| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1836 | Hbo0122 | HQ1711A | NP4530A | VNG1791 | Hut0691 | rrnAC1731 | Hmu2340 | hla1888 | HVO_2335 | Hbo2015 | HQ3324A |
| 949 | Hbo0122 | 1542 | 1153 | 611 | 803 | 715 | 717 | 732 | 622 | 664 | 684 | 647 |
| 1023 | HQ1711A | 1153 | 1786 | 661 | 840 | 778 | 771 | 775 | 684 | 739 | 712 | 686 |
| 951 | NP4530A | 611 | 661 | 1817 | 750 | 669 | 688 | 685 | 839 | 854 | 844 | 739 |
| 1195 | VNG1791 | 803 | 840 | 750 | 1892 | 999 | 1051 | 1092 | 745 | 860 | 805 | 753 |
| 1192 | Hut0691 | 715 | 778 | 669 | 999 | 1933 | 1324 | 1307 | 685 | 931 | 863 | 823 |
| 1262 | rrnAC1731 | 717 | 771 | 688 | 1051 | 1324 | 2020 | 1642 | 639 | 975 | 907 | 859 |
| 1280 | Hmu2340 | 732 | 775 | 685 | 1092 | 1307 | 1642 | 2043 | 689 | 990 | 908 | 884 |
| 989 | hla1888 | 622 | 684 | 839 | 745 | 685 | 639 | 689 | 1822 | 847 | 918 | 971 |
| 1269 | HVO_2335 | 664 | 739 | 854 | 860 | 931 | 975 | 990 | 847 | 1938 | 1204 | 1006 |
| 1197 | Hbo2015 | 684 | 712 | 844 | 805 | 863 | 907 | 908 | 918 | 1204 | 2039 | 1419 |
| 1154 | HQ3324A | 647 | 686 | 739 | 753 | 823 | 859 | 884 | 971 | 1006 | 1419 | 2200 |
288 symbols consensus ---------------------------GV--RRIVDALRR--FDDGLPDADDLPRYLAPL #oth 111111111111111111111122676341333455745216668651654621422212 Hbo0122 :::::::::::::::::::::::::::--::---------::------------------ HQ1711A :::::::::::::::::::::::::::--::---------::-MTSI:V:::::V::S:: NP4530A :::::::::::::::::::::::::::--::----MN::::YLESDV:R-::::W::::: VNG1791 ::::::::::::::::::::::::MRRPR:D::H:PMPT::DAAETT::-:T::W:V::: Hut0691 :::::::::::::::::::::::::MA:::G::FER:VGT:V::AE::SSPGR:Q:V::: rrnAC1731 ::::::::::::::::::::::MAPDE:::GG::DAVVA::V:SRR::::EG::Q:V::: Hmu2340 ::::::::::::::::::::::MAGHD:::G::LERLVG::Y:GVT:::TER::::V::: hla1888 :::::::::::::::::::::::::::--::MN:::::G:::---DP::RES:::W:::: HVO_2335 ::::::::::::::::::::::MDAATRL::::LL:DP::LIW:::::AGT::::W:::: Hbo2015 ::::::::::::::::::::::MATST:I::::L::EA::LAD:::::P::Q::WW:::: HQ3324A MKLPMRNCVLVSPPMRCYQSCISAITH::IYMS:S:::H:LTS:Q:::S::R:::W:S:V consensus PAWLENLGLRLAWVIVAINLVGTVFGFWYYRF------------QLAAAPLAMWPFVPDS #oth 154213431233141241.22.13..11..34212244311332.136413521331... Hbo0122 ------MT:::T::V::V::::::::::::::::::::::::::::LNSH:VI::A:::: HQ1711A ::QI:TFVFQYS::VIM::IA:SI::L:::::::::::::::::::LNT::::::V:::: NP4530A ::A::::A:N:::LV::V::A::A:::Y::SP:::::::::::::::QT:VE::V::::: VNG1791 :TR::D:A:::::::A:::VA::::::::::I:::::::::::::::DT:::A:I::::: Hut0691 :T:::DIA:::::P:AIV::::::::::::AGRPLNVEAPLLEG::G::::PA::V:::: rrnAC1731 ::::::V::::::P:ALV:::::L::::::AGRPLNTAPPLVEG::G:::::AY:LI::: Hmu2340 :E:::D:::::::P:ALV:::::L::::::AGRPLNLAPPLVEG::G:::ALAY:LI::: hla1888 :KA::DIAF:FV::::::::L::A:::::::::::::::::::::FREL:VE::A:I::: HVO_2335 :E::::F::NI::LV:V::::::A::::::GY:::::::::::::FGIE:T::::L:::: Hbo2015 :E::::V::N:V:TV:::::::::::::::G:HPLPLSDPLIVW:F:SE:VV:::::::: HQ3324A :R:::::::::VPA:II::VL::L::::::G:HPIPQTDPLITW:F:SE:VI:::::::: consensus PMATLFIALSLAAWRLGRDANWLHALAFFGCLKLGLWTPYVQLVFNGAFGSALW--MYWF #oth .5..111231133131155532233.1.2.1311.2.114.232353444665343225. Hbo0122 :L:::LM:V::VS:K::Q:R::I:::::V:N::Y:F:VVI::I:I:DVLV:GDP::YH:: HQ1711A :F::MLMVG::LS:::::NR::I:::::I:N::Y:F:VVA::IFI:D:LV:QNP::Y::: NP4530A ::::::M::A::S:K:::PQQ::I::::::NII::G::VW:H:A:WEQ:SYLHP:A:RQ: VNG1791 :T::::::A::V:YK:DW::D::::::::::::::::::F::::V::QG--:::WG:::: Hut0691 :::::L:::::L::::DLQ:::::V::::::::::::::F:::FV::PE:I:T:::L:V: rrnAC1731 :V::M::G:::V::::DW:TQ:::M:G::::I:::::::::::AL::PG:IP::::L::: Hmu2340 :V::M::G:::V::::DY::D:::M:::::::::::::::::::I::PA:VP::::L::: hla1888 :G:::L:::A::::A:::SSDT:AT:::::NV:::::::::LV::YP::LANSGPA::A: HVO_2335 :V::::::::::L:K:::SNEYVN:::::::::::::::::L:A:K:D:SYLH::A::N: Hbo2015 ::::::::GAF:L:::D:TNEYVN:::::::W:::::::F:LTA:SD::LDQTALP::L: HQ3324A :L:::::::AFFT:WR:KTNEY:A:::::::W:::::::::LT::AD::L:VT:TPL:L: consensus LILSHLAMVVEAFVIHRYADFSVPAVGVATAWYGFNDLVDYFVPILGDPHHTLLPAEL-- #oth .35..31.231.1222.133.2451122.36.1331242..141231331..62244431 Hbo0122 :LV::FG:GLQ:L::Y:::E:T::S:A:::L:FS:::M::::L:LV::Y:::YFGPR::: HQ1711A :LI::FG:GLQ::::Y:::E:::::::I::S:F:::::::::T::I::Y:::YFGPR::: NP4530A ::W::A:::AQ::LL::IG:::PW:::A::L:::VDTT::::I:VR::L:::F:::DR:: VNG1791 :V:::FG:A::::IV::::T:::::::::L::::I:::L:::LGV::G::::::R::::: Hut0691 ::T::::::L:::::::::E:TLS:I::::V:::::::::::W:V:DG::::V:R::PYV rrnAC1731 ::::::::AA:::L:::::S:::MS:A::VF::::::V::::::::DG::::W:R::PIV Hmu2340 :::::M::A::::L:::::S:::S::A::LG::::::V::::::V::G::::W:R::SV: hla1888 :LV:::G:::Q:::L::IT::PLK:::I:::::TVDL:M:::::VI:EVT::SI:YL-:: HVO_2335 :FW::::::::::L:Q:::E:PT:::L::VG::AL:::L::::::V:T:::::I:::PVV Hbo2015 :FF:::::::::::L::IS::P:R::A::IV::::::V::::I::V::::::SI:LA-:: HQ3324A :FI:::G::I::::L::I:::PIR:::::LI::::::I:::LI::V::::::AI:VA-:: consensus -DGAGDHTSPAHDLAAAGAVVLTLIATFLALATRVAKLERRS------ #oth 14348534561153..24.15.14424221131236455847555422 Hbo0122 :VS::::GTR:::V:::S:IG::IL:::::::I::RR::N:T:::::: HQ1711A :AST::::I::::V::TA::C:::L:M:::F:I:ARR:SPAVAGNGG: NP4530A :EA:MFLGAD:LGV::::::L:FVVSVY:::T:H::T:RQ::TAA::: VNG1791 :GAEAP:ALY:::I:::C::A::ML::Y:::::HIHAT:H:R:::::: Hut0691 ::::Y::AVL:::::::A:::::IS:IV:::G:YRSQA----:::::: rrnAC1731 AA:GF:::VL::::::GW:::::::::::::::::E:VK:QA:::::: Hmu2340 :V:GF:::L:::N:::GW:::::FV:V::::::::E:CK::EAAPE:: hla1888 ::TEPWF:TTVLQV::::::A::V:PL:W:::::::T:QI:LDRGDGA HVO_2335 :::VVQ:V::::EY::::::L::VA:::::::::::::::GVVD:::: Hbo2015 :::VIVGG:SVLQI:::::I::::V:::FS:T:::K:::SG:IPRQTE HQ3324A ::TTTVGN:T:LH::::::IT::F::::F::S::IY:IKA::::::::