| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2684 | VNG1369 | rrnAC3375 | hla2441 | HQ1628A | HVO_1110 | Hbo0614 | Hut0151 | NP3814A | Hmu1070 |
| 1442 | VNG1369 | 2731 | 965 | 1033 | 814 | 967 | 917 | 1062 | 822 | 949 |
| 1413 | rrnAC3375 | 965 | 2846 | 1237 | 836 | 936 | 919 | 978 | 783 | 996 |
| 1508 | hla2441 | 1033 | 1237 | 2848 | 927 | 1030 | 1011 | 1040 | 841 | 950 |
| 1373 | HQ1628A | 814 | 836 | 927 | 3180 | 1403 | 1379 | 913 | 645 | 989 |
| 1710 | HVO_1110 | 967 | 936 | 1030 | 1403 | 2784 | 1521 | 1071 | 884 | 1022 |
| 1658 | Hbo0614 | 917 | 919 | 1011 | 1379 | 1521 | 2760 | 968 | 831 | 1125 |
| 1488 | Hut0151 | 1062 | 978 | 1040 | 913 | 1071 | 968 | 2961 | 925 | 1047 |
| 1224 | NP3814A | 822 | 783 | 841 | 645 | 884 | 831 | 925 | 2561 | 951 |
| 1579 | Hmu1070 | 949 | 996 | 950 | 989 | 1022 | 1125 | 1047 | 951 | 2810 |
495 symbols consensus --------------------MRRLSAVVFALLLVLAAAG------GVPAPAAA------- #oth 111111111111111112354333453463524244532211111432433331111111 VNG1369 ::::::::::::::::::MHRG:FATL:IVA:A:TMT:PA::::::AL::QPP::::::: rrnAC3375 MYESPLAVDKYLLLLTPAYG:::R:L:CVFV:::GSF::::::::IT::S:T:::::::: hla2441 ::::::::::::::::::::::NRYVIAM:::VTT:LV:::::::::AG:::G::::::: HQ1628A :::::::::::::::::MLLRSQ::SIAHI::I::VVT:GLGTLLLI:T:TD:VDPRLSG HVO_1110 :::::::::::::::::::VN:Q:VVALL:FAT:::---::::::::::::::::::::: Hbo0614 ::::::::::::::::::::-M::RTLT:VT::FV::--::::::I:::TG::::::::: Hut0151 :::::::::::::::::::MS:TIAG:LAV::V:GGV::::::::VALS:::G::::::: NP3814A ::::::::::::::::::::::T:::::::IA::AV::-:::::::A:VA::P::::::: Hmu1070 :::::::::::::::::::::::F::::::AV:::S:V-::::::A::VT:TT::::::: consensus ------------------------------------AAAAQQTDACSFPVTVTDATGTEV #oth 111111111111111111112222222222222244555463364.41.4241..21131 VNG1369 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::QH:DADR:::::::EP::SN:AI rrnAC3375 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::---:T:AEG::::::M:::::::: hla2441 ::::::::::::::::::::AQPTMESSTIENPTGGPSVH:TD:::G:::EM::::::TI HQ1628A HMHTHSYHSTSRIDSKTVHNTISATTAVSGDSNTKNHGSSVT:T::RY:L::::::::T: HVO_1110 :::::::::::::::::::::::::::::::::AVGQ::P:::A::T::::::::::::: Hbo0614 ::::::::::::::::::::::::::::::::::TAG::SM:::S:T::Y:A:::::::: Hut0151 :::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::THES:VN::::I:::::N:AN: NP3814A :::::::::::::::::::::::::::::::::::A:DT:PADPT::::::E:::::::: Hmu1070 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::--SDV:S:G:E::HST:::::::: consensus TLDERPERVVTLNPSAAQTMWELGARDEVVG--VSQYASYLDGAAEKTNVS--DAGGPNV #oth 12423.2.11222..11.12..1.2324.1.212342231.22344232.3524532332 VNG1369 :::SE:::::::::::::::::::D::A::::::::FGT::PT:SQR:V::GGQPSQT:: rrnAC3375 :IE:::A::T:T::::::::::I:G:SQ:::::LT:::::::::ESR::::::ASF:V:: hla2441 ::::::::IT:I:::::::L::I::::R::::::T:::A:::::G:::D::A:EGF:VS: HQ1628A RIMSD:D:::::::::::::::I::QN::::::::R:::::N:T:S:Q:::::G::::S: HVO_1110 :ITDD::::::T::::::::::::::::::::::::::M::::::D:G:::::GS::L:: Hbo0614 :::SD::::::::::::::::::::S:::::::::K::T:::::D::Q:::::G:N::S: Hut0151 :VS:::::::::A:::S:VV:::::Q:S:::MP:N::T:::N:SS:::::VT::N:Q:QI NP3814A :VE:::::I:V:Q::::::V:::::E:R:::AP:VP:T:D:::IE:AE::LQV:DFTV:Q Hmu1070 :::SA:D:::A:Q::D::::::I::::Q:A:MPRNANTA::NDTGNR:D:TN::D:TTD: consensus EAVVGLDPDLVLAPNAT---SADRVTQLRAAGLTVYHFPAATSLDDVAEKTETIGRLTGN #oth .2124241.1.111.3423245241341.511421241351212531331.342.11212 VNG1369 :::::::::::::::TV:::RNTT::R::S::I::FQ:R::::I:G:V:::A:::::::: rrnAC3375 :R::STS::::I::::-:::::GD::P::Q::V::::L::::TIE:IRA::T:::::::: hla2441 :R::DT::::::::::-:::::GQ:EA::EQ::::::::::::VE:I:::::IT:::V:: HQ1628A :R:LAAT:::::V::S:HSA:P::IA::::Q:::LVV::Q::::TA:I::::R::::::: HVO_1110 :::I::E:::::V::SSYNAEP::IA:::S:DIP:VV:ESGE::AA::D:::RV::M::: Hbo0614 :R:LDAN::V::V::S:YAFAK:::D:I::Q:T::FV:ETGS::SF::N:::Q::::::: Hut0151 :TII::E::::::::II::::S:A:E:::D::V:::R:ES:S:IG::V:::RLT:::L:T NP3814A ::::E::A:::::::IV:::PD:T::S::E:DQQ:FK:GFG:::SF::D::ALT:Q:VDA Hmu1070 :::::AN::::::A::::::RS:T:D:::N:::::::::L::::::I:NN:::V:::::: consensus CEAAAETAAEMRDRVDAVREATADAD--RPVVLYPF-DGYTAGSNTFIGDIIETAGGDNV #oth 12215344434443345424335251212.423163133222133.115331331.36.2 VNG1369 :A:::A:T:::::::A:IAD:VP:T:SA::R:Y:HLG::::::P:::::AA::A:::H:I rrnAC3375 ::G:S:AN:W:DAN:::::QV:::VED:::TA:::LGG::V:AG:::VTSL::L::AE:: hla2441 :::::::NE::NQA:TDAENR:::L:::::AA:::LG::FV::G::::NE:MQIG:T::: HQ1628A :A:GDAR:T:LQQSINRIERV:E:T::::::GVNV::Y:::S:N::::DE::::G:LE:G HVO_1110 :::GV:R::::::SMANMEQ:LDG:E:::::G:NS::F::SS::G:::S::MT:::LR:G Hbo0614 :::GRQS:Q:I:NSA:LM::VL::E:::K::A:NY::YT::S::::::::VMT:::LT:G Hut0151 Y:T:TDVS:RTQAA:E:Y:N::TG:E::::T:Y:AMGG:F:::PQ:::::V:DA::A::: NP3814A :D::::VNDDYW::I:::E:RA:AVE::D:H:M:FT::NH::::G:::D:L:T::::V:: Hmu1070 ::G:T::V:::DE::ET:::TVS:R:::::R:::Y::YQ::T:NE:H:H:L::::::Q:: consensus AAEANITG-YPQINEEVVVEMDPDWIVV---------PDSAPVPDTEAYNSTTAVQEGNV #oth .14323231143124.522471.4323411111111246723325432342.1.434223 