| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4366 | VNG2019 | NP2268A | hla1582 | HQ1095A | HVO_1870 | Hbo1746 | Hut2680 | Hmu2581 | rrnAC3170 |
| 2454 | VNG2019 | 4454 | 1971 | 1877 | 1975 | 2090 | 2029 | 2069 | 1938 | 2013 |
| 2580 | NP2268A | 1971 | 4453 | 2029 | 1991 | 2037 | 2120 | 2101 | 2036 | 2131 |
| 2847 | hla1582 | 1877 | 2029 | 4584 | 2335 | 2433 | 2406 | 2013 | 1958 | 1993 |
| 3205 | HQ1095A | 1975 | 1991 | 2335 | 4502 | 2911 | 3241 | 2300 | 2038 | 2121 |
| 3295 | HVO_1870 | 2090 | 2037 | 2433 | 2911 | 4398 | 3168 | 2200 | 2107 | 2225 |
| 3331 | Hbo1746 | 2029 | 2120 | 2406 | 3241 | 3168 | 4567 | 2188 | 2112 | 2169 |
| 2746 | Hut2680 | 2069 | 2101 | 2013 | 2300 | 2200 | 2188 | 4353 | 2180 | 2407 |
| 2585 | Hmu2581 | 1938 | 2036 | 1958 | 2038 | 2107 | 2112 | 2180 | 4348 | 2542 |
| 2775 | rrnAC3170 | 2013 | 2131 | 1993 | 2121 | 2225 | 2169 | 2407 | 2542 | 4321 |
656 symbols consensus ---------MNTLLWVLVGLLAYSLLAMALRQRGLLPEFVRVSGPITTLHTKRGRAFLDW #oth 11111111223.2311.2.331.2333531452.41.432431..32.21.31.143211 VNG2019 ::::::::::E:WQLL:::::::WAAVSWAQS:::::S::HT::::::::::::KR:::: NP2268A ::::::::::S::::::::I:L:TSV::::KS::V::DA:S::::LL:V::::::::::: hla1582 MNALTDLFAE:::::::T:V::::AA::W::N::A::DS::::::VL::R:L:::::::R HQ1095A ::::::::::::::::::::A:::AGTFF:S::::::K::Q:Q::F::I::Q:::E:IE: HVO_1870 :::::::::::::::::A:FI::::::AL::A::I:::Y:::Q::L::V::R:::EL::R Hbo1746 :::::::::::::I:::::::::::V:LL:::Y::::SS::LQ::LA:I::::::D:I:: Hut2680 ::::::::MVD::TL::A:V:::::G:T::DR::Y::A:LK:::::::::::::::A::: Hmu2581 ::::::::MVS:FT:::::VV:::I:G:L::TW:V:::Y:HL:::::::::::::Q:V:: rrnAC3170 ::::::::MVS::T:::A::V::T:::::::T::VV::YI:F::::::I::QK:K:V::: consensus LATPKRFWRAWGNFGVGIALVIMVGSFLLLLLQAISALQNPP-PSAINQPQNFLVIPGVN #oth 3.3...2...23.3.1.5211211.314423541363234132125442.412.2...1. VNG2019 M:::::L::::::::L:L:S:VL::VLIA:V:V::TT:L:::E:TS:S::S:V::::::: NP2268A ::::::L:::::::::::::::::::::AV:AS::G::VE:Q:ATGFVR::DA::::::: hla1582 ::A:::L:::VA:L:L:G:::A:::::I:I:SS:L::IRTVQ:::::Q::::::I::::: HQ1095A I:Q::::::::T:::::T:::::::M:AF::I:G::I:::::A:::V:::E::::::::: HVO_1870 I:A::::::::S:V:L:::::::::T:V::VF::VVI:::::A:TQV::::::::::::: Hbo1746 V::::::::::T:::L::T::::::M::F:FV:G:FI:L:::A::VA::::::::::::: Hut2680 ::R:::::::F::I:::FG:F:LA:M::TV:FSG::S::Q:E:ANP:QE:K:A:::::L: Hmu2581 ::::::A::::::V:::VG::V:::::FYVV:A:VL:VRD:A::::VTE:R:V::::::: rrnAC3170 ::R::::::::::L:::FG::V:::::::VA:G:YQ::V::Q::::L:E:R:A:A::::: consensus DFLPLSVAPEIVFGLLVGLVVHEGGHGLLCRVEDIDIESMGVALLTIIPLGAFVEPDEES #oth 1...111.21.23..321211..11.1221..11.111...1211132.2....1.2113 VNG2019 :::::::::::IA::FI:I:I::F::::M::::G::V::::::::AVL:V:::::::QD: NP2268A Q:::WAA:ID::I:::::::::::::::::::::::::::::::FAF:::::::Q::::: hla1582 ::::::::::::A::A:AM:::::A::::::::G:::::::LVFF:FL:V::::::N::A