| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2880 | NP0030A | VNG2168 | Hut2210 | rrnAC2755 | Hmu2835 | HQ3066A | HVO_0285 | Hbo1198 | Hbo3588 | hla0686 |
| 1639 | NP0030A | 2936 | 1451 | 1404 | 1415 | 1458 | 1420 | 1417 | 1485 | 1394 | 1474 |
| 1940 | VNG2168 | 1451 | 2851 | 1648 | 1734 | 1574 | 1704 | 1668 | 1700 | 1584 | 1660 |
| 2121 | Hut2210 | 1404 | 1648 | 3064 | 1966 | 1949 | 1799 | 1805 | 1815 | 1539 | 1688 |
| 2066 | rrnAC2755 | 1415 | 1734 | 1966 | 3067 | 2151 | 1742 | 1712 | 1825 | 1616 | 1644 |
| 2097 | Hmu2835 | 1458 | 1574 | 1949 | 2151 | 2926 | 1641 | 1769 | 1785 | 1652 | 1705 |
| 2183 | HQ3066A | 1420 | 1704 | 1799 | 1742 | 1641 | 2876 | 2067 | 2114 | 1822 | 1730 |
| 2304 | HVO_0285 | 1417 | 1668 | 1805 | 1712 | 1769 | 2067 | 2866 | 2187 | 1920 | 1894 |
| 2316 | Hbo1198 | 1485 | 1700 | 1815 | 1825 | 1785 | 2114 | 2187 | 2889 | 1871 | 1833 |
| 2079 | Hbo3588 | 1394 | 1584 | 1539 | 1616 | 1652 | 1822 | 1920 | 1871 | 2919 | 1970 |
| 2102 | hla0686 | 1474 | 1660 | 1688 | 1644 | 1705 | 1730 | 1894 | 1833 | 1970 | 2928 |
438 symbols consensus -----------------MRGFRIGSAFGIPIQLDLTFLLVLPLFAWLIGSQVGQLVELLN #oth 11111111111111112112111.2221..12.13.1.11..11.32.132335525441 NP0030A ::::::::::::::::MFKS::V::IAD:::K::I:L::I::VL:F::::GM:EA::AFE VNG2168 ::::::::::::::::::::::::RV:::::K::V:::::::V::Y:::T:LEVW:ST:: Hut2210 :::::::::::::::::::R::::::::::::::::::::::::::I:::::::S:::M: rrnAC2755 MAVPPRGLKTVPRQPPD::R::::::::::::::::::::::::::I::T:IE:TT:::: Hmu2835 :::::::::::::::::::R::::::::::::::::::::::::::I:::::EPT::::: HQ3066A ::::::::::::::::::::I::::::::::K::I::::I:::::::::NDIA::TGIV: HVO_0285 ::::::::::::::::::::I::::V:::::K::::::I:::::::::::D:TN:AAIV: Hbo1198 ::::::::::::::::::::I:::RV:::::::N:::::I::::::::::D::E::QVI: Hbo3588 ::::::::::::::::::::::V:::::::VR:NW:::I::::::VF:AWDIAE::VVI: hla0686 ::::::::::::::::::::IK::TVL:::VR:NW:::I::::::Y:::::::MIA:VM: consensus DL-FGAGID-PAALTAGSLPWVLGAAAAIGLFTGVLLHELGHSLVAMRYGYEIDSITLWL #oth 4513323331344144.543.3..432.2...51.11..1..13..32.113.31....1 NP0030A Q-:I::AFES:EL:V::WT::L::FV::V:::VC::::::::AA::RH:D:G:A:::::: VNG2168 GAP:A::L::AT::::::VR::::::::V:::V::V:::::::V:::::DFT::A::::V Hut2210 :I:W::::P:VGP:AT:Q:::::::T::V::::::V:::::::V::::::FP:S:::::: rrnAC2755 GT:LN::L::V:V::D:A:V::::IG::L::::::V::::::::::I:::FP:::::::: Hmu2835 R-:::GNL::::V::T:L:::L::I::::::::::V::::::::::I::::P:E:::::: HQ3066A :V:::SA:V:ADP::T::TQ:I::::T:::::IC:::::F:::::::Y:::T:::::::: HVO_0285 :::::ST:::G::IS:::MQ::::S:::::::A::::::F:::::::::::::E:::::: Hbo1198 E::::SA:::A::::S::I:::::S:::::::LC::F::F:::::::H:::::::::::: Hbo3588 Q:::::TM:::DQ::G:N:Q::::L:S:L::::::::::F::::::L::::::::::::: hla0686 EA::S:::::::::G::LT::A::L:::L:::G::::::F:::I:::::::::E:::::: consensus FGGVASFTEMPEDWKQELVIAIAGPVVSVALGVVSYVGFVL--LPSGQA--------SVR #oth 1..1.22523..4.42116..21..2..12214422422552221636624111133333 NP0030A L::::RPEKQ::Q:NH:FW:::G:::::::::IGC:LVYGFAGAEPV:SVLGVLTAD:L: VNG2168 L:::::L:DQ::E:D:::C::L:::A:::::AA:A:GVLAV:::::SLD::::::::T:: Hut2210 :::I:QLD::::::::::F::L:::I:::::AGL::A::L:::V:T:D:VG::::IA::K rrnAC2755 :::I:QLS:::::::::::::::::I::I:I:A:CF:A:QI::::::AGTI::::VE:T: Hmu2835 :::I:QLD::::::R::FL::L:::::::LV:I::L:::::::V:::TTTF::::A:A:: HQ3066A ::::::::::::R:QES:I::V:::I:::GI::IA:I::ITVP::GSLE::::::::PAK HVO_0285 :::::R:K:I:::::::FT::V::::::::I::A::A::L:::::ES::::::::::PAQ Hbo1198 :::::::A::::::R::::::V:::I:::::::I:F::::V::::AT:G::::::::::K Hbo3588 L::::::::F::N:RH:::::::::::::L:::G:::A:IS::::PSVD::::::::A:: hla0686 L::I:::::F:::::H:FW:::::::::::V:L:C:GV:::::A:L:SN::::::::A:L consensus FVLGYLALMNIALAVFNMLPGFPMDGGRVLRALLARTRPHARATQIAAEVGKVFAFLLGL #oth .22....13.33..2..1..1..1....11....1.322213..35.111..5..33211 NP0030A :LF:::::L::V::A:::::A::L:::::M::::G::::FTE::KT:VA:::F::I:F:I VNG2168 ::F:::::::L:::A::L::::::::::::::::::::TF::::K:::::::L:::V::I Hut2210 :L::::::::F:::I:::::::::::::::::::::N::F:Q::::::::::L::L:::: rrnAC2755 :I::::::::::::A:::::::::::::::::::::R:SY::::T:::::::I::VF::: Hmu2835 ::::::::::V:::::::::::::::::I:::::::SN:Y::::E:::::::G::I::A: HQ3066A ::I:::::T:VL:::::::::::L::::::::::::::S::::::::::::::::::::I HVO_0285 ::::::::V:VS::::::::::::::::::::::::N::::K:::M:::::::::::::: Hbo1198 ::::::::T::L::::::::::::::::::::::::R:S:::::KL::::::M::::::I Hbo3588 ::F::::IL::V::A::L::::::::::I::::::::Q:::K:::Q::A:::::::G::: hla0686 ::F:::::L::V::::::::A:::::::::::::::NQ:::Q:::R::AI::::::FM:: consensus FGLFT-FNLFLVALAFFIYIGASGEAQQTVMKAAFEGVTVADVMTPAEDLDTVDEDTSVA #oth 4.11733242.222...1.11.12.212.323.1.3113.3.1..4235151.4754223 NP0030A :::LM:::P::::I:::V::A:AA:GR:::LE:::R::R::::::::NEVR::ETTATLD VNG2168 A::LS:::VI:IGV::::::::A::::R:A:N:::::::::::::::S:VH::AATA::: Hut2210 ::::GGGG:::::I:::::::::S:::M:T::::::::S:R::::::DRVQ:::P:L::: rrnAC2755 ::I:VLG:I::AG:::::::::A::SR::S:R:::::::::::::::DHVT::AD:M::R Hmu2835 ::::PP::PL:IG:::::::::A::SR::::R:::::::::::::::DRVT:::P::K:R HQ3066A V:::A:-::::::::::::::::S:::::::::::D::::G:I::ERS:::V:EQNV::: HVO_0285 ::::-::::::::::::::M::::::::::L::T:QD:V:R:I::GR:N::V:::K:::: Hbo1198 ::::-:Y::::::::::::M:::S::::::::::::D:::R:::::R:K::V::IR::IS Hbo3588 L:::::-:W::IV:::::::A::::::::TI:::::DI::S::::SE:N:E::S:E:TIS hla0686 I::::::Q:L:IV:::::::A::::::::TL:::::D::::::::RR:::H::TG::::: consensus ELLDRMFEERHTGYPVVRNGRLVGMVTLDDARAVREVERDAYRVADVMSTELTTISPDAD #oth 31253.141..1.1..5431631.3...3.11415311.21331511.241362261222 NP0030A AI:::::::::::::::EG:K:::I:::A:I:N:HPEK:SET:::::::ED:EAV:::TE VNG2168 D:M:S:L:H:::::::F:DATA::::::::::S::A:::::M:::::::DDVY::PGS:: Hut2210 ::MEL::R:::::F:::DS::VL:L:::E::::::::::E:F:TEE::T:D:R::H::EN rrnAC2755 ::IQT::R::::::::K:S:EV::L:::E:::::Q::::E::T:G:::T::II::::ET: Hmu2835 ::IRT:::::::::::E:::EI::L:::E:::::::::::::T:G:I:T:::IAVA::E: HQ3066A T::E:::T:::::::::D::G:::V:::::::S:E::::E::::S:::TPDV:::N:::: HVO_0285 :::E:::V::::::::L:::D:::::::::::G:K::::::F::D:I::D:::::T:::: Hbo1198 :::::::Y:::::::::Q::::::::::N:::T:D:::::::I:K::::G:::::::S:: Hbo3588 D::A:::T:::I::::M:::D::::::::::G:IE:::::::::E::::::PH:T::::: hla0686 D:MS::::::::::::LHG:N:::::::E:::S::D::::::Q:::::E::VVGVG:E:: consensus AMDALQRMQENGVGRLPVVDEAGELVGLISRSDLMTALNIIQSRGSPTA---RS------ #oth 111.356122231...3.42352423.121.1.212.23112253674432175111111 NP0030A ::::MRQLAQHS::::V:T::F:N:A::LT::::V::M:VV:EKR----:::L::::::: VNG2168 :T:::DAL::HS::::L:::AD::M::::T:::::D:FG::::T:AA--:::V::::::: Hut2210 ::T::T::::HNI:::I:M-:DD:F:::LT::::::::S::KES:RD::MSG:ALNGGVP rrnAC2755 V::::TSL:Q:S::::L:T::D:SFE::LT:::I::::S::K:SSDY::IG:E::::::: Hmu2835 V:T::SELEG:N::::I:L:::DAFR::LT:::I::::T::KENPDYR::::DD:::::: HQ3066A ::::M::::::DI:::::I-:NT::::::::::::::::::K::::Q::L::TE:::::: HVO_0285 ::::IAL:::R:::::::::::::::::V:::::V::F:::R::::LD::::MP:::::: Hbo1198 ::::ITT::Q::::::::::DE::::::::::::V::::::::::PS:SI:::P:::::: Hbo3588 ::T:F:Q::Q:::::::::ND::D:::I:::T:M:R:F:V:::G:::RML::Q::::::: hla0686 ::T:::T:::::::::::::RSD::::::::::::::F::::TG:T:SLISG:R:::::: consensus -----RGEAGLPERR--- #oth 111114454655665412 NP0030A ::::::::EAA:R--::: VNG2168 ::::::ESLD::S:P::: Hut2210 TTMSHDER::QDD::FED rrnAC2755 :::::ET:TVR::S:IER Hmu2835 :::::E:::TVF:PQT:: HQ3066A ::::::SSTS::NA:::: HVO_0285 ::::::SD:::AQL:::: Hbo1198 ::::::DPTDVI:P:::: Hbo3588 :::::H:ASEAR:LAQ:: hla0686 :::::Q:AE:G:GVF:::