|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2627 | HQ1052A | VNG2507 | Hut2380 | rrnAC2969 | Hmu3200 | NP0428A | hla0529 | HVO_2943 | Hbo1594 |
1883 | HQ1052A | 2651 | 1475 | 1627 | 1571 | 1676 | 1577 | 1638 | 1669 | 1811 |
1833 | VNG2507 | 1475 | 2615 | 1497 | 1496 | 1554 | 1681 | 1818 | 1626 | 1698 |
1986 | Hut2380 | 1627 | 1497 | 2624 | 1805 | 1791 | 1662 | 1709 | 1775 | 1786 |
1976 | rrnAC2969 | 1571 | 1496 | 1805 | 2597 | 2007 | 1638 | 1707 | 1775 | 1751 |
2067 | Hmu3200 | 1676 | 1554 | 1791 | 2007 | 2595 | 1692 | 1734 | 1848 | 1824 |
1998 | NP0428A | 1577 | 1681 | 1662 | 1638 | 1692 | 2616 | 1814 | 1707 | 1698 |
2057 | hla0529 | 1638 | 1818 | 1709 | 1707 | 1734 | 1814 | 2707 | 1932 | 1806 |
2186 | HVO_2943 | 1669 | 1626 | 1775 | 1775 | 1848 | 1707 | 1932 | 2653 | 1988 |
2115 | Hbo1594 | 1811 | 1698 | 1786 | 1751 | 1824 | 1698 | 1806 | 1988 | 2771 |
373 symbols consensus ------------------MNLYRLLKPALFQLPPETAHRLVHRLLRTVQGTPIERALARR #oth 111111111222222333353.423112..3.21..114341531442251233554353 HQ1052A :::::::::::::::MVIKQ:::AFR:L::A:::::::::::TG:E:::Q::::HGFSNQ VNG2507 ::::::::::::::::::--M:G:::S:::G:::::T:EITTSA::VA:RVGAH::Y:KQ Hut2380 ::::::::::::::::::::P:N:T::L::::S:::::A:A:EGMKL:D:::::S::::A rrnAC2969 :::::::::::::::::::RP:DIA::F::S::A:::NKS:::::E::D::RVADVM:D: Hmu3200 ::::::::::::::::::::::DIAR:L:::::A:::::T:::::EVADE::VTEL:E:: NP0428A :::::::::::::::::::G::Q:::::::::DA::::G:G::V:DGI::::L::IV:DY hla0529 :::::::::MPVRDETET:GA:D:::::::G:::::::G:T:::::A::T::VTEH:HS: HVO_2943 ::::::::::::::::::::P:::A::L::S::::::::TI:G::AAAR:::A:PL:E:: Hbo1594 MERLASDERDTAQRSSPMRL:::I::::::S:::::::G:::HG:::::H::::D:::T: consensus FRVDDDRLAVEAFGQTFPNPVGVAAGFDKNAEIPRALGALGFGHVEVGGVTAEPQPGNPR #oth 23.513..4231..44.11.1.1......1.13.54.22....12...1...13.5..3. HQ1052A ::::N:::Q::E:::S:D::I:::::::::::L:AI::::::::::::::::VS:S::M: VNG2507 :T:T:P::S:D:::::::::::M::::::::::::::AG:::::I:::A::::R::::D: Hut2380 :K::::::SMS:::CE::::I::::::::T::A:GT:::::::::::::::::::E:::: rrnAC2969 YT:A:E::::::::H::D:::::::::::::T::ET:AS::::FA::::::::::A::A: Hmu3200 Y:::::::::D::::Q:DS:::::::::::::::G::::::::F:::::::::::T::A: NP0428A CT:V:P::R:D:::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::A:::: hla0529 :S:N:P::R:::::NE::::::::::::::::V::G:A:::::::::::::::Q:::::: HVO_2943 Y::::A:::TR:::LD::::::::::::::::::TV:S:::::::::::::::::::::: Hbo1594 Y::E::::HT::::CS:D::::::::::::::V:DV::S::::::::::::::::D::A: consensus PRMFRLPEDEALINRMGLNNEGADAVGERLAATD-ADI----PVGVNIAKSESTPTDEAP #oth ..2...42.3.11....1..3..231.1..434234531111...1.11111423431.2 HQ1052A ::::::V:::::::::::::::::VI::::SSHR:RE:DHCG:::::::L:::::::::: VNG2507 ::L::::D:N::V::::F::::::T::A::D:EPLP:V::::::::::G::KT::LAD:: Hut2380 ::V:::V::::I::::::::P::KVI::::DN:::VSM:::::::::L::T:DV:M:::A rrnAC2969 ::::::KA:::I::::::::D::IVI::::KNV:::PF::::::::::::T:HVG:N::: Hmu3200 ::::::R::::I::::::::H:::::::::T:::::AV::::::::::::::HVG::D:: NP0428A ::::::A::R:::::::F::D:::I::::::::::CRV::::::::::G::K:AAN:D:E hla0529 ::L:::R::::::::::F::::::I:::::DREPLPE::::::::I::G::K:::LA::: HVO_2943 ::::::::::::::::::::::::::::::::GPHP:::::::::::L:L::V:::E::: Hbo1594 :::::::::G:I:::::::::::::::A::::GPR::::::::::::L:L::::DAED:: consensus ADYRYTYERVADGGDYFVVNVSCPNSEGFRELQNRDSLEAILGTLQDAGAAPLLVKLSPD #oth 2..32.11211112.1111...1..12.221..3.33124.2331311..312....1.1 HQ1052A :::Q::::QI:E:A::VA::::::::::MQD::Q::::SR:MDA:TN:::ETV::::A:E VNG2507 D::T::FS::G:AV::V:::::S::TP:L::::G::Q:A:::EA::::::S::::::::: Hut2380 ::::E:::Q::E:::F::I:::::::P::::::::E:::D:FS:VKN::::::::::::: rrnAC2969 D:::T:::H::E:::F:::::::::::::E::::::AM::::SE:::::::::::::::: Hmu3200 D::::::::::::::F::::::::::Q::E:::::E:MA::::E:K::::::I::::A:: NP0428A :::Q::::::::::::::::::S::TP:L::::S::R::S:::::::D::S::::::::: hla0529 E::L::::::::A:::::::::S::TP:L::::::AA::E:::::T::::D::::::::: HVO_2943 E::::::::::::A::::::::::::::::D::::V:::::::::V::::D::::::::: Hbo1594 ::::::::Q:::AA::VA::::::::::::D::::::::::::G:V::::D::::::::: consensus LPEPAVEDALELVDDLGLDGVIATNTTTERPASLRSPNRAERGGLSGAPIEDRATEMVRF #oth .333.111223214221...1111..1.3..34.623524.3.....2..2441.44121 HQ1052A :SLS:I::VID:::IFD:::I:T::::::::EN:E:TKQT::::::::::::H::KL:QL VNG2507 :HQD::A::V::AN::::::IV:::::::::E::SH:HAG:Q::::::::RE::::Q::: Hut2380 :::::::ET::::EEYD:::::::::::D::EA:T::D:V:E:::::R:::EQ::::::: rrnAC2969 ::::::::::D::TE:D::::V::::::::::::::::AV:T:::::K:::NQ::::::: Hmu3200 :::::I::::AI:RE:D::::V::::S:::::::Q:GH:V:T:::::K:::::::Q::K: NP0428A :TDA:I:::I:V:E::::::I:::::::K:::::H:DAAD:E::::::::T:ES:DI::: hla0529 ::::::::::GV::::::::::::::::S::N::K::QQ::::::::K:::PI:::R::: HVO_2943 ::D::::::::V:::::::::::S::::S::DT::N:::::::::::K:::AE::N:I:: Hbo1594 ::D:::::::DV:NEY:::::V::::::D:::E:QN:::::::::::::::E:::::::: consensus VAERTDVPVVGVGGVSDAEGAYRKIRAGASLVQLYTGLVYEGPTIARDINRGLLDLLERD #oth 1.2.1.2.11....132.22..2...1..22111..12112..321131.4.135..23. HQ1052A ::K:::::II::::::::A:::A:::::::::::::::::Q:::L:::::M:::Q:::D: VNG2507 ::::::Q::::::::AT::D::E:::::::V:::::A::::::WV:KR::E::VS::::: Hut2380 ::S::::::::::::FT:AD:::::::::::::I:::FI:R::::::NV::::AT::::: rrnAC2969 ::::V:::::::::::T:::::::::::::::::::::::R::S:::E::S::R:::AE: Hmu3200 ::::V:::::::::::S::::::::::::T::E:::A:::::::L::E::E::VA:::A: NP0428A I:K:::K:I:::::ID:::S::E:::N:::V:::::::::::::::::::::::K::::: hla0529 :::::::::I::::I:::K:::E::::::::I:::::::::::GL:::::G:V::::D:: HVO_2943 I::::::::::::::::::S:::::::::EM::::::M:::::S:::::::::::::D:: Hbo1594 :::::::::::::::AS::D::A::::::::::::::::F::::LT::::E:::T::::: consensus GFDSVEDAVGADL #oth ..22123.1.211 HQ1052A ::::I:S:I:::I VNG2507 ::::::::::::: Hut2380 ::::::::::::: rrnAC2969 ::::::::::::: Hmu3200 ::ETI:::::::: NP0428A ::A:::::::V:I hla0529 ::::::A:::::: HVO_2943 :::D:A::::SG: Hbo1594 ::::IDE::::::