9 genomes BUD0466 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG2643 rrnAC2082 HVO_0400 Hbo1102 Hmu0044 Hut0833 hla0472 NP0430A HQ3109A

Pairwise sequence scores
Consensus score	966	Hut0833	rrnAC2082	Hmu0044	VNG2643	hla0472	NP0430A	HQ3109A	HVO_0400	Hbo1102
706	Hut0833	987	726	708	693	662	668	572	605	584
772	rrnAC2082	726	986	835	704	727	679	584	601	595
834	Hmu0044	708	835	978	748	698	682	587	673	645
832	VNG2643	693	704	748	974	764	696	591	672	639
796	hla0472	662	727	698	764	973	658	608	627	644
755	NP0430A	668	679	682	696	658	986	621	689	639
691	HQ3109A	572	584	587	591	608	621	958	681	705
736	HVO_0400	605	601	673	672	627	689	681	942	775
732	Hbo1102	584	595	645	639	644	639	705	775	946

130 symbols
consensus       MKEYKMRRGEHLEDRVPDMEATVEEYFGEITDTEEYKGSDLYVVDDPDNPVFERIVAGTV
#oth            .2........2.21.21113431.21..4111.2433131.31.31.2....5.121.32
Hut0833         :R::::::::Y::::I:::RE:::::::P:AG::P:NDTE:FI:EE::::::::VTV:::
rrnAC2082       :R:::::::::::::::::::F:::::::V::::D:E:N::L::::::::::D:V:::R:
Hmu0044         :R:::::::::::::::::::F::D::::::::Q:R:::::L::::::::::::V:::::
VNG2643         ::::::::::Y:DE::S::L::::::::DV:::KRF:D::::::E:::::::K:::::::
hla0472         ::::::::::::D::M::LKGSI::::::V:::::WQDHE::::E:::::::D:::::AT
NP0430A         :E::::::::Y::E::::::::I:::::P::G::::::N::H::A:::::::N:V::::M
HQ3109A         ::::::::::T:A::I:E:KT:I:S:::S:::::S:N:::::::::::::::Q:::::G:
HVO_0400        ::::::::::T::E:I::::::::D:::P::G:::F::::::::GE:K::::T:::::A:
Hbo1102         ::::::::::T:D:::::::SY:::M::T::G::::::::::::GE:S:::::::I::A:

consensus       EYSGKKDKLAVDFEERDAEDVIAEGNADAAADAVDAKNDFLLEATGRDAKSRRDSMKRSV
#oth            3.22...1111413.2223122322322..31.142..2..211.1....1..1.1..2.
Hut0833         P:GS::::::L:I:::P::E:::::HVE::E:::NV:::::EM:::::::A:::::::::
rrnAC2082       ::GS::::I:LHID::P:::::::::V:::E:::AI:::::E:::D::::A::::L::::
Hmu0044         ::::::::::LHID::::::::::::::::QE::T::::::E::::::::A:::::::::
VNG2643         ::A::::::G:Q::::P:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
hla0472         K:GS:::::::H::::P:::::::::::::::::::::E::::::::::::::E:L::E:
NP0430A         S::S:::::::::D::EL:ELMET:DV::::::NN::::::::C::::::A::E::::A:
HQ3109A         S::N:::TI::::V:C:PSE-LDPDDLA::G::::I::T::K:::::::::::E::::A:
HVO_0400        K::::::::::N:::A:PA:-L:PEDLE::GE::S:::::::::::::::::::::::A:
Hbo1102         K::::::::::E:T:::PTE-LGPDELE::GE::::::T::::::::::::::::L::::

consensus       EDDA--PDYV
#oth            ....23..41
Hut0833         ::::DK::S:
rrnAC2082       ::::DA::N:
Hmu0044         ::::DK::S:
VNG2643         ::::EK::T:
hla0472         :::::::::-
NP0430A         ::::ET::N:
HQ3109A         :::::::::-
HVO_0400        ::::::::V-
Hbo1102         :::::::::-