[C] (-) COG1413 FOG: HEAT repeat 9 genomes BUD0153 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG0782 rrnAC1443 HVO_1020 Hbo0514 Hmu1961 Hut1408 hla0876 NP3228A HQ1584A

Pairwise sequence scores
Consensus score	3131	VNG0782	NP3228A	Hut1408	rrnAC1443	Hmu1961	hla0876	HQ1584A	HVO_1020	Hbo0514
1908	VNG0782	3187	1446	1442	1370	1516	1533	1490	1538	1610
2002	NP3228A	1446	3208	1690	1607	1610	1490	1358	1575	1529
2068	Hut1408	1442	1690	3148	1662	1778	1502	1420	1552	1602
2046	rrnAC1443	1370	1607	1662	3453	2107	1489	1488	1638	1694
2215	Hmu1961	1516	1610	1778	2107	3079	1615	1523	1663	1738
2045	hla0876	1533	1490	1502	1489	1615	3474	1601	1762	1883
2045	HQ1584A	1490	1358	1420	1488	1523	1601	3283	1722	1999
2210	HVO_1020	1538	1575	1552	1638	1663	1762	1722	3095	2173
2278	Hbo0514	1610	1529	1602	1694	1738	1883	1999	2173	3246

535 symbols
consensus       -----------------------------------------MSNGDDETADDA-EEAEAD
#oth            11111111111111111111111111111111222222222.111.11454557444454
VNG0782         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::E:P:ETTE:AG::A
NP3228A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::STE::PD::AS:
Hut1408         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::DAEP:GTDG:SG:
rrnAC1443       MLATHGTATPDTYSLLVGPAAAGPARLERKTLLARSDTVLD:::::::ADASDDA::TDE
Hmu1961         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DGE:A::------
hla0876         ::::::::::::::::::::::::::::::::MDYARSSWC::::::DP::ASG:ADA::
HQ1584A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DE:::::A:DAP:S:TS
HVO_1020        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::D:----:------
Hbo0514         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::P:ETS:KS:TA

consensus       ---------------------DEVTPESLESRLDDAEEALDAAETEADLDDVEATLDDIE
#oth            33312111111111111111152335242331.122233.11.2..21..2113312322
VNG0782         DT:::::::::::::::::::TA:D:DT:::::::::A::E::S::S::::I::S::AVA
NP3228A         GED::::::::::::::::::PDISI:EF:T::::I:A::ED:S::D:::A:::DA::V:
Hut1408         G::::::::::::::::::::A:LGV:DF:G::::::DT::::::::::::::G::SA::
rrnAC1443       :::::::::::::::::::::ID::A:E:::::TE:GD::E::::::::::::SS:::::
Hmu1961         :::::::::::::::::::::LD::---:D::::::A:::E::T::SA:::::::::E::
hla0876         DAEEAGGAGESTDAAAAPTLP::A:E:::NEY::EIA:R::D:::::::::ID:L:::A:
HQ1584A         :::::::::::::::::::::IA:::::VI:::::V:S::::::::SA::E::T::AT:T
HVO_1020        :::::::::::::::::::::T:LS:::FDE::TE:::::::::::::::E:::::::::
Hbo0514         AASES::::::::::::::::::I:A:::DE:::S:::D:::::::S:::E::S:::AV:

consensus       ADLEAADLP--EPDEDDEDA-DPREELEDRLSDLRDDLEDQRGPYAEDVAETVEAAASTI
#oth            31223221.11...211122211634.22212121122231....22.2235335.4422
VNG0782         ::I:::E:::::::D:::E-:SREAA:T:H:AEV::GVD:::::::S:A::::D::Q:::
NP3228A         ::::TVEF:VP:::DE::EPD::K:P:V:::::I::GI:::::::GD:::SDANG::GQ:
Hut1408         E::VD:::::::::::ED--:::Q:A::::::::::GVA::::::V::I::Q::T::G:V
rrnAC1443       S::::::::::::::::D::E::C::::SQ::::::::DE:::::::::VTI:SN::D:V
Hmu1961         S:::D:E:::::::::::::D::::Q::S:::E::::::::::::V:::::::DS:SA:V
hla0876         DG:DE:::::::::::::::D:::GD::::IAE:::GV:EA::::::::IDAI::::::L
HQ1584A         D::::ST:::::::G:::E-:::TD:::A:IE::ESE:DI::::::S::I:PL:E:TT::
HVO_1020        ::V:::::::::::DE:::-:::A::::S::::::::::S::::::D:AV::L:E:K:::
Hbo0514         S::D::::::::::::::::E:::AD::S::::::::::S:::::::::VDDI:S:Q:K:

