| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4111 | VNG0858 | Hut1222 | Hut2373 | NP2230A | rrnAC0415 | Hmu1374 | hla1774 | HQ1869A | HVO_1474 | Hbo0075 |
| 2058 | VNG0858 | 4464 | 1312 | 1237 | 1427 | 1317 | 1447 | 1336 | 1336 | 1476 | 1544 |
| 2092 | Hut1222 | 1312 | 4358 | 1227 | 1547 | 1470 | 1492 | 1397 | 1351 | 1489 | 1642 |
| 1805 | Hut2373 | 1237 | 1227 | 4794 | 1270 | 1249 | 1235 | 1159 | 1181 | 1238 | 1288 |
| 2273 | NP2230A | 1427 | 1547 | 1270 | 4107 | 1692 | 1601 | 1563 | 1524 | 1598 | 1650 |
| 2298 | rrnAC0415 | 1317 | 1470 | 1249 | 1692 | 4199 | 1942 | 1540 | 1568 | 1686 | 1717 |
| 2317 | Hmu1374 | 1447 | 1492 | 1235 | 1601 | 1942 | 4218 | 1412 | 1558 | 1694 | 1606 |
| 2349 | hla1774 | 1336 | 1397 | 1159 | 1563 | 1540 | 1412 | 4598 | 1703 | 1738 | 1894 |
| 2353 | HQ1869A | 1336 | 1351 | 1181 | 1524 | 1568 | 1558 | 1703 | 4507 | 1944 | 2229 |
| 2476 | HVO_1474 | 1476 | 1489 | 1238 | 1598 | 1686 | 1694 | 1738 | 1944 | 4111 | 2304 |
| 2701 | Hbo0075 | 1544 | 1642 | 1288 | 1650 | 1717 | 1606 | 1894 | 2229 | 2304 | 4165 |
790 symbols consensus ----------------------LAVPG-----WL----------------------LQRL #oth 122222121222112334425655318111113511111111111111111122234454 VNG0858 MHVPSDAAAVVALTAVGGVLAVSV::RFRRAR::AGAAVSGVLAGLVVAGSSGLLD:W:A Hut1222 MSAMVLALAPLPLTTSGIRATID:::L::::::A::::::::::::::::::::::-WQ: Hut2373 ::::::::::::::::::::::-MI:-::::::M::::::::::::::::::::::---- NP2230A ::::::::::::::::::::MP:PAAV::::::Y::::::::::::::::::::::---P rrnAC0415 :::::::::::::::MMQSLPTP:::A::::::::::::::::::::::::::::PW:EA Hmu1374 :::::::::::::::::::::MD:::S::::::::::::::::::::::::::::P:RT: hla1774 ::::::::::::::::::::::-M:AE:::::A:::::::::::::::::::SSNTVHLV HQ1869A :::::::::::::::MVYQLGF:SP:T:::::--:::::::::::::::::::::::::: HVO_1474 :::::::::::::::::::::M:EI::::::::I:::::::::::::::::::::PF::: Hbo0075 ::::::::::::::::::::::MEI:::::::V::::::::::::::::::::::TV::A consensus VLLAAVAV--ALGTVYRADRPR-------GRWGQALRRRFLLGVPWGTLLTIAGVAAVYL #oth 23423523113434465543451111111434474214.122.2.111234324.341.1 VNG0858 :GY:::V:LL:T::AVFTRG:G:::::::QDAV::V:S:L:F::::::::VAGI::GF:T Hut1222 ::A:GILL::SV:IL::IA:::::::::::::::R::S::V::L::::::GL:F:VC::: Hut2373 ::::::V:::FS:GYWWFVGG:::::::::::VSLT:D::VR::::A::V:A:L:VGF:: NP2230A ::A::L::::S:AA::YLSQ:A::::::::::::LV:K:L:::L::::::AVG::L:F:: rrnAC0415 :V:VV:LA::V:L:IC:VSD--:::::::M:L:DG::E:L:::A:::::::::::::::: Hmu1374 TV:L:A::::S::VALV:SDRT:::::::D:RLG:::::L::::::::A:::GA::L::: hla1774 