| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4698 | Hbo3710 | VNG2620 | hla0325 | HQ1364A | HVO_0415 | Hbo1088 | NP0930A | Hut2145 | rrnAC2267 | Hmu0102 |
| 882 | Hbo3710 | 4911 | 778 | 737 | 684 | 754 | 750 | 763 | 741 | 704 | 727 |
| 3733 | VNG2620 | 778 | 4646 | 3320 | 3380 | 3401 | 3396 | 3426 | 3357 | 3429 | 3351 |
| 3866 | hla0325 | 737 | 3320 | 4724 | 3552 | 3749 | 3700 | 3410 | 3411 | 3434 | 3420 |
| 3841 | HQ1364A | 684 | 3380 | 3552 | 4709 | 3745 | 3856 | 3381 | 3473 | 3431 | 3376 |
| 3912 | HVO_0415 | 754 | 3401 | 3749 | 3745 | 4681 | 3898 | 3428 | 3498 | 3428 | 3430 |
| 3949 | Hbo1088 | 750 | 3396 | 3700 | 3856 | 3898 | 4687 | 3439 | 3508 | 3536 | 3452 |
| 3912 | NP0930A | 763 | 3426 | 3410 | 3381 | 3428 | 3439 | 4694 | 3497 | 3582 | 3506 |
| 3919 | Hut2145 | 741 | 3357 | 3411 | 3473 | 3498 | 3508 | 3497 | 4671 | 3688 | 3601 |
| 3983 | rrnAC2267 | 704 | 3429 | 3434 | 3431 | 3428 | 3536 | 3582 | 3688 | 4686 | 3827 |
| 3923 | Hmu0102 | 727 | 3351 | 3420 | 3376 | 3430 | 3452 | 3506 | 3601 | 3827 | 4667 |
693 symbols consensus -----------MTDS-PEVTRLF--GGPGSGKTTALLDRVEEILEDDDVDVRDILVVSYT #oth 111111111112424555221.111.1..1...111113.222143212322.111.1.1 Hbo3710 MPMDLEDIEITGIEDV:VTES:AYH:P::T:::SKSAA::AKLIQ:H:YGIE:VAW:T:R VNG2620 :::::::::::::::E::::::::::::::::::::::H:::::SE:::S:::::::::: hla0325 ::::::::::::::-::T:::::::::::::::::::::::G::D:G:A::::V:::::: HQ1364A ::::::::::::S:AN::I:::::::::::::::::::E:DK::DA:::SI::::::::: HVO_0415 ::::::::::::SE:DVT::::::::::::::::::::K::::::Q:G:TI::::::::: Hbo1088 ::::::::::::S::DAK::::::::::::::::::::::::M::::::TI::::::::: NP0930A ::::::::::::A:::TH::::::::::::::::::::::D:M:-::G:::N:::::::: Hut2145 :::::::::::::EPTSK::::::::::::::::::::::::L::::::::::V:::::: rrnAC2267 :::::::::::::::TT::V::::::::::::::::::::D:L:::::::F::V:::::: Hmu0102 :::::::::::----:--:V::::::::::::::::::::::L:SE::A::::::::::: consensus RAAAAEVRERLAERLDISPRSLRGN-------VCTMHAKAYELLNLSRGDVVGESDKEEF #oth .11.11212...211243.22.311111111113.1..1.1111311111.12241132. Hbo3710 :SL:RDTLA:::SWDI:D:SE:ENPSDGATRYIG:A::V:NRCASIGE:-::EPWHRSD: VNG2620 ::::::::::::::::MN:::::::::::::::A::::::::::G:::::::::::::A: hla0325 ::::::I:::::::::::::::Q:::::::::::::::::::::D:::::::::D::::: HQ1364A ::::::::::::::::::::A:Q::::::::::A:::::::::::::::::IDD:::Q:: HVO_0415 ::::::::D::::::::N::::K::::::::::S::::::::::S:::N::::::::Q:: Hbo1088 ::::::I:::::::::::::A:Q::::::::::A::::::::::D:::N:::::K::K:: NP0930A ::::::::::::::::CT:K::::::::::::::::::::::::::::::::::QH:::: Hut2145 ::::::::::::::::V:::::K::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:: rrnAC2267 ::::::I:::::D::GL:::A:::::::::::::::::::::::::::::::::D:::A: Hmu0102 ::::::I::::::::::N::::K:::::::::::::::::::::D:::::::::::::D: consensus CEEYGIEF--EDEYEGARRRTARSTTLGNKIIATSQWLQRTRRDVADWYDVPFQWDDEEV #oth 1122.3211111333223112111112.112111111.1113111211121114123121 Hbo3710 ::KR:MQ:WTSEPW:DSA---------:KLLFRVLDY:ANANTTPE:---------KAAL VNG2620 ::::::S:::::::ASGS::::::::::::V::::::::::S:::SE::::::R:::::: hla0325 ::::::::::::QHG::G::::::::I::::::::::::::E:::S::::::::::V::: HQ1364A :::::V::::::K:G::G:::::::::::::::::::::::::::::::E:::::NV::: HVO_0415 ::D::V::::::::G::G::::::::I:::V::::::::::::::S:::::::::NV::: Hbo1088 :::::V::::::::G::G::::::::I::::::::::::::::::::::::::N:NV::: NP0930A :::::L:::::::NKS::::S::::::::::::::::::::E:::::::::::::::::: Hut2145 A::::::Y::::Q:::G:::::::::I::::::::::::::::::::::::::K:N::K: rrnAC2267 :::F:::Y::::::::S:::S::::::::::::::::::::::::::::::::K:::::: Hmu0102 :D:F:L::::::::::S:::S:::::::::V::::::::::::::::::::::K::E::: consensus RLPPEIDDNAQEGNKYTPTWPSDDDRIDIPEAIRAWRTYKGENDLVGFADMLERVKQRSL #oth .11.23.221131111111.122121411122122.15...223121.11..1.15.121 Hbo3710 :EC:HT::-------LRDH:QG-----::V::WYE:ED:::QMNIID:HE::K:PL:EGE VNG2620 :::::::E:::V::::::::::S:E:H::::::::::::::::E:::::::::::E:::: hla0325 :::::E:P::::::::::::::::E::::::T:::::G:::D:::::::::::::A:::: HQ1364A ::::DV:P:::::::::::::::::::HV::V:Q:::A:::DHG:::::::::::::::: HVO_0415 :::::V:P:::::::::::::::::::::::::::::A::::HG::::::::::::::A: Hbo1088 :::::::P::::::::::::::::::::V:GV::G::K:::D:G:::::::::::R:::: NP0930A ::::::::E::T::::::::::::::V:::::::::::::::H:I::::::::::Q:::: Hut2145 :::::::E:::T::::::::::::::::V::V:::::S::::HG:::::::::::::::: rrnAC2267 :::::::::::T:::::::::T::::V:V:SV::G::::::::::T:::::::::A:::: Hmu0102 :::::::::::T:::::::::G::::L:V::::::::::::D:::T:::::::::::::: consensus LPNVDYLVIDEFQDITTLQYDVYEEWKPHMERVLIAGDDDQVVYAWQGADPNLLLDEDVD #oth 2.3122.2...11.1.2.1131132.433335211...11...1.11..1.311113433 Hbo3710 S:GRPI:::::YH:V:A:MDALFRS:MEDA:I:IV:::PH:::N:YD::S:AFFE:L:LP VNG2620 ::::E:::::::::::S:::::::::R:::D::::::::::::::::::::R::::TT:T hla0325 V::::::I::::::::::::N:F:::E:::RK:::::::::::::::::::D::::T::: HQ1364A V:Q:::::::::::::::::::::K:RSSVD:::::::::::::::::::::::::ANR: HVO_0415 V:::::::::::::::::::::::::::::RG::::::::::::::::::::::::AER: Hbo1088 V::::::::::::::::::::::Q::L::L:G::::::::::::::::::::::::AER: NP0930A :::::H::::::::::::::G::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::: Hut2145 ::S::::A:::::::::::::::::::A:VDHA::::::::::::::::::::::E:E-G rrnAC2267 :::::::I:::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::D:::E:V:T Hmu0102 ::::E::I::::::::::::::::::::R:TKI::::::::::::::::::D:::E:::: consensus EDVVLPNSYRLPSRILNVVNREIRHIDKRQEKDLHPRKEGGRVEAVQSPSMLDLVRNVRR #oth 5122.1111.1.152142124223112211212141.121.6.23271.11221311225 Hbo3710 T-:L:DTT::V:EEHWALAT:MLADAHTPPAVT---:DGR:::NDIN::RFEHSEE:GWV VNG2620 D:Q::::::::::QV:EI:QQ::S:::T::::::K::::::S:::ID::::::::::::: hla0325 :::::::::::::E::::::A::::::::::::::::::::S:::I::::::E::::::Y HQ1364A :::::::::::::KV:S:::Q:::::::::::::::::Q::T::GIE:::::::A::::H HVO_0415 N:EI:::::::::NV:::::::::::::::::::K::::::A::::E:::::E:A::::Y Hbo1088 ::::::::::::::::D:::E::::::::::::::::::::V::G:A:::::::A::::Y NP0930A D::::::::::::::::I::TQ:S::::::D:::K:::Q:::::::S::::::::::::M Hut2145 :::I:DT:H::::E::E::Q::VT:::Q::::N:S:::Q::N::::RN:::::::::::G rrnAC2267 Q:E:::::::::::::::::::V:::E:::::::N::::::::::::N:::F::S:::T: Hmu0102 V:E::::::::::S::::::::V:::E:::::::N::::::E:LPMLN::::::::EI:: consensus TVEEDD--GT------------VMVLFRARYQMFQFIDEFIDEGIPFSALTDQRMW---- #oth 1226313321111111111111313.1.1.1.21213111236.1.135211211.1111 Hbo3710 NLPGR:TP:SPGWICEKFGREETLF:T:T:M:ADGVGAALEAA:::YRSQPELHG:NTEE VNG2620 :::AT::DD:::::::::::::::I:::::::L:D:V::::GD::::R:::::::::::: hla0325 ::DD:E:::S::::::::::::::C:::::::::D:::::::H::::TM:::G::::::: HQ1364A :::RS:GEE:::::::::::::L:I:::::::::::::::LPL:M::::::::::::::: HVO_0415 :::K:E::::::::::::::::::::::::::::::::::LPS:::::T::::::::::: Hbo1088 :I:::EDDES::::::::::::I:::::::::::::::::LPL:::::V::::::::::: NP0930A :L:::::::S::::::::::::::::::::::::::M::::G:::::VS::::::::::: Hut2145 ::::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::RTM:::::::::: rrnAC2267 :I:QS:::E:::::::::::::::::::::::::::::::::N:::::C::::::::::: Hmu0102 ::DD:E::::::::::::::::::I:::::::::::M::::G:::::TC::::::::::: consensus TDRLTQYVNAIEALDADEPLN----------------------GLEARRLADMLQDSAFG #oth ..122412412123243243311111111111111111111113.22211221.321111 Hbo3710 ::IRLAVH::LQKIEGYS:A:FRYGGNKAFGEYTGNNKNPADIS:KNSEA:AL:EATSAH VNG2620 ::::Q::I::V:::ET:DDV::::::::::::::::::::::::::::::M::::::::: hla0325 :::VQD::S:::KS::GD:V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1364A ::::::::RG::Q::R::T:T::::::::::::::::::::::::Q:::::::::A:::: HVO_0415 ::::::::R:V:::::E::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1088 :::::E::E:::K:ERE:NI:::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::: NP0930A ::::QG::D::::I:DG::ID::::::::::::::::::::::::Q:Q::GE::A::::: Hut2145 :::::D:::G::::A:::::T::::::::::::::::::::::A::G:::::::E:T::: rrnAC2267 :::::::::GL::VE:::::T::::::::::::::::::::::V::::::::::V::::: Hmu0102 :::::E::RGV:::::::R:S::::::::::::::::::::::V::G:::::::A::::: consensus TGE--RDDLFDALDERQEAAEVDDLTDIEFEPDVIREHAPFAPDPAAAADMLRK------ #oth 24111.123315212452472531124324353435423114144421411121111111 Hbo3710 DLDIT:S:AN:LVE:LRD-D:DGH::LR::DDY:TKSFWERYTAG:GSVNR:N:GPFGSG VNG2620 :ND:::S::RE:I::A:--G:ST:::ELT:PAEF::DYV::V:G:S:::::::::::::: hla0325 :H:::::EFY:F::D:E:::DA::ISL::VTT:ELDA:I::M::ANS:D::V:::::::: HQ1364A :K:::::A:::YI:DKK:::D:::::ELSI:::I:S:::::::NT:::G::::::::::: HVO_0415 :ND:::::::::I:D:::EVG:::I:N:::T:KE:KNF::::::SSS:S::V:::::::: Hbo1088 SN:::::::::YI::L::ETG:E::::L:V:L:::TD::::V::G:::G::V:::::::: NP0930A ::::::::Y:::::A:::TEG::::AQMTLPS:FVD:::::::G::::::::TR:::::: Hut2145 :::::::::::D:ED::::::T::::E::V:::L::D::::L:E:P:::::V:::::::: rrnAC2267 :::::::::::::E:ID:SH:DE:IA:::I::::VQ::V::L::S:S:G::::::::::: Hmu0102 ::D::::::::E:::IAD:S:K:::A:::MD::::::::::::::R:::::::::::::: consensus -VTSFQRRSVDAYFAGDYEGMDPDRVRVG--TIHSAKGREADHVFVATDLTEKVVEQMAA #oth 11232122234.1171415222142112111...11..1...1.1231111111111111 Hbo3710 SSGEREL:ALR:ALNRQDGPIS::SISCHAI:::AS::M:::D:V:YDGISNRILREIQV VNG2620 :::RY::::I::::E:::R::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::: hla0325 :::::::K:MG:::G:::::A::T:::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1364A :::::::K::E:::D:::G::::S:I:::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0415 :::::::K::N:::G:G::E:::S:::::::::::::::::::::M:::::::::::::: Hbo1088 :::::::K::E:::::E:Q::::N::::::::::::::::::::::S::::::::::::: NP0930A ::SN::E:::::::S:N:R::AA::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2145 ::::::EQTI:::::::::::::G:::L:::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2267 :::N::E:T:::::T:::T:::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0102 :::N::E:T:E:::H:E:A:::A:Q::L::::::::::::::::::G::::::::::::: consensus SVDD-EEVP--GVEEFTKHTDPVPTLTDNERRVFYVGMSRARERLVLLENLVDGAPTLPI #oth 3325155452235311145221214311..1.11..11...11..221221251111111 Hbo3710 NDES:----::---------------RR::Y:TW::AL:::KK::HVMRDGFAWTNSI-: VNG2620 TA:P::T::::DDV:::SK:S:::I:::::::::::::::::::::::QD::G::::::: hla0325 :I::PTD:D:::I:::::T:S:::V:::::::::::::::::::::IM:S:IS::::::: HQ1364A :::E:SA::::::D:::AR:::::I:::::::::::::::::::::::::::G::::::: HVO_0415 ::S::::LEAR:I::::AT:S:::LI:::::::::::::::::::IV:::::T::::::: Hbo1088 ::::::::S::::::::TS:::::I:::::::::::::::::::::I::::IK::::::V NP0930A ::EEP:A:::::A:::::RS:::::M:::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2145 T:ER:N:IDVPA:D:::::::::::::::::::::::L::::::::I:::::S::::::: rrnAC2267 T::Q:QGIEVP:M:::::::S:I::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0102 Q:EQ:NDRHVP:D:::::::::I::::::::::::::::::::::::M:::::::::::: consensus DVLLHNEPREEPAEELLDE-Q---ADAPAPEP- #oth 212.53162453634324541422354344651 Hbo3710 PEN:QAAA::AYQ:GHV:-:-:::G:L:GG:TA VNG2620 ::::YG:RTGQTLADA::-:-:::::T:VQI:: hla0325 S:::F::L:D:::Q::V::V:AE:LAV:E:::: HQ1364A S::::::T:H:SVDD::AAT:EESVP::E:DA: HVO_0415 S::::::I:::::QG:V:DA:E::LP::E::A: Hbo1088 S::::::V:DT:V::::E:A:T::G:::::::: NP0930A ::::ND::S::SLDVI:ERA:KRG:ELK:N--: Hut2145 ::::N:::S:D:EAV:ASIL-:::GEEA:AVH: rrnAC2267 ::::E:::SDRSI:Q:::D:-::::SETLAAD: Hmu0102 ::I:E::::PDSP::::I::-::::QE:L:T::