| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5043 | NP2310A | Hut1384 | rrnAC1455 | Hmu1942 | hla2592 | VNG0646 | HQ1646A | HVO_0986 | Hbo0455 |
| 3695 | NP2310A | 5039 | 3473 | 3384 | 3387 | 3366 | 3387 | 3315 | 3426 | 3484 |
| 3946 | Hut1384 | 3473 | 4994 | 3613 | 3642 | 3485 | 3549 | 3469 | 3612 | 3667 |
| 4228 | rrnAC1455 | 3384 | 3613 | 5255 | 4216 | 3642 | 3677 | 3767 | 3789 | 3872 |
| 4202 | Hmu1942 | 3387 | 3642 | 4216 | 5176 | 3614 | 3666 | 3680 | 3765 | 3808 |
| 4013 | hla2592 | 3366 | 3485 | 3642 | 3614 | 5099 | 3566 | 3628 | 3620 | 3780 |
| 4068 | VNG0646 | 3387 | 3549 | 3677 | 3666 | 3566 | 5220 | 3657 | 3838 | 4028 |
| 4183 | HQ1646A | 3315 | 3469 | 3767 | 3680 | 3628 | 3657 | 5025 | 3925 | 4123 |
| 4249 | HVO_0986 | 3426 | 3612 | 3789 | 3765 | 3620 | 3838 | 3925 | 5088 | 4245 |
| 4452 | Hbo0455 | 3484 | 3667 | 3872 | 3808 | 3780 | 4028 | 4123 | 4245 | 5078 |
727 symbols consensus MAGIFDFAPAIVLLPFASFLVALFAG----KYLPKGGALAGIAATAGSLLLSIWTA-VTV #oth 15422423.1.3.1.142.222.44.1111431..2..23..4.111112213332142. NP2310A :DL:YQLT:::::V:L:T:IIS:VF:::::QWM::K::I:::F:::AT:G::VV:LGWL: Hut1384 :T:::::::::A:::L:A:V:V:LG:::::N::::R::::::::LG:::V::ALSL::A: rrnAC1455 -MAA:TY:::::::::V:::::::::::::DRM:::::::::T::G::::::::V::L:: Hmu1942 -MTA::Y::::A::::V:::::::G:::::Q::::K:::::::::::::V::A:V::L:: hla2592 :IDV:SYV::::::::F:::I::GV:::::::::::::FG::::::::F:::L:VL:A:: VNG0646 :::ALE:I:::P:::::::::::L::YFAP:L::::::IP::V::::::VV:V:AF:::: HQ1646A :V::::L::V:I::::I:::T::AI:::::NR:::::::T::T::G::::IA:A::::A: HVO_0986 ::::L:::::::::::L:::I::G::::::R:M:::::::::G:::::FV:::A:F:FA: Hbo0455 :::::E:V::::::::V:::::::::::::::M:::::F:::V:::::F::::A:F:F:: consensus AGGETYNQTIYTWAA----GLE-AVELHFGILIDPLSALMLVIVSLIAFLVHVFSLGYMN #oth 23.3433352..23311112542534.51.2.2.1.212..21.21112..11....... NP2310A LT::PH:::W::LV::::::D::I:::S::::::Q:::S::::::::::::::::::::: Hut1384 :N:DP:HAEL::FLS:::::EG::IS:::::::::::::::TL:::::L::F:::::::: rrnAC1455 ::::VH:EIL:::T:::::SV::SLR:N::L:L::::::::L::C::S::::I::::::: Hmu1942 :::Q:::EAL::FT:::::::::TF:::L:::::::T::::L:::F::L::::::::::: hla2592 ::::AA:R:L::::SAGGI:PT:D:::S::::::::::::::::T:V:L::::::::::: VNG0646 SQ::YIAES::::V:::::APN::FS::::V:V:::A:M:::::::V::::::::::::: HQ1646A S::RV:TA::::::S::::::D:V:N:T::V:::::::M:::::T:VS::::I::::::: HVO_0986 S::Q::::H:::::T:::::AGD::T:D::L::::::SM:::::T:V:V:::I::::::: Hbo0455 SQ:Q::::::::::N::::::DG::T:E::L:::::::M:::::T::::::::::::::: consensus DEGETGLPRYYAGLGLFTASMLGFVVADNLLMAFMFFELVGLCSYLLIGFWFREPGPPSA #oth ....4..2....1.1..21...1..312.11...1..............12..241.1.. NP2310A ::::P:::::::::S:::::::A::I::::F:::V::::::::::::::H::::DA:::: Hut1384 ::::G::R::::E:S::AF:::A::F:::::::::::::::::::::::::::::::A:: rrnAC1455 ::::N::::::::::::::::::::::N:::::::::::::::::::::::::DD::::: Hmu1942 :::::::::::::::::::::::::Y:::I::::::::::::::::::::N:::A::::: hla2592 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N::::::::: VNG0646 ::::G::H::::::::::F:::A:::::::::::::::::::::::::::H::QQ::::: HQ1646A ::::V::::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0986 ::::::::::::::::::::::A:::SS:::::::::::::::::::::::::QE::::: Hbo0455 :::::::::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus AKKAFLVTRFGDYFFLIGVVAVFATFG-----TAAFA----GE----ESFPALAEAAL-- #oth ................1.1.11121.111111213.22222.4111122..42.23.122 NP2310A ::::::::::::::::V:::G:LV::::::::::Q:::::::A:::::G:::::Q::::: Hut1384 ::::::::::::::::V:T::ILSM::::::::GL:V:::::::::::G::K::QH:I:: rrnAC1455 ::::::::::::::::::::GI:::::::::::GL::PITQ:GEVVA::::M:::H::VD Hmu1942 ::::::::::::::::::::GI:V::AGATQTPGL::::::::::::G:::VV::H:IVD hla2592 ::::::::::::::::::::::L:::::::::::Q::::::::::::G::::::D::::: VNG0646 ::::::::::::::::::::::::::::::::::R:VATGE:A::::HA::HM::Q::AA HQ1646A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::S::::G:::::::::::: HVO_0986 ::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::::P:::::A::V:::E:::: Hbo0455 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::H:::Q:::: consensus ---EGEAA--VNTF----GMEPQTWFTVVGLLVLGGVVGKSAQFPLHTWLPDAMEGPTPV #oth 2334.4443345222111.3241412123...1....3...................... NP2310A :::D::::::IQ:::::::LSVEG:LS:L::::::::L:::::::::::::::::::::: Hut1384 :::D:---::GQ::Y::::LGAE:AI:LA::::::::I:::::::::::::::::::::: rrnAC1455 GEL::I:M::LE:V::::::G::A::::L::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1942 GAT::---::L::::::::F:::::::IL::::::::M:::::::::::::::::::::: hla2592 :::N:SGSVAWTPG:::::V:L:::L:::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG0646 VGG::TMPAH:AH:LDVV::SA:Q::S::::::::::I:::::::::::::::::::::: HQ1646A :::L::::ES:R:::::::F:::L:::II:::I::::::::::::::::::::::::::: HVO_0986 :::H::H:::::::L:::::GE:A:::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0455 :::H::H::::::::::::F:::::::I:::::::::::::::::::::::::::::::: consensus SALIHAATMVAAGVYLVARMYGFYALSPTALAVIALVGGFTALFAATMGVVKQEIKQVLA #oth ..............1.1.......1.2.12.11..12......1..1.11..4.1..... NP2310A ::::::::::::::F:I:::::::::L::V::I::F::::::::::::::::N::::::: Hut1384 ::::::::::::::::::::::::L::::::G::::::::::::::S:AL::::L::::: rrnAC1455 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::L:::::::::: Hmu1942 ::::::::::::::::::::::::::T::T::::::::::::::::::::::::L::::: hla2592 :::::::::::::::::::::::::::::::::::FI::::::::::::L::D:L::::: VNG0646 ::::::::::::::::::::::::::L::V::I:::::::::::::::::::D:L::::: HQ1646A :::::::::::::::::::::::::::::::::::FF::::::V::::::::R::::::: HVO_0986 ::::::::::::::::::::::::::T::T:GI:::::::::::::::::::K::::::: Hbo0455 ::::::::::::::::::::::::::::N:::I:::I:::::::::::::::R::::::: consensus YSTISQYGYMMLALGGGGYVAAVFHLTTHAFFKALLFLGAGSVIIAMHHNENMWDMGGLK #oth .........1.11..4.1.1.13...2...2..........1.......2.1..1....1 NP2310A :::::::::::V:::A:S::::F:::::::I::::::::::A:::::::::::::::::: Hut1384 ::::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1455 :::::::::::::::S:::I::::::::::V::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1942 :::::::::::::::S:::I::::::::::V::::::::::A:::::::E::::E::::: hla2592 :::::::::::::::A:::::::::::::::::::::::::A:::::::::D:::::::: VNG0646 ::::::::::::G::T:::I::S:::L::::::::::::::::::::::::::::::::R HQ1646A :::::::::I::G:::::::::T:::M::::::::::::::::::::::T:D::E::::: HVO_0986 ::::::::::::G::V:::::ST:::L::::::::::::::A:::::::::::::::::: Hbo0455 ::::::::::::G::::::I::T:::M::::::::::::::::::::::::D:::::::: consensus DKMPVTYYTFLAGSLALAGIVPFAGFWSKDEVLYEALIHGLGGS----PILLAAYAMGLL #oth 2211...21.12........2..1.......1.111.31122241111232.21.2.1.3 NP2310A :E:R:::L::::::::::::F::S:::::::::FDT:V:A::::::::TL::G::I:A:G Hut1384 ::::::::A::S::::::::F::::::::::::::T:::::::::::::L:::G:::::A rrnAC1455 :R:::::W::::::::::::::::::::::::::::::::F:TEGGLGTAY:V::::::: Hmu1942 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F:TEGGLGIVF:V::::::: hla2592 S:::::::::::::::::::F::::::::::I:::::V:::ND-:::::L::GG:L:::: VNG0646 K::::::::::S:::::::::::::::::::I::::::Y:A:D::::::::::::::::: HQ1646A K:L:::::::VT::::::::I::::::::::::::T:L:::D:N::::T::::::::::I HVO_0986 ::::::::A::S:::::::::::::::::::I:::::N::::TDGGLGTVF:V::::::I Hbo0455 :R:::::::::S:::::::::::::::::::::::T:::::::N:::::::::::::::: consensus AVFFTGFYTFRMVFLTFHGEPRSDTARDPHGVRWNVKGPLTVLGILAATIGFINMAPVAK #oth ..22.1...1...4.....31.12..13.13111.1.4..31..2..214.22.13..32 NP2310A :::L:::::I:::M::::::::::::E::::::::::T::S:::V::VVA:V::LV::E: Hut1384 ::A::::::::::L::::::::TE::EN::A::::::L::A:::::::VG:V::L:::E: rrnAC1455 :::::::::::::Y:::::DA::::::::EP::::::::::::::::T:::::::K:::E Hmu1942 :::::::::::::Y::::::A:TE:::K:::::::::::::::::::T::::V:L:::K: hla2592 ::PV:A:::::::::::::::::E:::::EP:::::::::::::T::VVT:::::V::Q: VNG0646 :::::::::::::V::::::::::::E::::::::::F::V:::V::::V:LV::T:::E HQ1646A :::::::::::::::::::N:::E:::E:EN:GM:I:I:::I:::::::T::L::T:::: HVO_0986 :::::::::::::::::::::::::::::::FG::::F::A:::V:::V::LV:::::ED Hbo0455 :::::::::::::::::::K::TQ:::::::::::::F::V::::::::A:LV::T:::E consensus LTGLH-IDFLHDWLNG----GWEAL---GNHHYEELLED---H-VAGYHAGEIG-----T #oth 31.311231.161.64212334432232352..541124131455323442434221112 NP2310A ::::E:VS::SEF:SR::::DVGL:::TD:A::S::::T:::AAY:::ET:YL:GGEEM: Hut1384 V::V::LT::::::GS::::AT:L::::SV::::V::H::YA:YT:ENPL::V::::::: rrnAC1455 :::A:::::::V::::PEEG::P:TLNT:L::::T::H::VA:ITK::PL::TT:::::: Hmu1942 ::::E:V::::K::L:SEGS::::::LT:YE:::HV:H:GPA:V:V:EPL:AT::::::: hla2592 VL::EG::I::R::DN::::E:GGIEGLSS:::AD:GP-:::YSSGSLVG::V::::::: VNG0646 A::::::E:::T::A:PEGTAFS::::::YE::HH:::S:::-:F:::::AD:A:::::P HQ1646A :::::::E:::K::EH:::::FTG::::TVE::G:::H::::-:::::G:TG:ELS:::P HVO_0986 :::I::LT::::::D::::::ISS::::TA:::L:V::S:::GVG::L:PAG:::::::S Hbo0455 F::::::E:::Q:::H:::::V:G::::T::::H::::N:::-:::::::A:LN:::::P consensus LLPGA-VSLGLALAGAGLAYRLYNVPEPVEHTDKLGGIKTLLYNNYYQDEYQVWLATGVT #oth 33321321.1..12.324.35..4123.33..21..22212111...1..1...1.5221 NP2310A V:L::GLG:::::L:::S::G::RGSD::R::A:::SLQ:V:MH::::::::::::E:F: Hut1384 V:A::A:::::::L:::I:::::A::D:E::::R:::L::::M:::::::::::::R::: rrnAC1455 ::AS:G:::::::::VLV:RS::AGAD::::::::::L::::MH:::::::::::::::: Hmu1942 :IAS:LI:::::V::VLA:RS::K::::::::::::S:::::MH::::::::::::::F: hla2592 V:V::A:::::::::LTV:W::::::S:T:::A::::::DV::::::L::L:::::YR-: VNG0646 FV:A:::::A:::G:::::WL::SG:A:TK::E:::AAR:::::::::::::::::K::: HQ1646A I::::::::::::::FL:::Q::::::::A:::R::SL::MV::::::::::::I:::F: HVO_0986 IA::L::::A::::::::::::::::::::::::::S:::V:::::::::::::I::::V Hbo0455 :A:::::::A:::::::::HM:::::::K:::A:::::::::::::::::::::::NS:V consensus QPLARAADKFDQGVIDGVVNGISSVSLFAGSRVRRIQSGVVSNYAALLTLGLVALLVAFG #oth 5211222211..111..2..22.11..1213.11.2.2.2.12..422111.32..2311 NP2310A VR:SK:::T::::::::A::AT:::::A::D::::L:T:L:T:::::II:::L::::F:A Hut1384 V:I:::::T:::SIV:::::AT::::::GSE::::::::::T:::S:V:::::::::::A rrnAC1455 Y::::VMN::::::V:::::::::::::G:::I::::::::::::T:::::::L::A::: Hmu1942 Y::S::::::::::::::::::::::::S::::::L:T:::T:::LFI:IA::V:::V:: hla2592 EDI:GG:NT::::I::::::SV::::::G::::::L::::::Q::M::::::I:::L:L: VNG0646 L::::G::T::::::::I::AV::I:::S:G:I::::D:I::H::TM::::::::::V:: HQ1646A :::::V:S:L:::::::::::V:G:::::::::::::T:I::::::::::::T::::GL: HVO_0986 ::IS::L::::::IV:::::::::::::::G::K:V:T::::::::::::::T:::LGL: Hbo0455 R:IS:G::::::::V:::::::::::::S:::I::::::::::::M::::::TV::LG:: consensus LLGGWF- #oth 23....3 NP2310A V:::::: Hut1384 ::::::: rrnAC1455 IM::::: Hmu1942 :T::::: hla2592 VT::::L VNG0646 VT::::: HQ1646A :M::::V HVO_0986 ::::::A Hbo0455 :A::::A