|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2690 | Hut0441 | Hut0854 | HQ3119A | HVO_2229 | Hbo1940 | VNG0622 | NP3824A | hla1325 | Hmu1852 | rrnAC0970 | Hmu1675 |
1198 | Hut0441 | 2576 | 1206 | 860 | 909 | 886 | 938 | 809 | 947 | 896 | 977 | 1046 |
1435 | Hut0854 | 1206 | 2579 | 985 | 1074 | 1082 | 1145 | 1061 | 1087 | 1050 | 1083 | 1164 |
1772 | HQ3119A | 860 | 985 | 2877 | 1681 | 1790 | 1402 | 1368 | 1347 | 1374 | 1345 | 1310 |
1787 | HVO_2229 | 909 | 1074 | 1681 | 2723 | 1760 | 1479 | 1336 | 1366 | 1419 | 1432 | 1399 |
1782 | Hbo1940 | 886 | 1082 | 1790 | 1760 | 2708 | 1457 | 1408 | 1385 | 1319 | 1389 | 1339 |
1772 | VNG0622 | 938 | 1145 | 1402 | 1479 | 1457 | 2683 | 1395 | 1378 | 1345 | 1348 | 1446 |
1830 | NP3824A | 809 | 1061 | 1368 | 1336 | 1408 | 1395 | 2671 | 1818 | 1832 | 1475 | 1419 |
1880 | hla1325 | 947 | 1087 | 1347 | 1366 | 1385 | 1378 | 1818 | 2701 | 1870 | 1529 | 1479 |
1860 | Hmu1852 | 896 | 1050 | 1374 | 1419 | 1319 | 1345 | 1832 | 1870 | 2713 | 1464 | 1551 |
1817 | rrnAC0970 | 977 | 1083 | 1345 | 1432 | 1389 | 1348 | 1475 | 1529 | 1464 | 2715 | 1698 |
1927 | Hmu1675 | 1046 | 1164 | 1310 | 1399 | 1339 | 1446 | 1419 | 1479 | 1551 | 1698 | 2674 |
374 symbols consensus --------------------MMRDVGIVGAGAAGAAAAYALREA--DADVTVFEKSGGVC #oth 1111111111111111111246762211.1.3111112132354314232.13.123221 Hut0441 :::::::::::::::::::::REEI::::G:I:::G:::::A--::::::::Y:-MDT:G Hut0854 ::::::::::::::::::::VTSK:C:::::I:::G:::::D::::-:E:::::-AEDIG HQ3119A MSQSSQNSAKLTETTSDEMESSF::::I:::P:::G:::::CDS::::T:::L::::::: HVO_2229 :::::::::::::::::::::T:::C:::::::::G::::::::::N:N::IL:::R::: Hbo1940 :::::::::::::::::::::TLR::::::::::VG::::::N:::::E::IV:::R::: VNG0622 ::::::::::::::::::::-:DSLA:::::P:::::::G:::::::REI::::::R::: NP3824A ::::::::::::::::::::-:VHI::::::::A:::TFVIDQTLP::E:::L::::::: hla1325 :::::::::::::::::::VTVTHI:::::::GA::::FTVDG:VP::::::::::::L: Hmu1852 ::::::::::::::::::::-:V:::V:::::GA::LS:VVDGSHPS::L::L::::::: rrnAC0970 :::::::::::::::::::::A:NLAV::::G::::::::::D::::VN:::::::R::: Hmu1675 :::::::::::::::::::::Q:S:AV::::::::::::::::H::P::::::::::::: consensus GRAATRRRNGCVYDYGANYLKADDDRVAELVRETLGTEGLVDIEEPVWTFDEDGEISEGR #oth ..1111124313112....235515223323454224232212441113.13314252.1 Hut0441 ::M:S:::::::F:F:::::EVA:PDLE:VIEDAA:-:K::E::P:::R::AA:::TP:D Hut0854 ::MVSAH:ED:::::::::VDPPN:::E:RF:SVV:-DR:AETTGD::V:::S::VE::: HQ3119A :::::::K:::R::H::::I:DA:P:T:::IPT-::::E::::D::::::::T:::T::D HVO_2229 ::::::::H::R::H::::V:DY:R:TER:::G-:::::::::::::::::G::VV:::D Hbo1940 :::::::KHD:Y::H::::I:ES:Q:TES:I:D-:::D:V::::K:::V:::S:::T::D VNG0622 :::::::KD::R::H::::V:PG:GP:::::HA-::DD::::VTA:::::TG:::L:P:: NP3824A :::::::HDDL::::::::V:S:::::VD:LT:::D:D::::VS::IY::::S:AVAP:: hla1325 :::::::HGELT:::::::::::::::V::IT:::DS::::::A::IYV::A:::V:P:: Hmu1852 :::::::HGSLT:::::::::S::E:::D:::::::EA:R::VT::IY:::G::TV:::: rrnAC0970 :::::::HGD:T:E::::::::::G::T:::T:::P:::::::::::YA::RT:D:GT:: Hmu1675 :::::::::::::E::::::T::::::::::TAE:PS:::TE:D:::::::A:R::R::: consensus DADEHKWTYEEGITQLAKRLFAATDATVHRRTRVESLART--EDGWRVTDTDGERHGPFD #oth 47164111226.211211222423113245412135252623646.4252341645441. Hut0441 TPQNSR::GRG:LDEIVRGMIN:SG::LEDGVG:TH:E:L::D::::::TEA:::--E:: Hut0854 PNQGV:LSGRD::DEIVRAFLD:S::::QEQ:A:NR::::::A:::A::-A::::LAS-: HQ3119A SR::::::WT::M:::::::::E::VNINH::::ADIS:V:::KA:TL::::NTDY:::: HVO_2229 :R:Q::::WT::::::::::L:E:::::E:E:::AAIDHNPDSGY:S:V:EA:T:::::: Hbo1940 :G:S::::WT::::::::::L:R:::E:R:E:::::IVCDDS:AT:SLI::E::T::::: VNG0622 GD:DP:::W:A:::::::::::::::::QTE::::T:::::DDGD:T:ATDG:T::TG:: NP3824A S::D:::S::R:L::V:::::G:::::::::::::::::::::E::TIE::::DSW:::: hla1325 :::::::S:RQ:L::I::::::R::::::::::I:TVR:V::G:R:E:D:AS:VTR:::: Hmu1852 :T:::R:S::S:L::I:::::SE::::::::::::AVR:LPET:Q:EL:::::RQW:::: rrnAC0970 ::::::::::A::::V:::::NEA::D:ENGV:::R:E:Q::R::::LE:DE:ADL:H:: Hmu1675 :EQTTR::::Q::::::::::::G::::::H::::::E:S::GA::::::AE:GTYDS:: consensus AVLLTPPAPQTADLLAAADWDDDRREALRAAAADVPYRTIRTAVLHYPFELDRPYYGLVN #oth 433121.2222351.6634.44653541551364231.224232.112.33242111111 Hut0441 :IV:AV:TASASV::ET::::APL::E:AIEINQI::::MD:VA::FA:::ET::F:::S Hut0854 ::VV::::---G::::K:::EA:F::T:V::RQRQS::::DSVA::::::M:V:::A::: HQ3119A :L:::::::::VT::E:TA:Q:T:L:T:MS:::::E::::::V::::::MESY:W::::: HVO_2229 S:::::::::::GI:TEMG:G:QCMV:::E:IGS:EH:::::V:::::::REE:W:A::: Hbo1940 RL::::::::::EI:R:TE::GE:LGDAT::VS::S::::::F::::::REEYSW::::: VNG0622 D:::::::::::T::SST::A::::D:::::::::S::S:V::::::::::::EW::::: NP3824A V:G:N:::::::E::::T::::K:LAT:QE:VKS:E::P:W::::R:::R::::::A::: hla1325 :L::N::::::::::RS:E::SPV::::VD:VG::A:::VW::::::::P::V::::::: Hmu1852 :LA:N:::::::A::DG:E:EHPV::R:A:::T:::::::W::::::E::::::::A:I: rrnAC0970 :A:::::::::::::GQSR::H:DCRE::QEI:A:::::VISG:::::::::V:W:AA:: Hmu1675 :::::::G:::::::GQSE:EHAD:RR::Q:::S:::::VVAGL:::E:::::::::::S consensus TDKDHDVGWLSREECKDGHVPDGESLLIVQMSPEWSVAHYDDDPAEAADAAASHAAALLD #oth 43351311.221131.5....1..22221.4336.2552125432535344274226222 Hut0441 EESVY::A:V:N:RH:P:::::::TVIV::FG:S:V:T:PQTS::A:SE::THR:RE:IG Hut0854 :::E:A:::::::S::P:::::::EI::::L::A:AAGRP:AT::::::::ST:::T::A HQ3119A V::E:P:::::::::::::::A::::F:A:::::::TNR:::PVDV:GADT:::V::::: HVO_2229 :::T:P:::VA:::::E::::::::::V::P:::::E:::::PLSD:::EV:GMV:G::G Hbo1940 V::A:E:::V::::::::::::::::::A:::::::AER:::PL:::G:D::ALV:E::: VNG0622 ::DG::I::::::A::A:::::::EI:::::A:D::RE:::HPASKQ:TV::RA:GV::: NP3824A PG:::::::IA:::::R::::::::::V::A:AQ::A:N::A::::NVAEL::LT:DIVG hla1325 :::A:A::::::D:::S:::::::T:::::ANH::::E:::A::::NVAML:E:::DIVG Hmu1852 ::D::::::IA:::::R::::::::::V::A::G:::DN::G:::DNVAEL:ELT::VVG rrnAC0970 S::E::I::VG::::::::::::::::L:::NEP::I:N::EH:DTLI:DI::RT:R::: Hmu1675 EAG::::::IG:::::A:::::::T::V:::A:D:::T::R::A:TLT::I:DAT:T::: consensus DDRLADPDWTDHQGWRYALPEDGVDRDPLRAAAEHGLYLAGDWVAGEGRVHAALRNGLDA #oth .1.142.3.3131211112.4553584344625431.452...32.31.223.134.342 Hut0441 ::::V::N:WEY:R:GD:I:TRSP:EELIEQ:LDSD:AI:::::T:I::TRS:::S::K: Hut0854 :::::E:::W::ERF:::::G:R:NPALFEQ:L::D:G:::::L::T::T::::ET::E: HQ3119A :E:YEN:::I:D:::::::::N:I:NRAA:V:ESA:::I::::IV:::::NK::W::Y:T HVO_2229 :E::R::::V:D::::::::DGVA::EI::RGES::::F::::TV:::::::::WS:V:: Hbo1940 :::Y:::::V:D::::::::N::::T:AV::TEDA::FF:::::V::::::H::W::HE: VNG0622 :::::::::::T::::::I:N:A:AGA:VD::R:A::HV:::::::D::::::VEA::A: NP3824A :E:::E:V::::::::::::::::R:G:VS::::A:::CL:::::::::L::::AE::AV hla1325 :::::::A:::Y::::::Q::T::::G::DS:CQE::::L:::::::A::::::A::::V Hmu1852 ::::TE::::::::::::::DA::QSG:VAS:N:::::PV:::::::A:L:::::::::V rrnAC0970 :::::::::::::H:::SQ::GE::H:L:SC::::D:HF::::::::::L::::::::ET Hmu1675 :::::E:::::::H::::::D:::GA:A:ET::A:D:F:::::::::A:L::::::::RT consensus GERIADAL------ #oth 13425865211111 Hut0441 :RNLQ---:::::: Hut0854 :R:LSTR::::::: HQ3119A :T:::N::SLSQRS HVO_2229 :::::EQ-:::::: Hbo1940 A:::VGRAE::::: VNG0622 ADH:TRG-:::::: NP3824A ::Q:VH:Q:::::: hla1325 :::V::GV:::::: Hmu1852 :::L:Y:::::::: rrnAC0970 ::A:::SR:::::: Hmu1675 ::::GEH:::::::