|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 7875 | VNG1814 | NP4506A | Hut0755 | rrnAC3360 | Hmu2234 | HQ3311A | hla1551 | HVO_2361 | Hbo2056 |
6255 | VNG1814 | 7782 | 5883 | 5743 | 5763 | 5817 | 5750 | 5918 | 5936 | 5892 |
6556 | NP4506A | 5883 | 8090 | 6218 | 6322 | 6366 | 5944 | 6029 | 6056 | 6116 |
6629 | Hut0755 | 5743 | 6218 | 8042 | 6594 | 6709 | 5903 | 5992 | 6044 | 6167 |
6900 | rrnAC3360 | 5763 | 6322 | 6594 | 8124 | 7232 | 5972 | 6198 | 6213 | 6381 |
6931 | Hmu2234 | 5817 | 6366 | 6709 | 7232 | 8208 | 6053 | 6149 | 6223 | 6316 |
6613 | HQ3311A | 5750 | 5944 | 5903 | 5972 | 6053 | 8106 | 6297 | 6457 | 6543 |
6784 | hla1551 | 5918 | 6029 | 5992 | 6198 | 6149 | 6297 | 8022 | 6409 | 6598 |
6846 | HVO_2361 | 5936 | 6056 | 6044 | 6213 | 6223 | 6457 | 6409 | 8112 | 6808 |
6991 | Hbo2056 | 5892 | 6116 | 6167 | 6381 | 6316 | 6543 | 6598 | 6808 | 8047 |
1153 symbols consensus ------------------MTASEDRTILLIGSGPIQIGQAAEFDYSGAQACRALQEEGAR #oth 1111112111111122233453231..........1..................1..... VNG1814 ::::::::::::::::::-MTEDS:::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP4506A ::::::::::::::::::-MPD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0755 :::::::::::::::::::::DDQP::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3360 :::::::::::::::::::::D:::::::::::::K:::::::::::::::::::::::: Hmu2234 ::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3311A :MTDEDANDNMRVDTNSAD:T:A::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1551 ::::::::::::::::::--M::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2361 :MTDEDT:::::::STGPQEGT::::::::::::::::::::::::::::::::R::::: Hbo2056 MMTDEDT:::::::STGSQDG::N:::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus VVLVNSNPATIMTDPEMADKVYIEPITTEAISEIIRKEDPDGVIAGLGGQTGLNVTAELA #oth ................1..3..2...211..1.1.24.4..................1.. VNG1814 :::::::::::::::::::A::::::EPD::A:V:EQ::::::::::::::::::::A:: NP4506A ::::::::::::::::::::::V:::::D::A:V:::::::::::::::::::::::::: Hut0755 :::::::::::::::::::E::L:::N::::A::::::E::::::::::::::::::::: rrnAC3360 ::::::::::::::::::::::L:::N:::::::::::E::::::::::::::::::::: Hmu2234 ::::::::::::::::::::::L:::N::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3311A :::::::::::::::::::R:::::::::::A::::S:Q::::::::::::::::::::: hla1551 ::::::::::::::::T::R:::::::P:::::V::I:E::::::::::::::::::::: HVO_2361 :::::::::::::::::::::::::::::::::::ER:R::::::::::::::::::::: Hbo2056 :::::::::::::::::::::::::::::::::V:A::N::::::::::::::::::::: consensus EEGVLEEHDVDIMGTPLDTIYATEDRDLFRQRMEDIGQPVPASTTISLDEGESVTDITEE #oth .111.1222.11.....1........11.12..251.1..14.1..31422132343214 VNG1814 :Q:::D:::::V:::::::::::::::::::::A:L::::::::::A:GDD:TA:::D:G NP4506A :::::D::G:E:::::::::::::::::::E::K:::E::CR:E:::S------------ Hut0755 :::::::::::V::::::::::::::EQ::K:::K::E::::::::KS------------ rrnAC3360 :::::D:Y:::V:::::::::::::::::K:::::::E:::R::::T::D::::::LD:D Hmu2234 ::::::::::E::::::::::::::::::K::::E::E:::S::::T:::::T::EL::: HQ3311A ::S:::T:N:E::::::E::::::::::::::::R::::::Q::::::T:D:A:QSL::A hla1551 :::I:::Y::EV::::::::::::::::::::::GL::::::::::::::::::::FD:: HVO_2361 ::::::KF::::::::::::::::::::::::::K::::::K::::::E:::A:EN:::: Hbo2056 :::::::Y::::::::::::::::::::::::::N::::::R::::::EDD::::S:::D consensus ALRDRVEDAVEEVGGLPVIARTTYTLGGSGSGVVHEMDELVERVRKGLRLSRNSEVLITE #oth 32521.331.13..1....2..1.....1....131122.3322.1.11...141.21.. VNG1814 :::E::D::::A:::::::::::::::::::::::DFEA::D:::T:::::::A:::V:: NP4506A --M:E::::::S::::::::::A:::::::::::DD:E::R:IA:::FQ::::H::Q::: Hut0755 --M:E::A:::::::::::M::::::::A::::IGD::::K:AT::::::::DDR:M::: rrnAC3360 S:I::::S::D:::::::::::::::::::::::D:::::I::::::::::::N:::::: Hmu2234 S:::::::::D::::::::::::::::::::::::::EK:I::::::::::::::::::: HQ3311A D:K:::HE:::T::::::::::::::::::::::A::N::I::::::::::::::::::: hla1551 :F:G::QA::D:::::::::::::::::::::::DDFE:::::::::::::::::::::: HVO_2361 ::VE::::S:DA::D::::S:::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::: Hbo2056 D:S::::A:::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::::::::: consensus SIAGWVELEYEVMRDADDSCIIICNMENIDPMGIHTGESTVVTPSQVIPDEGHQEMRDAA #oth ..4..1..........1..1..1.....1..........2......1...11..1..12. VNG1814 ::T:::::::::::::G:::::V:::::::::::::::::::::::I:::D::::::N:: NP4506A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::NS: Hut0755 ::D::I::::::::::::::::::::::L::::::::::M::::::::::::::::::T: rrnAC3360 ::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S: Hmu2234 ::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:::S: HQ3311A :::::::::::::::::::T::::::::L::::::::::I::::::::::::::A::::: hla1551 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::: HVO_2361 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2056 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::M:::::::::::::::::::: consensus LKVIRELGIQGGCNIQFAWHDDGTPGGEYRVVEVNPRVSRSSALASKATGYPIARVTAKV #oth 14...1.1.2......1..1...1.1.................................. VNG1814 VA:::::::::::::::::R:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP4506A :::::::::E::::::H::R:::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0755 :::::::E:H:::::::::R:::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3360 :::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2234 :::::::::E::::::H::R:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3311A :D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1551 :E:::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2361 :Q:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2056 :E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ALGKRLHEIDNEITGETTAAFEPAIDYVVTKVPRWPIDKFRDVDFELSTAMKSTGEAMAI #oth .1....1..3.....1...........1...1....2...4211...11.........1. VNG1814 :::::::::::::::Q::::::::::::::::::::N:::PE:::::::::::::::::: NP4506A :M:::::::E::::::::::::::::::::::::::K:::S::E:::GP:::::::::S: Hut0755 :M:::::::E:::::::::::::::::::::I:::::::::::::::GP:::::::::S: rrnAC3360 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TE::::::::::::::S: Hmu2234 :M:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::: HQ3311A :::::::::N:::::::::::::::::I::::::::K:::DN:::::::::::::::::: hla1551 ::::::P:::::::::::::::::::::::::::::::::D::::::G:::::::::::: HVO_2361 :::::::::T::::::::::::::::::::::::::K:::T:::::::::::::::::S: Hbo2056 :::::::::E:::::::::::::::::::::I::::K:::D::::::::::::::::::: consensus GRTFEESLLKALRSSEYDPAVDWGEVSDDELEAEYLERPTPDRPYAIFEAFERGYTVEDV #oth ..1.1..1..1...1..1.11127221.21.231..42.1...1..2....3.1111321 VNG1814 :::::::::::::::::::S:::AT::::::A:D::Q::S::::::V:::::::F::G:: NP4506A :::::::::::::::::::::::S::D::::A:D:::T:::::::::::::D:::::DEI Hut0755 ::::::::::::::T::::::N:T::::::::S:::V::S::::::M::::::::S::T: rrnAC3360 ::::P::::::::::::N::A:FN:ID:A:::T::::K::::::::M::::C::::::E: Hmu2234 ::::P::M::::::::::::::::::D:::::E:::I::::::::::::::A:::::DEI HQ3311A ::::::::::::::::::::ANLETL::ET:KS:::S::::::A:::::::D:E:::DT: hla1551 ::N:::::::S::::::::::::PAID:ET::T::::::::::::::::::D:::::A:: HVO_2361 ::::::::::::::::::::A::D::::E::::::::T::::::::::::::::::T::: Hbo2056 ::::::::::::::T:::::A:::::::::::S::::K:::::::::::::::::::::: consensus VELTDIKEWYVERFKRVADAAEAAQDGDFAAAATAGFTNAEIAALA-------------- #oth 512.2245..12.1221531341.43.13431.53.3.1431124211121211121131 VNG1814 NDH:GFR:::LQ::QN::A:SA::SE::V:TP:AL:Y::SAV:::::::::::::::::: NP4506A HD::G:YD::L:::G:I:E::D:::::::Q:::DK::::Q::T:I::GGEFNDTHASWIP Hut0755 S:::E:R::::::Y::I::::D::SA:ELDI::E:::::H:V:T::SGGAFDDTHASWLP rrnAC3360 :DI::::::::::::E::::::::R:::YET::Q::::DQ::T::::GGEFNDTHVSWLP Hmu2234 ::::::ER::::::Q:IEE::::::N::::T::E::::DQ::T:M::GGEFNDTHASWVP HQ3311A A:::G::Q::LK::Q::PT:LKT:EE:ELT::::T:V::T:::ETT:::::::::::::: hla1551 ED::G::P::L::::::S:S:Q:::N:E::Q:::::H:::D::::D:::::::::::::: HVO_2361 ::::::H:::::::G::VE:V:::AE:::::::S::H:::S:::AT:::::::::::::: Hbo2056 :::::M:T:::::::::T:SVA:::::::T::::::H::::::TTT:::::::::::::: consensus -------------------TDGGGVTVDDVEAEVPGRTFKQVDTCAGEFAAQTPYYYSAR #oth 44333341111223243332113233143.264233.21.1........2.3......2. VNG1814 :::::::::::::::::::S:::D:A::::A:TA:E:::::::::::::::S:::::::: NP4506A SEVREAD::::EEDGQQVE:::A:::I:::DT:TSD:::::::::::::R:S:::::::: Hut0755 DRLLDERGVVSDDGEATPQ::::::S:A:::DAA:A:S:::::::::::E:S:::::::: rrnAC3360 ADLDEDGG:::DEPEVEAA:::S:::::T::T:TTD:D::L::::::::E:T::::::T: Hmu2234 EGNLSEKG:::D::EIEAA:::S::::E:::S:TVD:D::L::::::::E:T::::::T: HQ3311A :::::::::::::::::::----EK:I:A::KT:::::Y:::::::::::::::::::S: hla1551 :::::::::::::::::::---:::D:ET::ED:::::Y::::::::::::E:::::::: HVO_2361 :::::::::::::::::::----:TS:GE::QN:::::Y::::::::::::::::::::: Hbo2056 :::::::::::::::::::----:SD:SA:::D:::::Y:::::::::::::::::::S: consensus K--------PLSGDD-ANELRVDRDVESVVVVGGGPIRIGQGVEFDYCSVHAVRALRELG #oth 421142111264.551231122.2242...1.................2...11..124. VNG1814 S::::::::--Q:ST:GSDV:A:::AH:::I:::::::::::::::::T:::::::::A: NP4506A E:::::::::PT:QG::S:VQ:::EA::::::::::::::::::::::A:::::::::E: Hut0755 E::::::::::::LE:R::VQ::PEI::::::::::::::::::::::::::::::E:I: rrnAC3360 D::::::::::::I::RD::QI:P:L::::::::::::::::::::::::::::::EN:: Hmu2234 D:::::::::V::I::R:::QI:P::::::::::::::::::::::::::::::::E:A: HQ3311A :PEFTSGSG:YE:AAA:G:::::::I:::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1551 QSEFNRG::::K::AA:G::V::KS:D:::::::::::::::::::::::::IQ:::::: HVO_2361 :PEFFRG:::FE::SAG::::::::M:::::::::::::::::::::::::::Q:::DM: Hbo2056 :PEFYSG::SST:::A:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::M: consensus IDAHVVNNNPETVSTDYDTSDGLFFEPITAEEVADVIEATDADGVMVQFGGQTSVNIGHP #oth .1...1...................1.1.......12.122.....1........11.3. VNG1814 