VNG1369 ::DV:T:SS:::LS:::I:SQ:::VV:TGVSADRLDATA::L:APSSVVRN:::YAT::: rrnAC3375 ::RNH-:Q::::LSD::ILQL:::VLF:::::::::TENT:T:AE::P:A::::GETNST hla2441 ::AEG-D:::::LSN:IILQT::KL:L:::::::::TDPE:SIL:E:P:A::::GV:::Y HQ1628A ::N:GLS::FVP:TD:S::AI::T:::I::::::::::T:::L:K:P:::::::Y:NN:I HVO_1110 :::::L:::FA:::::L::::N:EY::::::::::::::H::::SSP:::::::M::::: Hbo0614 :::::::::FAP::T:T::::N:EY:I:::::::::::TG:T::::::W::::::::::I Hut0151 :SA:::ST::DT:ST:::::EN:::::::::::::::SGQS:I:SDP:LSN:::I::NQT NP3814A ::::G:D:::DE::::AL::WN::V::A:::::::::S:AE:L:E:A::E::V::EH:Q: Hmu1070 ::::GLS:::QP::A:::ADS::Q:L:Y::::::::::SD:SQ:TGAP::E:::::REQ: consensus VRVNANYINQPAPR-VVEALETIAQAFHPDAFE---------------AQALETEATT-- #oth 252333522..1..1425353333523335353411111111111111344554444454 VNG1369 :A::T:H::::::::I::PMARM:N:::NT---:::::::::::::::----------:: rrnAC3375 :T:QVRN:::::::S::SFAHNATAQLY::RYD::::::::::::::::DSYVPRS--:: hla2441 :VM:V::L::::::S:I:ST::L:T:VEELQT:D::::::::::::::EE:ADG:D::D: HQ1628A I::ETEH:Q::::::AIY:V:::L::T::A:SDE::::::::::::::Y:Q:::TTPSAN HVO_1110 IVIE:HKLQ::::::AI::S:A:LE:V::::Y:R::::::::::::::Y:Q::::SV:AS Hbo0614 IE::S::LQ::::::S:D:A:::M::V::E:::E::::::::::::::Y:SMKA::EATT Hut0151 :::D::F:S::G::::TQP:R:L:T::::E:AADVTADPSTVSAPVCA:D:M:PTT:ESA NP3814A :T:DS:DVS::::::L:Y::::::DGL------:::::::::::::::----------:: Hmu1070 LS:D:::VS::::::::L:::AM:E::::::::T:::::::::::::::TTSA:P:::ES consensus ----------TEATTTDATTTTTTPATST--------ESAQDTTDADGPGF---GVV-AA #oth 343324222234552537545444754411111111165655335353111332142122 VNG1369 :::::::::::IN::L::QPSA::T::::::::::::APPT:AA:GTA::::::::A::: rrnAC3375 ::::::::::AVTK:SEP:PADH::----::::::::STD:S::::S::::TAV:AL::: hla2441 ::::::::::G:NG:N:GENG:SDGEDG:::::::::SDGE:GSESQA::::::::::T: HQ1628A TSS:::::::S:SSESNVSQ::ARQMR::::::::::P:GVTA:QTNS:::GIVH::FT: HVO_1110 TESATETTTAAD::A::::E:ES:E::T:::::::::::SDS::ES:A:::::::::::S Hbo0614 TESTET:::::TQ:::AQS:::QAVNDT:::::::::T:::TA:G::T::::::::A:LT Hut0151 SATTTDSSAE:TEM:::S::ES::AE:V:LETNQTMDQATEQ::T:T::::::::I:::: NP3814A ::::::::::AD:E:A:RP:DA:VD----::::::::-----DQPGV:IAPAAA:L::L: Hmu1070 ATPDTI::::::SE:P:TV:ESA::DIV::::::::::::TV:::GS::::GLV:T::L: consensus LVALLAAALLARRR- #oth 252644354333141 VNG1369 VC::AG:::V:::-: rrnAC3375 :LT:VCIQQVR:::P hla2441 :I:A:::::I:::Q: HQ1628A IGSVIIVCIIFP:E: HVO_1110 :A:IG::F::::::: Hbo0614 ::SM:::::::T::: Hut0151 :I::VG:GTVT::Q: NP3814A V::G:LVRT:R::-: Hmu1070 :::T::LGVRRKGS: