|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 5348 | VNG2267 | Hut1728 | rrnAC2857 | Hmu2870 | NP1350A | hla0679 | HQ3684A | HVO_0185 | Hbo1313 |
3089 | VNG2267 | 5399 | 2511 | 2444 | 2432 | 2509 | 2504 | 2291 | 2450 | 2479 |
3333 | Hut1728 | 2511 | 5390 | 2790 | 2641 | 2684 | 2416 | 2498 | 2508 | 2551 |
3295 | rrnAC2857 | 2444 | 2790 | 5621 | 3453 | 2859 | 2418 | 2413 | 2476 | 2441 |
3212 | Hmu2870 | 2432 | 2641 | 3453 | 5410 | 2579 | 2314 | 2249 | 2420 | 2397 |
3427 | NP1350A | 2509 | 2684 | 2859 | 2579 | 5549 | 2658 | 2490 | 2699 | 2614 |
3511 | hla0679 | 2504 | 2416 | 2418 | 2314 | 2658 | 5663 | 2934 | 3108 | 3008 |
3618 | HQ3684A | 2291 | 2498 | 2413 | 2249 | 2490 | 2934 | 5603 | 3536 | 3462 |
3915 | HVO_0185 | 2450 | 2508 | 2476 | 2420 | 2699 | 3108 | 3536 | 5352 | 3702 |
3739 | Hbo1313 | 2479 | 2551 | 2441 | 2397 | 2614 | 3008 | 3462 | 3702 | 5447 |
803 symbols consensus --------------MSSALDEDTRRTIASGRETAGAMLRAAQKDLQKVFIVFLVGFLGTF #oth 11111111112222113221212412235..113122.131.32..1..11112.22111 VNG2267 ::::::::::MSGSG:DLVSPG:A:A:D::::SI:VL:ST::DR::H:::A:V::L:AGI Hut1728 ::::::::::::::::G:::DG::::L::::::L:::::S::Q:::::::A:VL:LV::I rrnAC2857 MNKLITPTGLGTEK:A::I::::VQ:VQ:::A:L:::::S::VH::::::::VI:MI::I Hmu2870 ::::::::::::::::TG:::::M:SVQ:::::M:S:::::::H:::::::WV::LV::I NP1350A ::::::::::::::::::V:D:VA::V:Q::ASL:VL::N:::H:::::::::L:::::: hla0679 :::::::::::::::A:::::::QQSL:E:::S:K:F::SI::::::::V:::L:::A:: HQ3684A :::::::::::::::A::::D:A:QA:GT::::::::::::::::::::::::I:::::: HVO_0185 :::::::::::::::::::::::QQ:::A::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1313 :::::::::::::::::::::::::A:DD::::::::::::::::::::::::::::::: consensus YALRLFVWDFLKADT-RAQM---VAEAASIIAQTPFDVILLQAKIGLVVGVIIALPLFIY #oth 3311432.34135221845135547544411131..1.1.1.1...133.31423.512. VNG2267 FVM:::I:PT:E::L:----:::LPAN:EV::::::E:::M:V::::FA::LA:::VLA: Hut1728 WI:QS::::R::T:M:F:G:SEE:R:GTNVVTVS::::::::V::::I::A:LSV:::L: rrnAC2857 MG:QYG:::T:R::LLYS::DLTTQ::T::V:V:::::::::V:::A:I:ILMS:::L:: Hmu2870 :::QE:L::R::::M:IER-:::T::E:D:V:V:::::::::V:::A:I:ILL:::FL:: NP1350A M::::YI::I::R:L:N:H-:::--PDIVVV:I:::E::::::::::AA::::M::ALA: hla0679 W:::V:I::S:YNI::QSN:SPE::AE:DV::T:::E::::::::::I::::F:I:P::: HQ3684A :::::V::E:::SV::V:::NAQIKD:V::::::::::::::::::::::L:::A:I::: HVO_0185 :::::Y::E:FRGV::K:::DAS:SGNV:::::::::::::::::::::::LF:::P::: Hbo1313 :::::Y::G::ESV:::RN:NQVINQDLE:::::::::V:::::::::T:L:::A:V::: consensus FSRDALRARDLWPQAPVARWKLALIGLIMVGLFVGGVAYAYFLFFPIMFSFLAGNAVNAG #oth 32134.34.242.454124.13544334334.144.11.2153...21.6...422452. VNG2267 HAKRP:QD::IV:PIS:T::Q:GGVLV:AA::AAL::L::::A:::L::Q::::::DTV: Hut1728 :::::::R:NWL::::I::::MVFLVVA:LA:::::I::::SV::::::R:::S::I::: rrnAC2857 :G::G::Q:GW::AEHIPT::GS:FVT:SL:::F:::::::E::::L::N::::D:FK:: Hmu2870 Y::::::E:::::ADR:PL:::WSLL::AI::::::IL:S:N::::L::D:::E::DA:: NP1350A :::NS:K::GY:::N-IP:::AVSFVIASAT:::::I::::Y:::::::::::::::::: hla0679 VA::E::::GA:::S::::::::GM::LG:::::V::::GVYA:::::::::::FGLE:: HQ3684A Y:::::EQ:G:::S::::W:::LI:A:GG:S::II::::G::::::FT:::::K:::A:: HVO_0185 V::G::K:::A::KS:::P::::::::T::A::AA::::G::V:::FT:A:::Q::IS:: Hbo1313 :::::::E:::::S:::P::Q:::::TG::V::SL::::G:LF::::T:E:::Q:T::I: consensus FQPTYSIVKWAQFIFLLSLSFGLAAQLPLVMTGLSYAEIVPYETFRDKWRYAVVGIFAFG #oth 15.4.2.21.32.231.33..12.2.1..3134.1.321.3..1...2.12.1422232. VNG2267 LS:K::::::TE::LF:::::S:::::::L:S::::SG::A:::::::::::I:A:AT:: Hut1728 :V:::H::::VE::L:::::::I:S::::::ST:A::D:::::::::::KH:IF:LY:G: rrnAC2857 :T:Q::::::F::V:::AV:::::::::::::V:::T::::::::::::::::M:::::: Hmu2870 :R:D:::T::VG:VA::GF::::::::::F:SA:::TG:::::::::R::V:::L::G:: NP1350A :::::::SM::::::::AF::::::::::F:GT:::S:::R::::::::K:::I:::::: hla0679 L::::G::M:TE::VF::::::::G:M::LI:::::SG::Q:::::::::::::A::V:: HQ3684A :A:::::::::::::::TI:::F:S::::::P::::VD:::::::::::::::L:V:VA: HVO_0185 :T:S:::::::::::::T::::::S::::A::::::::V::::L::::::H:I::::::: Hbo1313 :S:K:::::::::M:::TV:::::S:::::::I::::::::::::::Q:::::L:V::A: consensus ALFSPPDPFTQIMWAVPLVGLYGISLYIAKIVVTAKRGSDQIDVKGTARARWNILAGGAV #oth .1.1....1..21.14.134..23..3221222322.22262254434242..5231643 VNG2267 ::::::::::::L::T:::L:::L:::VS:::::V:::R:D:::R:VF::A::RIL:VV: Hut1728 :V:T::::I::L:::T::::::AV::Q:T:L::G:::SRG:V::SE:L:::::V:::T:I rrnAC2857 :::::::::::::::A::C:::::::AL::LAMLVR:SG:LVSTWNV::GH::TIL:::: Hmu2870 :::::::::::V:::L::::::VV::G:S::L:LT::AGEEVGA:SV::T:::K::A::: NP1350A ::::::::::::::G::::T:::V::::S::::::::S::A::L:::::::::::::LF: hla0679 :V:::::::::L:::F::IV:::F:::L::L::::Q:S::R:::L:A::NH:::VG:A:: HQ3684A :::T::::::::L::::VLA:::::::L::::TI:R:::E:::ISASMG:H:::I::F:F HVO_0185 :::T:::::::::::::VIL::AF:::L:RV::::::::EK::::S::TTH::L:::VG: Hbo1313 :::T::::::::L::::VLT::::::::S:V::::R:::E:L:FRAAIGK:::LVV:STA consensus LGGGVVYAFYAYGGFQAINDGLAAAGSDYRF--LAPGAALGVPEETAAAALAAVFGLVAA #oth 323222.33352216543243156441344512344256313446434446433514434 VNG2267 ::F:AG::VEQ:N:I:LF::::::L::GV:V::PTVER:::::TD::VLV:G:A:AAL:V Hut1728 TAFA:::G:FSA::VG:::E::SM:PG:LGP:VPTI:::::L::SQ:::LV:G:VAVM:V rrnAC2857 :::::::YVL:TPA::Y:QQFAEVFP::RLTGDIQ:P:LF:L:V:RT:VL::::::VIG: Hmu2870 VA:::::YLL:TPA::Y:RAFA:WFP::RLTGDV:RPDL::LGT::T:I:I::::::::: NP1350A V:AAA:::::T:::YL:V::A:::VD:S::::::P::EGY:IA:TIYLGIAG:IY:A:F: hla0679 ::S:L:::::E:::RTGF::L:RL:N::W:::::E:::S:::NPA::T:IY::GWA:AFV HQ3684A C::::T:L:FNT::TIIA::A:VILE:Q::L::IT:EDP:------LF:TYTLAS::ITG HVO_0185 VV:LL:::::E:::VELA::::::I::::V:::::::S--::----:LG:FVVAG:F:GL Hbo1313 :::A:::LY:T:::PT:V:GL:DSV::::SI::P:L:TV:::APQ::LIVWSV:GAT:FT consensus AAGLGYLVYSDLD-AAA--GAEAGVGDPAAIDLGELDAAGVRAAPPEAFAALEEDEALAL #oth 23244243463236553115556442..331.254.2342112..232.3214.412214 VNG2267 L:ATL:YL:VAV:R:::RN:PRSRRP:::D:::NA:::::IE::::::::::S::::::T Hut1728 :IVGFR::A:QVQQE:G::L:M:TM:::S:::I:N::K::IE:::::::E::::H::M:H rrnAC2857 V:V:Y:H:LTA:S:EK::::PGR-::::T:::IE::N:SA:EV::::V:EEMT::::::H Hmu2870 VVV:Y:YMIQA::V:::::E:GN-Y:::T:::IEP:S:GA::S::VQR:QEM::Q:::E: NP1350A :::F::::::G:QSTDD:::YALIAD::ED:::Q:::::SI::::DAV:ED:D::R:V:: hla0679 :VATLWA:FA:::TTS::::YQ--Y:::::::V::::::::::::DN:::EMD:E:S::: HQ3684A :I:V::AI:T:I::DL:::AI::::::::S::::T::ET::::::::V:::MN:P::M:A HVO_0185 :F::A::::R:IE:RLE::RT:I:::::TKL::SA::V::::::::::::D:::::VM:: Hbo1313 VI::::V::K:IEESVG::PL:R:::::SK:::R::::M::::::::::TD:S::::M:I consensus ASAAIDDGDKDKAQAILDRFDEAQ---------------------AAGEGAGADADDG-- #oth 144.23212551.11221.2.425222222122222222233334447455244244623 VNG2267 ::Q:M::::DR::ELV:::::A:A::::::::::::::::::::::DDDDT:SE::NP:: Hut1728 VNE::GN:NT:::EL::::Y:::N::::::::::::::::::::ER:QNRQD:T:EG::: rrnAC2857 :DS:LA:DN:E::::V:::W:M:H::::::::::::::::::QDDPEP::E:DG::GTAE Hmu2870 :QS:M:::NP:::E:::G:W:F:::::::::::::::::::::::DTMA:T:EA:E:D:: NP1350A :GQ:MEADEHGR:::::::::Q::EAAEASDADADRDVDDDAADD:::D::ATA:AA::: hla0679 :Q:::::D:PE::::::::::AVHGEGDGDDGADGSATGSGDGAGRS:GSG:SGGSG:SG HQ3684A ::D:::A::RT:::::I:::::DG:::::::::::::::::::::KDA:NS:S:PTESSQ HVO_0185 ::::::::::A::::LI::::::E::::::::::::::::::::::DR:AEA:::E:E:: Hbo1313 :GD:L:::::::::::V::::::E::::::::::::::::EGQNAD:EAA:::::::Q:: consensus -DEED----SDRATRAGAGFLDAF---------------------TEGETT--EDDIGGY #oth 33444212244354223422221111111111111111111111121222222.1121.. VNG2267 ::A:S:::::ATMQ:TA::MM::::::::::::::::::::::::::DD::::::::::: Hut1728 :E:G::::::GVVSETAT:VV::::::::::::::::::::::::::E:::::::::::: rrnAC2857 A::::::::AGVF:STT::MV::::::::::::::::::::::::::D:::::::E:::: Hmu2870 :::D:::::A:VV:STT::VMN:::::::::::::::::::::::::E:::::::::::: NP1350A :::AE:::::SFLASR:::V:::::::::::::::::::::::::S:DDID:::::V::: hla0679 G:DGLMGTVQ::TS::SST::SEL::::::::::::::::::::::D:DEEEA::::::: HQ3684A QSQSTLGSIRE::G:::KT::SE:DRGETDAKTETETDTNTNTNTD::S::ST:EEFT:: HVO_0185 :PG:L::::E::T::::GA:VSEL::::::::::::::::::::::::::D::::::::: Hbo1313 :PG:L::::E:::::::GT::SEL::::::::::::::::::::::D:::D::::::::: consensus YYDIAFILDSLTSRAFRLVGVFMAVLAAAFGWLYTGGIGDVRRDFLSRLPAEIRPD--LN #oth 23.23.122212.22133214.2332233.53..51.235245213413.3445343244 VNG2267 :H:LR::F:::R:::::I::G::L:MVGV:::::Y::LATL:Y::IT:I:Q::Q::ANSW Hut1728 M::LR:::E::::K:::::A:::::::GS:MY::S:::::I:::::R::::DKIDQ::GD rrnAC2857 ::::Q:::SA:A::::VIL:I:G:::::::LF::Q::::SIQ:T:V::::P:MAA:::VS Hmu2870 :H:::::::::::K:IWF::T:::ISG:::VF::S:::::I:NT:V:N::PSM:A:::VT NP1350A A:::::VV::I::KS:Y:F:::AGIM::T:FL::R::::VLHEQ:V::M:SQFTAEQ:VS hla0679 :K:LK::F:::R::S::::A::GG:M::V:T:::L::LAT::N:LE::V::::EGG::I: HQ3684A :T:VR:::::I::H:::::A:::TT::V::::::::::KQ:YD:::R::::Q:::EEV:: HVO_0185 :T:::::V::::::::WV::W::L:::TT:::::::::R::YD:::G::::AV::EEV:: Hbo1313 :K:L:::FETI::KT::I:A::::A::GT:T::::V:FKA:FQQ::N:::::V::NEV:: consensus IVTLHPVEALIFEVKFSTILAAVAVLPLVLYYAWPALRERGLVAGRRRTLLLWGGALVAG #oth 323...1.1.2.31.2.222123213.132.12..1121.232433154233.3.21533 VNG2267 PI::::::::V:Q::L:VVI:::::V::LV::L::S:S:::::T:D:S:I:A:::S:AVT Hut1728 :AV:::::H:V::I:V:AL::V::::::::::V::::K:::WA::D:::::V:::S::V: rrnAC2857 ::::::::H:V:I:::::::G::S:I:V:::F::::M::::::I:N:NI:GI:::T:F:A Hmu2870 F:N:::::H:::I::::A::G::S::::IV:F:::::K:::F:G:Q:GV:GI:S:TVI:S NP1350A ::::::::::::M::V:VV:GVA:::::L::F:::S:KT:::AR:D::V::V:::T::TA hla0679 :I::::::::::M::::VL:GI:::F:VA::::::::::::F::::IYKVY::A:::LG: HQ3684A V:A:::M::::::::L::::::I:T:::AA::::::::::E:I:Q::HAVF::T::VG:: HVO_0185 V:A:::M::::::::::::::VL:T::::A:FV:::::::NIIRK::::VFV:T:::AG: Hbo1313 V:::::M:::L:::::::LV:IIVT::::A::::::::::NI:RR::S:IF::T:S::V: consensus LLGGSYLGYTYVAPAVISWLVNDALQAN---MIIAYRVTNFGWLVFFTTVGIGLLADIPI #oth 252.232.1431..22121117123513111.113.214313.12231.2...2.131.2 VNG2267 :V:::::::A:I::::::F::G:::::G::::V:S:TIGT:A::::LL::::::::S::V Hut1728 ISV:::I::SF:::::M:::AS::IN:H::::VVR:::NT::::LV::::::::::E::: rrnAC2857 :I:::L::FL::::TT:::IAY:Q:NS:::::V:::::S::::::::L:I::::::E::V Hmu2870 MV:::LV:F:::::T:::::AF:V::SG::::::S:::AK:::::LAL:::::::FE::V NP1350A :GI:::::FFH:::::::::AA:V:T:GREG:V::::IN:Y::M:::L:::::I::M::A hla0679 ::::FA:::A:I::GI:G:::T::EL::::::::T:Q:SD:L:::VY::::::F:::::: HQ3684A :A::FV::::II::T:::::::S:VI:D:::::V:::I:::F::I::::A:::::::V:: HVO_0185 ::::FA::::::::T::TF::E:::A::::::::T::I:::F::I::::A:::::::V:: Hbo1313 ::::LV:::F:I::::::::::::V:::::::::S::::D:F::I::::A:::::::V:: consensus TMLLFNRGGI-SYRSMRNRWREVTVAIFALAAVFTPAGIFTMFLVTIPLMAAYGVGLGVL #oth 3.3.125212221553261..2212343532.231.52351112332.3351132.112. VNG2267 ::V:::H:N:V:FDT::R:::VPVL:T:FF::LA::DSLY:::I:AL:VATM::L::AI: Hut1728 :::::Y:::LV::ER::SG::V:VL:F::::::V::G:M:SLLM:A::AAL::LL:::I: rrnAC2857 ::F::HK:::IPF:L:YE:::::VI::V::S:ILS:S::::::I:G::TAL::ML:::I: Hmu2870 :::::H::N:ITFQ:VQD:::T::LGV:VAG:L:S:K::::::::SV:VTI:FL:::::: NP1350A :::::Y::::VP:LT::T::::FV:LV:G:::::S:R:::::::LG::VVF:::::::L: hla0679 A:I:L:NA:::P:DVF:::::::::G:MLF:::::::DVI::::A:L:::::::::I::: HQ3684A I:I:L:NA:V:::N:::G::::::::ML:I::I::::D:L::::I:::::T::AI::::: HVO_0185 L:V:L:TA::::::M::::::::::F:L:IS::::::S:T:::M::L::::::::::::: Hbo1313 L:V:L:GS:::T:QVL:S:::::::G:LTF::L::::::VS:::::::::V::::::A:: consensus FLLTLGGRRDLAPASEPAD---- #oth 243.21...64645534453111 VNG2267 YA:::::::GGDSR:T:T-:::: Hut1728 W:Y::::::KG--PLT::TT::: rrnAC2857 WVY::::::TTNRR::::::::: Hmu2870 W:Y::::::APE-GA:::::::: NP1350A WM:::D:::ERR-QV:::::::: hla0679 ::V::::::::S:P::FVGR::: HQ3684A :II:I:::::R:TDHDRGAEANT HVO_0185 :V::V::::::S::RGA:E:::: Hbo1313 :VV::::::N::::RDSI-::::