|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2618 | NP4940A | Hmu2305 | Hut0185 | VNG1131 | hla1408 | HQ2949A | HVO_2790 | Hbo2523 | NP2824A | Hmu1274 | rrnAC0056 |
1477 | NP4940A | 2801 | 1246 | 1388 | 1310 | 1328 | 1246 | 1382 | 1347 | 1307 | 1270 | 1313 |
1623 | Hmu2305 | 1246 | 2693 | 1469 | 1522 | 1434 | 1442 | 1460 | 1518 | 1512 | 1512 | 1542 |
2051 | Hut0185 | 1388 | 1469 | 2639 | 1775 | 1793 | 1729 | 1817 | 1809 | 1864 | 1898 | 1860 |
2072 | VNG1131 | 1310 | 1522 | 1775 | 2586 | 1832 | 1834 | 1935 | 1930 | 1878 | 1773 | 1792 |
2047 | hla1408 | 1328 | 1434 | 1793 | 1832 | 2603 | 1885 | 2014 | 2001 | 1835 | 1820 | 1731 |
2041 | HQ2949A | 1246 | 1442 | 1729 | 1834 | 1885 | 2605 | 1982 | 2039 | 1765 | 1718 | 1666 |
2145 | HVO_2790 | 1382 | 1460 | 1817 | 1935 | 2014 | 1982 | 2610 | 2200 | 1923 | 1848 | 1759 |
2178 | Hbo2523 | 1347 | 1518 | 1809 | 1930 | 2001 | 2039 | 2200 | 2662 | 1963 | 1856 | 1808 |
2150 | NP2824A | 1307 | 1512 | 1864 | 1878 | 1835 | 1765 | 1923 | 1963 | 2627 | 1948 | 1980 |
2104 | Hmu1274 | 1270 | 1512 | 1898 | 1773 | 1820 | 1718 | 1848 | 1856 | 1948 | 2679 | 2009 |
2055 | rrnAC0056 | 1313 | 1542 | 1860 | 1792 | 1731 | 1666 | 1759 | 1808 | 1980 | 2009 | 2679 |
387 symbols consensus --MNEADVRERLRAVEDPDLGDDIVSLGLVNDIEV-----DDG--TIRISLALGAPYSPA #oth 11243232322.2412..2231111.21.113242111112442232512..111.21.3 NP4940A MTEL:DELEA:::EI:::IV:E::L:MQ:I::V:I:::::::::::AS::::FNT:FA:: Hmu2305 ::-MTEAI::A::DI:::II:EN:::A::IGA:T::::::E::::VAE:P::::::H::: Hut0185 :::D::EL::L:AS::::::D:::::::::::V:L:::::EN::::AH:D::::::F::T VNG1131 ::::DD::M:L:AS:T::A:::::::::::::LS::::::::::::VT:::::::::::: hla1408 ::::::::::::VD:R::::::::::::::::V:::::::::D::E::::::::::F::H HQ2949A :::HT:T::D:::D:T::::E::::::::::A:DI::::::ESNN::::::::::::::: HVO_2790 :::D:::::D:::::::::::::V:::::::AV::::::::GD:::V::::::::::::: Hbo2523 ::::DEA::D::::::::::::::::A::::A:::ASDDA:::SGVV::::::::::::H NP2824A :::::ET:LD::A:::::::::::::::::::VNI::::::AE::::HVD:::::::::T Hmu1274 :::D::A::::::E:R::::R::::::::::E::I:::::::A::S:AVD:::::::::N rrnAC0056 ::::ID:::::::M:::::::::::::::I:S:D::::::T:D::EVS:D:::::::::T consensus ETEIAAQVREALADL--DLEVDLTASIDR-LDADEEVLPGVKNVIAVASGKGGVGKSTVA #oth .2511451.2335251122242.3151233565344321314.11..1........1.31 NP4940A :L:LGDEI:A:VS:V::G::P::Y:EVG:EHGF::::M:N:R::V:::::::::::T::: Hmu2305 :::::D:::A:VREA::GY:PS:SIE::D:-QTPAAMVDDAP:::::S:::::::::::: Hut0185 ::T::DR:::VIG:AAP::A:E:S:T::::-GTEGDI:::::::::::::::::::::TS VNG1131 ::::::H:::T:EAE::G::T::::A:PD:-RSET:::::::::V::::::::::::::: hla1408 :SA::DD::A::::T::G:D:E:S:::PDD:EP::Q::::::::::::::::::::::M: HQ2949A :SK:::::::V::::::EYDL::A:T:PS:VESED::::::T:::::::::::::::::: HVO_2790 ::D:GRRI::V::ED::G:::::::KVPTDR:P::::::::::I:::::::::::::::: Hbo2523 ::D:::::::QFS:T:::Y::::::K:PSD:S:::D:::::::I:::::::::::::::: NP2824A :::L:GT::D::SE::::R:I:::::V:TG:S:::QI::D:E:I:::::::::::::::: Hmu1274 ::A:::D:::::D:D:::R:IE:::NV::GM::EGT::::::::::::::::::::::L: rrnAC0056 ::G::NE:::::G:::::R:I::S::V::GVPEA:DP::K:::::::::::::::::::: consensus VNLAAGLSDLGARVGLFDADIYGPNVPRMVDADEAPQ-ATDDETIVPPEKYGMKLMSMDF #oth 1.1.211251..2...1...11...2..1151313.31314423.1.2123.211..12. NP4940A A::::::DE:::::::L::::H:::A::VLPVE:Q:G:V:P::K::::TAD:V:V:::G: Hmu2305 ::::TAMAQR::A:::::::V::::I:::LGVHDH:GM:E:::::I:I:R:::::::IG: Hut0185 :::::::A:R:::::::::::::::::::L::H:R:E:::::DK:I::::H::::::::: VNG1131 :::::A:::R:::::::::::::::::::::::DH:::::ET::::::::H:::::::A: hla1408 ::I:::::A:::::::::::V:::::::::S:E:R:::-::G:::::::RF:V::::::: HQ2949A ::::T:::::::::::::::::::::::::::G:::E:TE:EQ:::::::::::::::A: HVO_2790 ::::::::K:::::::::::::::::::::A:E:::::::Q:Q:::::::::::::::A: Hbo2523 ::::::::K:::::::::::::::::::::A:::::::::G:Q:::::::::::::::A: NP2824A ::::::::Q:::::::::::V:::::::::E::DQ:K:::EQ:::I:::::::::::::: Hmu1274 ::::V:::E:::Q:::::::V:::::::::A:::H:::::E:DQ:I::::::I::::::: rrnAC0056 ::::::::R:::::::::::V::::::::L::::Q:::::E::E:I:V::H::R:::::: consensus LV-GEDDPVIWRGPMVHQVLTQLWEDVEWGELDYLVVDLPPGTGDTQLTLLQTLPVTGAV #oth 121121..1.2.....233211132114..4...113........11.231.33.13.21 NP4940A :LEE::::A:L:::::NN:M:HFF:N::::A::::::::::::::AS:D:V:::::A:V: Hmu2305 :::::N::::::::::DK::S:::H:T:::::::M::::::::::A::SM::QM::V:S: Hut0185 :L::::::::::::::::T::::F:::Q:::::::::::::::::::::::::V:::::: VNG1131 M::::::::::::::::K:::::I::::::Y::::::::::::::::::::::::L::S: hla1408 :T:::::::::::::::KII:::V::::::::::::M::::::::::::I:::::L:::: HQ2949A ::::::::::::::::::I::::V:::R::D:::::L::::::::::::I:::::L:::: HVO_2790 ::::D:::::::::::::L::::V::::::S:::::L:::::::::::SI:::::L:::: Hbo2523 ::::::::::::::::::L::::V:::Q::::::MIL::::::::::::V:::::L:::: NP2824A :::::::::::::::::K::::::::::::A:::M:::::::::::::::::SV::S::: Hmu1274 ::::::::::::::::DS:::::::::V::S:::M:I::::::::::::M::NI:::::T