consensus       EDTRWTDDGEGEAVAAVETF-------------LDAAGEHLDVDADA-G---DDEDALGA
#oth            5212..33.3533521.2411111111111111413342732543553211112444242
VNG0782         GE:::::Q::DDLA:V:AQ::::::::::::::RE:::DA:GETF--:-::::ETGD:::
NP3228A         RS::::R::RPAVK:::::::::::::::::::::::::Q::T:FE::::::::I::FAD
Hut1408         SE::::::::EAVI::::A::::::::::::::GE:VA::V::NGA-:-:::G:IQ:ASE
rrnAC1443       T:SE:::::::::QE::::::::::::::::::::ESA:FI:H:::T:::::G:FV:A:D
Hmu1961         A:SE::::::R:::::::S:::::::::::::::::::::Y:L::::::::::TLGSASD
hla0876         :::E::A::RDD:AD::DA::::::::::::::VEE:S:SVA:::FPEH:::::L:E:I:
HQ1584A         :E::::AT:LSTITD::DETYTNIAETVSNSITV:TSL:KI::P::GD:SNS:E:AQ:I:
HVO_1020        T:::::EQ:D::I::::::::::::::::::::A:EFNGV::ASVSVD::::::::::T:
Hbo0514         S::Q:::R::::I:DV::S::::::::::::::A:DVNDT::ASVSVS:::::::A::T:

consensus       ALDAAAEAIAAAGLDADDDAETIASLLEAADTLEDGLDDAEEWDDLEVREQLRAEGFYDV
#oth            2233243333243..1.2.222.24.222215.341223.1311..21421.332.1.12
VNG0782         D:A:VS:R:S:::::::A::D::E::VA:T:S:DE:VA::Q:::::S::QK:::::Y:E:
NP3228A         :VETV::TA:DGR:::::::::::A::D:V:D::SD:::::::S::::A::::R:::::R
Hut1408         ::T::SDVL:DRD::P:::S:V:::::D::E::A:DIEA::AF:::S::AK::Y::::E:
rrnAC1443       ::TTVVD::E::N::P:E:T:::EG:::::E:::T:::E::V::::T:Q:::D:R::::I
Hmu1961         ::AD::T:LD:S:::P:E::DA::G:V::::A:::D::A::T::::T:Q:::D:R:::::
hla0876         ::::V:::V:D:D::P:A::::::A:ID:T:G::A::::::::::::TH:::::Q:Y:::
HQ1584A         Q::GCMS:::DE::::::::A::ET:I:T:E::TED:ES:::::::::N:::M:::Y:::
HVO_1020        :I:D:VS::E::D:::::::::::D:I:VT:G:A::::::Q::::::T::K:QVQ:::::
Hbo0514         :::D:IS:VES::::::E:::::D:::::T:E::A::E:::::::::TN:K:Q:Q:::::

consensus       LG-EHRKDFPPEWSALKEWEKR-------GNVEMILLALESL-DSEFMQEYCLDAFERMG
#oth            2332221.1.1.12122431421111111233132121435213.1.1232232215222
VNG0782         M::DKH:::::::T:::Q::Q::::::::::::::::CM:H:D::::::RH::::LLHVA
NP3228A         :TA:N:R:::::LNVVRIA:AE:::::::NDP:R::M:F:Q::::D::::N:I::LS:L:
Hut1408         IEG:::::::::LN:VLS::H:YKQSRDPDD::Q:::::DLM::::::E:NI::::::V:
rrnAC1443       :TN:N::::::::N:A:LHAEE::::::::DFDQV:F:YDK::G:::FDG:IV:LLYNL:
Hmu1961         :DN:N::::::::::::IYA:Q::::::::E::PM:F::GK:D:::::E::V::Q:LH::
hla0876         :::-:Y::::V:::::::H:A:::::::::::D::::::N:::E:D::ERH::E::::::
HQ1584A         :::-:Y::::::::::::::::::::::::R:D:V:::K::::Q:::::DH:MN:LV::A
HVO_1020        :::-:Y::::::L:::::H::::::::::::::::A::F::F:Q:D::::::IE::T::N
Hbo0514         :::-:Y::Y:::L:::::::::::::::::RAD:::::KDN::Q::::::::ME::V:::

