| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2445 | Hut0107 | NP1156A | hla2697 | HQ1233A | HVO_0727 | Hbo0807 | VNG0361 | rrnAC0675 | Hmu0897 |
| 1479 | Hut0107 | 2820 | 1129 | 995 | 1125 | 1169 | 1157 | 1152 | 1262 | 1328 |
| 1585 | NP1156A | 1129 | 2467 | 1215 | 1288 | 1273 | 1302 | 1321 | 1306 | 1238 |
| 1458 | hla2697 | 995 | 1215 | 2478 | 1190 | 1213 | 1353 | 1158 | 1190 | 1157 |
| 1691 | HQ1233A | 1125 | 1288 | 1190 | 2388 | 1391 | 1476 | 1347 | 1264 | 1340 |
| 1678 | HVO_0727 | 1169 | 1273 | 1213 | 1391 | 2286 | 1605 | 1378 | 1275 | 1361 |
| 1757 | Hbo0807 | 1157 | 1302 | 1353 | 1476 | 1605 | 2349 | 1385 | 1408 | 1396 |
| 1699 | VNG0361 | 1152 | 1321 | 1158 | 1347 | 1378 | 1385 | 2599 | 1396 | 1490 |
| 1746 | rrnAC0675 | 1262 | 1306 | 1190 | 1264 | 1275 | 1408 | 1396 | 2477 | 1675 |
| 1747 | Hmu0897 | 1328 | 1238 | 1157 | 1340 | 1361 | 1396 | 1490 | 1675 | 2525 |
396 symbols consensus MATCDACGKHENMPYQCRRCGGTFCAEHRLPENHDCPGLDDWDDPAGVFDSGFDDSVNNG #oth .33..3..25121..3.52..3.1.12.....1.1.1..44.3..51....1..21.455 Hut0107 :T:::V::TEM::::H:NH::::::S::::::::::::::::G::E:::::::::::SA: NP1156A ::::::::E::::::N::H:::::::D:::::::N::::ES:N::DK:::::::G::QA: hla2697 :::::V::EY::L::::N:::K::::N:::::::N::::AE::::G::::::::G::ES: HQ1233A :::::E::::::L::::Q:::S:::::::::::::::::NG::::::::::::::::::P HVO_0727 :PI::V:::D:SL::R:S:::::::S::::::::::T::S:::::::::::S:::::::E Hbo0807 :::::E:::::::::::::::Q::::::::::::N::::SE:N::S:::::::::::::T VNG0361 :::::R::TQ:P::::::L::::Y:SD::::::::::::EN:G::N:::::::::T:DGQ rrnAC0675 :SE::::::Q:::::::GH::::Y::::::::A:::::::N:S::G::::::::E:::T: Hmu0897 :SK::::::T:::::R:HH::::Y:S::::::A:::::::::G::D:::::::::::DD- consensus G-----GGSGG--------LLDRLGIDTGPGGPLAYFRGNATYLFLGLMWVTFLLQWLVA #oth 453111331611111111125332433123.1322...2.22132.131221.5414525 Hut0107 NQS:::RS:K:::::::::::E:I::::::::::::::::M::V::::::I:::F:F::: NP1156A :SG::::R:P:::::::::::E::::::::::::::::N:VS::::AIIV:V:G::::I: hla2697 :AG::::SGD:ASAGVTDRVKQ:IDRE:ST::IVS::::::::AL:AA::I:::A::A:T HQ1233A :GQ:::SA:SK:::::::::SSK:---ADI::::G:::K:MS:V:::I:::::G::FFIL HVO_0727 :::::::RG::::::::::::SS:---::A::VFG:::::V:::::A:::L::FS:LVLE Hbo0807 -:::::AS:E:::::::::IM:::---::T::V:G:::::MAFT:::::::::A:E:I:T VNG0361 ATQQSR::G::::::::::IA:AIP:N:::::LV:::::::AF::::V:::::VI:YGI: rrnAC0675 QT::::S::::::::::::VA::F::::::::::::::::V:::::AI:GIV:I:EHI:I Hmu0897 -:::::::GR::::::::::G:::SV:::::SI:G::::::::TM:::::::::::H::V consensus LLL------G----------SELWQSIFVLTPDHPEYVWTWVTSVFSHG--GFAHIAGNS #oth 343211111.54411111135624542.3.62532211...21.111.222125.142.2 Hut0107 TVAI::::::TPNLQVATLS:::YR:::::A:Q::::::::F:::L:::::::::::F:: NP1156A P:FMALPPE:VNP::::::GHF::GQ::T::TV:::::::::I::::::::SPM:LLF:A hla2697 ::F:::::::::::::::::EAAHSQ::::RS:AIGN::::::::L::SRF:LF::I::: HQ1233A P:::::::::AFP::::::G:S:::A::::S:::VG:I:::L::I:A::::::::::F:: HVO_0727 QF::::::::L::::::::::D:SI:A:Y::SI:::::::::::I:A::::::Y::V::: Hbo0807 :T::::::::::::::::::NQAFY:::A::S:D:F::::::::I:A:SRFS:F::V::: VNG0361 P:A:::::::ITD::::::R:PT:YNL:T:NTA:::::::::::::A::::::S::VL:: rrnAC0675 :S::::::::::::::::::R:AF:TL:::H:NN::::::::::::::APF::Y::F::G Hmu0897 :V-:::::::IPI::::::GGPT:SA::T:Q:Q::::::::F::::::APLSLG:::L:: consensus IVLYFFGPLVERYIGSKKFTALFLGSGALAGLGQVGISLL-----TSPGPA--------- #oth .212...12..2321112.241.231.31...2112544311112473355222222111 Hut0107 ::IF:::R:::D::::RD::L:::S::::::::::L:Q:Y::::QGL:SA:AVGYFP::: NP1156A ::::::::::::Q::::::VG:::A::II:::::::VG:V:::::::E:V:::::::::: hla2697 ::IL::::::::AV::RR:VGF:FA::I:::::H:LFAI-:::::ATGA:T::::::::: HQ1233A :A::::::V::::LDT:R:::::I:A:VI:::A:I:ST::::::::MGPTG::::::::: HVO_0727 :::F:::::::::V::R::A::::V::M::::A:::S:M::::::L:::SL::::::::: Hbo0807 ::::::::::::::::R:::L::::::M::::SH::VGM::::::LE::VR::::::::: VNG0361 ::::::::I::DR::::::V:::::A:I::::A:::A::::::::AN::::VIASQNGRL rrnAC0675 :II::::R:::QQ::::::AVF::V:::::::::IA:Q--::::::VQ:TS::::::::: Hmu0897 ::IF:::RI::D:V::::::I:::V:::::::::I:L:H:LVFLGYQ::LG::::::::: consensus ------AGVLGASGAIMAIMGVLTVLNPGLRVYLYFIIPMPIWLLTGGFAA----LSIFG #oth 1111114211.....3412111.1223.4121111.31.221244.42323111141324 Hut0107 ::::::G::V:::::AI:::::::I:::S::::V:::F:V::::V:I:LV:MLPS:GM:: NP1156A ::::::--:::::::L:::::::AITS:D:K:L:F:F:::S:RT::IL:::::::F:::A hla2697 ::::::T::::::::GF::L:::::WR:NMQ:L:F:V:::K:KY::W:I:L::::I:AVL HQ1233A :::::::::V:::::::GVL::::::::K:K::::::::::L:V::F::::::::F::VA HVO_0727 ::::::SA:V::::::::VL:::::::::::I:::::::V:L::F:L:::G::::I:V:F Hbo0807 ::::::T:::::::::F::L::::::::N:KI::::L::I:L::F:L:::G:::::::VF VNG0361 LISDAFSAT:::::::A:L:::::L::::::I::::V::::L::A::L:::::::Y:::V rrnAC0675 :::::::::::::::AL:::AF::::K:D:::::::L::V:::AI::FYFL::::::::: Hmu0897 :::::::::::::::GL:::::::::::::::::::L::V:::AI::FYVI::::V:VA: consensus FLQPGGGG--G-GGVAHLAHLIGLVIGLAYGQRVKG--R-ARGPNQLQFGGGGG---PGG #oth 53565445652213212311.3125111321634241123634.5533312232122212 Hut0107 AGP:RRCQRRSPDRARDRSR:----------RPARP:::SDP::EPAPTRRRSRPWR::R NP1156A :VSD::IL::-:D::::F:::V::L:::W::N:I:D:::VGG::R::NL:P:R::::--- hla2697 VV:S:T::V:-:::I::::::::FA::::F:K:NESLA:S:G::GGM:M::AR::::::: HQ1233A GFGAA:::II:::N:::::::A:::::::::V::RD::::VGV::S::L::::R:::--- HVO_0727 :VSQSA--::-:D:I::F::::::::::::::::::::::RSV:S:MSL::R:-:::--- Hbo0807 :::::AAASV:Q:E:::F::::::I:::::::::::::::Q:V:SK:S:::R:::::--- VNG0361 SGTG:I:A::-:::::Q::::A::G:::L::AKL:R::EG::A::E::::::P::GGM:: rrnAC0675 S:N:M:A:LL:::NI:::::::::I:::W:::KI::::Q:T:M:G:I:::::::PGG::: Hmu0897 I:G-V::PFT:::N::DM:::V::::::W::SQ:::::Q:R:T:D::::::::R::G::: consensus PGGPGGP------GRGRF------------------ #oth 2222.1.111111.1312111111111111111111 Hut0107 :RR::W:RAVLSD::FPPRVRPRPFALPRRDGSATA NP1156A G::::::::::::::FP-:::::::::::::::::: hla2697 :R::::::::::::-::::::::::::::::::::: HQ1233A ---G:::::::::::-:::::::::::::::::::: HVO_0727 ---::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0807 ----:::::::::::-:::::::::::::::::::: VNG0361 :::::::::::::::R:-:::::::::::::::::: rrnAC0675 :::::::::::::::R:P:::::::::::::::::: Hmu0897 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::