| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4773 | VNG1128 | NP4046A | hla2431 | HQ3356A | HVO_1305 | Hbo0237 | Hut0504 | rrnAC1267 | Hmu1707 |
| 3758 | VNG1128 | 4905 | 3529 | 3462 | 3307 | 3297 | 3341 | 3327 | 3443 | 3289 |
| 3888 | NP4046A | 3529 | 4755 | 3538 | 3401 | 3394 | 3510 | 3440 | 3563 | 3454 |
| 3980 | hla2431 | 3462 | 3538 | 4782 | 3586 | 3655 | 3852 | 3394 | 3441 | 3255 |
| 3876 | HQ3356A | 3307 | 3401 | 3586 | 4815 | 3844 | 3968 | 3365 | 3457 | 3266 |
| 3931 | HVO_1305 | 3297 | 3394 | 3655 | 3844 | 4776 | 3981 | 3301 | 3487 | 3256 |
| 4101 | Hbo0237 | 3341 | 3510 | 3852 | 3968 | 3981 | 4798 | 3476 | 3598 | 3424 |
| 3812 | Hut0504 | 3327 | 3440 | 3394 | 3365 | 3301 | 3476 | 4784 | 3668 | 3530 |
| 4034 | rrnAC1267 | 3443 | 3563 | 3441 | 3457 | 3487 | 3598 | 3668 | 4818 | 3911 |
| 3894 | Hmu1707 | 3289 | 3454 | 3255 | 3266 | 3256 | 3424 | 3530 | 3911 | 4618 |
650 symbols consensus ------------MTDDELIWRIAGGSGDGIASTSQNFAKALMRSGLNVFTHRHYPSRIRG #oth 11111111111111241121112111111121111111111.11..21............ VNG1128 MPYWSTAGPDQI::::::::::::::::::D:::::::::::::::D::::::::::::: NP4046A ::::::::::::::E-::V:::::::::::D::::::::::::::::::::::::::::: hla2431 ::::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3356A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::H::::::::::::: HVO_1305 :::::::::::::::H:::::::::::::::::::::::::::A::H::::::::::::: Hbo0237 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H::::::::::::: Hut0504 :::::::::::::::T:::::::::::::::::::::::::::A:::I:::::::::::: rrnAC1267 :::::::::::::::N::::::::::::::D:::::::::::W::::::::::::::::: Hmu1707 ::::::::::::-----------------------------:::::D::::::::::::: consensus GHTYVEVRASDDPVKSRGDGYNFLLALGDSFARNPQEEAYYGNEEIKPLSENLDDLREGG #oth ...11.1.14324.4..........1.........213.2..3..3...4..111.11.. VNG1128 ::::::I::R:GT:T::::::::::::::::::::S:::V::D::V:::T:::::::A:: NP4046A ::::::I::APE::S:::::::::::::::::::::::::::D::V:::E:::::::::: hla2431 ::::T:I:::S::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::::E::::: HQ3356A ::::T:::V:A:S:T::::::::::::::::::::::D::::V:::::::::::::D::: HVO_1305 ::::T:::V:A::::::::::::::::::::::::S:G::::::::::::::::E:D::: Hbo0237 ::::T:I:::A::::::::::::::::::::::::::N::::::::::::::::E::::: Hut0504 :::::::::K:EE:T::::::::::S:::::::::A:D:::::::R:::G::::E::::: rrnAC1267 :::::::::K:E::Q:::::::::::::::::::::::::::K::L:::Y::F::::::: Hmu1707 :::F:::::G:ED:R:::::::::::::::::::::D:::::D::V:::::::H:::::: consensus VIVYDEGLLDADDIED--FEERAEENNWHVYPLDLRGIAREHGREVMRNTAGVGATAALL #oth 112..2..2.422142221122211.1..11231..22.112..11......112.1.13 VNG1128 ::I:::::::DE:VG:::L:QQ:DA:D::L:::::::L:K:::::::::::::::::::I NP4046A I:::::::V:I:::::::::A:V:A:D::::::::::L::DV:::::::::::::::::: hla2431 :::::::::::SE:P:::::::V::::::::S:::::L::DQ::::::::::::::C:IT HQ3356A :::::T::::P:::PN:::D::IDA::::::DIN::E::::::::::::::::AI:C:IA HVO_1305 :::::S:::::SE::::::D::V:::D::::DI:::T::::::::::::::::AV:C:IA Hbo0237 ::I::S:::::SE::::::D::V::::::::D::::TM::D:::::::::::::::C::A Hut0504 :::::T::F:E:EVAELNL:::::::::::::VN::E:::::::D:::::::::I::::: rrnAC1267 :LL:::::::DE:VDEIGL::A::::::::V:M::::::K:::::I::::::I:::::I: Hmu1707 ::::::::::E:A:AELNL:A:::::D:::::MN::EM:::::::::::::::AV::::: consensus DIDLDHIEDLMRDAMPGDILEPNLNVLDDAYEQV-EEYDVT-HDISVPTGE-HDEEQVLL #oth 23234622311321.22222.4.141153..251431313212.243.112111231212 VNG1128 :M:::::::::S:::G:::::Q::T::R:::::::S:MEH::::L:::::S::::P:::M NP4046A EY::E:V::::A:::S:EV::T::DI:ET:::E::A:MEH::::LRI:::S::::Q:::: hla2431 GM::::VQ::::::::EK::::::EI:QI::D::R:::::DAS:V::::::::::T:L:M HQ3356A :::PGI:K:M:A::::DK:F:::MD:F:::::T:TS:F:A:AP:::::::N::::::::V HVO_1305 G:EP:V:KS::S::::DK::::::T:F::::GM:Q:::::EAP:V:A::::::::::::: Hbo0237 G::TEW::E:::::::EK::::::EI:QE:::M:E:::::DA::VKI:E::::E:::::: Hut0504 GM:VSYF:E:ITQN:S:::Q:D:::::A:::::A:QAFEF::::LE::::::N:Q:LA:M rrnAC1267 ::ST:EF:K:ITQN:S::MQ:A:::::H::::AA:S:L::D::::E::E:S:::::::I: Hmu1707 :T:PAFF:E:::EN:S:::::D::A::E::::RA:::LEH:::::TM:EA:D::D::::: consensus SGSDAIAYGAIDEGCRFIAGYPMTPWTEVFTIMSQNLPELGGISEQVEDEIAAAALALGA #oth 1..31.2...1.1.....1........11..1.1121124..1............1.2.. VNG1128 :::H::::::::A:::::S::::::::DA::::T:L::DM::V::::::::::::M:V:: NP4046A :::N::T:::L:A::::::::::::::::::L:::H:::V:::::::::::::::::::: hla2431 ::::::S::::::::::::::::::::::::::TK:::K::::::::::::::::::V:: HQ3356A ::::::::::::::::::S::::::::::::::::::::I::V::::::::::::::I:: HVO_1305 :::::::::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::::::::::::I:: Hbo0237 ::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:: Hut0504 N::QS::::::::::::::::::::::::::::::HMGKF::V::::::::::::M:::: rrnAC1267 :::N::S:::::::::::S::::::::D:::::::H:::F:::::::::::::::::::: Hmu1707 :::N::::::L::::::::::::::::D:::::::H::KF:::::::::::::::::::: consensus SHAGVKAMSGSSGGGFALMSEPLGLAEMTETPVVLVEAMRAGPSTGMPTKPEQADLEHVL #oth ....1.1.........1..........1....2..2..2..............2...... VNG1128 ::::A:::::::::::::::::::::::::::L::L::Q::::::::::::::::::::: NP4046A ::::::::::::::::::::::::::::::::L:::::T::::::::::::::S:::::: hla2431 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::: HQ3356A :::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::G:::::: HVO_1305 ::::::::::::::::S::::::::::I::::L::::::::::::::::::::S:::::: Hbo0237 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G:::::: Hut0504 ::::::::::::::::::::::::::::::::I::L:::::::::::::::::G:::::: rrnAC1267 ::::::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::::: Hmu1707 ::::::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus YTSQGDSHRVVFAPANVREAYEQTRAAFEIAYEYQIPSIVLYDQKLGGELRNVPASFFDR #oth .......3.1111.3343.1.4.1.5..21..1.11.2.22....23..13121323..1 VNG1128 ::::::::::A:G:KDPK:C:::::T::::::D::::V:L::::::S::Y:::D:::::: NP4046A :::::::C::::::G::::::::::::::L::::HL:A::::::::S::::::DE::::: hla2431 :::::::Q:::L::GT:E:::::S:I::RL:::::::::L::::::::::V:::K:H::: HQ3356A :::::::::::::::DSE:::H:::R:::::::::::::I:::::N::::Q:I::TV::E HVO_1305 :::::::::I::::G:AA:::Y:::K::Q:::::::::::::::::::::S:::::V::E Hbo0237 ::::::::::::::SGAE:::H:::R::Q::::::::::::::::N::::Q:::::V::E Hut0504 :::::::A:::::::G:K:::::::T::::::D::::A::V::::IE::::S::VDL::: rrnAC1267 :::::::A::::::::I::C:T:::S::R::::::::V::I::::IQ:::::L:::H::E Hmu1707 :::::::A::::::::I::C:D::::::R:::::::::::I:::::Q::::::DE::::: consensus EPNADLGSVLTEEEIADAAHDASGKFQRFQHDPEDG--VSPRSIPGQKGGRYLATGNEHN #oth ..2211.3111.2214112.242.112.1213411122....12...31..2.12...14 VNG1128 ::A::::TT:S:DQ:P::P::PT::YH:Y:::V:::::::::T::::S::::::S::::W NP4046A ::D::::AT:::A:::E:::H:::::N::::::DNDRG:::::L:::T:::F:::::::T hla2431 :::PT::KT:S:DAL::EP:S:D:::H:::::V::::::::::::::::::::::::::D HQ3356A :::P::::T:::A:LE::S::P:::YN::::AG:N::::::::L:::E:::F:::::::M HVO_1305 ::::::::::::A:LE::P::D:::Y::::::T:N::::::::L:::::::::::::::M Hbo0237 :::G:::::M::::L:::P::D:::YN::::EG:N:::::::::::::::::::A::::M Hut0504 :::P:::K::S::::KE:::HE::A::::DPNA:::::::::TV:::::::H:TS:::T: rrnAC1267 :::::P:::::::::Q::::HS:::::::L:E::::SN:::::V::::D::F:::::::: Hmu1707 :::::P::::::::::::::H::::::::::E::::SN:::::V::::D::::::::::: consensus PAGHISEDPDNRVAQMNRRLQKLDAIRADLDEDDS-HQTYYGPEDADYGILTFGSQQGTV #oth 25...2.121..12133..24.123..31.13533242243.121.32.1321..111.. VNG1128 :N::::::T::::::VE::::::A:::D::::R:Q:-::H::D::::I:LIAW:::E::: NP4046A EQ:::::S:E:::::LE:::G::::::EE::AA::S:::::::DE:E::LI::::::::: hla2431 :T:::C::A::::::ID::T:::E:::::::TE:T:-GS:A::D::Q::::::::::::: HQ3356A :::::::::::::N:V:::ME::E:::D::ET:GQTRN:Q:::SE:Q::::::::::::: HVO_1305 :::::::S:E:::::::::M::V:N:::E::A:GE:FN:VH:D::::L:LI::::::::: Hbo0237 :::::::::E:::L:V:::ME::E:::::::S:ETSNN:L::::::E:::M::::::::: Hut0504 DY:::D::::::::H:S:::E:::T::G::::GET:N:A:R:::::R:::V:W::::::: rrnAC1267 :S:::::::E::I:::::::N:::D:::::::NT::::::H:::E::::::VW::::::: Hmu1707 :S::::::::::I:::::::D:::D:::::::NT::::::H::::::::::VW::H:D:: consensus EEAVDRLNDDGHSVKALGVSDMAPYPVEEVSAFLESVDEALVVEMNASAQFRGLTQKELG #oth 2..232.126.31.13311.112.1.331344121..1122....2112.11..11.12. VNG1128 ::::H::::::N::::::I::L::F::A:TR::VD:::::I::::SSTK:::::I:::V: NP4046A R:::T::::A::::R:VSI::LM:F:EA:IET:I:::E::V::::T::::L:::I::::: hla2431 ::::G::::::I:::SY:::::L:F:T:Q:E::V:::::V:::::T::G:::::I::N:: HQ3356A R::I:E:DTE:YH::M::::EL:::::K:::S:I:::::V:::::::::::::::::::: HVO_1305 :::A:V::EK:::::V::::E:M:F:KQ::AD::D::::::::::T::::::::IS:::: Hbo0237 :::I:::::R:Y::::::::E:::::::Q::E:::::EDC::::::::::::::::::V: Hut0504 F::::::::E::::::I::::LM:::EA:MTE:::::E::I:::::::G::K:::::::: rrnAC1267 F:::::::EN::::::::::::::::K::::EW::::::::::::::T:::::::::::: Hmu1707 F::::::::G::::::::::::::::::::::W:::::::::::::::::::::::::I: consensus RFGDKLSSLLKYNGNPFEPAEIVEGFETSI-EGE-DLPANNTKFVPAAGD #oth 32.3111............21121111422532314333451223.1111 VNG1128 DI:G::::::::::::::::::::AV:IEQ:A:DGAE::AQ:TLE::::: NP4046A :::P::H::::::::::::Q:V:D:::SA:EDED:--::PT:R::::::: hla2431 :Y:E:::::::::::::::::::D:::AA:I::DG:ASGHQ:T::::::: HQ3356A :Y:::::::::::::::::::::D::IN::V:DR:T:NG:E::YI:::S: HVO_1305 GY::QM::::::::::::::D:I:::::ALL::::E::D:R:::::KV:E Hbo0237 :::E:::::::::::::::E::T:::I:::V::::E::THE:::::::S: Hut0504 :::::::::::::::::::::::::::A::D:ET::::G:S:T::::::: rrnAC1267 KY:::::::::::::::::::::D:::S:::D:::E:A:S:M:Y:::::: Hmu1707 :::P:::::::::::::::::::::::::::N:::::A:S:M:YL:::::