|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 6683 | HQ2930A | VNG1501 | NP2944A | hla1569 | HVO_2767 | Hbo2503 | Hut1148 | rrnAC0954 | Hmu1756 |
4880 | HQ2930A | 7081 | 3957 | 4341 | 4345 | 4516 | 4572 | 4229 | 4170 | 4264 |
4688 | VNG1501 | 3957 | 6205 | 4187 | 4306 | 4187 | 4249 | 4169 | 4024 | 4110 |
5232 | NP2944A | 4341 | 4187 | 6666 | 4596 | 4733 | 4744 | 4514 | 4646 | 4620 |
5483 | hla1569 | 4345 | 4306 | 4596 | 6821 | 5128 | 5050 | 4556 | 4435 | 4537 |
5633 | HVO_2767 | 4516 | 4187 | 4733 | 5128 | 6662 | 5308 | 4714 | 4700 | 4710 |
5519 | Hbo2503 | 4572 | 4249 | 4744 | 5050 | 5308 | 7020 | 4721 | 4559 | 4723 |
5327 | Hut1148 | 4229 | 4169 | 4514 | 4556 | 4714 | 4721 | 6790 | 4821 | 5095 |
5215 | rrnAC0954 | 4170 | 4024 | 4646 | 4435 | 4700 | 4559 | 4821 | 6837 | 5354 |
5392 | Hmu1756 | 4264 | 4110 | 4620 | 4537 | 4710 | 4723 | 5095 | 5354 | 6970 |
1060 symbols consensus --------------------------------VNLRGPILEVGDERTVETQYGERDLAEV #oth 111111111111111111111111111112333331143342423341414314251512 HQ2930A ::::::::::::::::::::::::::::::::MRI::Q:IRID:::E:T:DQ:S:T:V:: VNG1501 ::::::::::::::::::::::::::::::::---------------------------- NP2944A ::::::::::::::::::::::::::::::::M:V:::V:::D:PKS:::SH:TSQ:::: hla1569 :::::::::::::::::::::::::::::MTA::V:::::S::ET:::S:S::D:E:R:L HVO_2767 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::LV:::EP:D:::K::::S:::: Hbo2503 LTQTTLEGVGGNVSVIDNRDRQRFSPRHGPVG:::::R:V::S:::E::::::T:S:::: Hut1148 :::::::::::::::::::::::::::::::::H::::V:D:SETK::S::::::::S:: rrnAC0954 :::::::::::::::::::::::::::::MSVDRV::VVVDIEEPK::N:::::S::C:: Hmu1756 ::::::::::::::::::::::::::::::::---------::::Q::N:::::S::C:: consensus TIRP---DRGAGDP----------------VTVTLWGKWTETAEHAEPGMELLVTDAEER #oth 4312111322434322222222222221223321111212234553242.2211213222 HQ2930A :L:I::::DLPANEAAELDIPDSSLIEDPIR:L::::D:A::MTY:::E::::::NVDLD VNG1501 ----:::-------::::::::::::::::-------------------:::A:H::T:D NP2944A V::::::E:::AS:::::::::::::::::T:::::::::::V:YLAV:::::A::LD:: hla1569 R::::::::::::A:::::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::D HVO_2767 :L:::::E::T:E:::::::::::::::::::::::::::HA::::::::DI:::::::S Hbo2503 S:::GAAGD:PI:AVGDGSADTTDADGDAL:R::::::::H::DL:::::D::::::::S Hut1148 :::::::ED:RA:::::::::::::::::::::::::::::::SVL:A::DVA:Y::::: rrnAC0954 ::::::::::::E:::::::::::::::::T::::::::::N:AAI:T:::IA:YNPD:: Hmu1756 :V::::::D:R:E:::::::::::::::::::::::::::::GAVL::::SVA:Y:::P: consensus EYRGETQYSTGGDSWVVVEPDFLVDVTDIRSWVQCPRMYYLNKLSGIPLAYPVVKGTIVH #oth 2241233121242262111.2.2....11.21...1.1...1..2.3122..12...1.. HQ2930A ::::DPR:::TS::Y:IL::S:I::::::::::::::::::::::::::K:::::::::: VNG1501 ----GAG:A:AAS:::::::E:V::::::::F:::::L::::::::L::K:::T:::::: NP2944A TFD:D:::::T:E:A:::::::::::::::G:::::::::::::T:L::K:::L:::V:: hla1569 :FG:::G:A:T::::::L:::::::::G:::::::::::::::::::::N:::::::V:: HVO_2767 ::::::T::::SE:F:::::::::::::V::::::S:::::::::::::N:::::::::: Hbo2503 :::::PT:::AKE:Y::L:::::::::::::::::::::::::::::::N:::::::::: Hut1148 :::::::FT::E:TM:::::::I:::::V:::::::::::::::::T::::::::::::: rrnAC0954 ::Q::Q:::V:::ATL::Q:::::::::::A::::::::::R::D:AEH:::L::::V:: Hmu1756 :::::::::V:S:ARI::::::::::::V:::::::::::::::::T:Q::::::::::: consensus EVFGDLLRGRDLEDSIAERVDEAGLELGLLGRDADEVADDVRDNAAAIEGWLQQGTLTD- #oth 1........111341134212221.21....23332.2411121.3..1...3..31131 HQ2930A ::::::::::::SS::DD:::::::::::::::::A:REE::Q::T::::::D::::GP: VNG1501 :::::::::::::A:V:Q::::::::::::::SRA::EA::::::S:::::::::R:::: NP2944A :::::::::::::S::ES::A::A:DI::::ET::A::::::Q:::::Q::::::RFG-: hla1569 :::::::::ME::::VVD::E::::::::::YEPE::::E::R:::::::::S::::::: HVO_2767 D:::::::::::DS::D::I::R:::::::::EV:::::E::R:::::::::S::V:::: Hbo2503 ::::::::::::D:A:E:::A::::Q:::::Y::T::E:E::R:::::::::A:::::E: Hut1148 :::::::::::V::AV::::E:V:::::::::::ET:RQ:AL:H:S:::::::::H:::G rrnAC0954 ::::::::::::DTA:E:Q::A:::DI:::::E:::::G::::H:S::Q:::::::::E: Hmu1756 :::::::::::VAEAV:AH:ED:::D::::::::::::A::::H:E::::::::::::E: consensus --------EDEWRSEQTLISPRFGIKGRADALRRGMPVELKTGKNTKREPRFQDKIQAAA #oth 11111112112....3..1.311.2...1..2...3.........1312...1..1..12 HQ2930A :::::::S::T::::::::::T:::::::::::::I::::::::::DHD::::::::::: VNG1501 :::::::::::::::Y::V:E:::::::C::I::::::::::::::N:::::H::V:::C NP2944A ::::::::::S:::::::::E::::::::::V:::::::::::::L::S::::::V:::C hla1569 ::::::::::T::::F:::::T::L::::::::::T::::::::::::::::H::::::C HVO_2767 :::::::::::::::Y:::::T:::::::::::::S:::::::::LN:D::::::::::S Hbo2503 :::::::::::::::Y:::::T:::::::::::::::::::::::L::D::::::::::: Hut1148 GQTTFGPT:G::::::::::Q:Y:L::::::V::::::::::::::N::::::::::::: rrnAC0954 ::::::::T::::::M::::E:::M::::::V::::::::::::::::::::::::::T: Hmu1756 :::::::::::::::M::::S:Y::::::::V::::::::::::::R::::::::::::C consensus YALILGERG--------VPPDTGTLLYTKNAAVDRNEESGDLSPAKEFSIGRGLLEFVVR #oth .1.3.42231111111352211........2111.3.12.1.1...1..125.1.31.1. HQ2930A :::::VN::::::::::IDVN:::::::::T:::::::T:::::::D:::AP:::K:::: VNG1501 :::M:D:H:::::::::::A:::::::::::::::S:A:::::::::::::::F:::::: NP2944A :G:L:ADDI:::::::AD::::::::::::S:L::S:::::::::::::::P:F:KY:L: hla1569 :::M:E::::::::::::D::I::::::::T:L:::::::N:A::::::V:Q:::Q:::: HVO_2767 :::::E:::::::::::F:V::::::::::TTL::T::::::::::D::::::::::::: Hbo2503 :::V:D:::::::::::::AN:::::::::T:LE:H:::::::::::::::N:::::::: Hut1148 :::::::H::::::::EE::N::::::::::::E:T::G::::::::::::S::::::L: rrnAC0954 :::M::::AAGAGSAVDAA::::::::::::::::::::::::::::::::S:::NY::: Hmu1756 :::L::::R:::::::EEA::::::::::::::E:T::::::::::::::ND:::N:::: consensus TRNEIAAMEHDM--------SVPTGYEADAKCEYCFEQDTCMVVSGRLDQESKAGQVGTP #oth 3..21..2.4351111111142...1.1112.2....1...11.1..........52.52 HQ2930A K::::::::::::::::::::I::::::::I::::::::::R::A:::::::::::::QT VNG1501 E::HL::L:ASD::::::::GP::::::::::D::::::::::::::::::::::RI:D: NP2944A