|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2778 | VNG2271 | NP0588A | HQ3680A | hla0659 | HVO_0194 | Hbo1318 | Hut1751 | rrnAC2862 | Hmu2864 |
2186 | VNG2271 | 2792 | 1925 | 1935 | 1967 | 2010 | 2068 | 2021 | 2000 | 1998 |
2221 | NP0588A | 1925 | 2756 | 1994 | 2082 | 2034 | 2035 | 2073 | 2096 | 2048 |
2264 | HQ3680A | 1935 | 1994 | 2803 | 2138 | 2199 | 2279 | 2083 | 2042 | 2103 |
2402 | hla0659 | 1967 | 2082 | 2138 | 2781 | 2238 | 2348 | 2178 | 2179 | 2171 |
2362 | HVO_0194 | 2010 | 2034 | 2199 | 2238 | 2745 | 2416 | 2129 | 2061 | 2097 |
2465 | Hbo1318 | 2068 | 2035 | 2279 | 2348 | 2416 | 2800 | 2249 | 2168 | 2176 |
2433 | Hut1751 | 2021 | 2073 | 2083 | 2178 | 2129 | 2249 | 2794 | 2174 | 2282 |
2362 | rrnAC2862 | 2000 | 2096 | 2042 | 2179 | 2061 | 2168 | 2174 | 2810 | 2434 |
2405 | Hmu2864 | 1998 | 2048 | 2103 | 2171 | 2097 | 2176 | 2282 | 2434 | 2807 |
377 symbols consensus MSDDPEEGMLSWDESVFRDEHVFEIDYVPETFRHRESQLESLKYALRPAVRGSRPLNVIA #oth 154223331.1.1.11....2.1.1.22.12.4..12.122.1..............122 VNG2271 :DE:::::L:G:G:T:::::::::::::::V::::::::QT:Q:::::::::::::::V: NP0588A ---MADDD::::::::::::G:L:L::L::A:L::DE:M:T:::::::::::::::::M: HQ3680A :NN::D:::::::::I:::::::::::M::::N:::T:::N::::::::::::::::TVI hla0659 :TG:AGGD::::::::::::S:::::H::::::::::::::::::::::::::::::T:V HVO_0194 --------::::::T:::::::::::H:::::N::::::R:::::::::::::::::TMV Hbo1318 :R::::::::::::T:::::::::::::::::N:::T::Q:::::::::::::::::T:V Hut1751 :T::::::::::::::::::::::::::::::::::::M::::::::::::::::::::: rrnAC2862 ::::::DR::G:::::::::::::::WL::::K::DT:M:T::::::::::::::::::: Hmu2864 :::::::::::::::::::::::::::::Q::E:::::M:N::::::::::::::::::: consensus RGPPGTGKTTAVQKLFGELGAQTGVRTVRVNCQVDSTRYAVFSRLFEEIFEYEPPSSGIS #oth ...........1.1.12..33241.3211....1.....1....2.132.1....1..2. VNG2271 :::::::::::::::::::SG:P::Q::::::::::::::::::V:::::D::::::::: NP0588A ::::::::::::::::D::AGVG::E:::::::::::::::::::::SL::::::A::V: HQ3680A ::::::::::::::::T:::::M::Q::H::::::::::G::::I::H::::::::::L: hla0659 :::::::::::::::::::S:R:D:::::::::::::::::::::::G::D::::::::: HVO_0194 ::::::::::::::::::::T:S:::::::::::::::::::::V::H:::::::::::: Hbo1318 :::::::::::::::Y::::T:S:::::::::::::::::::::I::H:::::::::::: Hut1751 :::::::::::::::Y::::S::D::VA:::::::::::::::::::SV::::::A:::: rrnAC2862 :::::::::::::I::D::T:::D:K:::::::M::::::::::::A:::D::::::::: Hmu2864 :::::::::::T:I::D::T:::D:QA:::::::::::::::::::A:::D::::::::: consensus FKKLFGQITDRLVEEDEVLVVALDDVNYLFYENEASDTLYSLLRAHEAHSGAKIGVIVVS #oth .1...1.11211113121.1.....1......3.11.1.........212..11..121. VNG2271 :::::::VAE:IADD:::::::::::::::::D::G:::::::::::TQP:::V::V::: NP0588A :N:::::::N::::D:D:::::::::::::::S::::::::::::::S:::::::::::: HQ3680A :::::S::::::ADS:NI::::::::::::::::I::V:::::::::T:T::R:::VII: hla0659 ::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0194 ::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::R::::II: