| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4535 | VNG2001 | NP5040A | Hut1861 | rrnAC3189 | Hmu2567 | hla0610 | HQ1110A | HVO_1847 | Hbo1723 |
| 3364 | VNG2001 | 4825 | 2855 | 2911 | 3024 | 2989 | 2848 | 2735 | 2801 | 3001 |
| 3480 | NP5040A | 2855 | 4545 | 3121 | 3343 | 3269 | 2848 | 2822 | 2886 | 2996 |
| 3634 | Hut1861 | 2911 | 3121 | 4520 | 3511 | 3498 | 2776 | 2831 | 2935 | 3012 |
| 3750 | rrnAC3189 | 3024 | 3343 | 3511 | 4585 | 3942 | 2948 | 2892 | 3020 | 3088 |
| 3621 | Hmu2567 | 2989 | 3269 | 3498 | 3942 | 4561 | 2868 | 2781 | 2932 | 3007 |
| 3370 | hla0610 | 2848 | 2848 | 2776 | 2948 | 2868 | 4518 | 2937 | 3265 | 3260 |
| 3323 | HQ1110A | 2735 | 2822 | 2831 | 2892 | 2781 | 2937 | 4557 | 3186 | 3349 |
| 3472 | HVO_1847 | 2801 | 2886 | 2935 | 3020 | 2932 | 3265 | 3186 | 4552 | 3486 |
| 3618 | Hbo1723 | 3001 | 2996 | 3012 | 3088 | 3007 | 3260 | 3349 | 3486 | 4530 |
637 symbols consensus -----------------------------------MSSVPERSEIDEEYKWDLASIYADD #oth 111111111111111111111111111111111111.11.2.211233.1.1.5211222 VNG2001 MPPATSGTGLISGAVAGNHPVVCERLTGRTRTLGH:::::D:ADVAD::::A:::::ET: NP5040A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::T:T:::TDLF::: Hut1861 :::::::::::::::::::::::::::::::::::V:T:::::::::::::::::L:::T rrnAC3189 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::D:::A:::::D:L::T: Hmu2567 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::::ETQ:::::E:L::T: hla0610 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::A:::::QG::::: HQ1110A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::N::ET::T:::SG::T:A HVO_1847 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::::::D::::S: Hbo1723 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::E::::S: consensus DEWEAAYEDVQERLEELAAYEGRATEDAETLLELLELREAIMRTVSNVAAYARMRSDEDT #oth 22..3.1142433343243...2211123..1231.331323.3234.33..31.321.. VNG2001 ::::::F::::AE:DA:ND::::L:::G::::AA::::D:VY:DAKT:S:::S::::::: NP5040A EA::D:FGELEG:::D:::::::V::SP:::QSV:::::SV::QAA:::::::::K:::: Hut1861 ::::T:F:EAN:LT:VV:S:::Q:::::::::SV::DY::L:::::::VS:::::Q:::: rrnAC3189 ED::::::EAE:LI:D:S::::::::::A::::T::TY:DL::::::::::::::R:::: Hmu2567 :D::::::RAE:LV:::::::::::D::G:::AT::TY:EL::::A:::S:::::K:::: hla0610 E:::S:::A:S::I:::E:::::VAD::A::::::::::::F:DLEQ:MT::QL::A::: HQ1110A A:::S:::S::DQ:TD:KE:::HV::SPS:::::::Q::E:F::LAT:ST::NL::A::: HVO_1847 E:::::::::A::VP:::S::::::::P::::::F:TM:SVL:E::M:VS::NL::SQ:: Hbo1723 ::::T:F:::::::S:I::::::V::SP:::::::::Q:E:::E::K::N::SL::A::: consensus RDQEYQALQARAESLSSEASSAASFLEPELQDLDRDDIEAMIEEEPALEAYEHYFDDVLR #oth 121321.3421241.32312.13.131.11.3144242422215212.45.1.11..... VNG2001 :::::::::::GA::MTDV:::T::FD::::ACT:EQLQS::::T:E:A::::::::::: NP5040A T::T::::T:::R::AAD:::::::I:::::A:::ET:DEY:D:N::::T:D:::::::: Hut1861 ::DDAK::F:::R:::AD::::::::D::I::::::EV:::::A:::::E:::::::::: rrnAC3189 T:DT::::T::SQ:::::::::::::D:::::::Y::::::VD::::::P:::::::::: Hmu2567 TRDQ::::T:::Q:::::::::::::::A::::AW:::::::DA:SP::Q:::::::::: hla0610 :N:::::MS:K:S::G:::::TI:Y::::::S:TEA:VA:FVDD::::AE::::L::::: HQ1110A ::::S::R:SK::::::R:R::I::I:::::E::SEE:SSFC:R::::KQ:::F:::::: HVO_1847 :N:::::QAG:::A:A:K:R::V:Y:D::::E:G::GVAEFV:K::E:D::::::::::: Hbo1723 ::::::::::K::::::::Q:TV::V:::::E:SEA:V:SF::T::E:VD:::::::::: consensus MKPHTRSAEVEELLADLGEVTGAPSDIYNMLTNADMEFPTVEDPD--GEAVEITLNNFTK #oth 2.3....3.1.31.11.111221211213..21..12113.13131112521.113...2 VNG2001 :::::::::::G::SE::::F:::::A:::::D::L::::::::A:::D::::SQS:::N NP5040A :::::::::I::::::::D::D:AG:V::::::::::::A:::::::::PQP:::S:::T Hut1861 :::::::T:::S:::::S:::::AG:V:D:::::::S::::::SQ::::::::::::::T rrnAC3189 ::D::::::::N:::E::::::::GEV::::A::::T:::::::::::DQQP:::::::T Hmu2567 ::D::::P:::N:::E:S:::::SGEV::::A:::::::S:::::::::PQP:::::::T hla0610 ::A:::::::::V::::S:::D:::E::S:::::::TYGV::N::::::E::::QA:::: HQ1110A A::::::S:::SV::::::IASS:::::G::S::::T::::DH::PGEDTI::::G:::: HVO_1847 T:E:::::::::V::::S:::::S::::S::A:::L::::::K:::::TS::::QG:::: Hbo1723 ::::::::::::V::E::::AS:::::FG::S::::T:::::N:E::::E:::SQG:::: consensus LQKHPDRAFRRRVYEQFYDEWADVRNAVGTALKNSVKKDVKLARARNYDTAREAALDGPN #oth .1.311.4..22.115...21521..2112221221141315.41.3.11..2.1.113. VNG2001 :L:T::::::QT:H:::::TISG:::TI:STM:TQM:R:::::E::::::::Q::::SG: NP5040A :::::N:E:::::::S:::::::Y::S:A::Y:K:::A:E:::A:::::S::::::N::: Hut1861 :::RQ::Q:::E:::G:::::E:::::::S:Y::A::T:S:I:Q::::E::::::::::: rrnAC3189 :::::::D::Q::::A:::::ET::::::::Y::A::T:::M:N::D::::::::::::: Hmu2567 :::R:::D::Q::::T:::::DG::::::A:Y:::::T:::M:Q:::::::::::::::: hla0610 :::N:::K::E::H:T::::::G:::T:::S::KA:REHATS:EI:G::S::Q:::::S: HQ1110A ::::::::::QT:::::::::K::::T:::::Q::::::::Y::::R:ES::A:S::::: HVO_1847 :::::::E:::T:H:E:::R::::::::::S::::::::::T::I:D:E::::::::::: Hbo1723 :::::N:Q:::E::Q::::::G::::T::::::::::::::Y:N::::E:::::::::T: consensus VPVEVYDTLVDTVRDNLDHLHRHAELKRDALGVDELRMWDLYMPLTGDESPEIEYEQACE #oth 1.14..11.21..31..25.1...3..25322322.221...41124321.314.23.32 VNG2001 I::::::::::::D::::T:Q:::D:::R:::::D:E:::::::IVDS:G:D:::AD:R: NP5040A :::A::E:::E::E::::V:::::A::::C::::::::::::A::EN::::TVD::::KS Hut1861 ::TD::::::E:::G:::P:::::::::EHTDGE::A:::::V:::ET:::::::::::: rrnAC3189 :::::::::::::H::::T:::::D:::QSI:A:::::::::T::VQE:::::::::::: Hmu2567 :::S::::::::::::::A:::::::::::I:A:::E:::::V::VQE:::::::::::: hla0610 :::::::::::::D::::V::::::::A::::::Q:ESH::::S::::QG:DVA::::R: HQ1110A :::T:::::CE::::::E::::::R::QA::NLN:::P::::IS:::::::K:P:DR:TT HVO_1847 :::::::N:L:::::::G::::::::::E:I:A:::::::::VS::::HG:::P::::K: Hbo1723 :::::::N::E:::::::Y:::::::::G::::E::E::::::S:::::G:::T::E:K: consensus YVIEAVAPLGEDYQSRVAEGLDSRWVDVYENRGKRSGAYSGGTYDTQPFILMNYQDDISS #oth 2121.11...22.131212..112......122.1...1.2.1..1..1.11...1.22. VNG2001 H:::::::::::::Q:::D::::N:::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP5040A :::D::::::D::RD:M::::E:Q::::::TEN:Q::::::::::S::Y::L:::::::: Hut1861 ::VD:L:::::A::::::::::::::::::T:::Q::::::::::S:::::::::::VE: rrnAC3189 ::T:::::::D:::::L:D:::::::::::TEH:Q::::::::::S:::::::::::VE: Hmu2567 ::VD::::::D::::::S::::::::::::TAN:Q::::::::::S::Y::::::::VE: hla0610 