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[U] (FtsY) COG0552 Signal recognition particle GTPase
9 genomes BUD0260 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2462

rrnAC3118

HVO_0120

Hbo1376

Hmu2643

Hut2029

hla2498

NP0182A

HQ3419A

Pairwise sequence scores
Consensus score2750 VNG2462 HQ3419A Hut2029 rrnAC3118 Hmu2643 NP0182A hla2498 HVO_0120 Hbo1376
1958VNG2462 2727 1635 1677 1751 1664 1737 1681 1747 1691
2022HQ3419A 1635 3014 1654 1679 1652 1708 1840 2017 1991
2017Hut2029 1677 1654 2892 1961 1963 1729 1699 1779 1722
2113rrnAC3118 1751 1679 1961 3176 2053 1812 1812 1813 1787
2060Hmu2643 1664 1652 1963 2053 2684 1806 1742 1748 1767
2137NP0182A 1737 1708 1729 1812 1806 2701 1839 1897 1854
2106hla2498 1681 1840 1699 1812 1742 1839 2723 1946 1903
2257HVO_0120 1747 2017 1779 1813 1748 1897 1946 3336 2287
2154Hbo1376 1691 1991 1722 1787 1767 1854 1903 2287 3260

463 symbols
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#oth            1.1..13..34.3511.1422325243433442124434433443553553434424332
VNG2462         ::::::::::N::E:A::V:E::N::EL::QP:::EA::::::::::::::::::-::::
HQ3419A         ::::::N::DQ:::::::TTT:KS:TDE:SSG::::EPNVKQSDESVSHMPSEAANDT::
Hut2029         :::::RE::GR:S::::::V:A:VE:GE::DI:::SG::AEAPGEGGSAGDVTQS:AES:
rrnAC3118       ::::::::::G:TS:::::V:D:::LE:E::P::ADE::GEAPPDQATESDPVAD:QASE
Hmu2643         :::::::::G::TS:::::V:D:E:QE:IE:--:--:--::::::::::::::::-::::
NP0182A         ::E:::::::::KG::::Q:::P:S::D:A:PE:--:--::::::::::::::::-::::
hla2498         V:::::::::G::K::::N:EV:EEP:EQ:::E:--:--::::::::::::::::-::::
HVO_0120        ::::::K::NR::N::::T:E::K::::::::ES::D:EAESAPADTDNAAVEPE:SEPA
Hbo1376         ::::::K::N:::EN::DT:E::K:::Q:EA:E:A:ADTTDADTETETPDAETHD:DATE

consensus       ----------------------TADAAADAAPESAAAETDAASTADAATEPDPDAD----
#oth            233323323322222222222233434343444244553423564435265322223334
VNG2462         :::::::::::::::::::::::EA::::S:::D:P:TA:::AP:TEPAGEQ:::-::::
HQ3419A         ::::::::::::::::::::::SEQTPD:NTHT:NSDV:T:E:DIS:N:DG::NI:TDSS
Hut2029         ::::::::::::::::::::::D:SSQS::DA::TVDTQP:DG::ATE:SAE:::-::::
rrnAC3118       GDTAEPTAETDQPQADSEPPAADSE:T:ES:TA::T:VE::DAVP:EESH::DA:ETEED
Hmu2643         ::::::::::::::::::::::D:AE:DS:::::G:QQ::::P:E::::ADA:A::::::
NP0182A         ::::::::::::::::::::::::::E:A:E::ASSTD::TGE-P:SV:::E::S-::::
hla2498         :::::::::::::::::::::::GESP:AESS:D:P:AESD::A:ESP::V:SA::D:::
HVO_0120        AADPDADAVGDADAGSEADAVDA:::P:::ESS:::V:A::E:ESES:AT:E::SEVDAG
Hbo1376         AVGGENEPTET::::::::::::::S:TVSDADDTTS::E:ET-:::QAS:A::SETPET

consensus       -----------------------------------DDEDDDESDPGRAKRAAAFATGKTV
#oth            33334243333211122222122222122122111455443243214451.133.1.131
VNG2462         :::::::::::::::::::::::::::::::::::---::E::SA:FVS:::SM:R:RV:
HQ3419A         SLASQEAAAVL:::::::::::::::::::::::::ETAQSDNK:::L::::::::::I:
Hut2029         :::::::::::::::::::::::::::::::::::ST::AA:P:R:V:E::KL:::::::
rrnAC3118       AATEAESE:::::::::::::::::::::::::::S:::::DGGR:L:AK:KLM::::::
Hmu2643         :::::::::::::::::::::::::::::::::::T:DASE:D:R:LTEK:KIL::::SI
NP0182A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:T:A:D:::L::K::LA:::R:I
hla2498         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:A:DN::STFQ::K:::::RII
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Hbo1376         GDESGDTADDSAADEADEAASSRERLASDAANEALESGQKES:GA::L::::::::::VI

consensus       IEEEDLEDPLWDLELALLESDVEMSVAEEILDTIREKLVGETRRQVESTGNLVEDALREA
#oth            .2.21.131.32..21..21....3.131.133123313.12.22231234113311311
VNG2462         :D:A:::A::RE::F:::::::::::V:::::Q::GD::::E:KFT:::DT:I:::::::
HQ3419A         :::::::E:::Q::M:::::::::Q::::::G:::S:ML::::A::NT:AA:::E::SD:
Hut2029         :D:D::Q:H:D:::::::S::::::::G::::GVEAN:::::::RLQ::::::Q:S::::
rrnAC3118       ::::::QSH:D:::::::S::::::::N::::GVK:N:T:Q:::RLS::::::R:::::S
Hmu2643         :D::::Q:H:D:::::::S:::::G::G:::SGVE:N:::::::RLS::::::R:::::S
NP0182A         :T::E::E::EQ:::E::QG:::::::Q::T:R:::E::::::K::::GEQV::R:IA::
hla2498         :::::::E::::::M:::::::::::::R::::V:::ML::S:K:::T::E:::S::HD:
HVO_0120        :::::::::::E::M:::Q:::::Q::::::E::::::I::::K::::::Q::SE::HD:
Hbo1376         :::::::::::E::M:::::::::H::::::::::::M:::::::::TM:Q::QE::HD:

consensus       LYDVISVGQFDFDQRIAEADKPVTIVFTGVNGVGKTTSIAKLARYLEDRGLSSVLANGDT
#oth            .22..3...1.1231134121..111...1.......1...12321142.3.2.1.....
VNG2462         :LS::D:::::LVDE:ESTS:::::::::::::::::T:::::::::SE:F:::::::::
HQ3419A         ::E::::::Y:::S:VES::S:::::::::::::::::::::VQ:::S::::V:M:::::
Hut2029         ::::::::::::EE:::A:E:::V:::::::::::::T:::::Q::::::H:::::::::
rrnAC3118       :::::N:::::::E:VQQ:::::::::::::::::::::::::Q:F::::::T:::::::
Hmu2643         ::::::::::::E:::RA:::::V:I:::::::::::T::::SER::GQ:::T:::::::
NP0182A         :R::::::::::ES:::D:E::::::::::::::::::::::::WF:E::H:::::::::
hla2498         :L:::A::::::EE::::::::::::::::::::::::::::SEW:A:::Y:::M:::::
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Hbo1376         ::::::::::::::::::::::::LI:::::::::::::::M:::F:KQ:::V:::::::

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#oth            ......1.131..23.1333.2.1..1..1..2..1....2.1.2.1...........12
VNG2462         ::::::Q::E::::::GV:C:T:::::::T::V:::::::D:::V:::::::::::::::
HQ3419A         :::::::::::::KT::T:::A::::::::::L::::::::::::::::::::::::::N
Hut2029         ::::::Q:LG:::::::VPY:::::::::T::::::::::::::V::::::::::::::E
rrnAC3118       ::::::::LEK:::N::::I:T::::S::T::V:::::::K:::::::::::::::::::
Hmu2643         ::::::::LQK::DN::RT:::::::S:::::::::::::::::T:::::::::::::::
NP0182A         :::::::::E:::D:::::I:T::::::::::::::::::::::V:::::::::::::A:
hla2498         :::::::::Q:::DR::RE::::D:::::::::::G::::::::::::::::::::::::
HVO_0120        :::::::::::::::::::::A:::::::::::::G::::::H:::I::::::::::::N
Hbo1376         ::::::::::K:::N::T:I::::::::::::::::::::::H::::::::::::::::N

consensus       DLMAQLEKIDRVVDPDMTLFVDEAVAGQDAVNRAREFNDAAEIDGAILTKADADSQGGAA
#oth            1..2..1.11.214..2.2...........12..21.12.111..11..1....12....
VNG2462         :::S::::L:::::::V:V::::::::::::::::::DE:SAV::T:::M::::::::::
HQ3419A         :::::::::::::N:::::::::::::::::E::KQ::E::::::TV::::::::N::::
Hut2029         G::D::S::E:IIE:::::::::::::::::T::T::DA::::::T::::::::P:::::
rrnAC3118       :::::::::::NI:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:::::
Hmu2643         ::::::::::::I:::::I::::::::::::::::::DE:::::::V:::::::P:::::
NP0182A         ::::::::::::::::L:::::::::::::T:::K:::::::::::::::::::::::::
hla2498         :::::::::::::A::::::::::::::::::::K:::::::::::V::::::::S::::
HVO_0120        :::::::::::::G::L::::::::::::::E:::Q:::::A:::::::::::::N::::
Hbo1376         :::::::::::::E::L::::::::::::::E::KQ::E:::::::V::::::::N::::

consensus       ISIAHVTGKPILFLGTGQGYDDLERFDPEEMVDRL-LGE----
#oth            ..111..........1..3.11124...243.33.11414221
VNG2462         ::VS::::::::::::::A:E:::P:::DAL::D:::AASDD:
HQ3419A         ::::Y::::::::::V::E:::I:::::KS::NQ:::::TESR
Hut2029         :::::::::::::::::::::H::::::::V::Q:T:::::::
rrnAC3118       ::V:::::::::::::::D::::DP:::::I::S::I::::::
Hmu2643         ::::::::::::::::::::::::::::::V::::::DA::::
NP0182A         ::::::::::::::::::::::I:::::D:I:S::::EA::::
hla2498         ::V:Y::::::::::::::::::TL:::::L:ES:::S:N:::
HVO_0120        ::::Y::::::::::V:::::HI:K::::Q::E::::::DE::
Hbo1376         ::::Y::::::::::V::::::I:Q::::R::E::::::DE::