Home |  Text search
9 genomes BUD0138 10 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1		 b Hma
Haloarcula
marismortui		 f Hvo
Haloferax
volcanii		 g Hbo
Halogeometricum
borinquense		 h Hmu
Halomicrobium
mukohataei		 i Hut
Halorhabdus
utahensis		 j Hla
Halorubrum
lacusprofundi		 q Nph
Natronomonas
pharaonis		 x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1034

rrnAC0527

HVO_0958

Hbo0490

Hbo3225

Hmu1485

Hut1631

hla0081

NP2136A

HQ1499A

Pairwise sequence scores
Consensus score1083 Hbo3225 HQ1499A VNG1034 hla0081 NP2136A HVO_0958 Hbo0490 Hut1631 rrnAC0527 Hmu1485
480Hbo3225 1031 306 206 376 363 371 362 361 374 363
498HQ1499A 306 1030 171 340 342 394 472 384 400 380
498VNG1034 206 171 1060 376 330 401 282 314 434 420
691hla0081 376 340 376 1124 597 533 466 465 540 544
694NP2136A 363 342 330 597 1101 571 485 478 529 524
749HVO_0958 371 394 401 533 571 1073 619 504 561 534
666Hbo0490 362 472 282 466 485 619 1145 494 475 484
639Hut1631 361 384 314 465 478 504 494 1156 588 534
763rrnAC0527 374 400 434 540 529 561 475 588 1087 788
766Hmu1485 363 380 420 544 524 534 484 534 788 1078 

164 symbols
consensus       ---------MAVLDTVMYTVHLVFAALWTGSVLFVALAVLPTARDGNIDAAPLESIVGRL
#oth            11122333225654542643.35312212.222232421213145353255324443431
Hbo3225         :::::::::---MLDIVM:I:T::::::::GT:V::G::I:A::SESLSRDG:TF:AR:F
HQ1499A         :::::::::-------:VII:T:AG:I:V::ITCMTVVI::::AT:D:::T:::R:::::
VNG1034         :::::MQSA:::IE::V:A::M:::G:L::::::T::T:--PRIAD::STSVR:T:A:T:
hla0081         ::::::::::NA:NP::WS::VG::V::::G::::::::::P:LR:E::GSA:G:::D::
NP2136A         :::::::::-M:V::::::L:TA:G:::A::::::V:::::L:MNAK::PGAFA:V:SK:
HVO_0958        :::::::::::LI::::A:L:::VGG::::::::F:::::::::A:::R::AF::V:S::
Hbo0490         :::VKDTVADMI:::::T:A:VLTG:::V:::V:::GV:::::L::SL::E:::TFADK:
Hut1631         MWIEAVRTS:TFA:V:VAGL::L:::V:A:::V:MTV::::A::::VL:SE::ARLTTQF
rrnAC0527       ::::::::::S:VNAAVFG:::I:::::A:T:::MTY:I::::MN:DSSPG::SA:T:K:
Hmu1485         ::::::::::SE:LAGI:A::MT:::::::::V:::I::::::M::EGSP:::STMI:K:

consensus       KWISRASAVLLLLTGGHL-AGTRYTAES-LTGTGRGHLVLAMLVLWFVLAGLVEVGRSRL
#oth            67421423333321..1211215.25341.43343.221221231.23212231214422
Hbo3225         WYLTV::TL:::FS::::::::I::::T::QTM:::N:::::VG::L:::IVLFF:YRQ:
HQ1499A         MAL::SGV::TT::::Y:::::T::T::::LN:AN:N:IV:A:LM:VIF:IF::I::RK:
VNG1034         :Y:::G::T::V::::YMFTIAG::DGGK::S::T::A:IG:V::::L:T::T::AG::I
hla0081         R::T:IA::AF:AS:::M::::L::FD:::::SA::::::T:IA:::LIT::::::SGK:
NP2136A         Q::T:I:::V::A::::::::::::::R:::::TP:YV:::::A::LL::AV::I:SA:A
HVO_0958        TMW::GASLVMFA::::::::::::VD:::F:S:::::::G::A:::::T:::::::V:A
Hbo0490         VFG:::AS:IMFF::::::::::::FDL::MNES::::::::::::L::TA:::I:::::
Hut1631         :R:A::G:IVT::::::Q::A:G:-M:T::FSST::::::G:V:::LA::A:S:I:AA::
rrnAC0527       RTV:::::T::F::::::::A::::::::::::::::::IT:I::::I::::::::A:K:
Hmu1485         :L:::T::L::F::::::::A:Q:G:SG:::::F::Y::V::::::::::::::::S:K:

consensus       TDGLDEKKVREPARNARPFFLGAAVVAVLLLVDAGLLAGP----
#oth            53135343423224313332321232212.2221.415567432
Hbo3225         :NS:S::SAVAA:TK:::W::::SA:SIA:::V::V:---::::
HQ1499A         VS::QA:R::A:VAAS:RS:QL:TG:SI:::::I:::TANMII:
VNG1034         ER:----------DD:TT:LY:G::L::A::L:::WIV:YPYL:
hla0081         :S:::AG:L:::::D:K:::Y:::GLS:A:IIT:::::S:TLF:
NP2136A         NR::A:D:I::::::::::Y:LG::F::G:::T::::GE:SLIL
HVO_0958        K:::A:::::T::EK:A::Y::::L::::::::::::LN-::::
Hbo0490         V:::R::R::T::E::ADI:RA::::GI::::::::::SGITLY
Hut1631         :::T:QQ:::T::AD::::::A:S::::A:F::::A::A:W:::
rrnAC0527       S::F:QQ::::::::::::L:::SL:SI:::L:::AIL:LY:::
Hmu1485         :::F:QQ:L::::::::::::::T:::::::L:::IIL:I::::