consensus       D----PAAFDEMHQLAQRRDKGAIRVLGKMGDE--RAVETLVDYVDEDGDPALQKVTLRA
#oth            311323422133422.31.1352.222.1113212213121311243112.4.123221.
VNG0782         K:::::::L:AVG:::A:::PK::E:V::I:V:::DGL:HIEE::A:::S:N:RTTA:K:
NP3228A         P::::E:::E::N::::::EV:::E::::I:::::::::::S:F::-S:N:P:::A:I::
Hut1408         P:::::E:::PV:::::::::Q:::::::I::D::::::::::FL--:::::::R:::::
rrnAC1443       S::DAEP:::A:::R::K:E::P:E::::I:::::::T:::H::I:G:::::::::::::
Hmu1961         S::EAAD::::L::R::K:::LP::I:::::::::::AD::H:FIEG:::::::::::::
hla0876         KRGKTE:SLE:LLGR:EK::QF:::I::::AA:::E:T::::EF:S::SN:Q:::IVFK:
HQ1584A         :::::::::::::E:::::::T::KA::R::SGATD:::::SE:I:::S::G:::::F::
HVO_1020        :::::DR:YETIEGQ:K:::::V:KAI:::AA:::EG::M::::::T:S:::::::VFK:
Hbo0514         :::::::V:::::::::::::T::KA:::::ADAAE::::::E:::T:S::::::::FK:

consensus       LGEIGSAEATQPVANKLVAENDN---VRSVAARALGLIGDTRAIDPLADVLADDDSD-DV
#oth            1.1..15221.22.14.341635111..17...1...1.....13..4131531143141
VNG0782         V:::::R:S::V::DQ::::RAD::::::Q::::::::::::::A::V:I:ES:::E:T:
NP3228A         ::::::Q:::::L::A:AD:EPM::::::M:::G::::::::::A::E:::G:::EPPE:
Hut1408         ::::::H::::A:::C:DDDT:S::::::S::::::::::::::::::::::E::A:::A
rrnAC1443       ::A:::::SV:::::R:D:DSEE::::::::::::::L::::::E::S:::KSGE:::S:
Hmu1961         :::::::DSV:::::R::::D:E::::::::::::::L::::::E::::::DE::V::S:
hla0876         :::::A:::V::L:DQ:DP:G:TEDL::PH:::::::::::::::::::A::E:::::::
HQ1584A         ::::::SNV:::L::::IM:::::::::PY::::::::::::::Q::GET:RT:E:::::
HVO_1020        ::::::E:::::I:::::T::::::::::A:::::::::::::VE::S::V::::E::A:
Hbo0514         :::::::::::AI:D:::MD:E::::::PF:::::::L:::::::::::T::::EDN:T:

consensus       RASAAWALRQIGTERALETAAEYADDRAYLVQAEAEKAAEAL----A---T----
#oth            ..1.1...2....34.22411413.13213126..22.35413333224223111
VNG0782         ::::::::V:::::A:::A::::::::::V:EQ::T::VT::DHRD:ADASTGSA
NP3228A         ::::::::V:::::::::A::A:D:::V:T::L:::::R::-::::-::::A:::
Hut1408         ::::::::N:::::::K:I::::::::::V::V::::::GV-::::-:::-::::
rrnAC1443       ::::::::::::::T::DE::R:T:::::I:::::::::S:-::::-:::-::::
Hmu1961         :::::::::::::A:::DV:G::T::E::::::::::::SV-::::-:::-::::
hla0876         ::A:G::::::::RE:I::V:::::EHSFI:ST:::::EQS::::D:ASA:A:::
HQ1584A         ::A::::::::::RD::Q::::HV:E:S::I:H::KR::D::ESAP::::-::::
HVO_1020        :::::::::::::ND:::V::G:::::SF:::R:::L:::F:GDDVEAEA:V:::
Hbo0514         ::A:::::::::::E::::::D:T:EQS::::H:::L:R:R:GDAD:DAP:A:::