| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5565 | VNG2441 | HQ3720A | hla0661 | HVO_0039 | Hbo1455 | NP1306A | Hut2116 | rrnAC2719 | Hmu3038 |
| 4031 | VNG2441 | 5643 | 3300 | 3593 | 3481 | 3511 | 3501 | 3493 | 3532 | 3596 |
| 4036 | HQ3720A | 3300 | 5570 | 3597 | 3854 | 3970 | 3329 | 3377 | 3384 | 3554 |
| 4391 | hla0661 | 3593 | 3597 | 5910 | 3900 | 4035 | 3640 | 3605 | 3696 | 3696 |
| 4414 | HVO_0039 | 3481 | 3854 | 3900 | 5619 | 4370 | 3612 | 3640 | 3672 | 3750 |
| 4518 | Hbo1455 | 3511 | 3970 | 4035 | 4370 | 5540 | 3615 | 3649 | 3661 | 3765 |
| 4149 | NP1306A | 3501 | 3329 | 3640 | 3612 | 3615 | 5541 | 3767 | 3807 | 3685 |
| 4331 | Hut2116 | 3493 | 3377 | 3605 | 3640 | 3649 | 3767 | 5565 | 4018 | 4145 |
| 4326 | rrnAC2719 | 3532 | 3384 | 3696 | 3672 | 3661 | 3807 | 4018 | 5572 | 4366 |
| 4463 | Hmu3038 | 3596 | 3554 | 3696 | 3750 | 3765 | 3685 | 4145 | 4366 | 5706 |
807 symbols consensus ---------------------------------VATTDG----------YMRFFPYEEPY #oth 1111111111111111111111111212221224464431111111111451...223.. VNG2441 :::::::::::::::::::::::::::::::::------::::::::::-:Q:::KPS:: HQ3720A :::::::::::::::::::::::::::::::::MS::GN::::::::::HK::::::::: hla0661 VCAQCTHPKQICLLKRLYRKDGHPVDHFHRATQPLLAG:DESRPVSEAPHL::::::::: HVO_0039 ::::::::::::::::::::::::VAHANGAPDDGDA::::::::::::AW:::::D::: Hbo1455 :::::::::::::::::::::::::::::::::::E:S::::::::::::::::::DR:: NP1306A :::::::::::::::::::::::::::::::::MSRS::::::::::::SRQ::::DQ:: Hut2116 :::::::::::::::::::::::::::::::::::SDPD:::::::::::A::::::::: rrnAC2719 :::::::::::::::::::::::::::::::::------::::::::::-:::::F:::: Hmu3038 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DD::::::::::L::::::::: consensus DNQREAMDGIADALDDGRDVLFEGACGTGKTLAALVPALEYARQTDKTVVITTNVHQQMR #oth 11.53.134132..34231..2...2.....111.3..222.13311...........1. VNG2441 ::::A:::A:R::::G:TN::::::::::::::::A:::SH:QAE::::::::::::::: HQ3720A P::HS::SE::E:::EQ::::::::P::::::S::C::IA:::::::::::::::::::: hla0661 P:::::::RV:N:::R:Q:::::::P::::::S:::::::H::EH:R::::::::::::: HVO_0039 P::EA::S::::::::E:N::L:::T:::::IS::::::S:::EH::::::::::::::: Hbo1455 P::G:::::::E::EAE::::V:::P::::::S:::::V:::::E::::::::::::::: NP1306A :H:SD::ER:RE::VEE::::::::::::::::::::::::::AAG::::::::::::T: Hut2116 :H::::IE::G:::E::S:::L:::T:::::::::T::::F::R:::::::::::::::: rrnAC2719 :H:Q:::GT:Y:::EE:::::::::::::::::S::::::H::E:G:::::::::::::: Hmu3038 :H:::::G::Y:::T::::::::::::::::::S::::::::::A::::::::::::::: consensus QFVEDARAITRQ--EPIRAVVFRGKGSMCHIDVDYEECQALRDTTRDLVEKERDKAELEE #oth ..121..2.34311241.11..1..2.......211...2..11.122.14131421.24 VNG2441 :::RE::E:HAT::::::::::K::::::::::::::::V:::N:HE::DAT:::RQ::: HQ3720A :::A:::::VHSGIDT::::::K::S:::::::G:Q:::T::::::S::D:::ERTQ:R: hla0661 :::::::::::E::T:::::::K::S:::::::::Q:::T::::::EM::T:SEVR:::T HVO_0039 :::::::::::E:::A:::::::::S:::::::GFQ:::T::::::SI::::S:::::S: Hbo1455 :::::::::::T::::::::::K::S:::::::E:Q:::T::::::S:::::Q:::::S: NP1306A ::I:E::::NE:::T:::S::::::A:::::::G::::::::::::E:::T:Q:I::::A Hut2116 :::A:::Q::E::::::::A:::::::::::::G::::::::E::::::DS:AEQ::::R rrnAC2719 ::::::::::D::::RL:::::::::::::::::::::::::::::::::V:S:I::::Q Hmu3038 ::::::::::A::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::D:::ER::::R consensus RQRELLDESREGDSG------AAEARSAVMDELDALEDELEELR-EGNICDHYYNNLTE- #oth 1352.225432.452111111.22..52.31..3424323232523333.22.13..141 VNG2441 :::A::::AQD::TE::::::::D::Q::::::E:V:S::AA:Q:D::V:ER:RQ::VG: HQ3720A QATA::::I:::ND:::::::::S:::::T:::ESVTS:I:D:S:S::::EY:R:::::A hla0661 ::::::A::::::A::::::::::::ES::::::E::ADID:YD:AA:V:A::R:::V:: HVO_0039 QTQS:::GI:::E::::::::::D:::::T:::::ID:::A::K::::Y:E:::::::R: Hbo1455 QADA:V:RM:A:EQ:::::::::D::T::T::::T::::::D::::::::EY:::::::: NP1306A :ES::R:A:KA::GD:::::::::::GT:L::::E::ASA:A::E:R:V::R::K:::G: Hut2116 :::::::A:Q::::E::::::::::::::::::::VAE:I:T:KE:QAT:::::R:::T: rrnAC2719 :EG:::SDGQA:S:E:::::::M:::N::VE::RD:Q::R::IET:RST:::::R:::V: Hmu3038 QES::::QAT::P:DGENQEN:L:::N::::::Q:V:ED::::QTDAT::::::R:::V: consensus -DTDEFYQWLFDDVRTPEDIYEYADQRGLCGYELLKEGIEGVDLVVCNYHHLLDPMIREQ #oth 13.31.13..11....112112..34241.......1.2111..11.........5..1. VNG2441 :N::::::::Y::::::::::G::EEA:F:::::::D:::::::A::::::::::G::A: HQ3720A DA:EA:F:::::::::A:E::A::E::Q:::::::::::::::::I:::::::::A:::: hla0661 ::::::FG:::E:::::::V:A:::E:E::::::::::M::::::::::::::::N:::: HVO_0039 :N::::F::::::::::DE:F:::GKQN::::::::::M::I:::::::::::::::::: Hbo1455 ::::::FS:::::::::::::::::::K::::::::::M:E::::::::::::::N:::: NP1306A :E::::::::YE::::::E::::::RQ:::::::::D::::I:::I:::::::::::::: Hut2116 :::::::A::Y::::::DQV::::ERQ::::::::::::D:::::I:::::::::F:::: rrnAC2719 :::S:::S:::::::::D:V::::H:Q:::::::::::MD:::::::::::::::T:::: Hmu3038 :::T:::A::YE:::::D:V::::HD::::::::::::V::::::::::::::::::::: consensus FFRWLGRDPEDVIAVFDEAHNVEDAARDHARRTLTENTLESALDELEDEDD--------- #oth ..1.12.1.211121......113...1..411.1.4.115.22.162421111111111 VNG2441 ::::::::::::VV:::::::I::::::::AE::::Q::D::::::Q:TS:::::::::: HQ3720A :::::::::D:IVTI::::::I:S::::::G:::::::::E::T:IK:CE:::::::::: hla0661 ::::ID:::SEI:T::::::::::::::::T::::::::DA:::::TES::::::::::: HVO_0039 :::::D:::D:::T:::::::I:G::::::S:A:::::::::MT:::::::::::::::: Hbo1455 :::::N:E:::::T:::::::I:S::::::S:A:::::::Q::N::::T::::::::::: NP1306A ::::::::::::::::::::::A:::::::::::A:R::DG:::::::VS:::::::::: Hut2116 :::::::::::::::::::::::::::E::::::A:P:::R:::::GEV::::::::::: rrnAC2719 ::H:I::::::I:::::::::::S:::::::::::::::DQ:::::DN:E:::::::::: Hmu3038 ::::::::::::V::::::::::N::::::::::::T:V:::I:::AESEETAAGSGGEG consensus SRAEAAANVIEAFLDALVETYDDAFGFGE------REQVGENWYDLPIANDDRRDDLTLA #oth 3.232.41.341122..3221221113.31111112131323.4.231114211.1.122 VNG2441 Q::A::ER:LG::R:::::::E::LRP:GDGPADTKSA:ES::V:V:V:::::::::::: HQ3720A ::::P::::F::::T::QT::A:::::::::::::::::TSE::::TV::T::::::::E hla0661 ::::::E::VR::R::::::R:::L:V:K::::::H:SI::::E:IS::::::::::::: HVO_0039 ::::S:R:::GT:::::RDS:ES:::::::::::::::::::::::S::SQG::::::ME Hbo1455 :::DS:E:::S::::::K::::E::::::::::::::::::D::::::::N::::::::: NP1306A A::D:::::VG::K:::::::ESS::Y:D::::::::A:::E:E:V:VDSESG::::SV: Hut2116 P::GP:G::L:TI:T::R::::::L::::::::::::T:E:D:T::A:D::::::::::S rrnAC2719 A:TD:::::::T:R:::::A:E:S::::G::::::::A:D:H:D:IT::::::K:::::: Hmu3038 A:S:::H::LAT::R::RT:::E::::::::::::::::EDH::::S::::::::E:::: consensus FLQNYEGRGIDEELELALQLGEALDQRYEEAYKDGETTTRKECQTLQAATFISAWMEDGD #oth 1.36.2.3.2421325.24.1361.62.252112.1231.3..23.3..6.343143424 VNG2441 :::S:T:P::T:DVTD::G:::Y::GE::D::RN:DA:::R::HV:A::E:VE:YV:R:G HQ3720A :::Q:::::::T:ID::R::A:SI:S:::T:::N:::A::::::A:H::::LN:::T:S: hla0661 ::R::::K:::T:T:::V:::Q:::EE::RR:R:::::::T:::I::::R:V:T:::E:T HVO_0039 :::S:::::::V:V:::::::KQ::EQ::D:::N::A::::::::::::N::AD:T:L:: Hbo1455 ::DR::::::ST:V:::::::KR::DE:::::::::A:::Q:::::::::::DT::A::G NP1306A ::EA:T:Q:FETD::S::S:::E::R:::QE::::::::::::P::T::A::ET::DASV Hut2116 I::::T:Q:VH:D::E:VA::Q::::Q:D::::::::SV::::P:::::::FDG:F:::E rrnAC2719 :::G:T:P:FH:::DR::E::RD::A::QK:F:E::LD:::::::::::G:::D:LDET: Hmu3038 :::E:S:P:FH:::DQ::E::RE:::Q::::F:E:DLD:::::::::::Q:L:::L:ES: consensus ELGQYPVVSVRRDDGTDEVYGRAELYTCIPRRVTEDLFDEVHASVLMSATLRPFDVTEDV #oth 44.41.342...324343211...1..11.24..53..2212121...........2321 VNG2441 :F::::TAA:::::R:EA::::::R::::::E::T::::A::::::::::::::::IG:: HQ3720A TV:TH:LI:::::ET:N:::A::::::::::A::A:::::::::::::::::::::A::: hla0661 :::::::::::::GA:E::::::::::::::::::E:::::A:::::::::::::::K:: HVO_0039 :::RH::L:::::G::::I::::::::::::E::KE::E:::::I:::::::::::::ST Hbo1455 K:::H:MC:::::G:::::::::::::::::E:::T::E:::::I::::::::::::::: NP1306A :P:E::::G:::SET--GIV::::::::L::::::P::E:L:GT:::::::::::::::: Hut2116 QT:L::::::::E::DGDL::::::::A::E:::RT:::DLY:::::::::::::::::: rrnAC2719 :T::::::::::::A::D::::::::::::EQ::R:::SDL::A::::::::::::::N: Hmu3038 D:::::::::::REESGDI:::::::::::SN::G:::SDL::::::::::::::::Q:: consensus LGLEDPVTMAYGLQFPEERRRTYAVDTPALFSSERDDPATQETVAGVLADAARFTPGNTL #oth 1.1422341.11431.211.1.32.4312..1.4.21152.3323632312333....1. VNG2441 :::D:::EL:F::::::D::::F::::EP::::N:E:R:::QA:::A:R:::AY::::C: HQ3720A :::SN::Q:::E:AY:A:N:::L::K:::::::A:N::D::SII:DT::::::::::::: hla0661 :::::VASL:::MGY:::N:::F:::::P::A:::N::E::::::SL:R::I:::::::: HVO_0039 :::D:::::::::EY:::N:::FS:SL:::::::::::G:::::EE::::::G::::::: Hbo1455 :::S::A::::::AY:::N:H:I::Q:::::::::EE::::::LTQ::T::S:::::::: NP1306A ::::E:L:::::E:::D::::::::E:::::A:K::::QV::::GN:I:ETVA::::::: Hut2116 :::KE:E:::::P::::::::::T::V:S::A:R::::EL:D:::S:VE::V:L:::::: rrnAC2719 