|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1339 | NP0224A | hla0555 | rrnAC3134 | Hmu2615 | Hut2800 | VNG2458 | HQ3417A | HVO_0124 | Hbo1372 |
715 | NP0224A | 1404 | 794 | 614 | 642 | 571 | 608 | 677 | 654 | 651 |
807 | hla0555 | 794 | 1376 | 665 | 679 | 616 | 659 | 735 | 729 | 763 |
980 | rrnAC3134 | 614 | 665 | 1345 | 1054 | 843 | 846 | 781 | 903 | 872 |
1004 | Hmu2615 | 642 | 679 | 1054 | 1325 | 827 | 863 | 819 | 906 | 888 |
980 | Hut2800 | 571 | 616 | 843 | 827 | 1354 | 927 | 844 | 927 | 915 |
1097 | VNG2458 | 608 | 659 | 846 | 863 | 927 | 1342 | 849 | 947 | 958 |
1013 | HQ3417A | 677 | 735 | 781 | 819 | 844 | 849 | 1394 | 964 | 1001 |
1112 | HVO_0124 | 654 | 729 | 903 | 906 | 927 | 947 | 964 | 1356 | 1152 |
1130 | Hbo1372 | 651 | 763 | 872 | 888 | 915 | 958 | 1001 | 1152 | 1352 |
204 symbols consensus --------MTVRDVAAEAYREALPALAASLVGGLFAGVVLG--GMRAELRAVPGLLVLVP #oth 11111111133133.532.113212132.231.131.51.1211.32225322..1111. NP0224A :::::::::DA:HG:WRI:::SIAI:VV::G::I:::S:::TE::TDGFEQF::::L:L: hla0555 :::::::::PGH:T:RDV::Q:::VILV:::A:::S:TI::SET:::GISE:::::L:L: rrnAC3134 ::::::::::::E::L::::::::V::L:A:::::::::::::::D:::QD:A::::::: Hmu2615 ::::::::::::E::::::::T::V:VL:AI::::::L::V::::E:::A:::::::::: Hut2800 ::::::::::I:E::VR::::G::::S:::::::L::::::::::::::T:ID::::::: VNG2458 :::::::::S::R:::T:::::A::::::VL::::::A:::::::::Q:E::D::::V:: HQ3417A MLDIIATDV::::A:R::::::I:::L:::I:::L:::::::::::S::::::::::::: HVO_0124 :::::::::::::::V:::K::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::: Hbo1372 ::::::::::I::A:T::::::::::V:::::::I::I::::::::::::D::::I:::: consensus ALLATRGNVYGSLGARIATALHQGLIEPRLRAGDRRLRAAVAAALANGLLASGFAAVVAF #oth .1.1...1..111...1211....311.22654.3.142.23.133..333.31113434 NP0224A :F:G:::::::A:::::SSG:::::::::FEW-::::IN::T:SFI::IGI:V:IGFLSW hla0555 :F:::::G::::::::LS:G:::::::::F:L-::::TN:IL:SFI::MTV:V:I::IT: rrnAC3134 ::::::::::::::::LGS:::::::N::FSFD:D:IN::::::::::V:I::V:::M:V Hmu2615 ::::::::::::::::LGS:::::V:::T:DF::E::N::I:::::::I:V::::::L:V Hut2800 ::::::::::::::::::::::::FL::::GDA:D::LR:::::IG::::::A::::::T VNG2458 ::::::::::A:F:::L::G::::I:::HVA::::::::::G::MG::::::::::A::: HQ3417A :::::::::::::::::S:G:::::::::::GV:T::T::AT:::M:::A::V:::IAV: HVO_0124 :::::::::::::::::::::::::::::VTG::E:::::AT::::::V:T:T::::::Y Hbo1372 :::::::::::::::::::::::::::::VT:::::::::A::::G::::::A::::AV: consensus LVLTALGRPV-AGLLTLVGIALIAGLLSGVVLIVAVVAVVFAGYRRGLNPDTLVGPVVTT #oth 4414523442113134.2311221.21124212531232122.111.31..222..2... NP0224A V:IGF:RPESE:S::A::S:M::::V:TS:::::GLL:L:::::KY:MD::N:::::::: hla0555 :W:RLF:N-A:GN::E::::MVVS:F::A:LM:SVLI::I:V::::::D::NVI:::::: rrnAC3134 AL:ALV:::S::P:T:::A::::::FV::LL:TI:::S:::V:::::::::::A:::::: Hmu2615 V::RV::SES::::A:::A::::::::::LL:T::::T::VV::::::D::::A:::::: Hut2800 AA:AW:A::A::::PV:LTV:V:S:::::IA:ATT::V:::::F:::Y::::::::L::: VNG2458 G:::::::::::::A::::V::V:::::::A:TG:::::::::::::Y::::::::L::: HQ3417A :I::I:ETS:::SV:I:IA:::L::::::G:::IT:ITA:II:::::Y:::A::::L::: HVO_0124 FL::F::SR:::P:PI:::V:IV::::::I::T:V::S:::::::::R::::I::::::: Hbo1372 :::S:::NR:::P:PV:::::VL::::::A:::AV::T:::::::::R::::::::I::: consensus TGDVFGIAFLLVAVRLVLAVGGV- #oth 2..21.332125132312132226 NP0224A L::I::VV::YT::LV:---:VLI hla0555 L:::::VF::::GIYV:---:T:V rrnAC3134 ::::V:::T::G:T:::::L::G: Hmu2615 ::::V:::TM:::A:I::::::G: Hut2800 A:::::M:A::I:A:::--IW::G VNG2458 :::L::L:::VL::::I--::::: HQ3417A ::::::ML:::A:::::S:::::S HVO_0124 ::::::VL:::I:::T::::A::F Hbo1372 :::::::L:::::::T:::I:::L