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9 genomes BUD0457 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1920

rrnAC3291

HVO_2213

Hbo1924

Hmu2266

Hut1979

hla1363

NP3172A

HQ3142A

Pairwise sequence scores
Consensus score1281 VNG1920 NP3172A Hut1979 rrnAC3291 Hmu2266 HQ3142A hla1363 HVO_2213 Hbo1924
525VNG1920 1181 329 370 418 424 345 418 407 430
756NP3172A 329 1346 662 579 636 407 372 460 523
749Hut1979 370 662 1304 629 670 461 341 434 490
747rrnAC3291 418 579 629 1268 759 416 437 397 478
719Hmu2266 424 636 670 759 1272 363 394 384 451
694HQ3142A 345 407 461 416 363 1270 450 522 616
668hla1363 418 372 341 437 394 450 1610 703 640
767HVO_2213 407 460 434 397 384 522 703 1251 770
841Hbo1924 430 523 490 478 451 616 640 770 1260

220 symbols
consensus       -----------------------------------------------MDDLPERVARAFE
#oth            111111111111111111111111111111111111111111112335434235334114
VNG1920         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::----MDEI:GE::
NP3172A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MPMS:E:::KAV::::
Hut1979         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MT:T::PA::D::D
rrnAC3291       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:V:DD::E::D
Hmu2266         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MS::S::SA:S:::
HQ3142A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:IR::TD::VA
hla1363         MSERESKSEDGGEIGGDGEGEGVTGDGEGVTGDGEGVTGDGEGAIGGGG:::D::R:::A
HVO_2213        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSE::I:G::R:::G
Hbo1924         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:V:::AR:::R

consensus       DHDSFEP--DDDGFAVTTTVFDGRVTAEEADDGRIEFEVTVRVPMLSAATE-DDVAPAVE
#oth            31122243123442442.1511241524464534672413122.2141226125.112.5
VNG1920         S:GR:RAV:AERS::P::NDWEAV:AV:PP-----GV:IA:V::T:D:::T:EQ::DV:S
NP3172A         R::A::R:::GEW:T::::T:::::::::T::WALSYT:E::A::::S::::EV:G::::
Hut1979         :::::::::AAE:YR:::::::PT:::TDIEGVGH:YT::::T:::G::V:GEV:G:::A
rrnAC3291       R::ALVS::AG:SY::E::N:::::::S:GEEW:TNY:::::A:S:Q:::S::E:GD::V
Hmu2266         SNGA:::::T:::YR::::A:E:T:V:DD:PKW:VAYT::::A:T:::::V:ET:GD::T
HQ3142A         L:::I:SDG:::VY:::::::::DISI:T:-::AAI:S:VIT:::ID:VVD:GH:::P:Q
hla1363         ::G::::V::EGVWVAE::P::AE:R::P:A::::H:V::::::T:::TAA::E::DV::
HVO_2213        ::G:::RV:::RT:ESV::P:::T:GVAAQ:S::V::D:E::::::::VA-::::::V::
Hbo1924         ::::::QR:::ST:EW:::::::::::A:-:::E:T::::::::::N::V:::::::V::

consensus       DGWFETFERRLEDAPSATRADHELDE-RVTRAGDEAVVTFEFADGNERRAADDAKALVEY
#oth            2..41.231.23.25411235522155725433352115453362333422331323221
VNG1920         :::Y::::::VR::D:V:::E-DVSVSA:::::G:IT::LTM:P-RSGM:::::L:::N:
NP3172A         ::::D:YD:::::::M:V:Q:L::::Q::FEEAGD::AV:G:EW::ADHVP:MT::IA::
Hut1979         ::::D::A::::::TQ::::QI:::QH:LVADDGQ::A::V:SY:DPDQ::AI::T::::
rrnAC3291       :::L::L::::::::K:::TAV:::DYS:VE::EQV::::QYTM:G::Q:::V::TF:::
Hmu2266         ::::::L::::::::K:::TSV::::FG:E:D:ESV:::Y::EL::ADT::RV::TFA::
HQ3142A         K::VD::G::MA::E::::GHET::I:KT::KD:T:::ETT:T:IDPS:GV:::VS:::F
hla1363         E::I::::L:VV:VGGV::G:::F:P:T:AV:A::IT:D::LTEI::::GV:::G::INF
HVO_2213        :::Y::::L::::VNGVVAG::D::P:N::L:::::::RAS:::I::::GV:::G:VID:
Hbo1924         :::Y::::L:V::IG:V:K:E:DF:V:E:S:DENAV::STS:::I::::GVE::G:IID:

consensus       VEGTYVEGVIPGYDYTEPVADLLQQARDAA-DGERGGTPL
#oth            1...221.11...1.5421461334.52513544311411
VNG1920         ::::WFQ:IV:::::I:A:RAMRE::AQN::-Q:A:::::
NP3172A         :::::M::IV:::E:GQ::SEM:S:::QS:GESG::PM::
Hut1979         ::::::::IV:::::R::::::I:N:KT:G::N:::::::
rrnAC3291       :::::::::::::::VGV:::::NS:STGGSE:S::::::
Hmu2266         :::::::::V:::E:EGA::::VN::QTNG:::GA:::::
HQ3142A         A:::::::::::::::D::TQ:I:R:S::::G:KK:::::
hla1363         ::::::Q::::::E::::LDG::SA::QQGNS----:GGF
HVO_2213        ::::F:::I::::::G:::TS:I:N:K::::-----:AGF
Hbo1924         ::::::Q::::::E::K::ST:::R:T:T::NS:--:P::