: Hut0366 :::V:::::::::::::::A::::RN:A:::::::::::::::A:::I:::::::::::: rrnAC0633 :::::::::::::IA::I:Y::::QY:D::::::::::L:K:S::::::::::::::::: Hmu0976 :::V:::::::::VA::L::::::GAG:::I::::::::::::::::::::::::::::: consensus -------------ELDGD---RVVDFQEKPDDPNSTLVSIACYAFPAETLR-FDEYLSGG #oth 1111111111111312111112.23.1...22.511...1...12.225244222..522 NP4680A SDTAAATPTDSDA:VG::TSLE:TT:A::::::S:S:::V:::G::::L:SK::A::AA: Hut1744 :::::::::::::DV:D:::::::E::::::::A:::::::::::::::IGL::T::T:E hla1460 :::::::::::::D:::::::E:I:::::::::KT:::::::::::::::PDLST::ED: HQ1670A :::::::::::::Q::D::::Q:I:::::::N:Q::::::::::::::::PN:ET::AD: HVO_1076 :::::::::::::::::::::::IN:::::E::K::::::::::I::DD:PK:::::::D Hbo0581 :::::::::::::::::::::::::::::::::K::::::::::::::::PK:::::QD: rrnAC1960 :::::::::::::::::E:::::::::::::N:K:::::::::::::DS::::E:::::D VNG0390 :::::::::::::::H:::::E:IN:::::::::::::::::::Y:ESVVEDI:T::AAD NP0384A ::::::::::::::::::::::::::::::AE::::::::::::::Q:SI:::E:::::: Hut0366 :::::::::::::TV:::::::::::::::E::D::::::::::::::DV:::E:::D:: rrnAC0633 :::::::::::::::::E:::E:T:::::::::::::::::::::::DAI:::::::ED: Hmu0976 :::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::SV:::E:::::: consensus NNPDEPGWFIQWLQDRGP--VHAFTFDGAWFDIGTPESYLDAVAWYLDGDSVVADDATV- #oth 1.......233..255431116.22.122.1.1..121.1211414.1.2341233.221 NP4680A :::::::::VK::VEET:ET:Q:VP::D::::V:::::::N::::A:::::Y:HPE:AIG Hut1744 :::::::::::::I::E::::Y::P:E:::::::::DG:::::S:::::GTL:HP::::: hla1460 :::::::::L::::K::A:::::Y:::::::::::AD::::::EYA:::GTL:::::I:: HQ1670A ::::::::LM::::N::S:::::::::::::::::::::::::S:::::ETFID:T:::: HVO_1076 :::::::::M::::QT:D::LF:Y:::E::::::::Q::::::G:::::ENF:HES::L: Hbo0581 ::::::::::::::Q::D:::::::::::::::::::::::::S:::G:ENF:HET:::: rrnAC1960 ::::::::Y:D:::QQE::::S:::::DV:::::::D::FET:E:K:::G:LIHP::::: VNG0390 G::::::::VE:::::QS:::R::::E::::::::::::::::::T:::::I:::::::: NP0384A ::::::::::::::NQE::::S::V::EP:::::::::::E::::T:G::::I:ES:::: Hut0366 ::::::::::E::V:::D:::N::::::::::::::D:::E:IQ:A::::::I:NS:::: rrnAC0633 :::::::::::::V:D:::::R:::::D::Y:::::::::E::::E::::N:::E:::I: Hmu0976 :::::::::::::VANDA:::S::::::::Y:::::::::E::::E::::A::::S:::: consensus ENSTLGENVHVMAGAEVVDSTLERSVVFPDATIRDCDIRNSIIDEETHLESLDLSGALIG #oth 33322.52.221421423215125211.33232642326512213335215322222211 NP4680A DDV:::S::::::D::IT::S:::T::::E:::A:SELERTLV:TGAE:::VA::ESV:: Hut1744 :G:D::::::::D::T::::K:::::::::::LDR:R:VS:L::Q::E::DVN::N:Q:: hla1460 :::D::DV::::S::T:T::::::A::::NV::T:SE::::V:::GAT::GV:::::::: HQ1670A :D::::N:::L::::S::::E:::T:::ENTN:DAATVSD:V::::SSI:AV::TET:V: HVO_1076 T:TEV:T::::::D:V:E::V::E:::::G:V::NAELK:::V:::::I::::::N:::: Hbo0581 SD:E:::::Y::ENSA:EG::::KT:::SNT:::NA::::T:V:::::V:N::::N:::: rrnAC1960 :::EI:DT:::::::::T::S:D::I:::::EVH::::DET:LG:NV:V:GYNM::S::I VNG0390 S:T:I::::::LP:::LTN::VSN::I:::::L::::V:::::::D:V:D:I:F:::::: NP0384A :R::I::::Q::::::IA:A::D:::::E::VVEG:E:HET::::G::::GI::A::::: Hut0366 ::AEI:G:::ILPD::I::::V:D:I::A:::::::E::::::::N::V:H:::A::::: rrnAC0633 ::T:::::::ILS:::::N:S:DGTI::::T::L:S:::Q::::RD:QV:::::A::::: Hmu0976 ::T:V::::::LD:::I:::R:DN:::::E:::::S:V:Q::::R:::I:D:::A::::: consensus AHTQLTNG-------------- #oth 2226245484422211111111 NP4680A :Y:R:GGAGGRPG::::::::: Hut1744 :::S::QTPPDPWVWEQHRDSE hla1460 S::SI:E:DDF::::::::::: HQ1670A SYS:IRQ-:::::::::::::: HVO_1076 ::SR::::Q::::::::::::: Hbo0581 ::SH:E--:::::::::::::: rrnAC1960 NR------:::::::::::::: VNG0390 :::TIE::HDADGR:::::::: NP0384A ::::::::VE:::::::::::: Hut0366 :::EI:::P::::::::::::: rrnAC0633 ::::::DES::::::::::::: Hmu0976 :::HI:::E:::::::::::::