|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2750 | VNG2462 | HQ3419A | Hut2029 | rrnAC3118 | Hmu2643 | NP0182A | hla2498 | HVO_0120 | Hbo1376 |
1958 | VNG2462 | 2727 | 1635 | 1677 | 1751 | 1664 | 1737 | 1681 | 1747 | 1691 |
2022 | HQ3419A | 1635 | 3014 | 1654 | 1679 | 1652 | 1708 | 1840 | 2017 | 1991 |
2017 | Hut2029 | 1677 | 1654 | 2892 | 1961 | 1963 | 1729 | 1699 | 1779 | 1722 |
2113 | rrnAC3118 | 1751 | 1679 | 1961 | 3176 | 2053 | 1812 | 1812 | 1813 | 1787 |
2060 | Hmu2643 | 1664 | 1652 | 1963 | 2053 | 2684 | 1806 | 1742 | 1748 | 1767 |
2137 | NP0182A | 1737 | 1708 | 1729 | 1812 | 1806 | 2701 | 1839 | 1897 | 1854 |
2106 | hla2498 | 1681 | 1840 | 1699 | 1812 | 1742 | 1839 | 2723 | 1946 | 1903 |
2257 | HVO_0120 | 1747 | 2017 | 1779 | 1813 | 1748 | 1897 | 1946 | 3336 | 2287 |
2154 | Hbo1376 | 1691 | 1991 | 1722 | 1787 | 1767 | 1854 | 1903 | 2287 | 3260 |
463 symbols consensus MFDGLKDKLSSFRDDVEEDADE-DAEAAADEAD-DA-AD----------------A---- #oth 1.1..13..34.3511.1422325243433442124434433443553553434424332 VNG2462 ::::::::::N::E:A::V:E::N::EL::QP:::EA::::::::::::::::::-:::: HQ3419A ::::::N::DQ:::::::TTT:KS:TDE:SSG::::EPNVKQSDESVSHMPSEAANDT:: Hut2029 :::::RE::GR:S::::::V:A:VE:GE::DI:::SG::AEAPGEGGSAGDVTQS:AES: rrnAC3118 ::::::::::G:TS:::::V:D:::LE:E::P::ADE::GEAPPDQATESDPVAD:QASE Hmu2643 :::::::::G::TS:::::V:D:E:QE:IE:--:--:--::::::::::::::::-:::: NP0182A ::E:::::::::KG::::Q:::P:S::D:A:PE:--:--::::::::::::::::-:::: hla2498 V:::::::::G::K::::N:EV:EEP:EQ:::E:--:--::::::::::::::::-:::: HVO_0120 ::::::K::NR::N::::T:E::K::::::::ES::D:EAESAPADTDNAAVEPE:SEPA Hbo1376 ::::::K::N:::EN::DT:E::K:::Q:EA:E:A:ADTTDADTETETPDAETHD:DATE consensus ----------------------TADAAADAAPESAAAETDAASTADAATEPDPDAD---- #oth 233323323322222222222233434343444244553423564435265322223334 VNG2462 :::::::::::::::::::::::EA::::S:::D:P:TA:::AP:TEPAGEQ:::-:::: HQ3419A ::::::::::::::::::::::SEQTPD:NTHT:NSDV:T:E:DIS:N:DG::NI:TDSS Hut2029 ::::::::::::::::::::::D:SSQS::DA::TVDTQP:DG::ATE:SAE:::-:::: rrnAC3118 GDTAEPTAETDQPQADSEPPAADSE:T:ES:TA::T:VE::DAVP:EESH::DA:ETEED Hmu2643 ::::::::::::::::::::::D:AE:DS:::::G:QQ::::P:E::::ADA:A:::::: NP0182A ::::::::::::::::::::::::::E:A:E::ASSTD::TGE-P:SV:::E::S-:::: hla2498 :::::::::::::::::::::::GESP:AESS:D:P:AESD::A:ESP::V:SA::D::: HVO_0120 AADPDADAVGDADAGSEADAVDA:::P:::ESS:::V:A::E:ESES:AT:E::SEVDAG Hbo1376 AVGGENEPTET::::::::::::::S:TVSDADDTTS::E:ET-:::QAS:A::SETPET consensus -----------------------------------DDEDDDESDPGRAKRAAAFATGKTV #oth 33334243333211122222122222122122111455443243214451.133.1.131 VNG2462 :::::::::::::::::::::::::::::::::::---::E::SA:FVS:::SM:R:RV: HQ3419A SLASQEAAAVL:::::::::::::::::::::::::ETAQSDNK:::L::::::::::I: Hut2029 :::::::::::::::::::::::::::::::::::ST::AA:P:R:V:E::KL::::::: rrnAC3118 AATEAESE:::::::::::::::::::::::::::S:::::DGGR:L:AK:KLM:::::: Hmu2643 :::::::::::::::::::::::::::::::::::T:DASE:D:R:LTEK:KIL::::SI NP0182A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:T:A:D:::L::K::LA:::R:I hla2498 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:A:DN::STFQ::K:::::RII HVO_0120 ADTGDEPSGEPTADEVEPRESLASDAAKAALT:::EEDE::S:G:::LR:::::::::V: Hbo1376 GDESGDTADDSAADEADEAASSRERLASDAANEALESGQKES:GA::L::::::::::VI consensus IEEEDLEDPLWDLELALLESDVEMSVAEEILDTIREKLVGETRRQVESTGNLVEDALREA #oth .2.21.131.32..21..21....3.131.133123313.12.22231234113311311 VNG2462 :D:A:::A::RE::F:::::::::::V:::::Q::GD::::E:KFT:::DT:I::::::: HQ3419A :::::::E:::Q::M:::::::::Q::::::G:::S:ML::::A::NT:AA:::E::SD: Hut2029 :D:D::Q:H:D:::::::S::::::::G::::GVEAN:::::::RLQ::::::Q:S:::: rrnAC3118 ::::::QSH:D:::::::S::::::::N::::GVK:N:T:Q:::RLS::::::R:::::S Hmu2643 :D::::Q:H:D:::::::S:::::G::G:::SGVE:N:::::::RLS::::::R:::::S NP0182A :T::E::E::EQ:::E::QG:::::::Q::T:R:::E::::::K::::GEQV::R:IA:: hla2498 :::::::E::::::M:::::::::::::R::::V:::ML::S:K:::T::E:::S::HD: HVO_0120 :::::::::::E::M:::Q:::::Q::::::E::::::I::::K::::::Q::SE::HD: Hbo1376 :::::::::::E::M:::::::::H::::::::::::M:::::::::TM:Q::QE::HD: consensus LYDVISVGQFDFDQRIAEADKPVTIVFTGVNGVGKTTSIAKLARYLEDRGLSSVLANGDT #oth .22..3...1.1231134121..111...1.......1...12321142.3.2.1..... VNG2462 :LS::D:::::LVDE:ESTS:::::::::::::::::T:::::::::SE:F::::::::: HQ3419A ::E::::::Y:::S:VES::S:::::::::::::::::::::VQ:::S::::V:M::::: Hut2029 ::::::::::::EE:::A:E:::V:::::::::::::T:::::Q::::::H::::::::: rrnAC3118 :::::N:::::::E:VQQ:::::::::::::::::::::::::Q:F::::::T::::::: Hmu2643 ::::::::::::E:::RA:::::V:I:::::::::::T::::SER::GQ:::T::::::: NP0182A :R::::::::::ES:::D:E::::::::::::::::::::::::WF:E::H::::::::: hla2498 :L:::A::::::EE::::::::::::::::::::::::::::SEW:A:::Y:::M::::: HVO_0120 ::E:::::::::::::::::::::LI:::I:::::::T:::::K:F:KQ:Y:T::::::: Hbo1376 ::::::::::::::::::::::::LI:::::::::::::::M:::F:KQ:::V::::::: consensus YRAGANEQIREHAEALDKKLISHEQGGDPAAVIYDAVEYAEANDIDVVLGDTAGRLHTSD #oth ......1.131..23.1333.2.1..1..1..2..1....2.1.2.1...........12 VNG2462 ::::::Q::E::::::GV:C:T:::::::T::V:::::::D:::V::::::::::::::: HQ3419A :::::::::::::KT::T:::A::::::::::L::::::::::::::::::::::::::N Hut2029 ::::::Q:LG:::::::VPY:::::::::T::::::::::::::V::::::::::::::E rrnAC3118 ::::::::LEK:::N::::I:T::::S::T::V:::::::K::::::::::::::::::: Hmu2643 ::::::::LQK::DN::RT:::::::S:::::::::::::::::T::::::::::::::: NP0182A :::::::::E:::D:::::I:T::::::::::::::::::::::V:::::::::::::A: hla2498 :::::::::Q:::DR::RE::::D:::::::::::G:::::::::::::::::::::::: HVO_0120 :::::::::::::::::::::A:::::::::::::G::::::H:::I::::::::::::N Hbo1376 ::::::::::K:::N::T:I::::::::::::::::::::::H::::::::::::::::N consensus DLMAQLEKIDRVVDPDMTLFVDEAVAGQDAVNRAREFNDAAEIDGAILTKADADSQGGAA #oth 1..2..1.11.214..2.2...........12..21.12.111..11..1....12.... VNG2462 :::S::::L:::::::V:V::::::::::::::::::DE:SAV::T:::M:::::::::: HQ3419A :::::::::::::N:::::::::::::::::E::KQ::E::::::TV::::::::N:::: Hut2029 G::D::S::E:IIE:::::::::::::::::T::T::DA::::::T::::::::P::::: rrnAC3118 :::::::::::NI:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P::::: Hmu2643 ::::::::::::I:::::I::::::::::::::::::DE:::::::V:::::::P::::: NP0182A ::::::::::::::::L:::::::::::::T:::K::::::::::::::::::::::::: hla2498 :::::::::::::A::::::::::::::::::::K:::::::::::V::::::::S:::: HVO_0120 :::::::::::::G::L::::::::::::::E:::Q:::::A:::::::::::::N:::: Hbo1376 :::::::::::::E::L::::::::::::::E::KQ::E:::::::V::::::::N:::: consensus ISIAHVTGKPILFLGTGQGYDDLERFDPEEMVDRL-LGE---- #oth ..111..........1..3.11124...243.33.11414221 VNG2462 ::VS::::::::::::::A:E:::P:::DAL::D:::AASDD: HQ3419A ::::Y::::::::::V::E:::I:::::KS::NQ:::::TESR Hut2029 :::::::::::::::::::::H::::::::V::Q:T::::::: rrnAC3118 ::V:::::::::::::::D::::DP:::::I::S::I:::::: Hmu2643 ::::::::::::::::::::::::::::::V::::::DA:::: NP0182A ::::::::::::::::::::::I:::::D:I:S::::EA:::: hla2498 ::V:Y::::::::::::::::::TL:::::L:ES:::S:N::: HVO_0120 ::::Y::::::::::V:::::HI:K::::Q::E::::::DE:: Hbo1376 ::::Y::::::::::V::::::I:Q::::R::E::::::DE::