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::N::::::::::::::DV:A: NP4506A :::::::::::::::::::::::::::::::::::I::E:::::::::::::::::V:E: Hut0755 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:E:G::::::::::::::D:::: rrnAC3360 :::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::::::::::D:::: Hmu2234 :::::::::::::::::::::::::::V::::::::V:::N::::::::::::::D::Q: HQ3311A :::::I::::::::::::::::::::::::::::::A:::N::::::::::::::::::: hla1551 :E:::::::::::::::::::::::D::::::::::V:::G:::::::::::::::::E: HVO_2361 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::::L::::::::::::: Hbo2056 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::: consensus LEAELDRRGLDCEIMGTSVDAMDLAEDRDRFNRLMDELGIAQPEGGTATSEEEALDLAHD #oth ..5.12..11..111..311............4.11221.3.13..1...231..2..31 VNG1814 :::::E:::::::::::D::::::::::::::::L::RD:S::D::S:::VAG::E::AE NP4506A ::D::E::::::D::::::E::::::::::::A:::::::S:::::::::KA:::::::: Hut0755 :::::::::::::V::::::::::::::::::::::D:::::A::::::::A:::E::R: rrnAC3360 ::Q::E::D:::::::::::::::::::::::K:::::::S:A:::S:::K::::::::: Hmu2234 ::R::::::::::::::A::::::::::::::Q:::::::::A:::::::K::::::::: HQ3311A ::T:::::::::D:L::::::::::::::::::::SS:D:K::V::S::::P:::T::N: hla1551 :::::Q:::::::::::::E::::::::::::V::::M:::::K:::::::S:::E:::: HVO_2361 ::S::::::V::::L::TI:::::::::::::::::D:::L:::::S:::::::::::N: Hbo2056 ::::IQ::D:::::L::T::::::::::::::V:::::::L::::::::::::::E::R: consensus IGYPVLVRPSYVLGGRAMDVVHSDAELEEYIEEAVRVSPDKPILVDEFLADAVELDVDAV #oth 2.................21.22.31.32.1........1..1.1.2..1.11....... VNG1814 V:::::::::::::::::EI::D:D::RR:V::::::::E::V::::::::::::::::: NP4506A :::::::::::::::::::::Y::::::::::::::::::::::::D::::::::::::: Hut0755 ::::::::::::::::::E::YN:DD:KT:::::::::::::::::D:::::I::::::: rrnAC3360 :::::::::::::::::::::YN:ED::T::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2234 :::::::::::::::::::::YN:ED::T:::::::::::::::::D:::::I::::::: HQ3311A L:::::::::::::::::::::::V::Q::::::::::::::::I:Q:::::I::::::: hla1551 L:::::::::::::::::R::ED:::::::::::::::::::::::Q::D:::::::::: HVO_2361 L:::::::::::::::::EI:::::D:K::::::::::::::::I::::::G:::::::: Hbo2056 ::::::::::::::::::::::::E::KT::::::::::::::::::::::::::::::: consensus AD---------------GEDVLIGGVMEHVESAGVHSGDSACMIPPRSLE-EDTMARVRE #oth 1.111111111111111122312..1...1.2..1.......1....123142213.1.1 VNG1814 S:::::::::::::::::::::V::::::I::::::::::::V::::G:G:D:IL::::: NP4506A S::::::::::::::::::::I:::I:::::A:::::::::::::::::S:Q:VLE:::: Hut0755 ::::::::::::::::::D:I::::::::::T::::::::::::::::D:I:NV:P:I:: rrnAC3360 :::::::::::::::::ED::::::::::::T::I:::::::::::::Q:IK:V:P:I:: Hmu2234 ::VGASHAPASETESRP::N:::::::::::T::::::::::::::::Q:IK:V:P:I:: HQ3311A :::::::::::::::::::RTI:::::::::::::::::::::::::::S:AE::::::T hla1551 ::::::::::::::::::D:::L::::::::::::::::::::::::::G::E:L::::: HVO_2361 S::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::::::D:DE::::::: Hbo2056 ::::::::::::::::::RRA::::::::::::::::::::::::::::D::E::G:::: consensus VTEDIARALDTVGLLNVQLAVR-------DGEVYVLEANPRSSRTVPFVSKATGVPIAKL #oth .122..41.1.1..1.....131122212231.1..............11.211..1..1 VNG1814 ::TE:::::::::::::::::Q:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP4506A ::L::::G:::::::::::::::::::::::::F:::::::::::::::::::::::::: Hut0755 :::Q::G::E::::M::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3360 :V::::D::::::::::::::::::::::::::F::::::::::::::I::TA::::::I Hmu2234 ::::::S::E:E::::::::::::::::::::::::::::::::::::IA:T::::L::I HQ3311A ::::::T:::::::::::::IK::::::::D::::::::::::::::::::::::::::: hla1551 :::::::::::::::::::::TGVGDDDAES::::::::::::::::::::S:::::::: HVO_2361 ::::::S:::::::M::::::K::RNEDGSND:::::::::::::::::::::::::::: Hbo2056 ::::::T::::::::::::::K:::::::::D:::::::::::::::::::::D:::::: consensus AAKVMAGA-SLAELDVEEQIPEQVSVKEVVLPFDRLPGSDPRLGPEMKSTGEVMGTARSF #oth .....21412.42.225.12.223.............1...................422 VNG1814 :::::::E::::D::AS:GV:::Y:::::::::::::::::::::::::::::::::SDP NP4506A :::::::Q:::E::AA::::::H::::::::::::::::::::::::::::::::::::L Hut0755 :::::::::N:D::::A::Q:::::::::::::::::::::::::::::::::::::G:: rrnAC3360 :::::S:::T:S::::Q::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G:: Hmu2234 :::::::::::E:::Y:::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::G:: HQ3311A :::::::E:::TT:::T::::AET:::::::::::::::::::::::::::::::::AT: hla1551 :::::TDDLT::D:::D:::::HR:::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2361 :::::::N::::D:::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:: Hbo2056 :::::::E:T:ET:GAT:::::H::::::::::::::N:::::::::::::::::::::: consensus GKAYQKAQMAVGKPIPLSGTAIVDLP--EFP----E-G--LREGFEEHFEVLTF---DDA #oth .2..3...41233131541.14..143422234332224423513433112434223335 VNG1814 :M::W:::V:ASNAPVPGS::V:::L::---::::-:-::-V::LG:R:::V:V:::--- NP4506A ::::::::S:T:T:L:TA:::L:::ETLGGMSQQD:DITDI:::A:R:Y::T:P:::::Y Hut0755 :::::::::::D::::::::::::::::---::::-:-::-IV:::::::T:DLDDF:SQ rrnAC3360 :::::::::::::A:::E::::::::::---::::-:-::-IL::::::D:QD:DDYE:T Hmu2234 :::::::::S:D:::::D:::L::M:::---::::-:-::-II:::D::D::D:DDFE:V HQ3311A ::::D:::HS::::::S::::W:::SDE:::APDSND:AA::D:YDAC::LV::SED::: hla1551 ::::D:::DSTN::::E::::V:::SAD:::DPDT:A:ES:VA:YA::::L---:::SE: HVO_2361 ::::E:::S:AND:V:AD::VY:::ADP:::DADS:A:QE:LDA:N:YY::::P:::::V Hbo2056 :R::D:::D:TS::V:E::::::::SAE:::DEGT:A:EE:::::AD::DLVS::::E:T consensus DDLIAAIRRGEIDLVVSRNRDVLEVCVEEEITYFSTHASAEAALEAIESKDQPLDVQAVS #oth 434651226.221323.12.15.231..1223.2..52124.22.124332332423223 VNG1814 K:VP:::::::VEFL::DD::A:TAA::A::P:V::V:A:::MR:G:AAA:GAREAMP:A NP4506A :::TG:L:D:D::IIF::D::T:::A:::::A:L::VP:SR:TI::::T::E::::M:L: Hut0755 AE:E::L:D::::::I:::::::::::::ST:::::I::GK::::::::D::::S::D:A rrnAC3360 :AI:D::QS:KV:::L::::::::A::::TV::::::E:::::::::N:A::::A:::ID Hmu2234 :AIVE::QN::::M:L::::::::A::::TV:::::RE:::::::::NAN::::N::DIA HQ3311A :T::N:L:Q::::I:I::D::P::::::::::::::T:::F::::::D::ND:I:IDP:: hla1551 T:::E:AK::::::I:::Q:EL:::A::::::::::::::K::::::DH:GDD:::M::: HVO_2361 ::FLTML:E:DF:F::::D::T:ID:::::VS::::Y:::K:::::RGAA:EDI::LP:G Hbo2056 EERD::::A::V:::::::::F::L:::::::::::::::S:::::V::::ES:::L:I: consensus ERPKTQRNWGA-- #oth 3..36434..541 VNG1814 D::VNDET::-:: NP4506A :::TE::K::Y:: Hut0755 T::::T:K::DN: rrnAC3360 :::::::E:::E: Hmu2234 S::::::E::R:: HQ3311A D::TLKN:::-:: hla1551 D:::RVE::::AE HVO_2361 :::RVVA:::Q:: Hbo2056 ::::QTAD:::K: