|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 879 | VNG1743 | HQ3190A | Hbo2210 | Hut0021 | rrnAC0313 | Hmu2517 | NP4938A | HVO_2632 | hla1254 |
634 | VNG1743 | 1794 | 567 | 647 | 562 | 586 | 630 | 594 | 562 | 560 |
644 | HQ3190A | 567 | 875 | 617 | 653 | 601 | 591 | 617 | 613 | 608 |
759 | Hbo2210 | 647 | 617 | 878 | 659 | 665 | 698 | 668 | 665 | 677 |
745 | Hut0021 | 562 | 653 | 659 | 889 | 727 | 677 | 700 | 600 | 648 |
749 | rrnAC0313 | 586 | 601 | 665 | 727 | 882 | 775 | 692 | 654 | 667 |
737 | Hmu2517 | 630 | 591 | 698 | 677 | 775 | 880 | 665 | 649 | 639 |
758 | NP4938A | 594 | 617 | 668 | 700 | 692 | 665 | 879 | 630 | 689 |
690 | HVO_2632 | 562 | 613 | 665 | 600 | 654 | 649 | 630 | 891 | 718 |
746 | hla1254 | 560 | 608 | 677 | 648 | 667 | 639 | 689 | 718 | 914 |
224 symbols consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 VNG1743 MSRRCSRRCRSPRSTRTRCGRRSRRTPTARRRHRGVQPRPTARRPTTGRRPSWSRVSVMA HQ3190A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2210 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0021 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0313 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2517 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP4938A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2632 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1254 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus -------------------------------------------------------MQFCD #oth 1111111111111111111111111111111111111111111111111111222....1 VNG1743 VRTLPRRRRWAAPTRARRSRRWWTWIISGWLTVRSSPGGRETTRVIFPPTTSNRG::::: HQ3190A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2210 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut0021 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E rrnAC0313 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2517 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP4938A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2632 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla1254 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::VAY::::: consensus ECGSMMHAQGGEMVCQS--CGATTEKDEDLAAEFVSTAAQTDDDVIETEEGANFEGKPTA #oth 1.....242222.1.5111..334331434134.11.44.22212..1111131.....1 VNG1743 :::::::K:D:::::A::::::SADSEGSEG--::E::S:DTS:::::S:D:AS:::::: HQ3190A ::::::KKRNEQ:::G:::::YQ:DQ:SAIG-N::::QK:::E:I:::::::E::::::D Hbo2210 :::::::N:D:Q:::S:::::::Q:Q:S:::S:::::E::D:S::::::::::::::::: Hut0021 ::::::::D:E::::::::::YREA::Q:::DD::::QD:::::L:::::D::::::::: rrnAC0313 D:::::::D:D:::::::::::RVA::::R::A::::DE:S::EL::::::S:::::::: Hmu2517 D::::::TD:D::::K:::::SRVQ::A:R::::::::::S::::::::::::::::::: NP4938A D:::::::::EA:::S::::::::::::AK:::::::D:::::::::SSPD:D::::::: HVO_2632 ::::::VS:N:A:T:TNDD::G:A:R::E::::::::E::SG:EL:::::::E::::::: hla1254 D:::::VSRD::::::NDD::::::R::A:::::E::TE::G:E:::::::::::::::: consensus DDVTCDECGHGEAWYTIKQTGSADEPPTRFFKCKECGHRWRGYN #oth 3223.32.1.12.........1...........12..3...2.1 VNG1743 EE-::P:::::::::::::::::::::::::::QD::N:::D:: HQ3190A :N:I::::E:TV:::::::::::::::::::::::::Y:::D:: Hbo2210 T::::ED:::::::::::::::::::::::::::N::R:::::: Hut0021 :::V:::::::V:::::::::::::::::::::::::::::::S rrnAC0313 :::::E:::::K:::::::::::::::::::::Q:::::::E:: Hmu2517 E::::AD::::K:::::::::::::::::::::QD::N:::E:: NP4938A ::II:::::::::::::::::A:::::::::::::::::::::S HVO_2632 K::H::D:::TK:::::::::::::::::::::Q:::Y:::E:: hla1254 K:IV::K::::::::::::::A::::::::::::::::::::::