W::::::::::A::E:M:::::::::::::::::::::F:S:::::::Y:::::::::A: HQ1110A :ITD::::::SE::Q:::D::E::::::::::::::::F:S:A::::::::::::::::: HVO_1847 :IV:::E::::A::E:M:::::D:::::::::::::::::A:::::::::M::::::SA: Hbo1723 :I:::::::::E:::QL:Q::ED:::::::::::::::F:S:::::::::M::::E:::: consensus MFTLAHELGHSMHSELTSEAQPYVYSSYEIFVAEVASTVNETLLTHHLLDTVEDDRLRRH #oth .1.........1..112324..13113.2..1..1......1..151..1211.241.3. VNG2001 :::::::::::L::QY:::H::::::N::::::::::::::A::VN:::::::::HF::: NP5040A :Y:::::::::::::::::T:::T::N:::::::I::::::::::K:::E::D:AAF::: Hut1861 :Y:::::::::L:::Y::::::::::G::::::::::::::A:::R:::::::::::::: rrnAC3189 :Y:::::::::::::Y:::E::::::G:::::::::::::::::::::::::::E::::: Hmu2567 :Y:::::::::L:::Y:::S::::::::::::::::::::::::::::::V:D:E::::: hla0610 ::::::::::::::::SGDT::WHDA::D:::::I::::::::::::::::::::E::T: HQ1110A ::::::::::::::::AKN:::WQ:AD:T::::::::::::::::N:::E:L:::T::L: HVO_1847 ::::::::::::::::AND:::WHDA:::::T:::::::::::::EY::EN:D::E::M: Hbo1723 :::::::::::L::::AK:E::WH:AD:T::::::::::::::::QY::EN::::EF:M: consensus VLDEYLERFRSTLYRQTMFADFEHRAHEISEAGEALTPDRLDELYGDLKGDYYAPAVLDD #oth 1.11....1....1...1..21.324.13422121....12.22.411.431.1114311 VNG2001 I:N::::::::::::::L:::V:Q:L::LTR:::::::::I::V:::R:RA:::N:TI:: NP5040A :::::::::::::F::::::::::::::LNA::::::::::::::RE::AE::E:::V:: Hut1861 :::T::::::::::::::::E:::::::M:::::P:::::::D:::E::::::::GEI:: rrnAC3189 I:N:::::::::::::::::E::::T::M:::::P:::::::D::R:::::::E:::::: Hmu2567 ::N::::::::::F::::::E:::::::M:::::P:::::::D::H:::S::::::AV:: hla0610 :::::::::::::F::::::A::Q:I::RV::DD:::::AF::I:A::::::::::E:TG HQ1110A I:::::::V:::::::::::E::STI:::I:E:G::::::F::I:C:::ET::E:::::: HVO_1847 :::::::::::::F:::::::::LQI:::I:NDG::::::F::::::::ET::E::AT:: Hbo1723 ::::::::::::::::::::::::QM:T:::E:G::::::::Q::::::REF::::NV:: consensus RIAREWMRIPHFYYAFYVYQYATGISAAVAIVDRILDEGEP-AAADYREFLRLGSSEYPL #oth 212...1......131..1..1......3.112514411331..21.232.44.125..1 VNG2001 H:E:::::::::::N:::F:::::::::::L:ED:::DDQ:D:::R:::::TR:::A::I NP5040A H::::::::::::R:Y::::::::::::T::::::ERD:AS:::::::::::S::RG::: Hut1861 ::V::::::::::R:::::::::::::::::AQS:AE::D::::ER::T::ES::::::: rrnAC3189 :::::::::::::R::::::::::::::::L::G:::D::::::QR:ID:::S::RQ::: Hmu2567 :::::::::::::RS:::::::::::::::L::T::::::::::ER:VD::GK::R:::: hla0610 GVE:::E:::::::N:::::::::::::A:::E:V::::DE::::::::M::A:G:D::: HQ1110A ::::::::::::::S:::::::::::::I::::Q:DTD::D:::E:::SA:E::G:A::I HVO_1847 ::::::E:::::::DY::::::::::::A:::E::RE:::S::::::::A:A::G::::: Hbo1723 ::::::::::::::NY:::::S::::::::::E:::N:::D:::::::DA:A::GAK::I consensus ELLQTAGVDMATPDPIESAISTYDDYLDEMAALL--- #oth 12122..1..2323.1.3.344.323112426.3331 VNG2001 ::::D:::::S:SA:::R::GV::H::::ADD:V::: NP5040A :::E:::I::S:A::V::::D:::EMVA:YES:EE:: Hut1861 ::::::::::T:A::::D::AE:::A::R::D::::: rrnAC3189 :::RD::::::S:::V:::L:::S:::::F:E::::: Hmu2567 ::::D:::::S:SG:V:A::D::G:::::FDQ:T::: hla0610 DVVEL::I:::S:E:::::VGI::E::::I::::DVE HQ1110A DI::::::::TDAA:::::LTG:A::::Q:E::VK:: HVO_1847 DV:R::::::TE:E:::D:M:V:AEF:::A:M::DLE Hbo1723 :V:E:::::::S:E:::::L:V:G:::::::G::DTE