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Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2179 | HQ1376A | NP0770A | VNG2608 | Hut1018 | Hbo1075 | HVO_0431 | Hmu0351 | rrnAC2106 | hla0209 |
1409 | HQ1376A | 2157 | 1235 | 1186 | 1208 | 1330 | 1286 | 1187 | 1268 | 1233 |
1628 | NP0770A | 1235 | 2167 | 1356 | 1350 | 1292 | 1341 | 1342 | 1376 | 1423 |
1590 | VNG2608 | 1186 | 1356 | 2210 | 1299 | 1279 | 1286 | 1373 | 1370 | 1290 |
1629 | Hut1018 | 1208 | 1350 | 1299 | 2225 | 1325 | 1267 | 1446 | 1406 | 1398 |
1600 | Hbo1075 | 1330 | 1292 | 1279 | 1325 | 2191 | 1459 | 1361 | 1404 | 1351 |
1609 | HVO_0431 | 1286 | 1341 | 1286 | 1267 | 1459 | 2132 | 1410 | 1519 | 1475 |
1669 | Hmu0351 | 1187 | 1342 | 1373 | 1446 | 1361 | 1410 | 2210 | 1531 | 1446 |
1710 | rrnAC2106 | 1268 | 1376 | 1370 | 1406 | 1404 | 1519 | 1531 | 2176 | 1514 |
1678 | hla0209 | 1233 | 1423 | 1290 | 1398 | 1351 | 1475 | 1446 | 1514 | 2162 |
300 symbols consensus MQVDAVVLDIDGVLVDVADSYRRAIVESVERVYGDTIDRADIQQFKDAGGFNNDWELTYA #oth .42.1.1..1....1..22.....11121214225..31332.4..1........21.3. HQ1376A :DA:::::::::::I::SQ:::::::DT:D:C:NQ::K:T:::E::N::::::::DV:N: NP0770A :N::S:I::::::::::E::::::::::IAH:::::::K::::L:::::::::::::::: VNG2608 :E:::::::V::::::::E::::::::A::H::::::E:::::::::::::::::TV:D: Hut1018 ::S::::::V::::::::::::::V:DT:A:IH:E::S:STL:A::::::::::::::D: Hbo1075 :HA::::::V::::::::::::::::::IA:L:DR:::KS:V:::::::::::::::::: HVO_0431 :HA::::::::::::::::::::::::::D:H::T::S:DEV:L:::::::::::::::: Hmu0351 :H::::::::::::::::::::::::::I::L::E::::SA::S::::::::::::::H: rrnAC2106 :::::::::::::::::::::::::I::I::::::::EK:AV:::::::::::::::::: hla0209 :::::::::::::::::::::::::I::::::CDK::::DA::L::::::::::::::D: consensus AALYVLARRE-GEDLSVEAFTDRIAARGGGLDAAEAVVDDELDPAARERVRDAWDPERLR #oth 3..32.15221356741341.25.223...242.333243614542435132212323.. HQ1376A V:::I:TT:H:-:SV::DQ::TQ:::H::::ES:LT:::NY:ST:DY:M:L:::NSD::: NP0770A :::::::::::KPA::I:TY:GL:::S::::Q:::TAIA:::P:::::K:LAE::RK::: VNG2608 :::W:::S::N:TIGG:G::::A::EH::::AG::::::AS:G:::V:::::::E::::: Hut1018 L:::::::S:::F:RC::G:::::::S:::FSG:RS:::::M:A:::::IYA:L:R:Q:: Hbo1075 ::::L::DDR:-:PI:IAE:::::HE:::::::::::TEAH::ADDYDA::E:::::G:: HVO_0431 :::S:::A:::-A::::A:::GE:E:::::::::K:T:EAL:SEPSV--:F:E::::A:: Hmu0351 G::::::S::::L:QT::::::G::Q::::R:::::I:REA:T:N:::D:F:::::DQ:: rrnAC2106 :::F:::G:::STVADIA::::A::E::::::::::::R:L::DP:ED::F:::NR:Q:: hla0209 ::::::::::::LGMD::T::G:::EG:::::::KE::G:-:PRV:QA::::Q::T:::: consensus DVFQALYLGSELYRELEGGEPPLAAPGYIHDEPVLVDPETLDALTARFDVGVLTGRPAAE #oth 23..3....313..22.222.32424.112..2412332.434.534562111....12. HQ1376A :M:::::::::R:::::D::::IDTQ:::I::::IIET::V:L:RETTKI:I:::::::: NP0770A ::::Q::::::::::::S:::D:DTE:F:::::::LA:D:RE::-EEWSL:::::::::: VNG2608 ::::Q::::T:Y::RF:::D:D:::::F::::DR:LA:::G:::::DWP:C::::::SD: Hut1018 E:::Q:::::DK:::I::S::T:SEA::::::T::::RS::ET:L:N:E::::::::::: Hbo1075 AA:::::::AD:::::::S:::FE:S:::::::II:EG::::Y::SNHR::::::::::: HVO_0431 ET::::::::D:::D::D:D::FE:::::::::::LR:::::::GD:-EL::V::::::: Hmu0351 ::::M::::A:::::I::R::RI:E::FVN::::I:::::IA::Q:DY::::V:::::P: rrnAC2106 ::::T::::TDR::DI::::::FT:::::::::L:::G:::S::QD::A:::V::::::: hla0209 ET:::::::E:::::::::A:::S:::::::::T::E:::IAD::D:::::::::::::: consensus ADIALDRVGLDIPEDHRFTMDDWEEGKPHPRALVTLAERFDADSVVFAGDTLDDVRTAVN #oth .21.12.1312214411......21...2.31.33112.22.2222.2......12..2. HQ1376A :S::::::QFS::SS:Q::::::::::::::::QM::D:LE:NTI::V::::::IK:::: NP0770A :E::::::::::::T:::::::::::::::HG::E:TK::::E:A:::::::::I:::R: VNG2608 ::V::::::::::GER:::::::AA:::N::::IA::::TG::::::V:::::::A::L: Hut1018 ::::M::::::::A:::::::::DA:::D:D::::::::::::T:T:::::::::::::: Hbo1075 :::::T::R:AV::N:::::::::::::N::::T:::D:LG:E::::V:::::::::::: HVO_0431 ::::::::A::VAD::::::::::::::::A::::V:::LG::::::V:::::::K::L: Hmu0351 :::::E:A:::VADE:::::::::A:::D:H::::::::::::RIA:::::::::::::: rrnAC2106 :::::E:::::L:AE:::::::::::::::A::Q::::::::ER:A:::::::::A:::: hla0209 :E:::E:::::V:::R:::::::::::::::::::::::::::RIA:I::::::::::R: consensus AAEADPDRVYHGVGVLTGGLTGDAGRQKFANAGADAVVESVNDLPELLD----------- #oth .334.43121211...1...1114..321653..331222121223.1554322211111 HQ1376A :NM::SS:T:::::::::::S:::::DA:MSV::HT:ID::::ISD:VQ::::::::::: NP0770A :::D::::EFY:::::::::S::E::R::R:::::III:TI::::G::G::::::::::: VNG2608 :R::::G:E::A::::::::::E:::::YHT::::H:LD::::::A::GQ:::::::::: Hut1018 ::DT:S::T:::I::::::::SES::E::EQ:::::::::::::::::EGGENRAGSQGA Hbo1075 :::E::EHT::::::::::::::E::E:YESV::A:::G:::::::::TDEG:::::::: HVO_0431 :DA:::E:::Y:::::S::::::D:::::SEI::A::::D::EV:D:::::::::::::: Hmu0351 :N:S:-G:::D:I:::::::::ET:::::TR:::A::::::D::::::SPRSTDR::::: rrnAC2106 :DA::D::::Y:I::::::::::::::T:::N::S::I:::T:::::::AV::::::::: hla0209 :DDE:AS:::Y:I::::::::::E::R:::EN:::::::D::E:V:::E:::::::::::