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[R] (Lhr) COG1201 Lhr-like helicases
9 genomes BUD0360 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1251

rrnAC1139

HVO_1333

Hbo0217

Hmu1436

Hut1241

hla0269

NP4002A

HQ2752A

Pairwise sequence scores
Consensus score7072 NP4002A VNG1251 HQ2752A hla0269 HVO_1333 Hbo0217 Hut1241 rrnAC1139 Hmu1436
5388NP4002A 7154 4777 4467 4607 4759 3859 4841 4884 4939
5362VNG1251 4777 7122 4641 4678 4795 3854 4776 4878 4932
5459HQ2752A 4467 4641 7168 4952 5264 4421 4673 4698 4798
5615hla0269 4607 4678 4952 7309 5336 4180 4819 4897 5002
5863HVO_1333 4759 4795 5264 5336 7133 4622 4821 5084 5047
4659Hbo0217 3859 3854 4421 4180 4622 6001 3934 3943 3976
5566Hut1241 4841 4776 4673 4819 4821 3934 7082 5173 5185
5799rrnAC1139 4884 4878 4698 4897 5084 3943 5173 7087 5827
5806Hmu1436 4939 4932 4798 5002 5047 3976 5185 5827 7061

984 symbols
consensus       -MSEG-TAAAGMDAFAALGDAVRSALSERGFTTPTEPQRRAIPPLADGRNALVIAPTGTG
#oth            1.312142561211.2412451.5...11..1...2...2.1.21.21421.12....1.
NP4002A         M::::HS:::::::::R:H:D::Q:::::::S:::A:::K:::T::A:ESG::V::::S:
VNG1251         ::::-::GGGR::::TH::SE::N:::::::::::::::::V:A::::::G::V::::::
HQ2752A         ::AD::::TR:A:V:SEFSAP::E::::::::::::::::::::::HD::::::::::::
hla0269         ::A:-:--LS::::::H::SEL:T::::Q::S:::::::E::::::::K::::L::::::
HVO_1333        ::PD::E:::::::::T:SSP::N::::::::::::::::::::::::N:G:I:::::::
Hbo0217         ::AD:::::Q:::::T::::T::A::::::::::::::::::::::A:K:::::::::::
Hut1241         ::::A::-RE:DAV::H::::::::::D::::::::::::::::I:::ED::::::::S:
rrnAC1139       ::TD::V-:R:D:::T:::P:::::::::::::::D:::K:::T:::::D:::V::::::
Hmu1436         ::::-:---T:A:::T:::GS::::::::::::::::::K::::::A:DD:::V::::::

consensus       KTETAMLPVFDAIAES------EDRFGISALYITPLRALNRDMRERLDWWGETLDIEIDV
#oth            ....1....11113344112215215.23...1..........12..2...14.12111.
NP4002A         :::::::::LSS:Q:R::::::PP:H::Q::::::::::::::::::E::::::G:D:::
VNG1251         ::::::::::::LVSDG:::::GPPD:FG:::V:::::::::::::::::::::GL:V::
HQ2752A         ::::::::::::::::D::FDDSE:E:F::::::::::::::::D::T::::::::D:::
hla0269         :::::::::::::VDARDAPGDQP:S:::::::::::::::::MD::E:::DR:GV:VA:
HVO_1333        ::::::::::S:::DA::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::D:::
Hbo0217         :::::::::L:S:V::P::::D:::A:L::::V:::::::::::::::::::E::::V::
Hut1241         :::::::::::::EG-::::::DPPD::A:::V:::::::::::D::E:::::::L::::
rrnAC1139       ::::G:::::::L:::::::::::::::G:::::::::::::::Q:::::::::GL:V::
Hmu1436         ::::::::::::L:D-::::::::::::G:::V::::::::::::::::::DA::L::::