AGG:L:::::::AV::Q:::::::::::::A:TR:::S:::::::::::VA::A:V:::: HQ1869A :VI:VT:I:::VL:IVWIR:TQTHDNGDH:HS:LQ:QD::I:::::::I:::VF:SL::: HVO_1474 AA:L:LLA:::AVALAVV:::-:::::::S:LSA:::::::F:L:L:::ASAG::LV::: Hbo0075 A::::FVL::::VV:FFT:::A:::::::::::T::::::V::::::S:I:LV::L:::: consensus FVQGGLEHPRRPLVIPFRAWSYFYPLGMLTAAFAHAGLGHLTGNLIGTLVFGPVAEYAWG #oth 22.313743451233..2221131.4.3112222.4252.24..16222341321.2131 VNG0858 L::R:PDGT--L::V::IS:::A::::V::SPI:::N:::V::::::::ALA::::::FS Hut1222 :::::WGNL:D:VSL::Q:T::A::::I:::G:::L:WS::F:::WAG::::SI::F::S Hut2373 ::::::G:WSQ::T::::S::L:E:V:L::SGL::::PA::L::VT:LV:::AIV:H:I: NP2230A LA:D::AN:NA:VQ:::::YG:T::::V:::G::::S::::V::::::::::SL:::::S rrnAC0415 :L::AWW:::N:::T:::T::::::F::::G::T:GSQ::I::::M::::Y:T::::V:: Hmu1374 :::::I:D::D:::::::S:::R:::::V::::T:SS:::V::::VA:AA::S::::::: hla1774 :::S:::N:N::V:::::S::::::E:::WSGL::S:RS:I::::LS:::A:AL::::Y: HQ1869A :L:D::T:W:::IT:::::::::::::::::::T:N:P:::F:::F:::AVA:L:::::: HVO_1474 V::D:WSSWY::V::::::::::::T:::::::::SSA:::V:::V:::TLA:::::::S Hbo0075 ::::::H:WN:::T:::::::::::::VV::::S:N:P:::I:::TA:AM:A:::::::: consensus HYP--RE--------------------------------------------RGSTSFGSW #oth .1.222411111111111111111111111111111111111111111111224623413 VNG0858 :::::TA::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TAA:::: Hut1222 :::::T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::S:: Hut2373 :::::GD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DD:ASRR: NP2230A :F:::T:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:L rrnAC0415 ::::::K::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::VQT:T:L Hmu1374 ::::::K::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::AH::::A hla1774 :F:DS::IDDEPGPVRSALSSAGSSSATVSLTSLPSRASLPSRASIRKSLAV::V:RE:L HQ1869A :F:HA:R::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::AQ:S:YS:I HVO_1474 :::::TR::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A Hbo0075 :F:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus RT--NPYVR-ILAVPAAVLVVGLLTAVFALGPVIGFSGVVFAFAGFALVFYPLATVLALV #oth 43111.21.243323433354123423.32.222.1..111.32...1262.34234.44 VNG0858 :::::::::AGVVF::G::A:A:::S::SW:AAV::::::::::::::LK::::::V:VA Hut1222 HR::H:F::::GI:FVTI:LT::V::A:SW::I::::::TY:M:::::::::IT:LV::: Hut2373 NRLRH:G:::::LISLGMIGLAVVPSP:V::W:L:Y::A:Y:L::::::TR:::A:::I: NP2230A :M::::FA:::A:FA:::FAF:IVS:A:G::::::::::::::V:::::RF::::AV:TL rrnAC0415 ::::::FA:::::::::MF:::VFS::::I::IV::::::::I::::::TR:TLFLG:FL Hmu1374 L:::::F:::::I:::GA:::::F:SL::::::V::::::::I::::::QR::TAL:::L hla1774 A::::::::AFVV::G:M:SF:V:ASL:::::::::::::::LW::::::::VT:IA::T HQ1869A :M:::::A::V::::CTAVI:::IGT::G::::::::::::::V:::VII:::G:A:::I HVO_1474 :E:::::::SLVVF::V:FG:::::::::::::V::::::::::::::::R:::::::F: Hbo0075 :::::::::AF:I::LV:F:AAI:::A:::::I:::::A::::::::::N:::V::I::: consensus GARALGVLYNALRSPVVVASASPRFGTP-WWAGIAIQGHAIGLLAGVLLGAALLRRRD-- #oth 38533543362445.533243365364113.14213...12.224.22314413441411 VNG0858 ARD:IS:FWRT:LE::TF::::QS::P::::::V:V:::LF:F:L:A:AAV:V:VH:::: Hut1222 :WSR:WHV:S:FV::YS::E:QV:YD:V:G::ST::::::F:F:L::FVA:L:::::R:: Hut2373 AHD:::::VD:AEQ:::E:TR:VGPP::PA:::::F:::LL:F:I:I:::IG::::Y::: NP2230A TTGVVSQ::::V:::ES:HV::ET:SQ:::::::SL:::LL:::::AVF:::::Y::G:: rrnAC0415 :N:V:DL::S:::Y::ST::GQT::V:::::SN:::::::::I::::VVAL:::W::::: Hmu1374 ADQV::F:VV:VQT:R:::VPR::VI::::::S::::::::::F::I:::FG::YY:::: hla1774 ::TLVN:T:ET::N::::SE::GSY:A::S::N::::::::::I::I:AAVW:V:::RRR HQ1869A ::D:I::FIT:VQ::TLT:GGRSAYLS:::::D:::::::L:::M:::::LVVI:S:Q:: HVO_1474 SG:VVSLF::VML::E::S::R:V:S:::::SQ:::::::::F:F::::::W:SH::G:: Hbo0075 :S::TR:V::::QT:QLT::GH:AYI::::::D:::::::L::FI::F::LVVV:N:P:: consensus ---------SRPNPLRLWLAVLLFAISQSLWAVYWYRGGETYVLFRAVGLALVFVLAAVV #oth 111112134542624341514233155521.22243314341211124.43314531422 VNG0858 :::::::::DH:::A:V::GAVVI:T:L:::::W::GRSAE::::::G::L::V:::V:F Hut1222 :::::::::RTGH:E:I:::AVIYG:ANG::R:::FL::GQ::Q:K:::T:::L:::GLI Hut2373 :::::::::WT:E:V::FG::IA::LTK:::L:VSSG:EGV:::Y:GA:VVM:LLGTLL: NP2230A :::::::::V::::THI:::A:V::VDRG:::::LPE:P::FR::::L:::A::CI::L: rrnAC0415 :::::::::E::DT::VFF:T:V::VA:G:::::IPL::GRFR:::WA:T:::::::L:: Hmu1374 :::::::::RW:D:T:::FGL:V::EF:G:::L:VPE:NGRF::::WL:A:V:::::::: hla1774 ETTEWIDPE::TSA:VAFG:I:::GG:RR:::I:::L:S:R:E:Y::I::G:LT::::I: HQ1869A :::::LDEQ:::RA::::VG:V:VG:Q::::::::::::D::::Y::::V:::II::V:: HVO_1474 ::::::::G:N:PA::SFAG:::::V:E:::::::::::::::::::::F:::VA::TI: Hbo0075 :::::::SAE::SA:K::TG::::G:Q::M:::::F::::::::Y::::V:::VTV:VII consensus ALAVAG-----SDRRALPRLD--------------------------------------- #oth 343363211116455343455344341221222221111111111111111111111111 VNG0858 :VVAGT:::::HGGVT::G--::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut1222 VA:::::::::P::S:VS::AT:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2373 T::AT:ARPEI:AP::::A:SWQPDIDTGVIPGALRRRVAAVSMPTWVREVLIVGLAFVA NP2230A :G:AVA:::::TP:DL:S:I:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0415 :A:TI:::::::G::LR:SF:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1374 I:GIWD:::::G:E::GS:::WLVER:::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1774 :::I:::::::R:EPIR:D:AVPEPE:::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1869A TI::MTN::::LNS:IHAGTNTNTDTDPPVSRDDK::::::::::::::::::::::::: HVO_1474 ::T::A:::::::KPLRASP:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0075 :VT:VA::::::::YI:RDTL::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus --------------------------------------------------GREGSARRRQ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111147575675347 VNG0858 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R:G:TT:TA:K Hut1222 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GD:SSDSP::L Hut2373 YVLVEPTSELAAKALALGVVAGSGYLVLKLLKWALGHLIAAVPTGGWLGRVPVP:IP:PG NP2230A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-----LS::E rrnAC0415 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-------::P Hmu1374 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RLP:ST:GVHT hla1774 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TI:D:VRSATP HQ1869A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SENH:LNGKWR HVO_1474 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::NSLF::::W: Hbo0075 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GAFAV::W: consensus AAAAVLLLVLA--ALAGPAVPYNLATVDD--ADLPGDA-VEVRDYEVTYAENVENGRVAA #oth 42424224443124313314351343554114622445213261.423.2.213246454 VNG0858 L:::A:IIPVV::TM:FV:::V::T::Q::::NVAQS:::S:NG::::::::AT:K:::: Hut1222 :::S:::A::I::TMSMVGAMV:::APAG::GG::D:::::LK:::IA:::::T:QQI:V Hut2373 K:TGT::GA::::VV:LLGLLFSP:::ST:::S:ADTGE::IQ::TI::::::SE::ALT NP2230A ::YGL:IAA:L:::V:LV:::L::Y:I::PD:G:DA:SGI::E::T:Y:::D:::QF:P: rrnAC0415 :SL::MV:LVVLG::SLA:::T:VVDLQA::DQ::E:G:I:::::V:::D:::P:AYFDG Hmu1374 VGL::V:VL:L::G:S:A:I:::V:PIG:::SPA:QPT:::::::T:S:G:D:PD:Y:RS hla1774 ::IGL::::S:LAIV:::GIAP::VA:::::DE::::P:I::SG:Q::::::::DRV:SV HQ1869A V:TG:::ITT:::::::::I::::Y:T:N::ES::::T::V::::KL::::G::::L:S: HVO_1474 :GL::::V:V:::::S:::ML::TF:ASG::D::::ES::T::::::::::D:P::LT:V Hbo0075 TG::C:I::A::::IS::::::::Y:AT:::G:::::E:IS:G::::::::::T::MT:: consensus FDLPAFGETTA--VNTSGVIVASARRGIWTTAVSKGRLAFDGQAAVRVGGLGWRETVHVN #oth 35436526524113631.1115143.43.44314434.254.552251.133.2551536 VNG0858 V:I:YS:AA:N:::SA::::::NPD::M::ER:GTDE:::R:D::IT::::N:::::G:H Hut1222 ::::YLDQA:Q:::R::::::T:EK:HL:RV:I::RA:EAR:SGR:L:::V:::SSLWAT Hut2373 W:SEI:DG:SS::----::::::E::AV:IE:::PD:::H::S:T::::::D:EQ::D:E NP2230A IPV:GD:NV::DRIEA::I:IV::E:D::WQE:::S:::SN:E:TL:L:S:T:N:D:::T rrnAC0415 IWV:TQRGGAS::::E::::::::E:EV:IA:IQP:Q::V:::ER:T:::PT:::S:YA: Hmu1374 VS::FVDDP::::I:::::V:T:Q::HV:Q:V:LESQ:RNR:F:T:E:::V:::RN:::: hla1774 VEME:::RS:S:::::::::::N:D:E:::::::::N:::W:YR::D:::T::::::W:Q HQ1869A :N:T::::::T:::T:::::IQ::D:::::::::T:::::A::ST:SL::P:::TP::IS HVO_1474 ::VEL:::S:T::T:::::::K:E::::::::::TS::::::ES::::::::::DR:TAV Hbo0075 :E:S:L::::::::K::::::R:RE::::::::TR::::::::T::::::::::D::YTV consensus RTGWVVAGNGSVYRVFLRPEG----------------ERRVLFTSEPATADPVLDGRNVT #oth .63233423533.4.5245644311111111111111362442515133.3342221314 VNG0858 :E:::AT:GQP::N:Y:::PDGG::::::::::::::SL:PV:A:ANR::A::::::H:R Hut1222 :S::S:V:GN:T::::FD:KDR::::::::::::::::K:LVH::S::V::LT:AN:TIE Hut2373 :QAVS:V::D:::A:D::T::::::::::::::::::STTRS:R:A::::GARI:::R:A NP2230A :PT:R:::TE:S:L:EAQA:TAD::::::::::::::::S:::Q:P::Q::AR::::::S rrnAC0415 :VD:S:L::S:::::Q::R::G:::::::::::::::QP:TAY::::L:::VI::::::: Hmu1374 ::::RP:::D:::K:Y:::A:D:::::::::::::::::TRGY::::RR::::VA::::: hla1774 :::::A:NG:PT:::DAVRNE::::::::::::::::T:ST:::::::R:E:RI:::::: HQ1869A ::::TAG:::TA:::NASIGNAPTTNRDADKTTKQLRSQT::YL:D:V::A:Q:ANKT:: HVO_1474 :D:Y::T:A:VA:::::VAD::::::::::::::::::A:LAYETG:VR:G::VAR:::S Hbo0075 :D:::TTQG:TA:::::SHNN::::::::::::::::TA::VH:::::::G::IG:::IS consensus VAPAAGGFELRVKRDNRTVATAPLPAANATTTAGGLTF----ERENRRLFAERDGTRVRI #oth 241565314241644334355443.462422233222111114257582313535.3232 VNG0858 LNAD::Q:S:T:L:NETAL::TGV::::::A::::::::::::HTAG::L:HTGN:T:TV Hut1222 LR::SDA::VAI:::::::DKVAI:EDG::::VD:V:V::::T:SG:D:Y:SI:::SI:: Hut2373 :::T:D::::::R:NGTV:GSR:::::::S:SV:S:R:VASE:N:T:TIR:VSGT:S::: NP2230A ::::DS::::::T:::E:LG::AV::DGESV::::VQ:::::::DD:S:::::GD::L:: rrnAC0415 ::ARQN::DVV:TQG:E::GQ:::::NMTQ:RI:::::::::::NRS::Y::T:::::K: Hmu1374 LV:TD:::AFA:S:EG::L:::SV:GR:R:::::::::::::R:NGSQV::SDE::::T: hla1774 ::AVE:::::::EG:GGETEI:::::V:ESV:LREV::::::V:::NAV::::RE::::: HQ1869A IV:KKTTY::::NAS:::-K:::::PT:TSV:IS::Q:::::::KSKIIYVSYEQ::IAL HVO_1474 :V:TPT:YDVQ:SS:SG::R-G:M:TG:T:::LD:IR:::::V:::SLV:::SR::K::: Hbo0075 IEA::Q::Y::::QG:ES::-:R::EN:Q:V:LD::::::::A::KQN::V:Y:E:::K: consensus AQRERYA--- #oth 1743647333 VNG0858 :HS:S:D::: Hut1222 :N:QVPPTRR Hut2373 :SV::P:TS: NP2230A :::ADRS::: rrnAC0415 :E:RQQ:AQS Hmu1374 :T::AA-::: hla1774 ::::::EGRQ HQ1869A FEA:T:N::: HVO_1474 :RQ:T:N::: Hbo0075 :K::Q:Q:::