Home |  Text search
[MJ] (GCD1) COG1208 Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase involved in lipopolysaccharide biosynthesis/translation initiation factor 2B, gamma/epsilon subunits (eIF-2Bgamma/eIF-2Bepsilon)
9 genomes BUD0056 12 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0390

rrnAC0633

rrnAC1960

HVO_1076

Hbo0581

Hmu0976

Hut0366

Hut1744

hla1460

NP0384A

NP4680A

HQ1670A

Pairwise sequence scores
Consensus score2452 NP4680A Hut1744 hla1460 HQ1670A HVO_1076 Hbo0581 rrnAC1960 VNG0390 NP0384A Hut0366 rrnAC0633 Hmu0976
1552NP4680A 2677 1489 1380 1344 1357 1215 1354 1384 1406 1296 1506 1476
1829Hut1744 1489 2594 1619 1557 1540 1445 1505 1573 1596 1524 1601 1633
1946hla1460 1380 1619 2455 1773 1710 1624 1527 1673 1649 1538 1636 1707
1867HQ1670A 1344 1557 1773 2428 1718 1701 1475 1621 1606 1442 1587 1671
1890HVO_1076 1357 1540 1710 1718 2465 1769 1532 1628 1642 1529 1622 1721
1789Hbo0581 1215 1445 1624 1701 1769 2249 1346 1466 1489 1533 1506 1585
1739rrnAC1960 1354 1505 1527 1475 1532 1346 2418 1541 1652 1474 1605 1629
1925VNG0390 1384 1573 1673 1621 1628 1466 1541 2607 1659 1586 1723 1802
1984NP0384A 1406 1596 1649 1606 1642 1489 1652 1659 2420 1620 1714 1823
1853Hut0366 1296 1524 1538 1442 1529 1533 1474 1586 1620 2271 1664 1745
1951rrnAC0633 1506 1601 1636 1587 1622 1506 1605 1723 1714 1664 2539 1943
2052Hmu0976 1476 1633 1707 1671 1721 1585 1629 1802 1823 1745 1943 2430

382 symbols
consensus       -------------MKAVVLAGGYATRLWPITKHRPKMLLPVGDTTVIDRIFEDLEADDRI
#oth            111212222212212121111121112112135111.1..2.16..1.521531.413.1
NP4680A         ::::::::::::::D:I::::::::::::V:R::::::::L:ER::L::LLAE:::ES::
Hut1744         ::::::::::::::D:::::::F::::::::RN::::F::I::::::::::RE:::::::
hla1460         :::::::::::::::::::::::::::::::ET::::F::::EN::::E::::F::::::
HQ1670A         ::::::::::::::::::::::::::M:::::D::::F:::::G::::I::Q:::::N:V
HVO_1076        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::F:::::Q::::T::::::::::V
Hbo0581         :::::::::::::-----------------------:F:::::E::::V::::::E::::
rrnAC1960       ::::::::::::::D:I::::::::::::::RR:::::::::E:::::GVLQS::D::::
VNG0390         MKKDLPDRVDLVG:::::::::::::::::::D::::F:::::S:::::::A:::S::::
NP0384A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::::SA::::E::
Hut0366         :::::::::::::-----------------------::::I::::::::VLGE::S::::
rrnAC0633       MKKNLYSGCLLPD:::I::::::::::::V::N:::::::::E:::::::LGE::E::::
Hmu0976         :::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::I::S::::::LGE::R::::