consensus       RHGDTTDYQRQKQANDPPDVLVTTPETLQAMLTGSKLRTALEDVAHVVVDEVHELAAAKR
#oth            ......2.2.21..3......1....11..11..211.5112114.1.1.......21..
NP4002A         ::::::::::::::E::::::::::::::::F::E:::R:I::IE:I:::::::::GS::
VNG1251         ::::::::::RQ::T::::::::::::::::::::T::DG:A::E:::::::::::G:::
HQ2752A         ::::::Q:::RQ::E:::::::::::::::::::::::K::AG:D:::::::::::::::
hla0269         ::::::R:E:S:::D::::::I::::S:::I:::::M:V:::::::::I:::::::S:::
HVO_1333        ::::::Q:::::::::::::::::::::::::::K:::K::S::H:::::::::::S:::
Hbo0217         ::::::Q:::::::::::::::::::::::::::E::::::S::R:::::::::::S:::
Hut1241         ::::::Q:R::Q::E::::::::::::V::I:::E:::EG:A::::::::::::::::::
rrnAC1139       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::IE:I:I:::::::::::
Hmu1436         :::::::::::Q::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       GAQLTVGLERLRELAGPFQRIGLSATVGDPEEVGRFLTG----------DRGCEIVEVDA
#oth            .1..211..1.2421.31..........2.41112..1.11111111111.414121122
NP4002A         :::::::::H:::H::::::::::::::::T::::::::::::::::::::::HVTD:E:
VNG1251         ::::AI:::::V:V::RV::::::::::::H:I:A::::::::::::::G:::::I:::V
HQ2752A         :V::S:A::::QV:::S:::::::::::S:T::A:::::::::::::::::PF:VI:I::
hla0269         ::::::::::::RV::::::::::::::T:::::K::V:SGKRDPDHPG::EF:::::A:
HVO_1333        :::::I::::::::::A:::::::::::S:D:::K::::::::::::::::PF:VI:::V
Hbo0217         ::::::::::::A:::::::::::::::S:::::K::::::::::::::::SF:::::::
Hut1241         ::::::::::::D:::::::::::::::::A::::::::::::::::::::::S:::I::
rrnAC1139       :::::I::::::::S:R:::::::::::::H::::::::::::::::::G:T:A:::::I
Hmu1436         :::::::::::::VS::V:::::::::::::A:::::::::::::::::::::R:::::V

consensus       GSRLDFEVVRPEVTDRDETLAGELATDAEVASHVRAIREIVDDHESVLIFVNTRQTAEAL
#oth            2243324.34.61253.3521231222333.....5.21114412.1.2.........1.
NP4002A         :TN::VT:RT::IRPE:R:A::::L::::::::::V:D:L::A:D:::::::::::::G:
VNG1251         T:NVS:::RE:A:::A::R::S::L:TPAM::::::::::::R:D:::::::::::::::
HQ2752A         ::AIE:S:HH:T::QK::Q:SR:::::ETI:::::V::D::S::S:T:::::::::::::
hla0269         :T:T:VR:LD:PI::::T:::::::V:ETT:::::T:::::A::::T:::::::::::::
HVO_1333        DN:VE:::::::::NE::A:::K::::P:I:::::T::D::R::::::V:::::::::::
Hbo0217         ::KVA:T::H:D::RE:Q::::Q::SED:M::::::::D::R::::T:V:::::::::::
Hut1241         ::DIEID::::SIEE:::NV:::IV::::::::::Q:D:LIET:::T:V:::::::::::
rrnAC1139       :::::I:::::QI:::::E:SSS:V:::GT:::::F:ADLI:EN::::L:::::::::::
Hmu1436         :::::VS::::T:::A::R::S::V::P:::::::R:D:LIAA:D:::V:::::::::::

consensus       GSRFKELG------------TNIGVHHGSLSKDVRIDVEDRFKAGDLDGLLCTSSMELGI
#oth            ...1.51311111111111133221.....1122.11...1..4.21.1.3.........
NP4002A         :::L:AY:::::::::::::::::I:::::::SA::::::A::T:EI:::M:::::::::
VNG1251         :::::::D::::::::::::A::::::::::::A:::::::::S::::::::::::::::
HQ2752A         :::::K::::::::::::::EP:E:::::::::::::::::::N:S::::V:::::::::
hla0269         :::::T:AEREEKAGSIDDP:E:E:::::::::::::::::::S:E::::V:::::::::
HVO_1333        :::::S::::::::::::::DP:E:::::::::::::::::::::E::A:I:::::::::
Hbo0217         :::::R:N::::::::::::EP:A:::::::::::::::::::T:E::::I:::::::::
Hut1241         :::L::Y::::::::::::::DV:I:::::AS:T:VE:::A:::::::A:::::::::::
rrnAC1139       :::::::::::::::::::::DL:::::::::EA::::::::::::::A:::::::::::
Hmu1436         ::::::::::::::::::::::L:::::::A:ET:::::::::E::::A:::::::::::

consensus       DVGRVDHVVQYGSPREVSRLLQRVGRAGHRRDLVSSGTVVTTSPDDTLEALAIARRAEAG
#oth            ...41...1..2...1.3..1..1.....21153.4..11.433.1.2...11213.641
NP4002A         :::DI:::I::A:::::R::::::::::::::ET:::::I::H::::F:::S:VD:::R:
VNG1251         :::GI::::::N:::::K:::::::::::S::A::E:::I:G:T::::::::V:D::NE:
HQ2752A         :::E:::::::::::::A:::::::::::H::RI:H:::I:S:::::::::::::::TE:
hla0269         :::::::::::::::::A:::::::::::::::::E:::::QGG:::::::::::::G:E
HVO_1333        :::::::::::N::::::::::::::::::LGV::R:::::DH::::::::::::::VS:
Hbo0217         ::::::::::::::::::::::::::::::::QT:R::I::S:A:::H:::::::K::::
Hut1241         :::::::::::N:::Q:::::::I::::::::RT:A::I::::::E:F:::::::M:R::
rrnAC1139       :::H:::::::::::Q::::V:::::::::::::::::::::DT:::::::::::Q::::
Hmu1436         :::H:::::::::::Q:A:::::::::::::::L::::::::H::::::::::T:Q:LD:

consensus       EVEPARIHHGSLDTVANQIVGVVMDEGEVSARRAYEIVTRAYPFRDLDEETFREVVRELS
#oth            4..2141.11.1......13.21.151135.331.212.2....4215334.22122..3
NP4002A         A::S:G:::::::::::::A:LL:GFE:LP:A:::::L:::::::N:P::Q:KA::::::
VNG1251         A::DTQV::::::::::::::::::V::TE:WH::N:I::::::KQ:T:::::A:AM::H
HQ2752A         I::::::::A:::::::::I:I:::::::::::::Q:::A::::AN::KQ:::::I::::
hla0269         L::::A:::::::::::::::::::::D:H::E::Q:::S:::::::A::::Q:I::::D
HVO_1333        ::::::V::::::::::::::::::Y:D:::::::::I:::::::::::DD::A::::::
Hbo0217         :::::::::A:::::::::::::::Y::::::KT::L::S::::C::EAA::::I:::::
Hut1241         :::::A:::::R:::::::A:::::L:::D::::::::::::::G:IS:AV:::I::::A
rrnAC1139       D::::E::D::::::::::A:L:::A::IR:M:::::L:::::::::::AQ:KQ::E::A
Hmu1436         :::::E::D:::::::::VP:I:::V::IR:ME::::::::::::::TT:E::::::::A

consensus       GNRLLWLDEDDDRLEKSGGTWQYFYANLSMIPDEATYDVYDMASGRQIGTLDERFVVNFA
#oth            5.222111.35.411112.....1.2........21.2.4.3211321...2.2..11..
NP4002A         E::I:::E:G:::I:::::::::::::::::::::N:T:T:::::DPV:::A:::::T::
VNG1251         R::VVYV:::::TIST:::::::Y::::::::::E::E:::::G:::V::::::::::::
HQ2752A         S:::V::E::A::::::S::::::::::::::::E:::::::S:RG::::::::::L:::
hla0269         ::H::::::AS:T:::::::::::::::::::::S::E::::S:R:G:::::::::::::
HVO_1333        ::H:::::::K:L:::::::::::::::::::::E::::H:IS:R::::::N:K::L:::
Hbo0217         :::::::::EK:V::::S::::::::::::::::E:::::::S:RG::::::::::::::
Hut1241         D::VI::E::::E:S:RR:::::::H:::::::::::::A:GT::::V::::::::::::
rrnAC1139       A:NVI:::::R:T:::RR:::::::Q:::::::::::::E:V:::Q:V:::::K::::::
Hmu1436         E::V::V::EN:::::RR:::::::Q:::::::::::::E:V:::D:::::::Q::::::

