Home |  Text search
[R] (-) COG0517 FOG: CBS domain
9 genomes BUD0431 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0651

rrnAC1274

HVO_0991

Hbo0450

Hmu1703

Hut0499

hla2289

NP2318A

HQ1650A

Pairwise sequence scores
Consensus score1931 Hut0499 NP2318A rrnAC1274 Hmu1703 VNG0651 hla2289 HQ1650A HVO_0991 Hbo0450
1395Hut0499 1973 1310 1268 1267 1230 1271 1253 1304 1217
1548NP2318A 1310 2022 1487 1419 1409 1378 1309 1362 1344
1503rrnAC1274 1268 1487 1964 1530 1359 1332 1255 1311 1310
1487Hmu1703 1267 1419 1530 2156 1358 1366 1285 1345 1355
1572VNG0651 1230 1409 1359 1358 1996 1415 1329 1432 1373
1635hla2289 1271 1378 1332 1366 1415 1927 1444 1483 1460
1559HQ1650A 1253 1309 1255 1285 1329 1444 1910 1499 1491
1617HVO_0991 1304 1362 1311 1345 1432 1483 1499 1916 1626
1596Hbo0450 1217 1344 1310 1355 1373 1460 1491 1626 1953

300 symbols
consensus       ---------MSEKPTVGEYMTRDVATVSPDDTVADVAQRIAESDGHNGFPVCDGRTVEGF
#oth            122222344464423.51...31.3..22211.42..5113213422.1..231.412.1
Hut0499         ::::::MASSE:SL::ED:::HE:S::A:::::::::S:::D:G::T:::::HD:D:Q::
NP2318A         MDAPDDGLDSRD::K:DD:::::::::::::::E:::::::D::S:S:Y::::::::D::
rrnAC1274       :::::::MED:NR::::D::::E::::EL::::GE::R:::DN:HFS::::T:::R::::
Hmu1703         :::::::MEADGE:R:R::::S:::::::::::EA::H::::::EYS:::::E::R::::
VNG0651         :MDEALAHANG:T:A::D::::::::::A::::S:::A::S:::-::::::T:::H::::
hla2289         :::::::::::G::::::::::::E:::::E::KA::::M:::N:::::::TQ:::::::
HQ1650A         :::::::::::::A::N::::Q::Q::::T:::::::HQ:KN:A::T::::SE::::::V
HVO_0991        ::::::::::TT:A::K:::::E:Q::::T:::::::::::::::::::::::::KA:::
Hbo0450         ::::::::::NG:AA:K:::::E:Q::::A:S:::::K::V:::::::::::E::K::::

consensus       VSARDLLLADDDAPIFTVMTEDIIVAHPDMAVTDAARVILRSGIQKLPVVDDAGNLVGII
#oth            .1.3.1..331222323..23.13....1.314.11.........2...1..112.1...
Hut0499         :::S::::V:::L:VTE::ST:LM::::::DLD:V::::::::::R:::L::D:Q:I:::
NP2318A         :::::::::E:HE:::K:::::::::::::KL:::::::::::::Q::::::::::::::
rrnAC1274       :::::::::E:HE:M:R:::D::L::::::::Q:::::::::::::::::::::H:::::
Hmu1703         :::::::::E:HE:M:R::SD::L::::E:G:Q::G::::::::::::::::::H:::::
VNG0651         ::::::::::P:ELL:K:::::LV::::E:D:::::::::::::::::::::::::::::
hla2289         :::A:::::::E::V::::SN:L:::::::K::::::::::::::R:::::::D::::::
HQ1650A         :T:C::::V::E:A::::::::::::::::::V::G::::::::::::::::::::::::
HVO_0991        :T:::I::SA:::::E:::AT:LV::::E:D:N:::::::::::::::::::::::::::
Hbo0450         :T::::::EN:E::::::::::::::::::::N:::::::::::::::::::::::::::

consensus       SNADVIRSQIERATPEKVGKLMRTLEQIHGVSARQERREVDLDDLTPTQGRVYADELEGR
#oth            1.1..1..1......4..21.42.1.41.11343221131514412...32..2...1..
Hut0499         :::::::::::::::D::EQ:LD:I:DV:D:E::::::V:::G::::::TK::G::::::
NP2318A         :::::::::::::::::::::KE:::N::::E:TED::T:E:NS:::::TK::T::::::
rrnAC1274       :::::::::::::::G::D::G::::N:::ITTHEG:::::::::::::TT:::::::::
Hmu1703         ::::::::H::::::N::D::T::::S::D::::D:::::VI:E:V::::T:::::::::
VNG0651         T:::::::::::::::::::::::::T:::::ITE:::T:TIS:VV::::K:::::::::
hla2289         ::T::V:::::::::S:::::::::::::::KL:E:::::R:T::::::A::::::::::
HQ1650A         ::T::V::::::::::::::::::::::::I:VE::::SIT::N:V:::S:::G::::::
HVO_0991        ::T:::::::::::::::::::::::::::ITVH::::T:S:SN:I:::A:::::::N::
Hbo0450         ::T:::::::::::::::::::::::::::ITIH::HDS:E::A:I::::::::::::::

consensus       RYELERGLAEPLVVIDNG-----G----------------------TLLLADGHHRVMAA
#oth            6...11.......1.11211111.1111111111111111111111412.......13..
Hut0499         M::::::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::D:::::::::TT::
NP2318A         S::::N:::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::E::::::::::K::
rrnAC1274       V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::K::
Hmu1703         T:::K:::::::::::::::::::LQPPDQATVTEFADGESPEQTRE::::::::::K::
VNG0651         :::::N::::::::::::STGDD:::::::::::::::::::::::S:::::::::::::
hla2289         K:::K:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H:::::::::::
HQ1650A         Q::::::::::::T::TA::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::::
HVO_0991        :::::::::::::::::N:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::
Hbo0450         K::::::::::::::N:N:::::::::::::::::::::::::::::YI:::::::::::

consensus       ARLGIEEMDAYVIVLDDPVELGMARTARKEGLDSIDDIEIVDYARHPLVETTERLQ----
#oth            5231232.1..1.1213311.1.12..5331.62.4..32.1.11....1114.111232
Hut0499         :E::::::::::::VEE::D:E::K::TE:D:Q:::::T:::::::::::S:Q:ETGSE:
NP2318A         S:::::::::::::::RR::::::E::::CD:ER:E::QE::::H:::::::::::::EE
rrnAC1274       :::D:D::::::::::ET::::::E::ADSD:E::::::V::::H::::Q:::::::::D
Hmu1703         EQ:D::T::::::::::::D:::::::DDAD:T::S:::V::::::::::::::::GEDD
VNG0651         E:A:VA:::::::::ERA:D::::::::T::::::A::DV:::::::::::I::::::::
hla2289         HEA::::::::::IT:P:::::::K::K:::::D:T::::::::::::::::K:::::::
HQ1650A         TEV::D::E::::IV::::::::Q:::K::::Y::::::::E:G::::::::R:::::::
HVO_0991        D:I:::::::::::V::::::::Q:::E::::S::S::D:::::::::::::R:::::::
Hbo0450         HQ::TGQ::::I::V:::I::::Q:::E::::N::E::DV::::::::::::H:::::RD