Hbo1318 :::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::::::::::T::::R::::I:: Hut1751 :::::::::EK::D:E:::A:::::I::::::G:::::::::::::::::::::::V::: rrnAC2862 :::::S::::K:::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::::::::C:: Hmu2864 :::::S::::::::RE::::::::::::::::S::::::::::::::::::::::::CI: consensus SDLDLDVIEELDGRVQSVFRPEEVYFPVYDEAEIVDILRERAERGFHEGVVGAPELDRVA #oth ...5.21.12..1.........121.24.1541.52..53.332..311113532.1211 VNG2271 :::E:::::A:::::::::::::A::SA::R:::T::::D:V:V::R::A:AE:V::A:G NP0588A :::::N::::::::::::::::D:::SA:G:RA:A:::S::V::::R::A:S:RV::::: HQ3680A :::T:E::::::::::::::::::F:::::IT::S:::QS:TRH::YD::I:ST:::Q:: hla0659 :::G::::DD::T::::::::::::::::GA:::Y:::F:::K::::D::I:DA::E:I: HVO_0194 :::S::::D:::::::::::::::F::R::VD:::::::G:SK:::::D:I::::::Q:: Hbo1318 :::A:::::::::::::::::::::::::GVD::FE:::G::K::::D::I:E::::::: Hut1751 :::::::::::::::::::::::::::K:::P::::::D::V:::::::::D::I::::: rrnAC2862 :::E::T:DA::T:::::::::::::NP:GQ:::A:::G:::D:::N:::::PTV::::: Hmu2864 ::::::::DA::T::::::::::I::NR:::P:::G::::::D::::D:::DTTV::::: consensus ELTAE-GGDLRVGIDLLRRAGLNAEMRASRTVEREDVEAAYDKSKYVHLSRRLRGLSDSE #oth 23.2223........1.....11..2.1.231361.11311111111....4.32..13. VNG2271 GR:D::A::::::::V::::::H::S:::K:::M:::D:V:EDA:H:::::T:AA:::N: NP0588A :H::DS:::::::::::::::::::F:G:TE:AVA::DT::E:A::I::::::Q:::E:: HQ3680A ::::::T::::::::::::::::::::G::SITS::I:T::E::RH:::::::::::ET: hla0659 D:::::S::::::::::::::::::::::K:IDE::::S::::::H:::::S:::::E:: HVO_0194 :F::D:S:::::::::::::::H:::::::::DM:::::::::::::::::C:Q::::P: Hbo1318 ::::::S:::::::::::::::::::::::S:TL:::::::::::::::::C:::::::: Hut1751 ::::DQ:::::::::::::::::::::::KQI::::::::FE:::H:::::H:K:::::: rrnAC2862 :::E:Q:::::::::::::::M::::::::S::T::::::::::::::::::::E::::: Hmu2864 ::::KQ:::::::::::::::M::::::::::::::::D:::::::::::::::E::E:: consensus RALVRVIAEHDGERAGDVYEAFNEETDLGYTRYSEIINKLDQLGVIDAEYTNVDGRGRSR #oth 32.22122331.22..31.12.313.2......1.221..121121116.2422....1. VNG2271 :::::TV::QE:D::::::DV::DR::::::::T::V::::E::::::A:EQRS:::::: NP0588A A:::::LTD:::::::A:::::S:::E:::::::::V:::E:V::V:::::::::::::: HQ3680A ::::E:VVD:::D:::T:::::H:Q:G::::::::VV::::R::::E:N::DI:::::T: hla0659 ::::::L::N::::::T:::::H:::::::::::::::::::::::::::AD:E:::::: HVO_0194 :E::::V::Y::::::A::D::::A:G::::::::LV:::::::::E:R::EIE::::T: Hbo1318 :::::::::Y:::Q::T:::::HD::::::::::::T:::::::I::T::AEIE:::::: Hut1751 QT:LA:::D:E::L::::::T:A::::::::::::::K::::::L:ETS::S:::::::: rrnAC2862 T:::E:::A:::QQ:::I:D::S:Q::::::::::::::::::DI:::D::::E:::::: Hmu2864 A::AE:::Q:::Q:::EI:D:::DQ:::::::::::::::::::::E:T::::::::::: consensus ELSLAYDAEAVLERL-- #oth 3121311211121..11 VNG2271 T:R:TH:S::::::::: NP0588A ::::::::D::::::EE HQ3680A SI:I:::PD::A::::: hla0659 ::::::E::T::D::E: HVO_0194 AI::::::D:::D:::: Hbo1318 S::::::P::::D:::: Hut1751 ::::Q:EP::ITD:::: rrnAC2862 ::T:N:::D:::::::: Hmu2864 ::T:Q::P:::::::::