consensus       EPGETFIQRGEMWRITNIDEEEERVNVSPIEDPAGEVPSWTGQEIPVPAAVAQEVGELRA
#oth            4..13.1.2.....1121.11144.4.1.12..3......2.3.....44..51.133.4
NP4002A         ::::::V:G:::::::E::D:::E:L:::::::T::::::V:::::::RG::EA:ATA::
VNG1251         :::A::V:::::::::::::DDQQ:E::::::::::::::::::::::Y::::A::GM::
HQ2752A         :::AA::::::::::ND::DD:TQ:::T:::::S::::::::A::::::H::N::::M::
hla0269         G:::::::::::::::EV:::::::::T::A:::::::::I:R:::::KP::E:::RI:G
HVO_1333        A::A::::::::::VNDV:D::A::::::::::G::::::V:S::::::P::G::::::D
Hbo0217         :::AS::::::::::ND::D::GE:H:T:::::S::::::::S::::::H::G::::I:E
Hut1241         A:::V:::A:::::::E:::D::T:H:T:VG:::::::::::::::::YD:::::A:::G
rrnAC1139       T:::V:V::::::::::::::::V:T::::::::::::::V:::::::R:::A::::::R
Hmu1436         N:::V::::::::::::V::D::V:T::::::::::::::V:::::::Q:::R::::::R

consensus       VAARQLAAGADREAVARDLARRYPADEATVRSALEPIERHV---EAPIPTADRIVVEGQG
#oth            41242156.46421.112326..32334.26421424351213324.1.3241112.452
NP4002A         D:RGRFDG:DG:G::::SV:D:::T::H:ASE::K:V:A:-:::KG::::P:::::::F:
VNG1251         TGG:::GT:TPKD:::::V:A:::TTHR:AG:::DRMA:::TEQD::V:S:E:::::QA:
HQ2752A         A::K:::T::NK:::G::::::::::VS:IT::I:::::QI:IG:Y:::::::L:I:A:A
hla0269         E::EA::::STP::::G:::E::::::R:IAT::K:VVD:::DADH:V::DR:::I::SA
HVO_1333        :::P:FES::::::::::I:M:::T:::::::::G:::KQ::EAD::::::N:L:L::SP
Hbo0217         T::::FEL:GE:D:::::FRG:::T::R::SKS:K:T::Q::DA:L:V:::::L:I::::
Hut1241         :::E::R::GEP:S:::H::G::D:A:::I:::::Q::Y:-::::G:V:GPN:::::FE:
rrnAC1139       ::G:::QD:::T::::::V:T::A:GPE::VDG:SQV:E:-::::G:::DDTT:L::FH:
Hmu1436         ::G:::QE::AAD::::::T:::EG:P:::E:G::QLRD:-::::::::DDET::::MH:

consensus       RTVVLNAAFGHRVNETLGRLLSALVGQRTGSSVGMDVDPYRIELEVPRGVSAGDVVEVLE
#oth            24132.123..42....1.2111.2..11.211121221..12111.4433421142122
NP4002A         :QI::::::::TA:::::::::::I::Q::G::A:E:::::::::::S:T:I:::::L::
VNG1251         S:::V::C:::E::::::::V:::L::Q::::::L:AG:::::::::SR:::T:::A::R
HQ2752A         Q:::I:SPH:::I::::::::A::::::::A:::L::S:::::::L::QA:I:::TA:FD
hla0269         :::AV::::::E:::::A:::A::::::A:::I::::::::::F:::H::GP:TFR::::
HVO_1333        :K:T::SPY:::::::::::::::I::::::::::E:::::::FD::GK:RPTTFA:::R
Hbo0217         :K:T::SPY::::::::::M:A::::::::::I:IET:A::VTF:::PNA:VH:FT::::
Hut1241         :D:::::::::K::::::::::::L:::::::::L:::::::S:::::N:T:::::D:::
rrnAC1139       :E:IV::CY::KI::::::V::::L:::A::::A::::::::T:::::RIT::::I::I:
Hmu1436         :E::V::CL::Q::::::::::S:::::A:AT:A:E:::::::::L:S:::G:::ID:::

consensus       TTDPDHVEALLELSLKNADALKFTLAQVAAKFGALKRWR-GRG----RFGGDRLLAALED
#oth            3...3113332..1..4122...2.....1...21.1121.43111321.31..12...1
NP4002A         :::::::PT:V:::::::ET::::::::::::::::::K::T:SSQN:::K:::::::::
VNG1251         D::::::AG:::::::QSET::::::::::::::::::K:::D::::GV:LS:::G:::G
HQ2752A         E:::M::::I:::A::K::::::::::::::::::::YQ:::E:::::::::::M:::::
hla0269         :::::RL::Y:::A:::S:::::::::::::::SI::Y:E:::::::::::::::::::G
HVO_1333        E::::::::::::A::RS:S:::::::::::::::::YQ::K::::::::::::::::::
Hbo0217         ::::::::GV:::A::HSES:::::::::::::::::YQ::NK:::::::::::::::::
Hut1241         S:::A:::G:I:::::::G::::R:::::T::::::N::::::S::N:::R::::E:::G
rrnAC1139       D:::::LP::I::::::::::::K:::::T:::S:::::::::S::TD::R:::::::::
Hmu1436         ::::E::RHII::::::::::::K:::::::::T:::::::S:S::G:::R:::::::::

consensus       TPVYDEALREVFHEDLAVAETSDLLRRIQSGDIALATVGERTAIGTGGRSSGRELLSPEN
#oth            ..312113122413412254254314432413363233233123.72.224232214.22
NP4002A         ::I::::V:V:L::Q:D:DGA::I:S:L:::::E:::::::::L:QA:::::::::::::
VNG1251         ::::E::I:::::TT:D::RA::V:A:V:::ELGVEI::::::V:A::::A:T:::T::H
HQ2752A         :::::::V:::::T::::P::TA::E:YHTDELTI::TR:::P::VD:::H:K:::V:S:
hla0269         :::::::::::::A::::G::AE::EDV:D:S:D::IAR:::PL:IA:::::T:F:V:::
HVO_1333        :::::::I:::::T:::::::VE::::VRD::VE::VAR:P::::::::G::TD::V:::
Hbo0217         ::------------------------HLRR:-------------:P::V--------:RR
Hut1241         ::I:::::::LI::K:DIDRA:E:::E::::::VVE:::G:::::R::::GSK:::A:::
rrnAC1139       ::M::::::::R:::::IEA:A::::D::N::V::E::::H:P:::::S:::::::::::
Hmu1436         ::I::::V::::::::::EA:QTV:SA::::S::VE:::D::P::L:::::::::::::H

consensus       ADASVIETVRDRIQNDRVILFCLHCKDWDRKQQVKRVRDQPECPRCGSTRIAALNPWAEE
#oth            111212323221134131413121154264435131141226115122112131211222
NP4002A         :::::V:::KE::LD:D:L:A:::::E:::R:T::::D::::::L:::::::::::::D:
VNG1251         :::::VQ:IK::::D:::K:::V::A::SHETM:R::T::::::::::::::::S:::D:
HQ2752A         :::G:::A::::::D:N:R:L::::T::EQ:KP:R::::::R::::EA::::C::::D:D
hla0269         :::D::::I:E::R:::::::::::A::K:TTK:R::P:::K::D:::::V:T::::D::
HVO_1333        ::::::::::::::::::L:A:::::::T::TK::::::PVA::E::A::V::::::D::
Hbo0217         FGC:--------------------------------------------------------
Hut1241         ::::::Q:LK::::E:::::::V::ESYKTTKP::::::::K::E::::::::::::D::
rrnAC1139       ::::::K::KE:::S:::::A:::::K::::::::::::::S::Q:::::::::::::::
Hmu1436         ::::::Q:::E:::::::L::::::R::R:::::G::::::D::D:::::::::::::::

consensus       TVTAVR--ADDKDDEQERRTERAYRSASLVQSHGKRAVIALAARGVGPHNAARIINKLRE
#oth            244112112522.2223342412223.122131.1113211211.11.321112123211
NP4002A         VLE:::::T:::::D:QKA:::::KA::I:::::::::::::::::::R:::Y:::NH::
VNG1251         VI::::::::::::::DD::Q::::N::I::::::::::::S::::::R::::V::RH::
HQ2752A         :PK:::GGTLEE:TDAD:LQR::H:::::I:::::Q:A::::::::::QT:::::GN:::
hla0269         :::::::::TE::E::::::K::H:A:::::T::::::::::::::::::::::::::::
HVO_1333        ::K::::::PE:::::::L:K::::::::::A::::::V:::::::::::::::::::::
Hbo0217         ------::---R::----------:T::--EDT:R:SGLGDG:-:TH::RYR:PV-----
Hut1241         :::::K::T:E:::::::::K:G:QA:D:::::::Q:I::::G:::::T:::::::::::
rrnAC1139       V:S:::::T::::E:::KM::::::::::::::::Q::V:::::::::::::::::R:::
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