|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2174 | VNG0387 | NP0798A | hla0077 | HQ1247A | HVO_0708 | Hbo0827 | Hut0140 | rrnAC0711 | Hmu0934 |
1311 | VNG0387 | 2188 | 1087 | 1141 | 1072 | 1187 | 1160 | 1231 | 1131 | 1179 |
1478 | NP0798A | 1087 | 2175 | 1257 | 1166 | 1304 | 1264 | 1356 | 1285 | 1301 |
1700 | hla0077 | 1141 | 1257 | 2342 | 1480 | 1549 | 1536 | 1372 | 1384 | 1349 |
1606 | HQ1247A | 1072 | 1166 | 1480 | 2337 | 1479 | 1618 | 1340 | 1312 | 1300 |
1800 | HVO_0708 | 1187 | 1304 | 1549 | 1479 | 2538 | 1621 | 1451 | 1377 | 1399 |
1786 | Hbo0827 | 1160 | 1264 | 1536 | 1618 | 1621 | 2277 | 1430 | 1399 | 1350 |
1700 | Hut0140 | 1231 | 1356 | 1372 | 1340 | 1451 | 1430 | 2224 | 1522 | 1502 |
1625 | rrnAC0711 | 1131 | 1285 | 1384 | 1312 | 1377 | 1399 | 1522 | 2217 | 1682 |
1598 | Hmu0934 | 1179 | 1301 | 1349 | 1300 | 1399 | 1350 | 1502 | 1682 | 2201 |
343 symbols consensus ---------------------MRY-HVDGELVPAEEATVSVRDRGFMYGDAAFETLRAYG #oth 1332442422222111111122411..1131.2333.1.313....4...12...3.... VNG0387 :::::::::::::::::::::::::::N:A::D:AD::::::::::Q::::::::M:::: NP0798A ::::::::::::::::::::::Y::::::D::DR:D:::H:D::::R::::::::C:::: hla0077 MGEDPGGADDAAE:::::::EL::::::::I:::SQ:::::E::::A::::::::::::: HQ1247A MSRDRSTSDS:::::::::::PS:A:::N::::M:D::::I:::::::::GV:::::::: HVO_0708 MSDDGVGDGDGDADADTGGRSL:::::::D:::::S:S:P:T::::L::::::::::::: Hbo0827 MTENDTGGDSAD::::::::EL:F:::N::::R:S::::N:::::::::::L:::::::: Hut0140 ::::::::::::::::::::::E::::::::::::::S:N:::::::::::::::::::: rrnAC0711 ::::::::::::::::::::::Q::::N:T:::ED::::::::::::::::::::::::: Hmu0934 ::::::::::::::::::::::Q::::N:D::::S:::::::::::Q::::::::I:::: consensus GEVFRWDAHAERLARTCETLGLDHGLS--ADLRARIDETLAANDLADAYVKLSVTRGVQP #oth .33.4.32.24..232134123331211534.35.12...2..3141..111.11..1.4 VNG0387 :QT:A:T::YR::QA::DS::I::::::E:A::G:VH:::::::::::::R::I:::::D NP0798A ::::L::R:R::::E::RL::MAEAVP::E::QG::::::Q::GY::::IRV::S::::S hla0077 :::::::D::A:::D:::::::::::::EI::K:::::::::::::E::::::I:::::: HQ1247A ::::::K:::N:::DSASAIN:E:::::Q:T:KN::::::T::N:DE::::::I:::::: HVO_0708 ::::H:::::D:::E::DA::M::::::DD:::::::::::::::DE:::R::::::S:G Hbo0827 :DI:::E:::N:::EGA:I:E:::::::N:E:KR:V:::::::E:S:::::::::::::: Hut0140 ::::A:::::D::E:::::::FARAIPPR::::E::A::::::::T:::::::IS::::A rrnAC0711 ::P::::::R:::Q::A::::FADAVP::E::GE:V:::::::::EE:::R::::::::: Hmu0934 :VP:E:T::R:::Q::A::::FG:AVP::DG::D:V:::::::::D:::::::::::::: consensus GKLTPDPAVDPTVVVIVKPLPRGGRDGDPVWDGPATVQTVKTRRIPDRALPADAKTHNYL #oth .2.2.3331..21.13333.2...5314311251.323.13112322432.141...... VNG0387 :R:::RDTT::::::V:DA:::::V::::::SM::::E:TTVTQHR:TTI:ST::::::: NP0798A :::::G::T::::::YA:::::::G::ENC:ETD:::H::E:::P:ESV::SA::::::: hla0077 :T:D:R:E::::::::A:::A:::V:ST::H::::AL::T:::KPSS::::::::::::: HQ1247A :::N:::T:::::::QTS::::::INSN::::D:::L::::::::::::::SH::::::: HVO_0708 :R:::AE::::R:::::E::S::::GS:::::::::::::::::::::S:::R::::::: Hbo0827 :::N:::E::::::IQ:::::::::GS:::::A:::L:::::::V::::I:SR::::::: Hut0140 ::::::::::::I::::DS:::::I:::::::D::::R::E::K:::A:::::T:::::: rrnAC0711 :::::GAD::::::::C:E:::::L::ER:::E::SA:::R:::::SE:V:::::::::: Hmu0934 :T::::ET:::S:::V:DE:::::TE:RS::::::D::::::::V::A:::::::::::: consensus NGILARLELRVTA-----ADEALMLDTDGALAEGATSNLFFVDDNALRTPSLDGPVLPGI #oth 1.1.1.411254332232...1133131.512...12.2..1434314..241222...1 VNG0387 P:V:::RDIAAD-::::::::::FVTP::H:T:::A::::::A:GT:Y:::G:LD::::: NP0798A ::::::I:::G:::::::::::::C::E::V:::::::V:::EEGT:K::A-K:AL:::: hla0077 ::::::::::::G:::::::::::::P::NV:::::A::::A:GT::K:::::::I:::V HQ1247A ::::::A::::SD:::::::::V::::::Q::::::G:I::::GD::C:::::::::::: HVO_0708 ::::::V:::::G:::::::::::::A::YVT:::::::::::::::C:::::::::::: Hbo0827 ::::::::::::D:::::::::V:::G:::::::::::::::RN:::H:::::::::::: Hut0140 :::::::::QQE:SG:DP:::::L:::::Y::::::::::::A:GVVH::TT:Q:I:::V rrnAC0711 ::::G:::::KA:AGGEP:::C:IR::::N::::::::::::T::G:::::T:LDL:::V Hmu0934 ::::::::::RA:TDRFR:::::LR::E:RVV::::::::::TEAG::::AS:LDL:::V consensus TRSTVLDLAREEGIPVEEGRYTPDDLRDADEAFLTNSTWEIRPVATVDGIDVGG------ #oth ..44.321.251121121251643323213.1.1..1...2..1331.134314111111 VNG0387 ::WA:AE::A:H:LT:HT:A:::SR:Y:::::::::T:::V::I:R::DATYDT:::::: NP0798A ::A:::S::ES::::::::::R:A:IEA::::::::T:::V::I:::::TT::::::::: hla0077 ::R::IEI:EA::::::::T:A::AV:E:::V::::::::::::E:::::G:D:DGEGVE HQ1247A :::::::I:A:::::IR:DSFDINT::E:E:::V::T:::::::K:I::::I:R:::::: HVO_0708 ::RV::::::Q::::IR:R:F::::V:::N::::::::::L:::E:::::E::D:::::: Hbo0827 ::AE:::I::D:::::R::::K:::::::T:::V::::::L::::S::::EL:::::::: Hut0140 :::I:::::::::L:::T:P:ER:::LAV:::::::T:::L:::GA:::ESI:::::::: rrnAC0711 ::DV:M:I::G:DF:::T:H:SL:A::::::::::::::::::I::::::S::S:::::: Hmu0934 :::V:M:::ES:DF:::T:T::V::V:E:::::::::::::::::::::::::T:::::: consensus GPITKLLSRLYDERVERRHY----------------------- #oth 124132.22112431.532.43323222221111111111111 VNG0387 CR:GAA:ASA:NAEI:::::::::::::::::::::::::::: NP0798A :ET:RR:::A:::L::T:C:::::::::::::::::::::::: hla0077 ::L:A:::::F:R:::EAY:DGERL:::::::::::::::::: HQ1247A ::L:T::QQAFQN:::K:Y:DTHREVPNEE::::::::::::: HVO_0708 ::V:::::::::DY::::::GGDGGSDDADNGGDADSVGGDEN Hbo0827 ::V:T:::::F:A:::Q:::TE::::::::::::::::::::: Hut0140 ::::R:::::::R::::SC:E:::::::::::::::::::::: rrnAC0711 ::M::::Q::F:::I:E:::::::::::::::::::::::::: Hmu0934 ::M::::Q::::::::SEC::::::::::::::::::::::::