|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1281 | VNG1920 | NP3172A | Hut1979 | rrnAC3291 | Hmu2266 | HQ3142A | hla1363 | HVO_2213 | Hbo1924 |
525 | VNG1920 | 1181 | 329 | 370 | 418 | 424 | 345 | 418 | 407 | 430 |
756 | NP3172A | 329 | 1346 | 662 | 579 | 636 | 407 | 372 | 460 | 523 |
749 | Hut1979 | 370 | 662 | 1304 | 629 | 670 | 461 | 341 | 434 | 490 |
747 | rrnAC3291 | 418 | 579 | 629 | 1268 | 759 | 416 | 437 | 397 | 478 |
719 | Hmu2266 | 424 | 636 | 670 | 759 | 1272 | 363 | 394 | 384 | 451 |
694 | HQ3142A | 345 | 407 | 461 | 416 | 363 | 1270 | 450 | 522 | 616 |
668 | hla1363 | 418 | 372 | 341 | 437 | 394 | 450 | 1610 | 703 | 640 |
767 | HVO_2213 | 407 | 460 | 434 | 397 | 384 | 522 | 703 | 1251 | 770 |
841 | Hbo1924 | 430 | 523 | 490 | 478 | 451 | 616 | 640 | 770 | 1260 |
220 symbols consensus -----------------------------------------------MDDLPERVARAFE #oth 111111111111111111111111111111111111111111112335434235334114 VNG1920 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::----MDEI:GE:: NP3172A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MPMS:E:::KAV:::: Hut1979 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MT:T::PA::D::D rrnAC3291 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:V:DD::E::D Hmu2266 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MS::S::SA:S::: HQ3142A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:IR::TD::VA hla1363 MSERESKSEDGGEIGGDGEGEGVTGDGEGVTGDGEGVTGDGEGAIGGGG:::D::R:::A HVO_2213 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSE::I:G::R:::G Hbo1924 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:V:::AR:::R consensus DHDSFEP--DDDGFAVTTTVFDGRVTAEEADDGRIEFEVTVRVPMLSAATE-DDVAPAVE #oth 31122243123442442.1511241524464534672413122.2141226125.112.5 VNG1920 S:GR:RAV:AERS::P::NDWEAV:AV:PP-----GV:IA:V::T:D:::T:EQ::DV:S NP3172A R::A::R:::GEW:T::::T:::::::::T::WALSYT:E::A::::S::::EV:G:::: Hut1979 :::::::::AAE:YR:::::::PT:::TDIEGVGH:YT::::T:::G::V:GEV:G:::A rrnAC3291 R::ALVS::AG:SY::E::N:::::::S:GEEW:TNY:::::A:S:Q:::S::E:GD::V Hmu2266 SNGA:::::T:::YR::::A:E:T:V:DD:PKW:VAYT::::A:T:::::V:ET:GD::T HQ3142A L:::I:SDG:::VY:::::::::DISI:T:-::AAI:S:VIT:::ID:VVD:GH:::P:Q hla1363 ::G::::V::EGVWVAE::P::AE:R::P:A::::H:V::::::T:::TAA::E::DV:: HVO_2213 ::G:::RV:::RT:ESV::P:::T:GVAAQ:S::V::D:E::::::::VA-::::::V:: Hbo1924 ::::::QR:::ST:EW:::::::::::A:-:::E:T::::::::::N::V:::::::V:: consensus DGWFETFERRLEDAPSATRADHELDE-RVTRAGDEAVVTFEFADGNERRAADDAKALVEY #oth 2..41.231.23.25411235522155725433352115453362333422331323221 VNG1920 :::Y::::::VR::D:V:::E-DVSVSA:::::G:IT::LTM:P-RSGM:::::L:::N: NP3172A ::::D:YD:::::::M:V:Q:L::::Q::FEEAGD::AV:G:EW::ADHVP:MT::IA:: Hut1979 ::::D::A::::::TQ::::QI:::QH:LVADDGQ::A::V:SY:DPDQ::AI::T:::: rrnAC3291 :::L::L::::::::K:::TAV:::DYS:VE::EQV::::QYTM:G::Q:::V::TF::: Hmu2266 ::::::L::::::::K:::TSV::::FG:E:D:ESV:::Y::EL::ADT::RV::TFA:: HQ3142A K::VD::G::MA::E::::GHET::I:KT::KD:T:::ETT:T:IDPS:GV:::VS:::F hla1363 E::I::::L:VV:VGGV::G:::F:P:T:AV:A::IT:D::LTEI::::GV:::G::INF HVO_2213 :::Y::::L::::VNGVVAG::D::P:N::L:::::::RAS:::I::::GV:::G:VID: Hbo1924 :::Y::::L:V::IG:V:K:E:DF:V:E:S:DENAV::STS:::I::::GVE::G:IID: consensus VEGTYVEGVIPGYDYTEPVADLLQQARDAA-DGERGGTPL #oth 1...221.11...1.5421461334.52513544311411 VNG1920 ::::WFQ:IV:::::I:A:RAMRE::AQN::-Q:A::::: NP3172A :::::M::IV:::E:GQ::SEM:S:::QS:GESG::PM:: Hut1979 ::::::::IV:::::R::::::I:N:KT:G::N::::::: rrnAC3291 :::::::::::::::VGV:::::NS:STGGSE:S:::::: Hmu2266 :::::::::V:::E:EGA::::VN::QTNG:::GA::::: HQ3142A A:::::::::::::::D::TQ:I:R:S::::G:KK::::: hla1363 ::::::Q::::::E::::LDG::SA::QQGNS----:GGF HVO_2213 ::::F:::I::::::G:::TS:I:N:K::::-----:AGF Hbo1924 ::::::Q::::::E::K::ST:::R:T:T::NS:--:P::