consensus       DEVFVSTNERFADDFEDHLADSPFEKPTLSVEETTEEDEKFGVVGALAQLVDREGI-DDD
#oth            42111...23.13413511434412.2511..2143.2..1..21..21.12..42332.
NP4680A         :D::::::AQ:ETLIRN:::ETD::::QV:::S::G::::L::IA::::::E::AL::::
Hut1744         ED:Y:::::E:::E:RN::::::::::RV::::ARA:::::::::::GE::E::::::S:
hla1460         :::::::::::::A:A:Y:T::::K:::::::::V::::::::::::::::E::NV::::
HQ1670A         ::::::::::::::::SYIES:SY::::::::D:S::::::::::::E::I:::NV:S::
HVO_1076        S:::::::::::GA::EYIDE:::D:::::::D:S:::::::::::::::I:::EV::E:
Hbo0581         S::::::::::EES::EY:S::::::::V:::::V::::::::::::E::I:::NV:EE:
rrnAC1960       GTTYL::::A:::E::A:IDEMGY::VQ::::S:AD::::::::::::::I:::::::::
VNG0390         :T:Y:::::::::E:RS:::ERS::::Q::::D::D:N:::::M::::::::::S::T::
NP0384A         E::Y:::::::::A::Q::::QS::::VV::::::::A:::::::::G:::E::::::::
Hut0366         ED:Y:::::::::::L::I:ETD::::R::::::V::::::::I:::::::::::LA:::
rrnAC0633       TD::::::Q:::G::R::I:A:R:::AS:T::::A::::::::::::::::N:::LG:E:
Hmu0976         S:::::::::::T:::A:::::SY:::K:T::D:::::::::::::::::::::::T:E:

consensus       LLVIAGDNLISFDLSEFVDFF--EAKDTPTLAAYDVGSRERAKSYGLV------------
#oth            13.11...21111323.4.3.1136555131......2423.32..12111111111111
NP4680A         T::VG:::VLGLS:AR:C:Q:::::HGG:::::::::TPAA:S:::VLETAAPAGQTDGG
Hut1744         T::::::::::::I:A:I:A:::::NNG::I::::::DL:S:TQ::VI::::::::::::
hla1460         :I:V::::M::::::D:A::::::S:G::::::::::D::::::::::::::::::::::
HQ1670A         :V:V:::::L::::::::::::::S:Q::C::::::::KD::S:::::::::::::::::
HVO_1076        :V:::::::::::VGD:::::::YE:NE:C:::::::DK::::A::::::::::::::::
Hbo0581         :I:::::::L:::V::::::::::::R::CI:::::::K:::::::::::::::::::::
rrnAC1960       :F::G:::::G::P:::L::::::ER:G:A::::::::::K:::::::::::::::::::
VNG0390         :V:::::::::::V:A:::::AADDA:N:AI:::::::Y:::Q:::::::::::::::::
NP0384A         :::V::::::G::::::I:Y:::QQ:E:AV:::::::D::K:::::::::::::::::::
Hut0366         :::V:::::::::::::::A::::RN:A:::::::::::::::A:::I::::::::::::
rrnAC0633       :::::::::::::IA::I:Y::::QY:D::::::::::L:K:S:::::::::::::::::
Hmu0976         :::V:::::::::VA::L::::::GAG:::I:::::::::::::::::::::::::::::

consensus       -------------ELDGD---RVVDFQEKPDDPNSTLVSIACYAFPAETLR-FDEYLSGG
#oth            1111111111111312111112.23.1...22.511...1...12.225244222..522
NP4680A         SDTAAATPTDSDA:VG::TSLE:TT:A::::::S:S:::V:::G::::L:SK::A::AA:
Hut1744         :::::::::::::DV:D:::::::E::::::::A:::::::::::::::IGL::T::T:E
hla1460         :::::::::::::D:::::::E:I:::::::::KT:::::::::::::::PDLST::ED:
HQ1670A         :::::::::::::Q::D::::Q:I:::::::N:Q::::::::::::::::PN:ET::AD:
HVO_1076        :::::::::::::::::::::::IN:::::E::K::::::::::I::DD:PK:::::::D
Hbo0581         :::::::::::::::::::::::::::::::::K::::::::::::::::PK:::::QD:
rrnAC1960       :::::::::::::::::E:::::::::::::N:K:::::::::::::DS::::E:::::D
VNG0390         :::::::::::::::H:::::E:IN:::::::::::::::::::Y:ESVVEDI:T::AAD
NP0384A         ::::::::::::::::::::::::::::::AE::::::::::::::Q:SI:::E::::::
Hut0366         :::::::::::::TV:::::::::::::::E::D::::::::::::::DV:::E:::D::
rrnAC0633       :::::::::::::::::E:::E:T:::::::::::::::::::::::DAI:::::::ED:
Hmu0976         :::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::SV:::E::::::

consensus       NNPDEPGWFIQWLQDRGP--VHAFTFDGAWFDIGTPESYLDAVAWYLDGDSVVADDATV-
#oth            1.......233..255431116.22.122.1.1..121.1211414.1.2341233.221
NP4680A         :::::::::VK::VEET:ET:Q:VP::D::::V:::::::N::::A:::::Y:HPE:AIG
Hut1744         :::::::::::::I::E::::Y::P:E:::::::::DG:::::S:::::GTL:HP:::::
hla1460         :::::::::L::::K::A:::::Y:::::::::::AD::::::EYA:::GTL:::::I::
HQ1670A         ::::::::LM::::N::S:::::::::::::::::::::::::S:::::ETFID:T::::
HVO_1076        :::::::::M::::QT:D::LF:Y:::E::::::::Q::::::G:::::ENF:HES::L:
Hbo0581         ::::::::::::::Q::D:::::::::::::::::::::::::S:::G:ENF:HET::::
rrnAC1960       ::::::::Y:D:::QQE::::S:::::DV:::::::D::FET:E:K:::G:LIHP:::::
VNG0390         G::::::::VE:::::QS:::R::::E::::::::::::::::::T:::::I::::::::
NP0384A         ::::::::::::::NQE::::S::V::EP:::::::::::E::::T:G::::I:ES::::
Hut0366         ::::::::::E::V:::D:::N::::::::::::::D:::E:IQ:A::::::I:NS::::
rrnAC0633       :::::::::::::V:D:::::R:::::D::Y:::::::::E::::E::::N:::E:::I:
Hmu0976         :::::::::::::VANDA:::S::::::::Y:::::::::E::::E::::A::::S::::

consensus       ENSTLGENVHVMAGAEVVDSTLERSVVFPDATIRDCDIRNSIIDEETHLESLDLSGALIG
#oth            33322.52.221421423215125211.33232642326512213335215322222211
NP4680A         DDV:::S::::::D::IT::S:::T::::E:::A:SELERTLV:TGAE:::VA::ESV::
Hut1744         :G:D::::::::D::T::::K:::::::::::LDR:R:VS:L::Q::E::DVN::N:Q::
hla1460         :::D::DV::::S::T:T::::::A::::NV::T:SE::::V:::GAT::GV::::::::
HQ1670A         :D::::N:::L::::S::::E:::T:::ENTN:DAATVSD:V::::SSI:AV::TET:V:
HVO_1076        T:TEV:T::::::D:V:E::V::E:::::G:V::NAELK:::V:::::I::::::N::::
Hbo0581         SD:E:::::Y::ENSA:EG::::KT:::SNT:::NA::::T:V:::::V:N::::N::::
rrnAC1960       :::EI:DT:::::::::T::S:D::I:::::EVH::::DET:LG:NV:V:GYNM::S::I
VNG0390         S:T:I::::::LP:::LTN::VSN::I:::::L::::V:::::::D:V:D:I:F::::::
NP0384A         :R::I::::Q::::::IA:A::D:::::E::VVEG:E:HET::::G::::GI::A:::::
Hut0366         ::AEI:G:::ILPD::I::::V:D:I::A:::::::E::::::::N::V:H:::A:::::
rrnAC0633       ::T:::::::ILS:::::N:S:DGTI::::T::L:S:::Q::::RD:QV:::::A:::::
Hmu0976         ::T:V::::::LD:::I:::R:DN:::::E:::::S:V:Q::::R:::I:D:::A:::::

consensus       AHTQLTNG--------------
#oth            2226245484422211111111
NP4680A         :Y:R:GGAGGRPG:::::::::
Hut1744         :::S::QTPPDPWVWEQHRDSE
hla1460         S::SI:E:DDF:::::::::::
HQ1670A         SYS:IRQ-::::::::::::::
HVO_1076        ::SR::::Q:::::::::::::
Hbo0581         ::SH:E--::::::::::::::
rrnAC1960       NR------::::::::::::::
VNG0390         :::TIE::HDADGR::::::::
NP0384A         ::::::::VE::::::::::::
Hut0366         :::EI:::P:::::::::::::
rrnAC0633       ::::::DES:::::::::::::
Hmu0976         :::HI:::E:::::::::::::