rrnAC0056 ::::K:::::F:::::DN::::::D::L::::::M::::::::::::::M::QV::S::: consensus IVTTPQDVALDDARKGLRMFGKHDTPVLGIVENMSSFVCPDCGSEHDIFGSGGGEEFAEE #oth 1....151.2.1.4..1211231113...22...1314..1.135.22.14..1342245 NP4940A ::::::EM:V::::::::L:E::E:::::::::::RYH::S::D:::P::R::A::MV:S Hmu2305 V:::::N::::N::::V::YDDY:AH:::VI::::T:::::::::::V:DV::::RL::: Hut0185 ::::::G::::::K:::E:::::::::::::::::::K::::::::A:::E:::R::::Q VNG1131 V::::E:::V:::::::::::R:::T:::V:::::::::::::GT:::::A:::::::TA hla1408 ::::::E::::::V:::::::::::N::::A:::AG:R:::::GF:E:::::::KAL:Q: HQ2949A V::::::::V:::::::::::E:::N::::::::A::T::::E:I:::::E:::QV::AN HVO_2790 ::::::N::::::N:::::::::::N:::::::::T:R:::::NR:::::A:::R:::AS Hbo2523 :::::::::I:::::::Q:::::::N:::::::::::R::::::S:::::A::::A::A: NP2824A ::::::K::::::E:::Q:::E:::::::::::::G:::::::::::::::::::S::DD Hmu1274 ::::::T::::::::::E:::R:E:::::L:::::T:T:::::G:::::D::::R::S:: rrnAC0056 :::::EE::::::::::::::R:E:::::::::::::::::::GT:::::::::R:::D: consensus NDLPFLGEIPLDPAVREGGDDGEPVVLDDDGETGDAFRDFTANTADMQGIVRRRRV---- #oth 42211..52.1114212313515.412443542331237434521223.323.4621111 NP4940A Y:VEL::QL:IHEDFGAD:SE-L:A:KL:ASPVQ::AQSVMTDI::RL:E:N:LK::::: Hmu2305 YEV::::R:::::SI::S:E::::I:Q-R:VAA:S::D:LASTVM:RV:E:::QSHRLTA Hut0185 VQM::::::::::EI::R::E:R:A::A::LDVS::::N:V::::NN::::H:N:::::: VNG1131 :E:::::S:::::S::A:::N:Q::A::P:N:::AS::T:A:E::::L:L:Q::G::::: hla1408 H::::::GV:::::::T::::::::::-EE:::A::::VIVE:V:NNA:V::::G::::: HQ2949A :::::::SL::::Q::T:S:::D:A::-GS:G:A:::EAM:::V:::V:VT:::D::::: HVO_2790 :::::::AL:::::::::::G:K:I::E::D::A::::VM:E:I:::V:::Q::S::::: Hbo2523 ::M::::A:::::D::T:::G:R::::E:E:::AE:::RM:ESV:::A:V::::E::::: NP2824A VEM::::R::::::::::::A:R:::::E:D:::E:L:S::ER::N::::::::Q::::: Hmu1274 T:::::::::::::::::::::::M:::E:S:::E:::E:VHR::IN::::H:K:H:::: rrnAC0056 TEM::::::::::E:::::AT:::L:::E:SDV:ES:::IA:R::N::::IH:K:Q:::: consensus SER------------------------ #oth 336744432211111111111111111 NP4940A ADMLELGREEDKSPVDESPQSQSGPKL Hmu2305 :DSPDTPPAQ::::::::::::::::: Hut0185 A:QSE:::::::::::::::::::::: VNG1131 G:-:::::::::::::::::::::::: hla1408 ::GR::::::::::::::::::::::: HQ2949A MN::::::::::::::::::::::::: HVO_2790 ::::::::::::::::::::::::::: Hbo2523 ::::::::::::::::::::::::::: NP2824A :AADR:::::::::::::::::::::: Hmu1274 AD:MAPDQ::::::::::::::::::: rrnAC0056 :DSQRAQPEQ:::::::::::::::::