Home |  Text search
[J] (SerS) COG0172 Seryl-tRNA synthetase
9 genomes BUD0306 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2072

rrnAC2808

HVO_1921

Hbo1793

Hmu3118

Hut2468

hla1183

NP1692A

HQ3138A

Pairwise sequence scores
Consensus score3541 HVO_1921 HQ3138A Hut2468 Hbo1793 hla1183 rrnAC2808 Hmu3118 VNG2072 NP1692A
2829HVO_1921 3523 2462 2628 2744 2557 2686 2606 2470 2604
2878HQ3138A 2462 3535 2593 2846 2677 2620 2613 2756 2702
3016Hut2468 2628 2593 3453 2869 2738 2714 2711 2765 2682
3196Hbo1793 2744 2846 2869 3543 2941 2910 2891 2847 2851
3063hla1183 2557 2677 2738 2941 3471 2733 2772 2754 2773
3099rrnAC2808 2686 2620 2714 2910 2733 3538 3050 2798 2810
3086Hmu3118 2606 2613 2711 2891 2772 3050 3549 2745 2844
3019VNG2072 2470 2756 2765 2847 2754 2798 2745 3638 2821
3051NP1692A 2604 2702 2682 2851 2773 2810 2844 2821 3534

476 symbols
consensus       --------------MLSRQFVRENPEEVREALDAKGVTDVDLDRILDIDEEWRELKARGD
#oth            11111111111111.11..21.221261.3113611131111.41.3213...11.21..
HVO_1921        :::::::::::::::ID::LL:DE::R::D::A:RNME:::I::V::VYD:::S:::E::
HQ3138A         :::::::::::::::ID::LL:K::DAI:G:::E::::::N::Q::TL:Q::::R:::::
Hut2468         :::::::::::::::::::Y:::H:G::::T:A:R::D:::::A::E:::::::::::::
Hbo1793         :::::::::::::::I::::L:::::T:::::RS:::D:::::H::EV:::::S::K:::
hla1183         ::::::::::::::::::::::::::V::::::N:::-:::::::::V::::::::S:::
rrnAC2808       :::::::::::::::::::::::H::T::D:IER::::G::::E:::::::::::::E::
Hmu3118         ::::::::::::::::::::::::A:M::::IEQ::::G::::E::R::A:::::::E::
VNG2072         MRYVLAAARRTRTQ:::::::::H::K::D:::::::-:A::::::EV::::::::::::
NP1692A         :::::::::::::::::::::::::::::R:::T:::-:::::::::::::::::::E::

consensus       DLRHERNEVSSKIGELKQEGDEEAAQEAIERSQELKDELQEVEDRADELEAELEEALLEL
#oth            2..22..12.13..21.22.2112.21..21.211.4.1232.41..2.122.1331131
HVO_1921        ::::::::::QQ::Q:::::KD:E:::::D::G:::E::::L:T:::::::::D:::M::
HQ3138A         E::::::QI:::::K::AA:::D::S:::AQ:::::N::E:I:RE::K:KS::DT:M:KI
Hut2468         ::::D::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::R::::R:::I
Hbo1793         ::::::::T::::::::A::KD:E::::::::::::S::A:::::::::::::::R::::
hla1183         :::::::::::T::::::A:E:::::::::::::V:S::::I:E:::::::::::S::::
rrnAC2808       G::Q::::::::::::::D:KD:E:::::D::::::::::DI:E::::::SQ::::::::
Hmu3118         ::::Q::::::E:::Y:R::E::K::D:::::S:::A:::R::::::::::K::AR:::I
VNG2072         E:::D:::::::::::::A:::D::::::::::A:::::AD::A:::D::::::RL::T:
NP1692A         :::RQ::::::E::K::RD:E::::A::::::::::E:IEA:::::::::S:::A:::R:

consensus       PNIPHESVPVGEDESDNVERRREGFDDLRDLPDEVVPHYDLGEELDILDFERGAKVSGGG
#oth            .22.2231.2.32.21.1.32.2..111.31.14.3...1...2.111.11.1..12.1.
HVO_1921        ::L::::::::A::D::E:V::V::::::E:::::T:::::::::::I:EG:A::TT:S:
HQ3138A         :QV:DDA::::T:::E::::::::::S::S:::T:I:::::::::E::::::::::T:::
Hut2468         ::::Q:G::E:::::::::T::W::E::::::ED:T::::::::::::::::::::::::
Hbo1793         :Q:::DD::::::::E:::::::::::::E:::::I::::::::::::::::::::T:::
hla1183         :Q:::::::::A:::E:::::::::::::EV::N:E:::::::::E::::::::::A:::
rrnAC2808       :::::::::T::G:A:::::Y::::::::::::::::::::::D::L:::::::::::::
Hmu3118         ::V:::::::::G:D:::::Y::::::::T::ED:::::E:::R::::::::::::::::
VNG2072         :MV:D:DA:::DS:AE:::::::::::R::::ES::::::::::::::::::::::::::
NP1692A         ::V::PDA:::D:::::::ID:W::::R:S::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       FYFAKGDGARLEHALIQFMLDVHR-EQGYVDVFPPIPVNSQSMRGTGQLPKFAEDAYRIG
#oth            1113..21.1..1..1...2.1..1.12.5111..21.225..3....1...21...122
HVO_1921        :::L::E::M:::::V:::::::::::E:::L::::::KTT::E::::::::::::::::
HQ3138A         :::::::::::::::V:::::I:::::::Q:::::::::::::V::::F:::T:::::::
Hut2468         :::L:::A:::::::::::R:I:::::::EE:::::::S:E::T:::::::::D:::KL-
Hbo1793         :::::::::::::::::::M:::::::::::L:::::::::::T::::F:::T:::::::
hla1183         ::V::::::::::::::::::::::::D:R::::::A:::T:::::::::::T::::::E
rrnAC2808       YQ:V::E::::::::::::::::::::E::::L:::::::D::E::::::::::::::V:
Hmu3118         :Q:V::E:::::Y::::::::::::::E:I:::::L::::E::::::::::::::::::E
VNG2072         :::S::A::::::::V:::::::::::::E:::::M::SAR::E::::F:::V:::::::
NP1692A         ::::::E::::::::V::::::::D:H::T:::::L::::A:::::::F:::V:::::::