V::::::A:Y:::::::::::::::F::::N:D:::::::::::::::::::::::L:E: hla1569 E::AL::::WRALNDRGERPT:::::::::::Q::::::::::::::::::::::S:::: HVO_2767 :::::::::::V:::::::::::::::VNS:::::::K:::::::::::::::::A::K: Hbo2503 :::::::::F:T::::::::A::::F::::N::::::::::::::::::::::::KI:K: Hut1148 ::::::::::G:::::::::D:::::::::::::::::::::A::::::::::::::::: rrnAC0954 :::A:::::Y:S::::::::G:::::::N:::::::::::::A::::::::::::T::RA Hmu1756 :::::::::Y:A::::::::::::::::::::::::::::::A::::::::::::::::A consensus VPEDEREYFDRFYRAIEAERRAVHAEYRKLWEQSPEERADDDRALIDLEPTGQRELDDGR #oth 2.33.12.1123.4.2.2..123.3..1...3.3231..31...112.3.4332322222 HQ2930A L:A:::::LE:::H:::R::::::D::::::T:::S:::S::::::N:T:A:ATQ::T:: VNG1501 ::AE::A:::EL:D::::::G:I:D::::::::::D:::A::::VVG:S:AE:T::P::: NP2944A L::P::A::E:L:::::E:::E::::::::::::AA:::::::::V::D:L:REP::G:: hla1569 ::NE::D::::::V:L:E:::ET::::::::::T:::::A::::::::::VS:T:I::A: HVO_2767 ::::::D::::::::V:E:::S::K::::::D::A:::::::::::G:::I::T:RP::T Hbo2503 L::::::::::I:::::E:::ET:::::::::::AA::::::::::G:::LD:::IEGQ: Hut1148 I::::::::EAN::::::::::A:R::A:::R:DK::::E:::::::::::::::::::S rrnAC0954 ::DE:LD::E:::T:V:::::S::R::A:::::T::::::N:::::G:::::R::::G:: Hmu1756 I::Q::::::::::::::::::::R::A:::D:R::Q:::::::::::::::E:R::G:: consensus WELRARRTGDAVSKIREGDVALASDGDPVTGHAELARVERLGDE---------------- #oth .212.34223.2..1.2.132.111.2.25.62.221144.2521111111111111111 HQ2930A ::I::I:DD:::::L:N::I::G:N:N:I::QS:VC:IQT:DVD:::::::::::::::: VNG1501 :R:T:T:P:S:A:::::::RV::::::::A:R::M::::::DAD:::::::::::::::: NP2944A :A:S::::S::::::::::RV:::::H:TQ:T::::T:RH:D:::::::::::::::::: hla1569 ::::::KP::::::L:::::::::::::::::G::G:ITA:SED:::::::::::::::: HVO_2767 :::::KQ:D:::::L:A:::::::::H::E:::::::IVE:::::::::::::::::::: Hbo2503 :::T:KKPDG::::L:::::C:::N::::G:::::C:IRE:::R:::::::::::::::: Hut1148 :::::KA::-:T::::::::V::N::::IE:E::::::Q::SA::::::::::::::::: rrnAC0954 :::::TG::-::::::::NLV::::::::::N::::::::::N::::::::::::::::: Hmu1756 ::::::G::-:::::::::I::::::::ID:D::::::::::S:TREERSDEGVSETRAG consensus ---------------------------------IVVTADEPVELRRLDVYPSELSVDRML #oth 11111211111121221111111111123332311.21..134.2.1......1211.31 HQ2930A :::::::::::::::::::::::::::DDGDGT:::::::KIT:K::::::::IG::::: VNG1501 ::::::::::::::::::::::::::::::::RVE::T::::S:C::::::::::::::: NP2944A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::F::::I:::::::G:::Q: hla1569 ::::::::::::::::::::::::::::::::EV::ET:::::::::::::::I::::S: HVO_2767 :::::::::::::::::::::::::::::::::V:::T::::P:::::::::::T:::L: Hbo2503 :::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::I::S::: Hut1148 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:::: rrnAC0954 ::::APRA:::SDSGNG::::::::::NAVNEE::::::::LD:::::::::::TT::LQ Hmu1756 AKRHASRADEHSESADGASGETASSGDDSTRGE::::T:::::::::::::::IGT:::: consensus TALHDAVLKGDPDRKDVLFGRREPAFRD-------ADETFIDNNDAQNEAVRLAVDAEDF #oth 1.21.12.4224421111.2123.6.55221111155333121.31.13..41.13.1.3 HQ2930A :::D:FI:R::DTQ:A:F:N::::T:SNR::::::::::Y:PS:::::R::KR::N:::: VNG1501 :::::::::S:QR:T:L::D:AS:R:EG:::::::G:HDL:P::::::A::NR:LN:::: NP2944A ::::::::R:::::::::::::::S:VG:::::::DHRPI::::ES:::::NR:LA:::: hla1569 ::::::I:::SEA:::::::::::E:::AADRPAD:P:AY::::AS:::::S:::::::G HVO_2767 ::::::::::S:::::::::::D:D:S:RS::::::GR:::::::::DD::::::::D:L Hbo2503 ::V:::L::::S::::::::::D:::TER::::::SEA:Y:::::::::::K:::::::: Hut1148 ::I:::L:QQS::E:A::::GQA:::E::::::::VA:::VE::P::DR:::R::G:::: rrnAC0954 N:::::::LQS:EQ::::::::::K:NP:::::::VE::::::::::::::Q:::G:::: Hmu1756 ::::::L:TQP:EQ:::::D:::::::S:::::::I:::::::::::::::::::G:D:C consensus ALIHGPPGTGKTYTIARLVRALVARGDRVLLSAFTNRAVDNALEALRDQGF----EDIVR #oth ..1.........1.1.232311.12.2...1..........222.12311311113321. HQ2930A ::::::::::::::::Q:LSV::::::::::::::::::::::T:V::PDVDVSD:S::: VNG1501 ::V:::::::::::::T::Q:F::::::::V::::::::::::D:::Q::H::::::::: NP2944A ::::::::::::::L:QT:Q::::::::::::::::::::::I:::EA:::::::T:VL: hla1569 :::::::::::::::::TI::::EE:N::::::::::::::::::::::::::::DEVL: HVO_2767 ::::::::::::H::::TI::::ED:N:::::::::::::::::::::::::::::N::: Hbo2503 ::V::::::::::::::I::::::D:N::::::::::::::::::::::::::::A:A:: Hut1148 ::::::::::::::L:T::D:::E::E:::::::::::::::V:::LE::V::::::V:: rrnAC0954 ::V:::::::::::L::M:::::::::::::::::::::::L::::EE::Y::::T:::: Hmu1756 ::V:::::::::::L::I:::::::::::::::::::::::CI:::EE:::::::T:::: consensus VGTESGVRDDMQDYRLDRSGDPNARAAALRDAPVVAATTATCGSRVLREQSFDVALVDEA #oth 3.113.1121114321443.2.423142132.2......12..11322223..1121... HQ2930A :::NA:ID:S:::IK::DT:S:A:C:T:VQS:S:::::::::::::M::::::::VI::: VNG1501 ::::T:::A::::L::::::::GE::::::S::::::::::::::I:::LE:::V::::: NP2944A W:S:::::::::S::F::T:::RE::::::::Q:::::::A::::A:KQ:Q::::VI::: hla1569 ::S:T::::::::V::VQR:::::K::E::::::::::::A::::::::CE::::::::: HVO_2767 ::::::::E::::V::S:::::::L:::::N:::::::::S:::::M::::::A:::::: Hbo2503 ::::N:I:E::::LH:KTT::::D:V:E:T:::::::::SS:::::M::::::::::::: Hut1148 M:::T:::E:LKHV:::PA:N:D:::DE:T:::::::::::::::IM:::D::::VI::: rrnAC0954 ::::::::::::K:::ET::::GEC:SR:QS:Q::::::::::GST:QT:E::::V:::: Hmu1756 L:::::::E:::Q:::ETA:::DDCVGR:E::S:::::::S:::::AKT::::::I:::: consensus SQLTEPGTLAAINRADRFVLVGDHEQLPPVVRAEND---------LQTSLFERLIEAYPD #oth 1.1...2121.22112.1......2......11232111111112.13...11.113211 HQ2930A ::::::N::::VAL:::V::::::Q::::::::DT:::::::::::::::::::::TH:E VNG1501 ::::::D:::::::GA::::::::::::::::SGGR::::::::::SK::::::H:T::E NP2944A G:::::::FL:T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::DD::: hla1569 ::::::::H::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::E::: HVO_2767 ::I::::::::V:L::::::::::K::::::::::::::::::::::::::Q::::T::: Hbo2503 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::::::D:A:E Hut1148 G::::::A:::VA::E::::::::::::::::::D:IADRDATAD:SQ:::::::D:HS: rrnAC0954 G::::::::::TTL::::::::::Q::::::QS:DE::::::::T:S::::::::D:H:: Hmu1756 G::::::::::TTL::::::::::Q::::::QS:DE::::::::T:SR:::::::::::: consensus ASVMLDRQYRMSQRIQAFASREFYDGQLRPATGEVAAQRLADL----------------- #oth .2.1..1....1.2..111.21....2....2421.3.224.111111111111111111 HQ2930A :::L:::::::A::::::S:QK::::E:::::RT::T::P:::LDETPTGPATDGGDGYR VNG1501 ::::::Q:::::::::::S::::::::::::SS:::G:::T:V::::::::::::::::: NP2944A :A::::::::::::::Y::::::::::::::NA:::S::::::::::::::::::::::: hla1569 ::::::::::::::::::::A:::::A:::::P:::G:T:R::::::::::::::::::: HVO_2767 ::::::::::::::::::::::::::A::::::A::::H:R::::::::::::::::::: Hbo2503 ::::::::::::::::::S:A:::::A:::::::::::::S::::::::::::::::::: Hut1148 :G:L:::::::A:::::YS:::::::::::::::I:G:T::::::::::::::::::::: rrnAC0954 :G:::::::::A:H::::::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::: Hmu1756 :::L:::::::A:Q:::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::: consensus ------------DGVDPAALPEALRDGVAFVDPDGSRDGNTNPTEADRVADIVAAYLAAG #oth 111111111111111344411451314.5.4.23.441112124..311.23142143.. HQ2930A QQKQQRLDAHQD:QTQTHT::AH:::P:V:I::::T::::::L:::::I::::TT:IN:: VNG1501 ::::::::::::-::::GG---:VHG::T:Y:VP:TD:AHVD:A:::::::V:T::VD:: NP2944A ::::::::::::::::VST::S::::A:S::::G::A::::::::::::::::S:::D:: hla1569 ::::::::::::-:::::D::DG:AG::D:D::::T::::R:VR::E:::E::D::V::: HVO_2767 ::::::::::::-:::T:D::AE:A:Q::::::::R:V::::::::::::EV::::E::: Hbo2503 ::::::::::::-:::ES::::P:::P:::I::N:::V:::::V::E:::EL:ETFV::: Hut1148 :::::::::::::::::::::DH:GGR:T:L::::QAV:::::D::AA::QT:ES::D:: rrnAC0954 :::::::::::::::AT:S:::::::R:::::SG::QV::::::::::I:E:L:S:RS:: Hmu1756 :::::::::::::::TLD::::T:::::N::::::HV::::::A::RA:::V:D:::::: consensus VDPDDIGVIAPFRAQVAEIGRRTP--VTVDTVDRFQGSSKEVIVVSFVATGSLDGPIFED #oth 222421.....1.....11221333111..........1..1121.1..223.22.1... HQ2930A I::S:::::::::::::A:SQ::S::::::::::::::A::I:II:::::N::EE::::: VNG1501 L::GE:::::::::::::::::::AG:A:::::::::::::::::::::R:T:E:::::: NP2944A ::::::::::::::::::LS::IDE::::::::::::::::::I:::::::E:SS::::: hla1569 :::::::::::::::::::::::A::::::::::::::::::::::L::::D:::::::: HVO_2767 ::A::::::::::::::::S:::D::A::::::::::::::::::::::::E::::L::: Hbo2503 :E::::::::::::::::::K::D::::::::::::::::::VI:::::S:T:::::::: Hut1148 :::G:V:::::Y::::::::Q:V:DG::::::::::::::::VL:::::::::::::::: rrnAC0954 :PAA:::::::Y:::::::SK:L:D:::::::::::::::::::I:::::ET::S::::: Hmu1756 IESEAV:::::Y:::::::DKHV:EG:::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus HRRINVALTRAKKALVLVGDADALSSDPFYARMLEWARR- #oth 2..2...11..113.2.1..44..31213.41122..441 HQ2930A T::V:::I:::R:G::::::TA:::::::::TL::::KQ: VNG1501 :::V::::S::::S::::::ER::R:E:L:D::ID::DME NP2944A Y::V:::::::::::::::::T::R:V:::E::::::G-: hla1569 :::M:::::::::Q:T::::D:::A:E::::::::::Q:: HVO_2767 :::::::::::::::C::::::::E:::::D:::A::::: Hbo2503 :::::::::::::S:::::::N::E::::::::::::::: Hut1148 Y:::::::::::R::::I:::::::T:ER:R::V::::-: rrnAC0954 Y:::::::::::::::::::G:::AT:EV:G::V::::G: Hmu1756 Y:::::::::::::::::::ER:::T:EL:E::V::::-: