| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1978 | NP3188A | HQ3204A | hla1320 | VNG1852 | HVO_2611 | Hbo2237 | Hut0652 | rrnAC3430 | Hmu2347 |
| 1124 | NP3188A | 1969 | 778 | 868 | 848 | 900 | 879 | 707 | 644 | 664 |
| 1101 | HQ3204A | 778 | 1946 | 906 | 791 | 930 | 1072 | 615 | 619 | 591 |
| 1224 | hla1320 | 868 | 906 | 2000 | 797 | 1014 | 975 | 672 | 684 | 741 |
| 1182 | VNG1852 | 848 | 791 | 797 | 2037 | 1013 | 890 | 660 | 702 | 707 |
| 1281 | HVO_2611 | 900 | 930 | 1014 | 1013 | 1952 | 1127 | 710 | 757 | 796 |
| 1303 | Hbo2237 | 879 | 1072 | 975 | 890 | 1127 | 1982 | 595 | 706 | 773 |
| 1003 | Hut0652 | 707 | 615 | 672 | 660 | 710 | 595 | 2098 | 948 | 955 |
| 1043 | rrnAC3430 | 644 | 619 | 684 | 702 | 757 | 706 | 948 | 2047 | 1147 |
| 1134 | Hmu2347 | 664 | 591 | 741 | 707 | 796 | 773 | 955 | 1147 | 2046 |
291 symbols consensus ----MAILPSGFALPPLPYLLALLAGTGVVTALLRRRRPPVTQRRVLALAPWMALGGALH #oth 12223431.42221.12111232442433243226262.31354312113...23.2331 NP3188A ::::-MV:::D::::A::::A::AL:GV:AVV::Y:::::::E:T:A:::::::A::T:Y HQ3204A :::::V:F:D:::::AI::::TIIFAG:::AYAAI:Q::T::SS::::::::::::A::: hla1320 MVGDLPF::A:TT:::A::::VV:LA::G:V:A::::::R::G:::::::::::::S:A: VNG1852 :MDTI:V:::::::::::H:::VA:LAAA:LVG:::DP:T:DG:A::::::::VA:SS:Y HVO_2611 :::::::::E::::::::::V::V::LVG:GVG:T:T::T::PAH::::V:::VS:S::: Hbo2237 :::::::::E::::::::::VG::VAV:::V:AVA::::E::PQ:I::FV:::I::S:V: Hut0652 ::::::L::::LVV:A:::::V:GL::LLT:L::LGFE:::GKLH::::L::::I::MA: rrnAC3430 ::::-MV::::L:::::E:TV::::::L::::::YALE::IN::T:V::T:::::::::: Hmu2347 :::::Q:::TS:::::::::VV::G:A:L:::::SAAE:EID::A:VS:L::::I:::F: consensus ALYQ--L----GALPPAVAPLFGTPAVYLTVGVLAGATWLALDALGAARG----VVRNLA #oth 2321113111151212436.2212.2..221543422212536465645353345466.2 NP3188A ::::::A::::::A:EPL::::SA::::VS::::::GV:AGVADRDGSTWSLTGAAGP:: HQ3204A VQ:V:::::::S:::::IR::A::::::AI:TIA:IG::VS::L:VTSAY::::IAQI:: hla1320 V::V::V::::D::::LLS:FA:S:T::::::S::::A::VA::TRPD:-:::::PAV:: VNG1852 :CH:::::::::LY:S::::V::S:I::A:TAAA:::::::VRRF::R--::::PQVL:: HVO_2611 V::V::V::::D::::::E::A:::::::S:A:V::::::::::ADL:--::::SPQT:: Hbo2237 V::V::V::::N::::VIH::G:::::::S::::GIG:FV:-----::EWAEEAL:PL:T Hut0652 GF::::IPQPP:LY:EW:G::::A::::V:TY:VVA:V::L:IL::T:I:KLDR::TY:G rrnAC3430 :FH:PPI::::E:YR:V:T::::A::::::TF:TL:VV:VT:TLFSVR::HSETIS:::G Hmu2347 :FE::::::::ALY::LYE:::::::::::TLL:T:GV::::Q:V:IV::NEDT:::::G consensus AVGTVLLAVLLAAAVLQGIAPGT-LSPVWPAIALVVALVVTAGVWVLLTRIRP-ETAATG #oth 45.534433433325563465342343521433343233322342352215423334332 NP3188A :S:S::::AA:V::A:AETPDTMGT:AAGS:VI:AASIAA::VA::::S:TA-::VS::: HQ3204A G::V:--:A:I:I:GVIA:N:TS::RVTVSI:GIG:SVILSG::::M::::V::K:QL:A hla1320 VA::L:::PVV:V::ST:LS:E-:-GAR:ST::::LTIPIAGA:::G:::L::::::I:: VNG1852 G::A:AA::PIT::LAR:WTA::::TLA::LG:VGA:::L:::S:R::A::::TD:R:V: HVO_2611 :P:LLVA:G:AGF:LFI:L:A:::::V:::GT:::A:::::PLT:RVV::LA:::A::A: Hbo2237 G:::::S::AV:::F:V:ASE::::A::V:::G::::T::S::A::I:::VL::DARI:A Hut0652 :T:VGV:I:F:G:M:W:::G::LSFT:L::TV:FLIS:AL::VIYF:VSLRWTGVV:R:: rrnAC3430 YI:IG::T:::VI::VMALES:L::GLI::T::VI::T::::VTVLAVALW:TPVVVRMR Hmu2347 L:::AIFV::VVVRIW:S::QP::F::::::VS:I:::A:::L:VLAISLW:TPVFVR:R consensus PAGALAVFGHALDGVSTAVGADVLGFGERTPLSRAIIEFAGALPTAPVIGGGWLFVLVKL #oth 6315321.1.21.131.21.5132142.11.21251214135..24353.51...22..2 NP3188A AV:V::::::T:::I:::::Y:L:::::Q:::::I:L:AGA:::--:D:::::::A:::I HQ3204A :M:TF:::::T::::::TI:I:L::::::::::AL:::::SG:::DAI::S:::::V::: hla1320 GV::::::A:::::::::::TTH::::::::V::ILL:IG:-::SL::V:E::::L:::: VNG1852 V::V:::::::::AT:::::V:A::Y::Q::::T::::L:R:::::::V:::::::V::: HVO_2611 SL:L::L::::::AL:::::V:::::::::::::V:LDA:A:::::E:::V::::::::: Hbo2237 :V:I:T:::::::A::::::I:L:::S:::::::::::::AT:::E:FF:TV:::::::: Hut0652 I:::VVL:A:TF:::I:MI:K:::EG:::::IPAM:MDV::S:::::YL:S::::L:::V rrnAC3430 Y:APTV::A:M::::::::::::I:IT::::IPAR:M::::T:::::YL:K:::::F::: Hmu2347 Y::PVV::A:::::::::I::::V:AS:QS::P:L:M::::Q::::DLL:V::::L:::: consensus AIASAVVVLFADYVREDPAEGNLLLGLVAAVGLGPGVHNLVLFAAAG---- #oth 22244114313423324.42252213312...4..131.33..44444211 NP3188A :LGG:I::::ES::::A::::Y:V::::::::F:::F:::::::LL-:::: HQ3204A L:V:V::WV:::IADTA::QS:I::AIIS:::F:::::::L::SV:::::: hla1320 :V:::::W:::G:I::T:G::Y::::F::::::::AA:::L:::V:A:::: VNG1852 :L:AG::::L:ES::DR:Q::TAI:::::::::::::::V:::I::NPTGF HVO_2611 :V:GF::A:L::::::::T::S::::::::::::::::::L:::I:::::: Hbo2237 V:V:GI:A::::::::::T:::::::F:::::::::::::I::TIL:GA:: Hut0652 LL:TL:IIT::E:IE:R::R:H:::VIIT:::A::A:N:F:::TLG-:::: rrnAC3430 LV:IG::F:LD::LE:::V:AS:::AV:T:::I::ATN:I:::LFSPV::: Hmu2347 V::A:I::S:NR:LADE:T::A:VFS:I::::M::ATN::F::L:PAF:::