|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1925 | VNG0759 | Hut0976 | NP4102A | rrnAC0863 | Hmu1532 | hla1559 | HVO_1176 | Hbo0383 | HQ2489A |
752 | VNG0759 | 1798 | 514 | 511 | 512 | 523 | 366 | 534 | 524 | 499 |
953 | Hut0976 | 514 | 1900 | 679 | 810 | 652 | 500 | 556 | 699 | 730 |
1058 | NP4102A | 511 | 679 | 2114 | 841 | 777 | 540 | 644 | 725 | 687 |
1137 | rrnAC0863 | 512 | 810 | 841 | 1953 | 886 | 585 | 744 | 790 | 725 |
1047 | Hmu1532 | 523 | 652 | 777 | 886 | 1899 | 477 | 590 | 763 | 668 |
902 | hla1559 | 366 | 500 | 540 | 585 | 477 | 1957 | 765 | 796 | 722 |
1148 | HVO_1176 | 534 | 556 | 644 | 744 | 590 | 765 | 1887 | 1080 | 1018 |
1310 | Hbo0383 | 524 | 699 | 725 | 790 | 763 | 796 | 1080 | 2022 | 1206 |
1231 | HQ2489A | 499 | 730 | 687 | 725 | 668 | 722 | 1018 | 1206 | 2038 |
298 symbols consensus MNRRLLLALAVLALLGL---AGCLGF-GTG-EVDP--ERLNEEA---DYDWDTDADAAIT #oth 232244334213213323111..2244255254441135233311335.41444343524 VNG0759 -M:A:WV::::A::AVT::::::A::G:PQSAAT:SD:Q:AQN::::T:E:SHT:PV:VN Hut0976 ::S:TRFVFG:VG::::LAL::::S-:---:P:SD::AD:A:N::::T:::::E:N:TYR NP4102A ::::::A:V::FV:F::::::::TTIF:AD:VD:::::A:S::::::E:NF:::R::F:: rrnAC0863 :K::H::LV:::::VA::::S::T::F:SE::::::::::::N::::S:::N:S::GT:V Hmu1532 ------VLA:::::VA::::S::TSLL:P:::P::::QQ:::S:::::::::SSVN:S:: hla1559 V:::FA:::::V:::VVS::::::TYIND:G::AN:::T:DA:P:PQA::FA::R:T::N HVO_1176 ::::::VGI:A::::LVT:::::::-:::S:S:SN::D::DAAP:DG::A:TAET::H:: Hbo0383 ::::::::::A::::V:T::S::::::::::D:SK::::V:A:PPDGG:T::ANTTVR:E HQ2489A ::::::::VCA::F::VL::S::::I:::::PIPA:::EIDS:P:AES:E:TN:RSTR:: consensus IQAN-RYTAVYEVN-----D-SEIELYRRDGLGGEQPLEISALRYRYPNGTVV------- #oth 3453252231353411111445344333733315442433312311122.1331111111 VNG0759 MSRD:T::V:AS:T::::::RQNVTIG:PA:R:DAA:TD:::VAF:H::::::::::::: Hut0976 LY:G:N::::V:IQ::::::QASL::FLE::::S:::IP::G:KFQ::::::G::::::: NP4102A VNRD:N:::::NTSASATG:EGTM::W:TNR:TI:::::LYG:QF::D:::TIRYIEGEP rrnAC0863 :EES:K:::::A:E:::::NETTFDV:TV::::R:RSVP:::::F::E:::::::::::: Hmu1532 LEK::ASAH::GTE:::::NR::LRV:E::A::Q:TH:::R::Q:::::::::::::::: hla1559 LSTGT::::::N:S:::::GVD::RF::QTPYT:D::F:FE:F::Q::D:E::::::::: HVO_1176 V:D:G:FR:::::::::::S::SV::::F::F:SRT::SVE:V::::D::::L::::::: Hbo0383 ::::TQ::::::L::::::Q:T::::::::::::RN::SVE:VQ:::::::QL::::::: HQ2489A ::E:TKFRTIIT::::::::::S:Q:F:N::F::TN::S:::V:::::G:EII::::::: consensus ------G-EARARGGSVSQTRRRTIVDLPSDA-----GKLAFTAPRSGKRFSLPTYV-DG #oth 1111131235662333234335524353264553312.341214443322344324214. VNG0759 ::::::-:--GSDAIN::T:DSALVATF:ATN::::::TF:Y:::AD:SQTVI:VV::N: Hut0976 ::::::-:--NDSVY:::TG:SKVVLEP:VEN::::::TV::::R:::ST:RTR:L::A: NP4102A MRIHQD:TTEPTDSL::DN:::::::::::AD::::::Q::Y:T:KT:::IAVYAP::H: rrnAC0863 ::::::-:S:ANSSL:A:ES:Q::T:N:SGNVS::::::VGYSVA:T::::AS::L:E:: Hmu1532 ::::::-:T:DHSAL::::::E:::I:V:NETA:::::QV::::::Q:::Y:T:VF::E: hla1559 :::::N:S:F:::::EIDR:PDE:W:RFDDEMD:::G:RM:IS:SG:PR::TTL::I:E: HVO_1176 :::::N:T:LK::::D:T:ND:I:N:T::E::GRD:::::::SSSSTP::::::VF::E: Hbo0383 :::::D:S:I:E:::EIR:::DV::IA:::::PENGG::::::GSG:A:::::::::::: HQ2489A :::::T:T:I:E:::EIR::QAE::IE:::::PDE:T::I:::SGG:R::::::::A::: consensus SYEVTLPPNRRADLPILSQVRPGGYEREV-VDDRVHLRWDEVTADT--VVVRFYLQRDLL #oth 12424.12253334.331424.3221424143215513133245451112134.221115 VNG0759 :HS::::RGM::S:::I:S:Q::::D:RI:D::::R:A::S:P::R::IRISY:S::NAM Hut0976 :H::A:S::K:VG::VV:R:V:::::T:R:SG:::L:Q::TIERN:::ISIKT::E:::V NP4102A :::IA:::DTD:A::L::::::SNDD::E::G:::::Q::::DTSV::::::W::D:::W rrnAC0863 ::T:V::::TG:GI:F::RIS:::::S:T:::GQQVI::::::S:Q::I:::Y::D:::W Hmu1532 ATNL::::GA:VGV:L::::N:PAG::S::T:N:MT:TYEN:::Q:::IR::Y::::::: hla1559 ::V:::::GFST:M::VGH:S:R:::I:T:I:G:DQIT::S::SGS:::::QS:RET::: HVO_1176 ::::V::VD::V:F::FGS:::S::DT:::::::L:I::::::DGN:::::Q:::::::G Hbo0383 :::IL:::D:SI:V::IG:A::P::DYSR::NGQIL:::S:MS::::::S:Q:::E:::Y HQ2489A :::II::::::I:I:VFGTAS:::::T::DTE::L::Q:ANIDES:EI:S:::::::::Y consensus LFGGLAVIAGLVGVGGLLYYRRQIQALRRRRQEMGLDV-ETD---DDE-DDGPPPGMR #oth 2.1324245533143.53112211452354.525232211522231153131111113 VNG0759 ::A::::LL::::A::VI:::L::RQ:ESE:VASEV:L::K-:::---:--------- Hut0976 :::::VG:VSV:A:I::A::::E:AKV::Q:::L::::::GETDD::PR:R::::::K NP4102A :::::V:::VIAA:::AV::Y:::KQAEKT:K:E:F:I:DI-:::::DG::::::::G rrnAC0863 :::::SA::IAI::V:T:::Y::L::VI:::::A:I:L::E:DGD::PR:R::::::: Hmu1532 I::SVFGGGIVLAI::SV::W::::S:K:K:E:TAI:I:D::::G::FG::::::::: hla1559 V::VIL:::AIAA:I:TV:F:::LEE::E::RQ:::G:Y:D:::E::::--------- HVO_1176 I:AAV:AVSV:::GA:I:::::::R:::D::::L::::::D-:::::R:--------- Hbo0383 I:::VF:LF::I:L::::::::::EE:KDQ:E:::::::D:-::::::F:E::::::: HQ2489A V:::I:AFVL:::L::::R::Q:::R::AQ:T::::E:::::::D:::F::::::::G