V:V:::::::::A:::::::::::::G:::::::::::Q::QRI:RT:E:IV:::::::: Hmu3038 :::T:AEA::::E:::::::::::::G:::::::::::S::DA:::::E:::QM:::::: consensus AFFPSYAEAERYHERL----AVDATLYLDEPGTRAEDLRESFVDDDDAVLFTSLWGTLAE #oth 2.1...1..1..233322452343552..11.252342.45.2353324.3.......1. VNG2441 F::::::::K:::DL::::ADC:::R::::::VA:D::::A::A:G:GA::::::::::: HQ3720A F:::::::::::ATQ:RQHD::SKPVM:::S::ET:P::Q:::GQNGC::C::::::::: hla0661 ::::::::::::Y:::::GG:DLGS::::G::EDE:K::RR::ES:::T::::::::::: HVO_0039 ::::::::::::::::RANPN:::E:F:::::V:::EM:RE::AE:G:::L::::::::: Hbo1455 V:::::::::::::::QARMD:TDR:F:::S::PT:EI:SK::ESQS:I:L::::::::: NP1306A ::::::::::::YH:Y:::::GE::P::::::VE::S::Q::IE::Q::::::::::::: Hut2116 :::::::::::::D:V::::D:E::K:::::::::QE:::T:T:G::G::::::::::G: rrnAC2719 V:C:::S::::::DMT::::::S::R:::::::Q:R::::A:T:G::G::Y:::::::G: Hmu3038 :::::::::::::::V::::D::GKQ:::::::Q:R:::D::::R:::L:C:::::::G: consensus GVSFDGDDARTVVVVGVPYPHLDDRMEAVQDAYDRAFGDR----------RDAGWRYAVE #oth ...1.11...1.2.......1.12.31.1.3..25214443221111111411..2.11. VNG2441 ::::::::::::A::::::::::A:T:::::::AQ::A::DADQGLRSDRQ::::::::: HQ3720A :::::DN:::::A:::::::::SE:A::::S:::::YSG:::::::::::K::::::GI: hla0661 ::::::::::::::::::::::S::::::::::N:V:A::DRS:::::::::P::A:::: HVO_0039 ::::::::::::::::::::::SE:L:::::::::VYRRK::::::::::K::::::::: Hbo1455 ::::::::::::::::::::::SE::::I::::::VYSS::::::::::::E:::::::: NP1306A ::::::::::S:L::::::::::E::::::G:::G::::GT:::::::::D::::::::: Hut2116 :::Y::::::::L:::::::Y:::::D:::::::A::DA-::::::::::EE:::::::: rrnAC2719 :::Y::::::::::::::::::::::D:::::::V::::DE:::::::::D::::::::: Hmu3038 :::Y::::::::::::::::::::::D:::N::AMS:::D::::::::::EE:::H:::: consensus IPTIRKTRQALGRVVRSPDDFGVRILADRRYTEAA-AEMGKYAVRGTFPPEERAEMIDID #oth ...1......2...1.2.3.1.1.3.3.2...444243232.2.234..13..5.32.24 VNG2441 :::V::::::M:::I:::E:::::M:V:::::A:SRTG:Q::S:NP::::S:::::V:V: HQ3720A ::::::::::::::I:::S:Y:::L:I:K:::QEG:::::::G::DQ::::::::L::VE hla0661 ::::::::::I:::::G:::::::::::::::S--::D::::S:::A::::::E:LL:L: HVO_0039 ::::::::::::::I:A:::::::V:::K:::RES:TS::::G:::S::V:::S::V::A Hbo1455 ::::::::::::::I:::::::::::::K:::R:S:S:::::G::S:::::::::IV:VS NP1306A :::V::::::::::::::T:::::V:V:E:::QSKR:DL:E:S:YPE::::::N:H:::G Hut2116 ::::::::::M:::::::::::A:V:V::::::K:EI:SPE:::::::::V::G::::V: rrnAC2719 ::::::::::::::::::::::A:::L:K::::::EM::HD:::::::::G::R::V::G Hmu3038 ::::::::::::::::::E:::::::L::::::::EM::HD::::::::::::::::::: consensus PEKLKFAMLNFYGDHDAYDGDPPAP-- #oth 13.12.21....5.31111131.5.11 VNG2441 ::::R:SL::::::LG::G:::::::: HQ3720A :S:VQ:SL::::D:L::::ETA:S:SP hla0661 ::::::::::::::::::::A::E::: HVO_0039 :N::::::::::T::::::::::R::: Hbo1455 A::::::::::::::::::::::R::: NP1306A ::::::::::::S:M::W:::::T::: Hut2116 :D::::GL::::A:M:::::::::::: rrnAC2719 ::::::::::::Q:M:::::P::N::: Hmu3038 ::::::::::::Q:V:G:::P::T:::