|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4375 | VNG2505 | NP0694A | rrnAC2967 | Hmu3199 | Hut2378 | HQ1050A | hla0623 | HVO_2947 | Hbo1590 |
3375 | VNG2505 | 4358 | 3043 | 3101 | 2941 | 2961 | 2952 | 2997 | 3027 | 3078 |
3359 | NP0694A | 3043 | 4345 | 3077 | 3106 | 3001 | 2819 | 3031 | 3046 | 3108 |
3447 | rrnAC2967 | 3101 | 3077 | 4437 | 3271 | 3124 | 2879 | 3080 | 3135 | 3126 |
3425 | Hmu3199 | 2941 | 3106 | 3271 | 4590 | 3268 | 2835 | 3024 | 3042 | 3077 |
3484 | Hut2378 | 2961 | 3001 | 3124 | 3268 | 4404 | 2964 | 3052 | 3128 | 3209 |
3399 | HQ1050A | 2952 | 2819 | 2879 | 2835 | 2964 | 4781 | 3038 | 3190 | 3270 |
3561 | hla0623 | 2997 | 3031 | 3080 | 3024 | 3052 | 3038 | 4419 | 3274 | 3308 |
3715 | HVO_2947 | 3027 | 3046 | 3135 | 3042 | 3128 | 3190 | 3274 | 4337 | 3686 |
3833 | Hbo1590 | 3078 | 3108 | 3126 | 3077 | 3209 | 3270 | 3308 | 3686 | 4526 |
651 symbols consensus MPVVDIDPDELRRLTGHEDKSDDELKDDLFALGLEFEGETDDGAFQLEFAPDRLDRLSVE #oth ..2.1132....5.1125211.21113...4..1.1..311214131..21......... VNG2505 :::::::::::::::::RS:D::::RQ:::G::I:Y::::E::D:K:::EA::::::::: NP0694A ::::EV::::::S:AAI::::::::::::::::::::::S:::D:E:::::::::::::: rrnAC2967 :::::V::::::Y::::SE:D:::::S:::N:::::::W:E:DE:::::::::::::::: Hmu3199 ::T:::::::::E::::G:::::::R::::S::::Y:::::E:H:E:::::::::::::: Hut2378 ::T::::T::::E::::GE::::D:R::::E::::Y::::EE:ELRF::E:::::::::: HQ1050A ::I:::NM::::S::::DE:::T:F:S:::E:::::::K::T:LL:F::G:::::::::: hla0623 :::::::T::::G:::RT:T::E:F:E:::G::::::::::EDLL:F::::::::::::: HVO_2947 :::::VQ:::::::::::::::E:F:::::::::::::V::::::::::G:::::::::: Hbo1590 :::::VH:::::D:::::E:::E:F:::::::::::::::E::::::::G:::::::::: consensus GVARSLRYQYGDDRGVYVPKTNDPEWTIEVDEDVPDERPYVTGAVVRGVDLDDAALDSLI #oth .1......21.111.141.4..4111215.2222.43.......12..111.452.1... VNG2505 :I::::::HA::::::DI:D::A:::A:D:-T:::AD::::::::I::::::AD:::::: NP0694A :I:::::::::H:::ID::::::A::::T:::S::EA:::::::::::L::::TQ::::: rrnAC2967 ::::::::H:::::::EI:N::SAD:::::-::Q::::::::::I:::L:M:E:::E::: Hmu3199 :I::::::D::::::::::S:::A::::::-::T:P::::::::I:::L:::QSS::::: Hut2378 :::::::::::::W::::::::GAD:::H:-::::E::::::::::::L:::::S::::: HQ1050A ::::::::H::::::IA::S::N::FQFI:TDT::TR:::::::IA:::S::KH:::::: hla0623 ::::::::H::::::::::E::::::::::::S::::::::::::I::::::EG:::::: HVO_2947 ::::::::::::A:::S::N::::D::FV::D:::::::::::::::::::::::::::: Hbo1590 ::::::::::::A:::::::::::DF:FV::::::::::::::::I:::::::D:::::: consensus QLQEKLHATMGRKRAKGAIGIHDLTMLKGDALDD-------------------------- #oth ............2.......1...1.1..3626522222221222222221221122222 VNG2505 ::::::::::::::::::::::::A:::::TV:G:::::::::::::::::::::::::: NP0694A ::::::::::::N:::::::V::::::::GGARS:::::::::::::::::::::::::: rrnAC2967 ::::::::::::::::::::V:::::::::SVT-:::::::::::::::::::::::::: Hmu3199 ::::::::::::::::::::V::::::::G:ANVTASPPQDGAVDDLARPDADPTGEGAD Hut2378 ::::::::::::::::::::V::::::::GEAA::::::::::::::::::::::::::: HQ1050A :::::::::::::::::::::::::::::RT:::SGVDITGGNEMVDTATDSRPTADRET hla0623 ::::::::::::G:::::::::::A:V::AP:Q-:::::::::::::::::::::::::: HVO_2947 ::::::::::::::::::::::::::::::V:SE:::::::::::::::::::::::::: Hbo1590 ::::::::::::::::::::::::::::::::SE:::::::::::::::::::::::::: consensus -----DGSG-KSITYTGIDPDGDTFVPLDADAEMTPAEVLAEHPTGETYADLVAEYDRYP #oth 21111236424121.112112233..1.131212..33.234.41.32.1112324112. VNG2505 :::::::TAAR:L::::::::::::::::D:::R:::D::T:::::::::::L:DH:T:: NP0694A :::::::KPS:::::R:V:::::R:::::D:::R::::::DA:::::::GH::DGL::F: rrnAC2967 ::::::ET::::::::SA:::EA:::::::::::::S::M:S:E::Q::G::::DF::V: Hmu3199 A:::::SVT::T:::::::::SEE::::EG:RA::::::TET:HI:VE:::::::M::V: Hut2378 :::::::E::::VR:::::R::::::::EG::::::G::::::HI::E::::::::::V: HQ1050A DTSAT:SPT:H:::::::E:T::::::::SNR:L:::A::D::::::::::II:D::::: hla0623 :::::E::E:P::::R:V::::VS::::::ND:L::N::::::D::Q::::::EGL:::: HVO_2947 :::::NA:::N:::::::::::::::A::SND:L::::::EQ:A::RK:::::S:::::: Hbo1590 ::::::SD::N:::::::::E::::::::::::::::R::E:::::Q::::::S::E::: consensus AIYDEIGLFSFPPVINGRRTEVTTDSRDLFIELTGTDQWTIDRMCNIICYALDARGATIE #oth ....31........1..2....2111.2.11.1...1.....1.13.1....3...121. VNG2505 ::::D::::::::::::::::::::::E::V::::::::::::::A:::::::::::::: NP0694A ::::D::::::::::::S::::D:GT::::::::::::::::::LA::::::S:::GR:: rrnAC2967 ::::A:::::::::::::::::SV::::::::M:::N:::::H::::V::::A:::GQV: Hmu3199 ::::S::::::::::::K::::D:G:::::::M:::::::::H:LS:V::::::::G:V: Hut2378 ::::S:::::::::V:::::::S:::::::::M:::::::::H:LS:V::::::::G::: HQ1050A :::::L:::::::::::::::::::::N:L:::::::::::::::T::::::T::::::: hla0623 :::::L:::::::::::K::::::G::E::V::::::::::::::::V::::S::::::: HVO_2947 ::::::::::::::::::::::S::::::LV:::::::::::::::::::::A::::::: Hbo1590 :::::L:::::::::::::::::::::E:LV::::::::::::::::::::::::::::: consensus DVEVEYPDGT---------LLRPDFSVRTKHVSHDRIETILGVDLDGREVVDLFERAGLD #oth 5.5.4.4243122222243351.115141.212.....24..121454212.221.1..1 VNG2505 ::T:D:::RE::::::::::H::::A:::::::::::::L:::EFTTEA::::A:::::: NP0694A S:A:D:G:R:::::::::::T:::L:TT::T::::::::T:::::A:TD::::L::S::: rrnAC2967 K:D:S:A:DA:PGEYAGKT:E:::::::::T:T:::::S::::S::S:::::YA:::::: Hmu3199 E:A:::T::A:PGEYAGQSF::::LGTK::T:A:::::::::::::K::IG::AD::::: Hut2378 ::R:::E:AP:::EEYRDS:::::::TK::T:A:::::RT::I::Q:ED:I::L::S::: HQ1050A S:N::::EQ::::::::::FS:::LT:D:::I:::::::::::SF:TA:II::::::::A hla0623 Q:::N:A::ATAPSEYGAE:V::N:DTDE:S::::::::L::::FEPE:I::C::::::: HVO_2947 E:::Q:ET:::::::::::VTK:::E:E:::::::::::V:::E:ELD::I:::::S::: Hbo1590 A::::::::::::::::::YV::::E:E:::::::::::M:::::EP:::::::::S::: consensus ATATDT----------------------DDLVYEVEIPPYRVDVLHPLDLVDDVGRAYGF #oth 14523431222212222212211111114453.2121.1.....2..3.21..2...21. VNG2505 ::P::D::::::::::::::::::::::---G:D::::::::::R::V:V:::L::::D: NP0694A :E:DTE::::::::::::::::::::::GE:T::::::A::::::::A:I:::::::F:: rrnAC2967 ::E:ESD::::::::::::::::::::::GVA:D::V:::::::I::::II::I:::L:: Hmu3199 :SE:::::::::::::::::::::::::-:G:::F::::::::::::I:VI::L:::::: Hut2378 GES:E:D:::::::::::::::::::::GSPA:D:T:::::::::::V:VI::::::::: HQ1050A ::T:::TDTAVTSNVDIDGSD:::::::NSP::V:S::::::::::::::I::::::::: hla0623 :SY:LD::::::::::::::::::::::E:VT:::::::::::::::::::::::::::: HVO_2947 :N:ELG::::::::::::::::::::::EET::::S:::::::::::::::::::::::: Hbo1590 :D:D:GADAGDGSDTTEAGGENATDAES:::::::S:::::::::::::::::::::::: consensus NELEPRYPDVGTVGGRHERSRLEDAVRTSLVGLGFEDLLNFHMTSEEENYDRMRL----- #oth 15.3.2..212.1.1.11111..322.33.1....1.1...2111331222.15311111 VNG2505 :D:T::::::N:I:::T:S::::RS::QA::::::::::::N::::A::F:::::::::: NP0694A :::::Q::::S::::::D:::::::::NT::::::::::::Y::::T:LF:::S:::::: rrnAC2967 :S:::T::::S::::::::::::::A:DA:::::::::::::::N:V::FE::N:STPEA Hmu3199 :T::::::::S::::::D::K::R:T:DV::::::::::::Y:I:::A::E:LQV::::: Hut2378 :N:D::::A:::I::::::A:::E::::V::::::Q::::::L::A::LH:::GI::::: HQ1050A DK:::::::I:::::::::::::AVT::T:T:::::::::::L:NKA:V:N:::T::::: hla0623 DN:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GT::::::N:::::: HVO_2947 ::::::::::::::Q::::::::::::::::::::::::::::I::::::E::DV::::: Hbo1590 :::Q::::N::::::::::::::::A:N:::::::::M::::::::::V::::GI::::: consensus EPGSDA----------LGGGDPAEITEPYSEDYTILRTWALPSLMMVLENNTHRAYPQDL #oth 23243222111111112.324122.33...211.31.2.31..1421..2...23....1 VNG2505 T:DH::::::::::::V:AAQ::T:A::::Q:F:::::::::::A::::T:::H:::::: NP0694A S:DDN:::::::::::V:ARE:PT::::::::::VV::::::::L::::::::::::::: rrnAC2967 :D:N::DT::::::::V:LA::VT:Q:::::::::::::::::I::::::::::S::::: Hmu3199 T::::V::::::::::V:::::VT:Q::::::::M::S:::::I:L::::::::S::::: Hut2378 :::V::::::::::::::::::V::RN:::::::VV:::L:::I:Q::::::::R::::: HQ1050A S:L:P:AFNSTPDDID::SAP:::::D:::G::::::P:I::::VQ::::::::T::::: hla0623 :A::::::::::::::F:::N:V::::::::E::Q:::::I:::V:L::R:::N:::::V HVO_2947 :V:::Y::::::::::::::E::S::::::::::M::::V::::T::::::::::::::: Hbo1590 :A::EV:::::::::::::::T::::G::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus AEIGLVAERDDSENTNVAERRHVAGALARHDASYEDAKARLQALCRDFDAELETPPTDHP #oth ..1.31143.2242.3.1.2.2..111..3.111.1..21.112333.33313..213.. VNG2505 ::V:FA:HA:GDTQ:G:::::T::AV:::N:::::::::::::::DE:AVA::::::T:: NP0694A :::::::GV:E:KP:::::H:S:::VV::T:::::::::::::IGSA:GVDIK::::::: rrnAC2967 :::::A:GL::::::G:::H:T::A::::T::::::::::::::ADA::KD::::::T:: Hmu3199 :::::AV:V:E:T::::::H:T::A:V:::::::::::T::::IAAN::T::A:::I::: Hut2378 ::V:F::Q:::GA::G:::A:::::::::::V::::::::::::VA:::::::::::A:: HQ1050A ::V:V::N::::V::H::::::::::V:::::T::::::A:::V::E:::T:Q::::T:: hla0623 ::V:FA::::::::::::::::::::V::R:::::A::G::::V:D::R::::::R:E:: HVO_2947 ::::H::H:::D:::R:::A::::AV::::::T::::::::A::::::::D::::A:::: Hbo1590 ::::::::::::V::R:D:::::::V::::::TF::::::::S:::::G:::K::A:::: consensus SFIDGRTAAVVIDGEAVGVIGEIHPAVLVEHDLEVPVAAFEFRLDALA--- #oth 1..1..1.312211351..1..21.4.1....111..11...3.2..3211 VNG2505 ::::::A:TIE:::QPA:::::L::G:I::::V:::::G:::E::::R::: NP0694A :::::::::::::::PA:::::L::R::::::::::::G:::::::::D:: rrnAC2967 :::G::A:E::L:::S:::::::::K::::::::L:::::::::::::::: Hmu3199 T:::::::::EL:::::::V::VD:::::::::::::::::::::::E::: Hut2378 ::::::A:::E:::D:::::::V:::::::::::L::V::::D:A::Q::: HQ1050A :::::::::II:NDTS:::::::::E:::::::A::::::::E:A:::SEA hla0623 :::::::::::::::V::::::V:::::::::::::::::::H::::R::: HVO_2947 :::::::::::::::E:::V::L::K:I::::::L:::::::D:S:::::: Hbo1590 ::::::A:S::V:::N:::V:::::R::::::::L:::::::D::::R:::