|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2417 | VNG2595 | hla0976 | HQ3140A | HVO_1925 | Hbo1797 | NP0584A | Hut1859 | rrnAC2374 | Hmu0113 |
1769 | VNG2595 | 2473 | 1473 | 1498 | 1574 | 1552 | 1545 | 1552 | 1481 | 1587 |
1863 | hla0976 | 1473 | 2781 | 1670 | 1786 | 1850 | 1600 | 1613 | 1526 | 1547 |
1843 | HQ3140A | 1498 | 1670 | 2437 | 1826 | 1867 | 1503 | 1565 | 1497 | 1518 |
2037 | HVO_1925 | 1574 | 1786 | 1826 | 2441 | 2021 | 1694 | 1634 | 1565 | 1665 |
2011 | Hbo1797 | 1552 | 1850 | 1867 | 2021 | 2439 | 1700 | 1684 | 1626 | 1640 |
1914 | NP0584A | 1545 | 1600 | 1503 | 1694 | 1700 | 2467 | 1725 | 1660 | 1739 |
1899 | Hut1859 | 1552 | 1613 | 1565 | 1634 | 1684 | 1725 | 2438 | 1766 | 1855 |
1831 | rrnAC2374 | 1481 | 1526 | 1497 | 1565 | 1626 | 1660 | 1766 | 2491 | 1873 |
1880 | Hmu0113 | 1587 | 1547 | 1518 | 1665 | 1640 | 1739 | 1855 | 1873 | 2460 |
379 symbols consensus ---------------------------------------MIFESLPTTPRSEELIDKAFS #oth 11111111111111111111111111111111111112212..3.....112.12.1... VNG2595 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::::Q::: hla0976 MGGERREVADSRRVRPCAAVSRGSSNGRSYTRRQSSRGN::::G::::::::::V::::: HQ3140A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::: HVO_1925 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::: Hbo1797 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::::: NP0584A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H::D::::::::::V::::: Hut1859 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSHP::T:::::T::::::Q::: rrnAC2374 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSHP::G:::::TA:::V::::: Hmu0113 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSHP::D:::::TA::V:::::: consensus RAARAGRAKQG-HEAQQSMLQTASNILSDNLENVVTEWPDFD-TVDPFYYELADAIV--- #oth ..1.2.2..411521.1...2..22121..12...13..11214111..3.1...33434 VNG2595 ::::::::::::V::::::::::::::G:::H:::::::::::H:::::G::::::LREE hla0976 :::::::::H::::::E:::R::G:V:::::::::VS::::GFD:E:::::::::::::: HQ3140A ::::S::::S::LK::::::::::A:::::::::::Q::::E:S:::::::::::::::: HVO_1925 ::::T:::::NKL::::::::::::::::::::::V:::::E:::::::::::::::::: Hbo1797 ::::S::::S::::::E:::::::S::::::::::::::::G:::::::::::::::::: NP0584A ::::::::::::K:::E:::::::::::::::::::S::::E:L::T::::F:::TLADT Hut1859 :::::::::S:::D:::::::::A:V::::::::::Q:::::::L::::R:::::EH::: rrnAC2374 ::S:::G::D::N:::::::M:::::A:::M:::::A::TI::DL::::V:::::V:GEA Hmu0113 ::::::K::T::I:G:::::::::::V::::Q::::A:::I:::L::::V::::::ITSN consensus -------GVDELRQHLSEVMWASRQIDDIRREYQSRLRNTDADTARKLRKQAFARMADIV #oth 443221111.31112..223.1221374143..53133341523..11...1.1.21122 VNG2595 FASED:::I:::::::::LS:::SKTH:LG:::IG::P:-::EK::S::::G:G::GSVM hla0976 :::::::D::R:::A::Q::::::::E:L:D::TTKI::S:V:::::H::::::::::VM HQ3140A :::::::D::A:::S::R:T:T::::GTL::::::K::K:ESK::::H::::::::::L: HVO_1925 :::::::D:::V:KS::::::::::V:N:A::::PK::K::::L:::H:::::::::SV: Hbo1797 :::::::D::::::S::::T::::::AE::S::L:KM:K::K:::::H:::::::::::M NP0584A DVG:::::::P:::::::::::G::A:K:KD::HG:I::S:T:::::::::::::L:::T Hut1859 :::::::::::::::::::T::::KTS:::D:::::::GV:V:G:::::::::::L:::T rrnAC2374 YPADDDP:I:A:K:::::IS::ADKVVE::Q::E::VARG:I:::::::::::::I::V: Hmu0113 VEGEG:::I:A::::::::Q::::KAK::HS:::G:MTG-:::::::::::::::::::: consensus EQVEDDLAAIGAARDALKTLPDIRPDEPAIVVAGYPNVGKSSFVNAVTRASNEIAAYPFT #oth 221211.4422411331151.1.2111.21.1.............61.1.2111.4.... VNG2595 D::::::E:V:::::::::::E:Q::V:TV::::::::::::::::::N::I:T:E:::: hla0976 D:I::::RY::DS::Q::V::::::::::::I:::::::::::::R::::::Q::E:::: HQ3140A :DIA:::DQ::S::::V:N:::::::::::::::::::::::::::I:::D::::H:::: HVO_1925 :E:::::LR::E::::::D::::::::::::::::::::::::::D:::::::::R:::: Hbo1797 DEI::::LQ::E:::S::G::::::::::::::::::::::::::H:::::::::R:::: NP0584A :::::::L:::T::E:::::::::A::::::::::::::::::::T::N:R::T:::::: Hut1859 R::DEN:::LAD::QE:RK::::K::::V::I:::::::::::::S::::D::::::::: rrnAC2374 :E::::::::ST:HN:::DI:::::N:::::::::::::::::::R::::D::::S:::: Hmu0113 :E::::::G:S:::::::::::::::::T::::::::::::::::L::N:R::T:S:::: consensus TTGIQVGHFERDRIRYQLVDTPGLLDRPEDERNDIERQAVSALEHLADAVLFVLDASGAC #oth .13141..21121111.11.........331..3..4.....21.11.221124.1.23. VNG2595 :KSVDI::::::H:TW::::::::::::A::::E::D::::::T:VG:VI::FV:::A:: hla0976 :K:V:I::::::HV:::I::::::::::::::::::::::::::::::V:V::::P::D: HQ3140A ::::H::::::N:::::I::::::::::AT::::::::::::I:::::II::MT:::E:: HVO_1925 :K:V:I:::D:::::::II::::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::: Hbo1797 :K:V:I:::::::::::II::::::::::ED:::::K::::::::::::A:::V::::D: NP0584A ::E:N:::V:DNHV::::I:::::::::SED::P::S::::::T::::::::::::::E: Hut1859 ::Q:H:::I:::H:::::::::::::::PA:::A::A::::::::::::::VMV::::E: rrnAC2374 ::Q:R:::::DQ::::::::::::::::PED::E::S::::::::::::::VFI:P::E: Hmu0113 ::Q:R:::V::::::::::::::::::::A::::::S:::::V::::::::VF:::::N: consensus GYPLADQLELRDAVEARFG--DVPVLTVCNKSDRSTDVEA---DHYMSVEEDENVDEVLD #oth .1.233.22.1322532.41132.221121.3.123233.111.42..1242111241.2 VNG2595 :::V:::QA::AE:GD::::::A:LV:::S:T:L:AEI::::::C:::::GG:G:T:T:T hla0976 ::::NV:::::EE:REL::E:A::F:::A::H::FEA:Q:ESV:AT:::T:::::ED::: HQ3140A ::::::::A:::D:IE::REREI:::::N::::::EAIA:::::CQ::IKY::GI:T::T HVO_1925 :::IES::::::::K:::EER:I::::::::::::::MD:::::I:::::TG:::EA::: Hbo1797 ::::DA::::::::::::AERN::::::::::::::::::::::Y:::::NE:G:E:::T NP0584A ::::DS:RD:L:DI:ST:-::::::IV::::A:::::T::::::::::::TG:::::::: Hut1859 :F:IDV::::::DIAS::::::A::::::::A:::R::A::::::::::T::D::EG::: rrnAC2374 :::::::::::N:I::::-::::::::IA::::L:::::::::::::::T::D:::G::Q Hmu0113 :::IEV:::::::L:D::-:::A::::IA::A:LTR:::::::::::::T:GD:::G::: consensus AAVDAVGYEPELPFER-E- #oth 2211.2231211.232521 VNG2595 :::::::H:::::::E:-: hla0976 M::E:AAF::D::TRDG:E HQ3140A TT:::A:W::DI:PS:QA: HVO_1925 :::E:I:F::DI:PS:N:: Hbo1797 :S::::AWS:DI:PS:Q:: NP0584A ::I:::D::L:::::DD:: Hut1859 ::I::::::::::::E:-: rrnAC2374 ::I:::D::L::::DE:-: Hmu0113 ::IE:::::I::::DDE-: