9 genomes BUD0280 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG0125 rrnAC2308 HVO_0508 Hbo1040 Hmu0080 Hut2536 hla0438 NP0412A HQ1137A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1011	VNG0125	HVO_0508	Hbo1040	HQ1137A	hla0438	Hut2536	NP0412A	Hmu0080	rrnAC2308
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727	Hbo1040	501	697	1193	670	632	606	571	637	617
630	HQ1137A	470	579	670	992	582	540	540	561	530
769	hla0438	557	655	632	582	1064	631	560	647	622
763	Hut2536	573	596	606	540	631	1015	645	658	690
714	NP0412A	536	552	571	540	560	645	961	695	621
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765	rrnAC2308	549	605	617	530	622	690	621	800	1094

167 symbols
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#oth            11..11113..1..1...4.1.31..21142.142..22133.521211.2..1..3.13
VNG0125         :::::S:::::E::::::::::::::G:IE:::D::::D::L:::D:GG:::::::T::T
HVO_0508        ::::::::G:::::::::A::::::::::GE::S::::P:D:::A:::::V:::::::R:
Hbo1040         MS::::::A::::::::::::::E:::::::::EE:::::T::SA:E:::I:::::::R:
HQ1137A         MS::::::S:::::::::::::EE::A:::N:H::::::ASM:QT:N:::V::A::::R:
hla0438         ::::::FD::::::::::::T::E:::::Q::::E:::::::::T:::::V::A::::::
Hut2536         ::::::::::::::::::N:::S::::::E:::DE:::P::I:D::E:::::::::A:R:
NP0412A         ::::A:::::::::D:::T:::E:::AS:::::EE::A:ADI:TT:::G::::::::::E
Hmu0080         :::::::::::E::::::S:::E:::AS::E:::V::V::DI:N::E:::::::::A::G
rrnAC2308       :::::S:::::E::::::N:::T::::S:AE::N:::A::S::D::E:::::::::S::T

consensus       ALDVGDAEDHLRDAKKWYTMGERADAFDDADDLEAEIAALEALLEDIEAAREQVGELTAT
#oth            2.132212321.2...2123.31.1..2.221.3422232151243243.513123.15.
VNG0125         ::NTEEVAS:V:::::AFVI:Q:::::-:G:::ADDL::I:DV:A:L:::S:HA:A:AE:
HVO_0508        S:::EG:AE:V:Q:::::VI:Q::E::::PE::::A:EE::::I:MV:E:H:L:::::N:
Hbo1040         S::::::::N::Q:::TFII:Q::E:::::::::E:::SV:E:::TLGD:GDL:::::S:
HQ1137A         :::A::::E:::Q:::TFVV:T:::::::P:E:RS:VESV:E::SS:NT:D:LAS:::T:
hla0438         :::::::V:SV:S:::A:VL:::::::E:::::K:::E:::S:VA:::::A:E:AS::G:
Hut2536         E::P:E::T:::::::::::::::::::::G:::D::D:V:GVIT:LS::::::SD:AG:
NP0412A         S::T:E::T::::::::F:::RK::::E::::::TD::::::::::::T:H:::SD::::
Hmu0080         ::::D:::E::::::::::::::::::E:::::::D:::::T::::V:T:::::::::S:
rrnAC2308       :::::::::::::::::::::::::::E:::::AE::ETIAD:ID:VDD::::::D::::

consensus       VPQLRGALED-AAE-------D-------------------EAEADE
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VNG0125         L:E:::::P::E--:::::::-:::::::::::::::::::------
HVO_0508        M:::::::T:::::AAEAASA:EDED::::::::::::::::D:EE:
Hbo1040         M::::SQ:Q::::DAVDAAESEADTDEDTEESDADADDTAD:::::D
HQ1137A         ::::HDQ:PE::--:::::::-:::::::::::::::::::DE:S::
hla0438         ::AI::::Q:::::AGDDESE:DE:::::::::::::::::DG:DE:
Hut2536         ::EI:S:::S::D::::::::-::::::::::::::::::::S:S::
NP0412A         I:E::S::D::---:::::::-:::::::::::::::::::---S:D
Hmu0080         ::::::T::EF:::DADEETD:AEADDDA::::::::::::::::EA
rrnAC2308       I::::ST::EFEG:DGADAEA:GDA::::::::::::::::D:::EA