| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1489 | HVO_A0038 | hla0194 | VNG2121 | HQ3231A | HVO_0330 | Hbo1149 | NP0986A | Hut2726 | rrnAC3070 | Hmu2759 |
| 874 | HVO_A0038 | 1561 | 787 | 724 | 723 | 673 | 727 | 796 | 764 | 734 | 754 |
| 1069 | hla0194 | 787 | 1764 | 825 | 844 | 923 | 902 | 881 | 905 | 833 | 887 |
| 1002 | VNG2121 | 724 | 825 | 1529 | 853 | 864 | 878 | 878 | 874 | 845 | 877 |
| 1050 | HQ3231A | 723 | 844 | 853 | 1502 | 948 | 1038 | 850 | 836 | 867 | 874 |
| 1023 | HVO_0330 | 673 | 923 | 864 | 948 | 1564 | 1115 | 882 | 804 | 811 | 795 |
| 1066 | Hbo1149 | 727 | 902 | 878 | 1038 | 1115 | 1423 | 909 | 858 | 861 | 807 |
| 1095 | NP0986A | 796 | 881 | 878 | 850 | 882 | 909 | 1566 | 1006 | 958 | 1004 |
| 1114 | Hut2726 | 764 | 905 | 874 | 836 | 804 | 858 | 1006 | 1542 | 994 | 1054 |
| 1060 | rrnAC3070 | 734 | 833 | 845 | 867 | 811 | 861 | 958 | 994 | 1610 | 1097 |
| 1113 | Hmu2759 | 754 | 887 | 877 | 874 | 795 | 807 | 1004 | 1054 | 1097 | 1630 |
261 symbols consensus ----MSSWKRDFASGLIVLVPLLVTLYVLAWLYNRIASIPL-------ILPALQAPL--- #oth 1235331.11.2....1123.12.233126321371533234563322636566514111 HVO_A0038 MPGRLTT:RG:A::::V::A::::IA::VI:I:SVL::F:-:::::::V:N:V:L:I::: hla0194 ::::::T::::::::::::A::::L:L::Q:I:QY::::::IEGLQPA:I::PLE:I::: VNG2121 :::::G:::::::::::::::IV:::::IY::FGLLSN:T:FTQ::::LTDTQYQAV::: HQ3231A ::::::::R:::::::V:V:::::I:S:VNY::S::V:L:-:::::::FVRR::E:F::: HVO_0330 ::::::::R:::::::V:::::I:I::I::FF::G:T:::YVATVL::STDGTVT::::: Hbo1149 ::::::::R:::::::V::::I::I::::SI:::S:IEL:-::::::::IKG:HQ:F::: NP0986A ::MLS::::::I:::::::::::::A::V:FI:QA::NL::FEE::::A:GG:PVAV::: Hut2726 :::MA:T:::::::::::IT:::::VM::L:::::LEG::-:::::::-::VEP:::::: rrnAC3070 :MASST:::::::::::I:L:::::I::ILY::SIL::AAVIPAIDGEL:A::GL:S::: Hmu2759 ::MASAT::::::::::I:L:::::V::::Y::GIL::L::ANV:::::T:ERL:::LNI consensus --------------RVFITLAVFVLLVLSVGYLMRTTAGRLLESALDAAMNRLPGLRVVY #oth 1111112122223422543223.4321122.11...13.324.642.532.32.32.11. HVO_A0038 :::::::::::::V::A:V::G:AG:::VT:S:::::T:TIV:AT::TLV::I::::I:: hla0194 :::::::::::::S::I:AM:::ATV::A:::F::::F:::A:::V:G:I::I:A::::: VNG2121 ::::::::::::::--AA:::::::I:F::::::::A::SI::ALI:YV:::::V::I:: HQ3231A ::::::::::::::GF:AAII:::::IF:::::::::::::I:NY:::::::V:LI::L: HVO_0330 ::::::::::SEALGFI:SIII:L::::::::::::::::::::G::::::KV:LV:I:: Hbo1149 ::::::::::::::GF:VAII::MM::::::::::::::::F::GI::::::::LV::L: NP0986A ::::::::::::::::VV::VL:::::::::::::::::D:::E:::NV::::::::::: Hut2726 ::::::::::::::::GL:IV::I:::FA:::::::AV:SIV:D:I:DL::Q:::::::: rrnAC3070 ::::::GTSSVELA:::T::II:I:I:F:I::::::AF:DIV:R:I:D:::HV::::::: Hmu2759 SAEHQLMTQLVTFV::LT:::::::::F:I::::::AF:DVI:Q:::DM::QV::::::: consensus NASKMAVETALS-GTDELQTPVKLETWPGMRMTAFKTGKTTEDGRDVLFMPTAPNITTGF #oth ....112..1131.122114..22.2.2.211.1.2..2317..1322.2.........1 HVO_A0038 :::::GI::VVD::::H:R:::RV::::::Y::G::::NRAS:::::V:I:::::::::: hla0194 ::::L:I:::V::::::::S::YI:::::I:::::R:::K:R::KI:::::::::::::: VNG2121 :::::::::V::D::G:F:Q::RV:P:::::L:::::::KAP:::E:V:::::::::::: HQ3231A ::::L::::::::::E:::::::V:::::::::::::::::V:::E:::::::::::::: HVO_0330 ::::L::::::T:::ED::K::R::::::I:::::::::::K::KVIV:::::::::::: Hbo1149 ::::L::::::T:::ED::K::R::V:::I:::G:::::::Q:::E:I:::::::::::: NP0986A ::::::::::V:::::D::::::::::N::::::::::QQ::::::M::L:::::::::: Hut2726 ::::::A::::::::::::A:::::::D:::::::L:::::::::::::L:::::::::: rrnAC3070 ::::::::::VG:::ED::A:::::V:D::::::::::Q::D:::E:::L:::::::::Y Hmu2759 ::::::::::V:::A::::::::::V:D:L::::::::QQ:::::::::L:::::::::Y consensus VIEVEPEDYEETDERVEEALTRILSAGFGEADRN-SIQIPVEEE---------------- #oth 12.1113231.21.41.1111.21.1..11746644343344356243221111111111 HVO_A0038 :V:L:T::VT:L::ST:D::I::I:C:::::PQP:--DA:N:DDRSS::::::::::::: hla0194 :::::::RI:::G:T:::GM::V:::::A:SAH-:--:V:::::RPPEGTTGQPGGVGGV VNG2121 :M::::::L:::::G::D::::V:::::::N:DS:--EVAID:LLP:::::::::::::: HQ3231A I::::TS:IT::::T:::::::T:::::ADE:::A:TESATGASFST::::::::::::: HVO_0330 :M::D:::I:::G:K:::::::V:::::A:Q:HVDEFN:E:T::S::::::::::::::: Hbo1149 :M::::::LT::::::::::::::::::A:DESVSA:D:D:::::::::::::::::::: NP0986A ::::::DR:T:L::S:::::::V:::::::RNTQ:::::D:T:GPPTAKT:::::::::: Hut2726 :V::::DR:T:I:::::D::::::::::::S:EK::::VD::DVVSEVGG:::::::::: rrnAC3070 :V::::HR:::I:::::::::::::::::DT::SNATP:::AD::::::::::::::::: Hmu2759 ::::::DA:::::::::D:::::::::::D:EE::HT:V:AGLV:::::::::::::::: consensus --------------DDDSDDD #oth 111111111111565568673 HVO_A0038 ::::::::::::NAPPPTTT: hla0194 RTDGTPGESDRPST:GGGEG: VNG2121 ::::::::::::ED:::ENEE HQ3231A ::::::::::::TENI::S:N HVO_0330 ::::::::::::GDGRVPSNE Hbo1149 ::::::::::::::------- NP0986A ::::::::::::EKRPS::SE Hut2726 ::::::::::::SP:GER:A: rrnAC3070 ::::::::::::::-::LA:: Hmu2759 ::::::::::::::--:A:::