|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4295 | NP1746A | Hut2176 | rrnAC0546 | Hmu1350 | VNG0324 | hla2733 | HQ1573A | HVO_0806 | Hbo0728 |
3035 | NP1746A | 4308 | 2373 | 2567 | 2512 | 2619 | 2791 | 2685 | 2785 | 2744 |
3021 | Hut2176 | 2373 | 4278 | 2988 | 2866 | 2444 | 2461 | 2558 | 2619 | 2711 |
3409 | rrnAC0546 | 2567 | 2988 | 4478 | 3483 | 2712 | 2880 | 2767 | 2893 | 2926 |
3373 | Hmu1350 | 2512 | 2866 | 3483 | 4277 | 2741 | 2841 | 2790 | 2850 | 2973 |
3137 | VNG0324 | 2619 | 2444 | 2712 | 2741 | 4235 | 2826 | 2679 | 2864 | 2748 |
3338 | hla2733 | 2791 | 2461 | 2880 | 2841 | 2826 | 4480 | 2880 | 3043 | 3023 |
3340 | HQ1573A | 2685 | 2558 | 2767 | 2790 | 2679 | 2880 | 4316 | 3062 | 3302 |
3471 | HVO_0806 | 2785 | 2619 | 2893 | 2850 | 2864 | 3043 | 3062 | 4286 | 3349 |
3607 | Hbo0728 | 2744 | 2711 | 2926 | 2973 | 2748 | 3023 | 3302 | 3349 | 4471 |
631 symbols consensus ----------------------------MRNAKIVCTLGPASDDRATIRALADAGMSVAR #oth 1111112122222233323232323323.12......1...132444125.23...1.1. NP1746A :::::::::::::::::::::::::::::QR::::::::::::::G:::R:::::::::: Hut2176 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::ESK:D:KE::E::::::: rrnAC0546 ::::::::::::::MNAVNCGSPDAEVT::S::::::::::::SVDD:AS::K::::::: Hmu1350 ::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::::TESVEQ::G::E::::::: VNG0324 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TN:D:SV::::::::T::: hla2733 VPGATVTNVHSVATQPCGFFLSCAKSGD:::::::::I:::::S:DA::D::::::::V: HQ1573A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::EQS:::::VN::::::: HVO_0806 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F::E:::G:::::::::: Hbo0728 ::::::VNTLLDSEFIIGLFTRSAVVGA::::::::::::::::Q::::::S:::::::: consensus LNASHGTPEHRREVIDRIRAVDAATDEPLAAMLDLQGPEVRTAPIDEP--IQLDTGSEVR #oth 2.....3322.3321223141.4433311.2.3.33.......3231211.515311213 NP1746A :::::::TDE:A:LLS:VQ:A:E::AD:::::I::R:::::::T:A:::::R:P:::T:: Hut2176 ::::::S:::::TM:::::E:::EMEKS::V:H:IP:::::::::R:::::E::G:TTI: rrnAC0546 ::::::S::::::M:::::Q::E:VE::V:::::MP:::::::E:::::::::TE::TI: Hmu1350 :::::::::::::ML::::E:::T:ER:V:S:::MP:::::::::RD:::::::E::T:E VNG0324 I:::::DAAA:::L:ETT:::::Q::K:::V:::T:::::::::::DDGT:HIE:::D:A hla2733 :::::::TA::E:::E:A::::NEI:D:::V:V::K:::::::EL::S:::S:A:::::T HQ1573A ::::::::D:::L::::::N::KV::K:V:::V:::::::::::SSDS:::SIGSD::I: HVO_0806 M:::::NV:::SD:::S:::::D::::::::::::::::::::D:::D:::Y:E:::::: Hbo0728 :::::::::::A:::::::T::D::T::::::V::::::::::::::::::H:::::::: consensus FVEGDEATPERVGLSHSIAAVEPGDTVLLDDGRIETTVERVDGDSVHATVDSGGELGSRK #oth 1341121.1251.2152.32132..21........22.23.2224.4.3121..3122.1 NP1746A :IK:ET::S:T::::::::::::::::::::::::::::::::ET:I:R:::::AV:::E Hut2176 :YK::D::::D::::VD:SV:::::S:::::::::::::K:EDGD:Y:H:EN::K::A:: rrnAC0546 Y:V::D::::E::::Q::T::::::R:::::::::::::::EDET:F:::EN::::AA:: Hmu1350 ::QS:::::::::::L::TS:Q:::R::::::::::::D:::::::Y:::EN:::::A:: VNG0324 :::::T:::D:I:I:T::::A::::::::::::::AD:D::A::T:::::V:::S::::: hla2733 :::::D::::::::T:::::AG:::::::::::::CR::::::E::V:::V:::K:S::: HQ1573A :TT:::I:::VI:::Y::D::D::::::::::::::::RS::S:G:I:H::::::::G:: HVO_0806 :Y::::::::A::::Y::T:A:A:::I::::::::A:::Y:ED::::::IV:::::S::: Hbo0728 :I:::::::AE::V::P:D:A:K:::I::::::::A:::::E:GA:V:YI:::::::::: consensus GVNVPGVELDLDLITENDRRELDVAAEKEADFVAASFVRDAEDVYEISDALENRGAD-IP #oth ..121..4112143125.242.41..1432.2.....11214.12515341134.42221 NP1746A ::TPR::D:G::::DDE::ED:RL:::HG:::::::::G::A::::VV:T::SF:GTETA Hut2176 :::::::::G:PFP::Q::T::E::::::V:L::::::::GD::RK:G:F:::E:TE:V: rrnAC0546 :::::::::::PT:::::EQ:::::::::P::::::::::G::I::::Q:::E::V:::: Hmu1350 :::::::::::PAV:D:::::::::::::P:::::::::SGK:I:::EAEM:A::I:::: VNG0324 ::::::::::V:VV::K:::D:AL:::LDV:Y:::::::::D::LAVNRV::SH:::::: hla2733 :::L:::AI:V::::AE:EA:::L::RTN::::::::::N:N:::R:A::::E::G:D:: HQ1573A :::::::N::I::L::S::ED:R::::AN::::::::::S:A:::M:::::DAL:G:::: HVO_0806 :::::::D::I::::DS:YEN:KL:::::V:Y:::::I:::::::T:::T:::L::E::: Hbo0728 :::L:::K::I:::::G:::::E:::::N::::::::::S:::::T:::::::L:::::: consensus IVAKIERAGAVENLDEIIDAAYGVMVARGDLGVECPLEDVPIIQKRIIRRCHDAGVPVIT #oth 111.1..21.11..12.12113.1..........2.1.1..32...1.221431.2.... NP1746A V::::::GR:I::::G:::::D:::::::::::::::::::L:::::::::V:::I:::: Hut2176 V:S:V::K:::::::S::E:S:::::::::::::L:::E::LY::::::Q:NE::::::: rrnAC0546 :I:::::::::::::S:::E::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::: Hmu1350 :I:::::::::::::S:V::::::::::::::::::::::::F::::::K:QE::::::: VNG0324 :::::::::::::::G:::::Q::::::::::::::M::::M::::::AQ:R:::::::: hla2733 :::::::::::::::G:::::D:::::::::::::::::::V:::::::K:VN::::::: HQ1573A V::::::::::::::::::::::I::::::::::M:::E::V::::::TQ:::T:T:::: HVO_0806 :I:::::::::D::::::Q::H::::::::::::::::E:::::::T::KAQA::::::: Hbo0728 V:::::::::::::E:::E:S:::::::::::::M:::E:::::::::::::AT:T:::: consensus ATEMLDSMVHSRRPTRAEASDVANAVLDGTDAVMLSGETAIGDNPVRVVETMDRIVRQVE #oth ........242...............1....1....1...2..3.221.1..22.1231. NP1746A :::::::::SA:::::::::::::::F:::::::::A:::A::Y::EA::::A::::RI: Hut2176 ::::::::EE::::::::::::::::F::::::::::::::::H:A:::S::AD::NE:: rrnAC0546 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H:A:::::::::I:D:: Hmu1350 ::::::::I:E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:: VNG0324 ::::::::::A::::::::::::::::::::G::::A:::V::::T:::::::::::E:: hla2733 :::::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::D::N::::::::::::: HQ1573A :::::::::QA:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I: HVO_0806 :::::::::R::::::::::::::::::::::::::::::V::H::::::::S:::KE:: Hbo0728 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::: consensus SSAEYAENREQRVPTADEGSRTEALARSARYLARDIGASAIVAASESGYTARKTAKFRPG #oth 314.133522131.4144421.1...111.2.21.12.211.11....1..112.11..3 NP1746A A:G:::AT:DE:::A:KA:A::::::::::::::::D:T:::VV::::::::R::::::P Hut2176 Q:::F::L::::L:PS:K-T::D:::HA::T:VD::D:T::::::::::::LR::::::E rrnAC0546 G:E::::S::::::N:GD-T::D:::::G:F::::::::::::::::::::L:S::Y::S Hmu1350 :AP::DQ::::Q::A:G:-T::D:::::::F:::::::::V::::::::::L:S::Y::S VNG0324 G::::S:RQ::A:::::GTAK:D:::::::::::::D:::V:V::::::::::A:::::S hla2733 ::D::::T::::::::A::::::::::::::::::::::TV::V::::F::::::M:::: HQ1573A :::::GTIEQEH::::A:N::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::::: HVO_0806 A:P::D:SQ::::::::::::::::::::::::::VN:A:V::V:::::::::::::::: Hbo0728 ::P::G::Q::H::V:EDD:::::::::::::S::VN::::::::::::::::::::::: consensus VPVVASTPSDRVRRQLALSWGVIPVYAEYT-EDADAIMDNAVQAALDAGVADSGDTVVVL #oth 1.1114..2221..1.1121.1725325342623232323..32.22233131...2..1 NP1746A :::::V::D::::::::VA::IDAR::S:S:T:I:::LET::AK:TA::::E::::I::: Hut2176 ::II:::::E::::::::AR:IF:TT:PF:T:G::::VQ::::S::KT:I:E:::::::I rrnAC0546 I:I::::::E::::K::::::IT::TT:::T:G:::VIQT:::::::TEA:::::::::: Hmu1350 I:I:::::::E::::::::::I:::ST:::TQG::::IQ::::::::TEA::G::::::: VNG0324 ::::CA:::HD:::::::N:::HAN::AVAEG::TTVVER:::::V:S::VA:::::::: hla2733 :::::T::::::::::::::::R::LT::A:H:MET:L::::D::::T:G:A::::L::: HQ1573A :::I:I::N:::::::T:::::AST:SGSH:G:IEGM:ED::D:::::N::S::::I::: HVO_0806 :::::V::N::T:::::V::::SAQ::D:S:PSVEGV::D::T::::::::E::::I::: Hbo0728 :::::T::N:::::::::::::::K::D:R:AGI:D:::D::D:::::D:::::::L::: consensus SGMMTELEGTNTTNMLKVHVAAETVATGRKVVDGRVAGPLYRTDD-------GDLSDVPE #oth 1..21121.2212.2....21..3232.231.3.132112334521111111.1.34213 NP1746A :::IAGVA::DA::T::::TV::RL::::G::S::S::::V:::::::::::::::G:QS Hut2176 ::::::::::S:S::::::L:::::T::QS::::L:T:::V::T:::::::::::ES::: rrnAC0546 :::::::::M::A:::::::::::::S::SI:::L:T::VH:ISTAPPRESP::::N::: Hmu1350 :::::::::M::A:L::::::::RI:N::S::::L:S::V:HVP:::::::::::::::D VNG0324 V::::::::AS:::T:::::::::LS:::A:::::TT:RT::A:S::::::::::::A:: hla2733 :::L::F:::::::T:::::::::LV::KA::A::::A:V:::A:::::::::::::::: HQ1573A ::::::::::::::::::::V:::I:::::::G::T::::ATPT:::::::::R:DEI:H HVO_0806 :::::::::::::::::::::::P::::::I:G::::::::::E:::::::::::T:::: Hbo0728 :::::::::::::::::::::::A::::::::G::IS:::AI:S:::::::::::::::D consensus GAILALPADFDGEFDGDASKIGGIVDAREGMTGYPAIVARELDIPMVSGAPLPDAVEDGT #oth 112222343.12..411454111.122241411111311.1.22.1123141145244.3 NP1746A :::V::::G::::::::VTN:::::AVD::L::::::I:::::V::::::TV:A:::E:A Hut2176 ::::SV:::::D::L::P::L:::I:GHTNRR:HAVT:G:R::::T::HVTV::EL:::A rrnAC0546 :::::V:EG:::::V::T:R::::I:GH::V:S:A:::::::S:::I:N:D:::::S::S Hmu1350 ::VISIA:::::::::EVER:::::::HD:T:::A:::::::S:::IAN:E:::-LA::: VNG0324 N:VVL:AHG::::::::L::::A::S:DA:L:::::VI:::::V:::GDVDV-:::PA:D hla2733 :SVV::GPS:E:::T::LDA:A::::::::::::::V:::::GV::::::R::ES:T::: HQ1573A :::::::::::A:::H::AML:::I:::P:::::::VI::::::::I::::::PQIS::: HVO_0806 ::V:::SSE:::::::::D:LA::::::A:::::::L::::::::::::::::KTIAQ:A Hbo0728 ::L:::::E:::::H:::K:L:::I:::P:::::::L::::::L:::::::::ESI:P:: consensus TVTLDAERGVVYEGDVGRHDD---------- #oth 62.2121.111.2343677566433222111 NP1746A DI:V:GD:A:::::::VSRRTNGTETSVRDR Hut2176 ::::::::::L:R:QL:TL:::::::::::: rrnAC0546 :::::S:::::::ES:::E:ISGRERDY::: Hmu1350 Q::::::::I:::DTTEDDRS:::::::::: VNG0324 L::V:G:::::::A:Q-----:::::::::: hla2733 V::V:G::::::D:::IAATQKR:::::::: HQ1573A AI:IH::::I:::::LT:SH:QDRN:::::: HVO_0806 ::::H::::I::::::IN::RDSR::::::: Hbo0728 EL::H:::::::::N:LK:ESTRDP::::::