HQ1095A :::::::::::I:::::::::::::::I:::::G:E::::::F::::::::::::::::: HVO_1870 :::::::::::L:::::::::::::::V:S:::G::V:::::V::::L:V::::::S::: Hbo1746 :::::::::::::::::::::::::::I:::::::E:::::LV:F:LL:::::::::::: Hut2680 :::::AA::::I::::::MI:::::::::::::::::D::::::F::::::::::::::: Hmu2581 ::::::::G:::A::V:A::::::::A:::::G::E:::::L:::::V::::::::N::G rrnAC3170 ::::::::::::L:::L:::::::::::F::::::::::::L:::A:::I::::::::DE consensus QRRADRGGKTRMFAAGVTNNFAVTIVAFALLFGPVAGSIAVAPGVAVGGALPGSPAAAAG #oth 55731..323..12....1.122332312.1.11122324222.43112343121.13.2 VNG2019 :AD::::S:S:::::::::::L:VV:TL:::::::::AV::SD:GL::EVHD:TA::::: NP2268A :DA::::::::::::::::::L::A:C:::A:WM::SF:S:::::::::V::::A:DD:D hla1582 TQEVS::ARA::::::::A:TVL:VLV::::::::V:A::P:::Y:::EVT:E::::::D HQ1095A E:F:S:::R:::::::::::::I::I::V:::::II:::T::::L::S::YDE::::T:: HVO_1870 :::::::::S::::::::::::::L::::::::::I:::S:::::::S::YA::::D::: Hbo1746 ::N::::::S:::::::::::::::::::::::::IA::S::::M:IS::YD:::::T:D Hut2680 RAK::::AQ::::::::::::VI:AL::L::::::::::QAVG::::::::::::::D:S Hmu2581 VSLS:::KQI::YV:::::::::SLLCL:::::::IAGFG:VD::H:::T:::V::DQ:: rrnAC3170 LL:T:::SQ:::YT::::::::LA:ITLL::::::::AV::VD::P::SPIN:T:::D:: consensus IEQGDRITAVAGTPVANASELDAALAEADA-TVEVELND--------ARTVTVERELIVA #oth 245.1121214.3315154224431534254214.4354132112116523413.414.4 VNG2019 FSG:::::::G:A::::NTAFRQ::D:Y:DP::P:T:AS::::::::NE::R:::Q:S:V NP2268A LDR::VL:::N:QG:E:V::F::::SD::R:E:T::RK::::::::::AP:D:Q:::::T hla1582 :AH:::LV:::::::DT:D:FE::I:D:GE:::S:TAD:GDG:::::E:::E:::R:H:I HQ1095A ::::::::T:::::IS:E:::NNI:S:RSNREIT:KI::GTSAAKRESQ:L::::::::: HVO_1870 :SG:::V:::E::::NTTR::::::LAT::G::S:::DG::::::::E:::S:T:::V:: Hbo1746 :S::::::::::M::N:ETT:::::YSTSDQR::::::GGESAADREK:::S:::S:::: Hut2680 LGE::V::GIN::E:T:Q:T:RD::GD::GR::A:S:HE::::::::DE:KRIQ:SVF:T Hmu2581 ::S:SV::GID:QS::::T:MQQR:D::GG:::::T:QN::::::::GTVT::D:AVV:V rrnAC3170 ::S::V::::N:QS:E:QQA:ESV:::S::Q::::ARK::::::::::D::::::SVV:S consensus GAVAGNPLGITV------------PITITAVNGTAVATESGFEDAVGDRRFATLTTDDG- #oth 332533135444111111133332254133.1.22.4.444166.333733133326421 VNG2019 ANASNS::S::T::::::::::::ND::::::::T:S:::ELRA:LA::EV:AFELN::: NP2268A H::RDG:IEQ--::::::::::::GAVVAT:D:D::Y:::ALAT:IEGTERIE:GLK:E: hla1582 :SAG:::::V:I:::::::::ESE:VA::S:::ES::::QQ:L:::::AER::V:V:ADG HQ1095A :S:G:::AD:N::::::::DAEGD::GVET::::::Y:QA::SN:::TD::IE:::TR:: HVO_1870 :S:::::ANL:::::::::ESGSD::RV::::::::S:RAD::S::::S:::R:D:SA:: Hbo1746 :T:::::A:LS:GDDDSAASQNDD::RV:Q::::::H:QR::SE::::G::::I::SR:: Hut2680 V::LDG::::DR::::::::::::GD:::S::::::H:V::LV:::EN:TV:::E:A::: Hmu2581 :::S:A:VRT--::::::::::::NR::V:::::::N:TTA:N:::E:KPI:R::L:N:: rrnAC3170 A:LQSAS::T--::::::::::::GE::VS::::::::R:E::Q:AQ:HPV:::E:ES:: consensus --------ETVTIPIGAYVTRVAEDGPL-AAEGAPAGEPAIVTAIDGERVPSSAALSAVL #oth 111111124332213.2243413422.21453.4243434213222121263654.5532 VNG2019 :::::::AA:A:G:A::L::TIP-:A:A::TD:LS::TN:V:VSVN:T:::TYD:::GE: NP2268A 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:R:D:DQ::A::L::RN::::::::GF::VQ:::::::::G::::::::::Q:::::::T Hbo1746 GD:Q:::::P::L::H:::::::::AFK::D:::::::R:NG:::::::L:::::::::T Hut2680 EG:D:::::DI::::::::::::::::R::S:::E:::R:GT:::::VG:Q::I::IVVN Hmu2581 G:R:::::IRLAG::::::::::::Q:::::I::A:AS:S:P:-I::DYVAR::::ISVG rrnAC3170 EGG:::DE:T:TG::A:::::::::S:::::::MA:SE:V:::II::S::QQ:I::IQVS consensus DFGIQSYPAGTYLELLGGD--GG----DALGLGGALADSFLQAVFVALILPLASVVL-GL #oth 1..344...33133311.3111222234453464656532323245315..132235113 VNG2019 G::ATL:::D::RG::S:ETS:SAYLSTLF:GADDPITG:::::VI::Y:::IGL:DPT: NP2268A ::::DT:::EQ:H:M::::::--::::---:::ENPVAT:VSQT:G::V::FMNIIDPTV hla1582 :::VSE::::A::::::::::::EGATNG:A:T:-:T::P:GL::AS:::::G:LF-::: HQ1095A :::A::::::::::::::E:::::::PG:I::S:TI:::P:G::Y:S:V::::::::::I HVO_1870 :::T:E:::::::S::::::::::::::GG:::S:F:G:P::L:Y:S:L::::::::::I Hbo1746 :::V::::::::VS::::::::::::P:::::S::V:::P:S::Y:::::::::L::::I Hut2680 :::::::::E:::GI:::N::--::::------:D:DIPLG:QIILLIT::::::AAP:: Hmu2581 ::::ET:::ERF:AM::::::--::::-VP:QQPFESTP:::RIGL::A::F::I:E::: rrnAC3170 ::::DA:::AAF::FI::S::--:::P::PTSVSEF--::A:RI:ST:L::FIG:AG::F consensus PFNFAGFTGEVTNFYTVSGPLGALG-GGVFLLANVLFWTGWINLQLGLFNCIPGFPLDGG #oth 32..1.1315432..514.2134322432.441.221.11.2.12213..22.42..... VNG2019 G:::::IA:MNAS::H:T:V::VFPDWVT:GA::::L::::V::N:A::::::A:::::: NP2268A GY:::::N::I::::D:::::::--::I::A:V::::::::V:IN::I:::::SY::::: hla1582 ::::::::::M::::V:E:AFA:F::::T:::::L::::::::I::A::::L:A:::::: HQ1095A :-::P::::A:H:::AIT:::EPI::S::::I::IA:::A:::::::I::F:::H::::: HVO_1870 :-::P::::::I:::Q:G::::F:::::::IF:::::::A::::::::::::::Y::::: Hbo1746 :-::P:::DS:A:::A::::F:F:::S::::::::C::MA::::::::::::::Y::::: Hut2680 T::::::L:PI:D::::T:::AG:::::::VV::L::::A:V::N:AV::L::L:::::: Hmu2581 SY::P::::IAA:::::::::S:::TD:A:VV::L::::::L::VV:Q::LV:TY::::: rrnAC3170 GY:::::::IA::::::Q:::::::TTP::::::::::::::::VI:Q::L::T:::::: consensus HILRTSTEAVVSRLPV--SDPRTAVRTITTSIGLTMLLSLLLMIFGPQLLG----- #oth 11..443.1232.2.41135444223111322224.2411332212142.321111 VNG2019 :L::SAA:::TV:::F::ER:E::T:A:::G:::L::C:::::L:::E::S::::: NP2268A ::::S:::::LA:::G::EASPALAGAV::AVS:V:I::::GLL:I:W:::::::: hla1582 R:::MVA::::::V:I::::RHA::::::V:S::V::AG:IM::::N:I::ALGLL HQ1095A R:::::A::::::::LPA:GK:RL:::::::V:II:::::::LV:::TV:SG:::: HVO_1870 R:::::::::::::::::D::H:V:::::::::::::A::V::::::T:::::::: Hbo1746 R:::::V::::::::::::E:Y:V::::::G::V::::::::LV:::TV:N::::: Hut2680 :L:::G::SI:A:T::::-NK:W::::V:V:V::V:FG::M::L::::::T::::: Hmu2581 ::::VCS:SIAA:::I::ERREGL:KA::YGVS:::IG:FVFI:AV:::::::::: rrnAC3170 ::::A:::SF::::::::::G:RVTTAVSIA:TVS:ISG::::V:::R::T:::::