consensus       GANDDDYDDDDLWLLPTAEVPVTNMYRDEILLDDDLPLKHQAYTPNFRREAGEHGTETRG
#oth            4534453131....1.........11.1....21...2.3..11....1...........
HVO_1921        ::ETEN::::::::C:::::::::::::::::K:::::::::::::::::::::::::::
HQ3138A         ET::EPW:N:::::C::::::::::::::::::::::V:I::::::::::::::::::::
Hut2468         -------EEE::::C:::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::::::::::
Hbo1793         K::GKER:::::::C::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::::
hla1183         :T:E:A::::::::::::::::::LH::::::GE:::::Y::::::::Q:::::::::::
rrnAC2808       ARQ:::::S::::::::::::::::::G:::::::::V::::FS::::::::::::::::
Hmu3118         ARQ::E:::::::::::::::::::::::::::::::I::::FS::::::::::::::::
VNG2072         :E::A::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::S::::::::::::::::
NP1692A         :D:::P:::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::S::::::::::::::::

consensus       IVRVHQFNKVELVNFVRPENSYERLEGLLDEAEEVLRRLELPYRVLEMCTGDLGFTQAKK
#oth            1......1...1....1.12.311123.13..23..3..2....1.21....11.111.1
HVO_1921        ::::::::::::::::E:DE::D:::A:V:::A:::D::G::::::SL:::::T:AS::T
HQ3138A         :::::::::::::::::::D:A::FD:::T:::V::Q::G::::I::::::::::::R::
Hut2468         ::::::::::::::::E::E:D::::::::::::::::::::::I::L:::::T:AS::T
Hbo1793         :::::::::::M:::::::::::QF:E:::::::::::::::::I:::::::::::::::
hla1183         :::::::::::M:::::::E:H::F:::V:::::::::::::::I:::::::::::::::
rrnAC2808       Y::::::H::::::::::::::D:::S:::::A:::D:::::::::D:::::M:::::::
Hmu3118         Y::::::::::::::::::::::::::::S::::::D::D::::::D:::::M:::::::
VNG2072         :::::::::::::::::::D:A::FH:::::::A:::::D::::::::::::M:::::::
NP1692A         :::::::::::M::::::::::D::::::G::TD::E::G::::::::::::M:::::::

consensus       YDIEVWAPGDDMEDGPEEGGRWLEVSSVSNFEDFQARRAGIRYRPERHESAEYLHTLNGS
#oth            ..2.....1111231.35.........2...22..1...212..1.2....221....1.
HVO_1921        ::L::::::TES::A::Q:::::::::A::::::::::::L:::::::::::::::::A:
HQ3138A         ::::::::::::AT::DI:::::::::::::GA::S::::L::::::::::S::::::::
Hut2468         ::V::::::::::E::T::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::::A:
Hbo1793         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::::::::
hla1183         ::L:::::A:::DE::A:::::::::::::::E:::::::::::E:H:::::F:::::::
rrnAC2808       ::::::::::::::::DR::::::::::::::::::::::L::::::::::D::::::::
Hmu3118         ::::::::::::D::::::::::::::I:::::::::::::H::::::::::::::::::
VNG2072         ::::::::::::DG:::M:::::::::::::K:::::::D:Q::::::::::H:::::::
NP1692A         ::V:::::::::::::DV:::::::::::::::::::::H:Q::::Q::::::I::::A:

consensus       GLAVPRVLVAILEYYQNDDGTVTVPEPLRPYMGGQEVIEGHDPVGESAVGAGDRD-
#oth            .2.21.12..11.....1...111..1.1..12.332.1.2221..211.323322
HVO_1921        :T::G::M::L::::::E::::D:::::Q:::::R::::::E::::A:::::KK::
HQ3138A         :V:::::M:::M:::::::::I:I::::Q:::N:LS::::::::::A:::::K:E:
Hut2468         :V:L::::::::::::::::::::::A::::LD:::L:::Q:::::::L:::::-:
Hbo1793         :::I:::V:::M::::::::::::::A:::::::T:::::::::::::::::KK::
hla1183         ::::::IV::::::::::::::::::A:::::::T:::::::A:::TKL:GE---:
rrnAC2808       :::::::::::M:::::::::I::::::::::::::::::SEKI::::::::EKE:
Hmu3118         :V:::::M:::M:::::::::I:::::::::::::::::::E::::::::E::G:D
VNG2072         :V::::::::::::::::::::::::A:Q:::N::TR:::SRK:::::L:D:::EA
NP1692A         :::::::V::::::::::::::D:::::Q:::::TD::D:Q:::::::L:E----: