|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3936 | NP5004A | Hut2581 | hla0358 | HQ2544A | HVO_1706 | Hbo3130 | VNG0923 | rrnAC0907 | Hmu1587 |
2237 | NP5004A | 3949 | 1777 | 2046 | 1814 | 1974 | 1940 | 1850 | 1913 | 1804 |
2362 | Hut2581 | 1777 | 3944 | 1962 | 1899 | 1969 | 1968 | 1984 | 2048 | 2033 |
2759 | hla0358 | 2046 | 1962 | 3938 | 2235 | 2347 | 2284 | 2025 | 2150 | 2084 |
2874 | HQ2544A | 1814 | 1899 | 2235 | 3975 | 2942 | 3136 | 1995 | 2089 | 2037 |
3078 | HVO_1706 | 1974 | 1969 | 2347 | 2942 | 3910 | 3129 | 2100 | 2201 | 2172 |
3047 | Hbo3130 | 1940 | 1968 | 2284 | 3136 | 3129 | 3952 | 2107 | 2185 | 2135 |
2528 | VNG0923 | 1850 | 1984 | 2025 | 1995 | 2100 | 2107 | 3911 | 2316 | 2305 |
2800 | rrnAC0907 | 1913 | 2048 | 2150 | 2089 | 2201 | 2185 | 2316 | 3959 | 3042 |
2749 | Hmu1587 | 1804 | 2033 | 2084 | 2037 | 2172 | 2135 | 2305 | 3042 | 3970 |
555 symbols consensus MATEQRTARIREQTTGGDDRDDP---PLGLTVLSGAIAAAVVAPLAWLVLRAGEVGLARA #oth 14345255344467545454644112444.2321312233225.2411254353425531 NP5004A -M::::QSDESPPSGSIKE:I::::WMV::AL::AIL::L::S:ML:::WQ:TT:E:G:: Hut2581 :SR:G:VEDL::RFSRVP-GIGR::::SE::L:AA:::V:L::::G::F:EVFDL:-P:: hla0358 ---MSW:R:::DIL:D::::L--::::::::L::A:::GT::F::::::IE:VT:ERS:: HQ2544A ::::YQ:DTDTDTN::P:AA::ESSL::::::AA::V:::A:I:FI::LRTGSD::IKN: HVO_1706 :::::Q:G-----:G::::EQ--:::::::::A:::V:::::V::L:::RT:LN::F:E: Hbo3130 ::::::::TD---DR:P:EGT:A::::::::IA:::V:::::L::L:::KSSL::::SE: VNG0923 ::ARE:L::::SAVVS::-D:E::::G:S:A::A::V::F:SL:::G:LV::SNY::GHF rrnAC0907 :G:KD:YE:L:::A:TSERDSS::::HTL:A:V:L::SLLLL:::V:VF:::::IEF::: Hmu1587 :::GD:-D::A:::Q:ATTERSA:::SRV:SGVAV::TLL:LS:::::::::::MDAV:: consensus LELLTSPTTIEVLLNSLVLVALVTAASILLGVPLAYLTVRTDLPFRRFWTVVAALPLVVP #oth 441532541331231144.1431.441212...1.3..11...124.3111421...11. NP5004A YD:MF:LR:A:IT:::I::MVS::GF:::::::::V::::::::YP::::::::::::I: Hut2581 :::TLDSR:::I::R:VA:::I:::G:V:V:::I:L::A::::::A:LF::L:::::A:: hla0358 M:::F:SG:V:::::::L:M:G::VF::::::::::::A::::::::::S:::::::::: HQ2544A IG:I:R::::QI:I::A:::I:T:SICV:::::::::::::::L:S:V:::AVS::::I: HVO_1706 VA:V:R:A:V::F:::A:::T:::::C:G:::::::::::::::::::::::VS::::I: Hbo3130 :S:::R:::LD:FV::TI::::T:::C::::::::::::::::::::::::AVS::::I: VNG0923 :DVFADTSSLD::V:::S::G:::VGCV:V:::::V:::Q::::G::A::II:::::::: rrnAC0907 V:::::D::VS:T::T:A::TG::V::::I:::::I::AQ:::::K::::ITS::::::: Hmu1587 I:::::Q:::::TA:TI:::GS::LL:A:V:::::I:::Q:::::::::::TS::::::: consensus SYIGAFAFVSAFGPRGDLQRLLAPLGIEQIPEIYGLPGAVLVLTLYTYPYVFLTTRAALL #oth ..2..2111.1..22.52532122312232.4.2.15.131112.1....121.1..1.2 NP5004A :::::I::::M::SG:EIDS:FGM----T::R:D::W:::FII::::::::::::::::V Hut2581 ::L::L:VL::::TG:V:TSV:::V::::L:::S:FA::A:::::::::::L:::::S:: hla0358 ::V:::::::::::::EFHDV::::::DRV::::::::TI::I::::::::Y:::::::: HQ2544A ::V:::::::::::::GF::::S:I:::::::::::T:T::::S:::::::YI::::S:K HVO_1706 ::::::::::::::Q:AF::::::::::SL::::::::::::::::::::::I::::::K Hbo3130 ::::::::::::::::::::V:::::V::L::::::Q:T::::::::::::YI:A::S:K VNG0923 ::::::T:::::::::::AGA:GVI:::R::S::::H::A:::I:F:::::::::::::: rrnAC0907 ::::::::::::::::V:AD::S::::::::T::::H::I:::::F:::::::::::S:: Hmu1587 ::::::::::::::Q:H:SD::::::VD:::A:::::::T:::::F::::I::::::::: consensus SMDTTLVEAARTLNHGRWEAFRRVTLPQIRPGIAAGALLAALYALSDFGTPSIMRYDVFT #oth .2.22211...1.2121231.111.2.2.2.11.1.2..22..222.....21.34311. NP5004A :::SR::D::::::::PVK:::D::::N::::::::::::G:::I::::::AF:QAR::: Hut2581 :L::S:I::::::DA::L:::::::::::A:::::::::V:::T:A:::::NF:GVE::: hla0358 :F::::I::::::::::L:::::::::V:::A::::S:::::::V::::::::::LP::: HQ2544A :::::::D:::::D::::AT:::::I:::::AV::::::SS::V:::::::::::::::: HVO_1706 ::::::ID:::::::S:::::K:::V:::::AV:::S::::::V:::::::A:::F:A:: Hbo3130 ::::::ID:::::E:::::::K:::V:::::AV:::S:::G::V:::::::::::::::: VNG0923 :F:G:::::::::::S::Q::::I:V:::L::V:::G:::::::::::::::::::E:Y: rrnAC0907 :F:G:V:::::::::T:::::::::::::A:::::::::V:::::::::::A::Q::::: Hmu1587 :F:G:I:::::S:::T:::::K:::::::L::::G:G::V:::T:G::::::::K::::: consensus RVIYVEFGAFGRD--YAALLSLQLLAVTLVILALESRIR-GDERAYGS-GGRSGALIPLG #oth 24.1322233332112121.131.1322341.42.23231342313423122433626.. NP5004A SR::G::SG:QVE:::::::A:::VSIVAIV:VI:AG:G:R::D:S:-:::G:::T:M:: Hut2581 QA::ARYNTTM:P::W::::::::::::VG::Y:::KVGAD::G::Q:R:ASG::V:E:: hla0358 :Q::::YN:::::::::::::::::::V::V::::WLV::SNRD:H:DDA:STNR:VN:: HQ2544A :::::::::::::::T:T::::::V::::F::W::::::::E::TSA-:::::RDIVS:: HVO_1706 ::::::::T::::::T:T::::::V::::L::T:::K:::::::TTT-:::::::PM::: Hbo3130 ::::::::T::::::T:T::::::VG::FI::W::::V:::E::TS:-:::::RDVV::: VNG0923 QQ:F:AQ:SL:VPEG:P::::I:::::VA:V:::::::G:DGDT::V:R:ASQPGRVS:: rrnAC0907 :M::N::::RRL:::::SV::ML::VMA:G:::V:::LSA:RDG::V:S:S:RPG::R:: Hmu1587 :M:FN::::RRI::::::V::WL:::MAV::::V::::EA:RDG::V:R:A:RPGE:K:: consensus RWKLPALLFCAAVATLALVVPIGILLTWLGRSGAGYSAS-LAFEPEYAWNSVSVAAAAAG #oth 4.131.34133422314132.231164.26335434553132.347434..2511331.3 NP5004A H::W::MG:VSLLGV:T::I:VA:FT::VF::EGDRIPA::E:QT:V:F:::YL:LL::L Hut2581 T:RYV:A::P:VI:G::IAL:VIVFGL::SSDAG::T:GG:::SWT:G::::YL:LF::: hla0358 ::RW::T:LP:S:SAV::L:::W:::L::L::E::RRP::M::::IQVI::::::::::V HQ2544A ::R:::MILP:G:SA::::::VI::IS:::TAS:TV:E:::::QWR:IG:::T::T:T:: HVO_1706 :::Y:::G:A:L:::V::L::L:::F:::AQGV:AT:G:::::Q::::L:::L::::T:: Hbo3130 V:::::MM::::::G::::::L:::V::::T:N:AVNQ::::::WQ:VF::I::STG::L VNG0923 V::W:::A::T:I:V:S:G::L:V:AW:FQ:A:DAI---:FE:D:MI::::LK::V:::: rrnAC0907 Y::V::::::G:I:::C::L::::::Q::L:::T::::GGF:::AA::::::GL:::::A Hmu1587 V:::::T:::G:::::G:AL::A:::Q::V:G:V:::GAGRP::LGF::::LT::::::A consensus VAVLAALPVAYLAARGDSRLSSLFERATYVGYAVPGVVLGLALVFFGL-----SYVPPIY #oth 2252412.2.231113423225241.21.1.1.2..1.1111..2122111114344431 NP5004A ::C:F::::::YSG:TS:FV:RVL:::::I:F::::::I::::::L:T:::::RTL:SL: Hut2581 ASL:V:M:::VA::::R:::AG:AD:LS:::::T::I::AF:::L:A:NTLPL::RETA: hla0358 ::A:::I:I::F::TS::P:AT:::::::::F::::I::A::::Y::S:::::G:L:W:: HQ2544A :::IGGI:::::S::H:GF:P:A:::F:::::::::::I:::::Y::T:::::::AA::: HVO_1706 A:T::G:::::::::HP:::::V::::::::::::::::::::::::S:::::::AT::: Hbo3130 A:IV:G::::::S::HSN:::P::::::::::::::::::::::Y::S::::::VGA:V: VNG0923 ::TVL:::::GY:::SS::::MVSD:L::::::I::::IA:S:::LST:::::EF:QSLV rrnAC0907 IC:V::::I:::S:::T:GV:::P::::::::::::::::::::YL:::::::R:::FL: Hmu1587 :S:VV:::L::::::::::I:::PD:LS:::::::::::::::::LS::::::K:::FV: consensus -QTLYLLVFAYVVRFLPQAVGSLRSSFLQVDPSLIEAARTLGRSSLGAFRRVTLPLVAPG #oth 153152.1.1..1..2..21.23221413..2523..1.1.1442541..5.11.1211. NP5004A REGVW::::G::I::::::::TV:::V::::DET:::::::NAGR:ET:::::::MI::: Hut2581 :DL:LI:::::::::V:::I:AI:TATM:::GR::::::::::TRTE:::A:::::I::: hla0358 ::::P:::::::::::::V:::T:TAI:G:::K:V::G::::E::M:::::::F::TRS: HQ2544A :::::::I::::::::::S:::::A:::A:::::P:::::::Q::V::::Y::::::::: HVO_1706 :::::F::::::I::::::I::::A:::R:::A:P:::::::ETPS::::H::::::::: Hbo3130 :PS:::::::::I:::::::::::A:::R:::::P::::::::T:I::::H::::::::: VNG0923 :K:VP:::::::::::::::::V:::V:::::K:T::::::::::TD:::S:::::I::: rrnAC0907 ::SVI:::::::I::::::::TTE::I:::::GY:::::S::YHP:S:::K:V::::::: Hmu1587 :N:VF::::::::::M:::::TTK::L::::::YV::::S::YPP:T:::K:V::::::: consensus IAAGAALVFLTTMKELPATLLLRPSGFE-TLVTYIWRAQEAGYYGQAAVPALVLLVVSGL #oth 232.11...........2..2.1.51141.2.231.4132323123.11.112.242.12 NP5004A VV:::V:::::::::::M::M:Q:I:MD::::IKV:Q:H::LA:RY::::::L:ILI::V Hut2581 ::T:::::::::::::::::::::FW:DH::::::::VR:::L::R::::::::I:I:A: hla0358 :V:::::::::::::::V::I:::::::::I::Q::::::TAL:QY:V::T:I:::I::: HQ2544A LLG:::::::::::::::::::::A::T:::::H::A:YKS::F:::::::::::A:::I HVO_1706 LFG::::::::::::::::::::::::S:::::H::T:Y:Q::F:::V:::FI::F:::: Hbo3130 LFG::::::::::::::::::::::::K:::::H::T:Y:S::F::::I::::::F:::: VNG0923 V:::::::::::::::::::M:::I:::::::S:::LVRG::S::A::::::::VG::A: rrnAC0907 ::::::::::::::::::::M:::T:::::F:::::LV:G::::::::::::::VGL::: Hmu1587 ::::G:::::::::::::::M:::L:::::F::::::V::S:::::::::::::V::::: consensus SMLVILTQEGYNVK- #oth 1.3.1141.343431 NP5004A T:I:L:R::::E:T: Hut2581 ::A:::S:::S:T-: hla0358 ::V:::::::GEEGL HQ2544A ::::::A::::D::: HVO_1706 :::::I:::::D::: Hbo3130 :::::I:::::D::: VNG0923 ::V:::A::R::G-: rrnAC0907 ::::::RR:DTS--: Hmu1587 ::::::GR:QQ:GT: