| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5388 | VNG0326 | NP1192A | rrnAC1800 | Hmu0870 | Hut0568 | HQ1572A | hla0091 | HVO_0809 | Hbo0726 |
| 4083 | VNG0326 | 5340 | 3593 | 3761 | 3634 | 3547 | 3503 | 3559 | 3689 | 3554 |
| 4305 | NP1192A | 3593 | 5421 | 4012 | 3898 | 3644 | 3670 | 3720 | 3858 | 3764 |
| 4341 | rrnAC1800 | 3761 | 4012 | 5570 | 4452 | 3819 | 3566 | 3722 | 3788 | 3666 |
| 4278 | Hmu0870 | 3634 | 3898 | 4452 | 5550 | 3721 | 3569 | 3676 | 3746 | 3642 |
| 4197 | Hut0568 | 3547 | 3644 | 3819 | 3721 | 5419 | 3662 | 3848 | 3835 | 3742 |
| 4241 | HQ1572A | 3503 | 3670 | 3566 | 3569 | 3662 | 5723 | 3817 | 4059 | 4078 |
| 4436 | hla0091 | 3559 | 3720 | 3722 | 3676 | 3848 | 3817 | 5567 | 4115 | 4048 |
| 4548 | HVO_0809 | 3689 | 3858 | 3788 | 3746 | 3835 | 4059 | 4115 | 5700 | 4370 |
| 4418 | Hbo0726 | 3554 | 3764 | 3666 | 3642 | 3742 | 4078 | 4048 | 4370 | 5340 |
794 symbols consensus -----------------MSHEDFPTDNPAVVTCGLPYANGDLHIGHLRTYVGGDAYSRAL #oth 11111111111111111223231..13.....1....11....1....1..3..223.1. VNG0326 ::::::::::::::::::TD::Y:::D::::::::::PT::::::::::::S:::F:::: NP1192A :::::::::::::::::-M::E:::ET::::::::::::::::V:::::::S::::A::: rrnAC1800 :::::::::::::::::::NDE::::Q::::::::::::::::V:::::::D:::L:::: Hmu0870 :::::::::::::::::::DQQ::::::::::V::::::::::V::::G::N::V:A::: Hut0568 ::::::::::::::::::::DE:::E::::::::::::::::::::::::::::VLT:S: HQ1572A MTMKQYTMSKMNAETQTQTR:S::::D:::::::::::::::::::::::::::IF:::: hla0091 ::::::::::::::::::::D:::::D:::::::::::::::::::::::::::V:R::: HVO_0809 :::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::I:::S: Hbo0726 :::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::::I::::: consensus RRLGQQTAFVSGSDMHGTPVAVNAAEEGVDPESFALEHHEQYAETFPQFNIEFDNYGHTH #oth 232..211..1.1......11.1.322114.2421124..2.23..13.412..1....1 VNG0326 :K:::E:V::::T::::::I::Q:I:A::G:LDLG::R:::::D::EE:SVA::T::::D NP1192A ES:::SV::::::::::::I:::::::::::::::V:Y::::E::::::::::::::::: rrnAC1800 ::I::::::::::::::::::::::::::A:RE:::DF::T::::::::::::::::::D Hmu0870 ::V:::::::C::::::::IV:::G:::::::AY:::Y::T:::::::::V::::::::: Hut0568 EK:::::::::::::::::I::Q:I:DDI:::A::::Y::::E::::E:DVD:::::::: HQ1572A K::::E:::::::::::::::::::::::T::::::R:::::ET:::::G:::::::::: hla0091 E::::E::::::::::::::::::EQ:::S::Q:::DW:::::A:::K::V::::::::: HVO_0809 :T::::::::::::::::::::::EK:::T::E:::R:::K:EA:::R:::::::::::: Hbo0726 K::::E::::::::::::::::::EK:::T::::::R:::K:K::::K:E:::::::::: consensus DETNTELTQEFVRALEDAGHVYEKEIPVAYDPEADQWLPDRYVEGTCPYCGEHARGDECD #oth 21..312.222.2313351113131.4.11.232..2....2.2.1.....14....... VNG0326 E:::V:::R:::G:W::ND::::T::Q:::::D::::::::::::::::::::::::::: NP1192A ::::::M:RS:::SWI:DD::V::::E::W:A::::P::::F::::::::::K::::::: rrnAC1800 ::::V::::::::SWVEND::H::::E::W:T:E::P:::::::::::::::Q::::::: Hmu0870 :D::Q::::::::SWVEQD:::::::Q:G::::::::::::L::::::::::R::::::: Hut0568 Q:::R:::H:I:E:::A::Y:D:Q::K::W:::D::P::::::V::::::::T::::::: HQ1572A ::::V:M:R:I:E::IQ::Y:::R::::::::A::::::::F:N:::::::A:::::::: hla0091 :::::AV::QL::D:DEG::L:::::M:::::VD::F::::::::::::::A:::::::: HVO_0809 ::::::::::I::T::AE:Y::::::::::::D::::::::F:::A:::::A:::::::: Hbo0726 ::::::::::L::T:::E:Y::K:Q:::::::D::::::::::::::::::::::::::: consensus EGCQRHLEPGEIEDPVSTITGNPAEYREREHKFFRVSDFQEYLQGFLDRLEGTSNAQNQP #oth ...1.......1.2.2.221..2...13.4.2.12133122..32.11.11..5..2... VNG0326 :::::::::::::A::::::::S:::H::A:::L:L:::::::E::IN:M:::N::K::: NP1192A :::::::::::::A:::::::::::::T:P:::L:L:::::::R::I::::::E:::::: rrnAC1800 :::::::::::::A::::L::::::::T:::::L:LA::::::::::::::::D:::::: Hmu0870 ::::::::::::::::::R::::::::T:::::L:LN:::::::::::::D::D:::::: Hut0568 :::G:::::::::::::K:S:::::::::T::::E::KLAD::S:::::::::A::K::: HQ1572A :::G:::::::::T::::::::D::::R:::Q::A::EL:S::SS::::::::T:::::: hla0091 :::::::::::V:::E:::::::::::::T:Q::E::A:S:::S::::::::::::R::: HVO_0809 :::G:::::::::::T::L:::::::::::::::A:::L:D:::E:I:::::::::R::: Hbo0726 :::G:::::::::::::A:::::::::D:N:R::::TEL:::::E:I::::::::::::: consensus REWIEGELQDWCITRDMDWGIDYPG-----------------------DGD------DDL #oth .1.1.22.1.2.....2...2...41111111111111111111111126553433241. VNG0326 ::::::G:E:F:::::L:::::::::::::::::::::::::::::::E:G::::::::: NP1192A ::::::::::L:::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::ESG:::E:: rrnAC1800 ::::::::::L:::::::::V:::E::::::::::::::::::::::::V:GG:::::E: Hmu0870 :::V::D:::L:::::I:::V:::T::::::::::::::::::::::::A:DEETE:E:: Hut0568 :Q:::EG:::::::::::::F:::E:::::::::::::::::::::::VD:TGDDTAE:: HQ1572A :::V::::::::::::::::V:::D::::::::::::::::::::::::--::::::N:: hla0091 :::::QG:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::ENP::::::Q:: HVO_0809 :::::::::::::::::::::::::VSESAEDSEADQTESGRDEGDES::SSSPSGTS:: Hbo0726 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::ETE::::::::: consensus VLYVWVDAPIEYVSSTKQYTERVGADEFDWEAAWKD------------------------ #oth .........1..111....2111.5131..252.14111111111322222223443445 VNG0326 :::::::::::::AA::::S::::TE::::ASV::::::::::::::::::::::::::: NP1192A :::::::::::::::::::S:Q::R::Y::::V::N::::::::::::::::::QVDGVP rrnAC1800 :::::::::::::A::::::::::D::Y::::V::I:::::::::DSEERHGTEWDDEWA Hmu0870 :::::::::::::A::::::::::E:TY:::SV::L:::::::::GGEERHGTDWDDDWT Hut0568 ::::::::::::IA::::::D:::PEAY::AET::E:::::::::::::::::::::::: HQ1572A ::::::::::::I::::::A::::T:S:::KN::R:IPGVRSHSSSSAKDSSEGNSPSNI hla0091 ::::::::::::I:::::::::::::A::::::::E::::::::::::::::::GASDAH HVO_0809 :::::::::V::::::::::::::::T::::V:::::::::::::::::::::::::::: Hbo0726 ::::::::::::I:::::::::A:::T::::K:::E:::::::::::::::::::::::: consensus -EGGEIVHVIGRDIIQHHTVFWPAMLRGAGYNEPRAVMASGFVTLDGKGFSTSRNRAVWA #oth 343.1.1.1..1......11...1..321223...113.2..2313.321...11..1.. VNG0326 :GD:::I::::::::::::::::S::A::D:A:::::C:T:::NI::R:L:::K:::I:: NP1192A P:::::::I::H::::::::::::::::::F::::::::C:::N:::DA::::::::::: rrnAC1800 DDS:::I:::::::::::A::::::::::::::::SIL:T:::GI::NAL:::::::::: Hmu0870 D:A:::::::::::::::A:::::::::::::::::IL:T:::NI::NSL:::::::::: Hut0568 :-S:::I::::::::::::I::::::HV:EF::::::V::::MS:::DA::::::::I:: HQ1572A NN::::I:I:::::::::::::::::HA:::T::::::::::I::E:::::::::::::: hla0091 P::::::::::::::::::I::::::EATDHT:::::::::::::G::::::::D::::: HVO_0809 :-A:D:::I::::::::::::::::::::::V::::::::::I::N:::::::::::::: Hbo0726 :-S:D:::I::::::::::::::::::ATDHV::::::::::I::N:::::::::::::: consensus DEYLDEGFHPDLLRYYLATNGGFQQDVDFSWDRFRERVNGELVGTVGNFLYRSLLFAERN #oth 21.122.11.113..1131322134.11...33133.1.3..1121...2..11...6.1 VNG0326 A::::A:::::::::::::AS::ER::N:::AE:AQ:::T::ADA::::A::A::::N:: NP1192A :D:IES:L::::Y::HII:GSE:TA:::::::GLQ::T:S:::::L:::::::::::::: rrnAC1800 :::::A::::::F:::I::GAQIDT:::::::::Q:::::::::N::::I:::::::::: Hmu0870 :::::A::::::F:::IVSGS:IET:::::::::A:::::::::N::::::::::::K:: Hut0568 R::::::::::::::::T:V::::D:I::::::::::::::::::::::A:::::::D:: HQ1572A ::::A::::::::::::::::::::::::::S:::::::N:::::::::I:::::::A:E hla0091 :::::::::::P:::::::::::::::::::EK::D:::T:::::::::::::::::H:: HVO_0809 :::::::::::::::::::::::::::::::SK:KD:::S:::::::::::::M:::Y:: Hbo0726 ::::::::D:A:I::::::::::::::::::EK::N:::N:::::::::::::::::H:E consensus YDGTPD---------------AALSDDVEERIEDAIADFEAAVNDYSVRALGDAAVELAQ #oth 1211.2111111111111112333132.351.24.1231221221.32.43244324.15 VNG0326 F::::Q::::::::::::::EVS:T::::TE:AQ:MD:Y:D:L:E:DL:TA:ER::A::R NP1192A :G:::::::::::::::::::::V::E:RNE::A:M:::RT:::::R::G::R:P::::T rrnAC1800 :::::::::::::::::::::::V::::RG:::::::::::::RE:DI:E:AEI:I::SN Hmu0870 :G:::::::::::::::::::TEI::::R:::::::ET::D::D::EL:::A:VG::::D Hut0568 :G::::::::::::::::::::D::P:::D::::::E::::G:::::I:KATQ::::::S HQ1572A F::::::::::::::::::::V::::S::::::T::DA:T:G::E:::::V:::::K::: hla0091 ::DA:I::::::::::::::AD:T::E:A::::E::::::::::::::::V:::VTD::R HVO_0809 FE::::VSELHSEASETGSRA:EV:EE::A:::E::DE:::GI::::::KS:N:::R::: Hbo0726 :E::::::::::::::::::::D::AE:K:::Y:::EE:::G:::::::EV:NSV:R::: consensus FGNEYIQRNEPWKLVDDDPEEAAQVIRDCVQIAKAIAVLFQPVLPGKAERLWAQLGEDGS #oth 1......22...1.322.333231111..1113..1...32.32.323332.31.2.2.2 VNG0326 :::::::H::::N:---:S:A::P:M:::::LV::V:::L::F::E:T:T:::::::::R NP1192A ::::::::H:::::T:::::K:R::::::::::::::::AE:::::::AA::D::::::: rrnAC1800 Y:::::::::::N:::::::::E::::::::LT::V:::M::::::::::::G::::Q:: Hmu0870 ::::::::::::N:::::::R:Q::::::::LS::V:::L:::::E::::I:G::::Q:: Hut0568 ::::::::H:::N:---:DD:::PI::::::::::V:::L::TT:DTSR::::::D:::: HQ1572A :::::::HH:::::SN:::QK-Q::M:::I:L::::::::E::T:AA:::V::D:::S:D hla0091 ::::::::S:::::::::::::::::H:::A:::::::::E:IA:E:T::::D::::::: HVO_0809 ::::::::::::::T:E:::A:::::::::::::::::::F::A:::MQA::E::::::: Hbo0726 :::::::GH:::::--::GA:KR:::::::::::::::::E::A:::::K::DD:N:::D consensus VADVTLDAALEAPPAEFDEPTELFEKIEDERVEELNEKLEARVEEASD------DDED-- #oth 123232321243.14412..411.1122211122.233.231222233223224343411 VNG0326 :S:A:IADC:Q::::::G::A::::::::D::T::D:A:A:KI:A::S::::::E:A::: NP1192A :H:AE:G::::S::EA::::D:::::L::D:I::::RQ::E:I:A:DA::::::G::E:: rrnAC1800 :::::::S:::::::::G::A::::QV::DHI:A:::E:QE::::::E:ASAEASN:G:: Hmu0870 ::::P:::::AT:::D::::::::SQV::DHI:G::DQ:QR:::A::::::::::EG::: Hut0568 I::::::::::S:::::G:::::::::PA::::A:::::::::A::T::::::S::A::: HQ1572A IHT:GIES::V:::QT:::::::::::PE:::D::TA::AD::TDPT:DDDSDT:T:T:: hla0091 :HET:VE::R:G:AGDLA:::::::Q:::::::A::::::::AA::E:GDEADEESG:DG HVO_0809 :::TGV:D:F:::::S:G::EA:::::::::::::::::::::A:TES::::ES:ES::: Hbo0726 :HA:GVE:::D::ATT::::S:P::::D:::::::::::Q:::::::A::::::ET:S:: consensus ----GEDEADETADDD-----ADLEPLADDRISFEDFQELDIRVGEIVEAEGIEGADDLA #oth 1111234441346465535215132.24211.2.22.131.2.1131431.21311.2.2 VNG0326 ::::::GM:::::::G:::::IE:::::E:D::::E::A::L::::V::::::::::::: NP1192A ::::::::DE:PPA--::::::::::V::E::::G:::D:::::A:VL:::P:::::::: rrnAC1800 ::::::AAG::VD:G:VDT:::::Q::VE::::::::EGV:M:::::RS::PV::::K:L Hmu0870 ::::ED::G:::----:::::VE::::E:E::G::A:EGV:M:::Q::A::D:ADS:N:L Hut0568 ::::::T:S:DSEEAETAD::M::::::A:::G:D::::::::::K::D::P:KDS:::V HQ1572A :::::T:V:ET:NESHSESNMTEID:I::E::D::E:E:::L::A::I:T:P::D::K:: hla0091 EADD:S::::DDTT:EPDM::T:I:::S::::::D::::::::I:R:E:::::::::::L HVO_0809 :::::DA:E:MD::T:ADAD:I:F::I::::::::E::::::::::::A::::D:::K:: Hbo0726 ::::D:SD:E:S::VT:::::DEH::VLE:::G::E:::::L::A::ID::::::::K:: consensus RLEVDIGVETRQIVAGIKQLHDLDDLPGTRVVVVANMEKAELFGVESNGMVLAAGDEADL #oth 215..1.4.3.12...111...215.3.321121..1.1111..3.....2...122..1 VNG0326 :::::::H:V::::::::::::::A:::::::::::::PS:::::::::::::::ED::: NP1192A K:A:::::::::::::::::::::S:S:::I:::::L:::::::::::::L::::EQ::: rrnAC1800 :::::::H:V::V:::LR::::AEK::::::ILL::::::::::I::::::::::::::: Hmu0870 E::::::I::::V:::L:G:::V:E:::::::LL::::::::::R:::::I:::::D::: Hut0568 ::D::::L::::V:::::::::VET:::::::LL::::::::::Y:::::::::SE:::: HQ1572A :IV::L:I:Q::L::::R::::::::I:ET::I:::L::::I::::::::L::::AD::: hla0091 K:R::L:A:::T::::L:::::V::::::K:::L:::::::::::::::::::::E:::: HVO_0809 K:T::::::E::::::::::::::S:A:SK::I:::L:::G:::::::::L::::::::I Hbo0726 K:T::::::E::::::::::::::E:::KK:I::::L:::::::::::::::::::Q::: consensus LTTHEDAEPGTKVQ #oth ...31.141.1213 VNG0326 ::::::S::::::M NP1192A :::L:::::::::: rrnAC1800 :::::::PL::RIK Hmu0870 ::::::SPL::RIH Hut0568 :::::::PL:S:IK HQ1572A :::R:::D:::SI: hla0091 :::Y:::G:::::K HVO_0809 ::::G::V:::::: Hbo0726 :::Y:::::::R::