[J] (-) COG0042 tRNA-dihydrouridine synthase 9 genomes BUD0549 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG1431 rrnAC0052 HVO_2478 Hbo2377 Hmu1280 Hut1454 hla0939 NP2026A HQ3013A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1841	hla0939	HQ3013A	Hmu1280	VNG1431	Hut1454	HVO_2478	Hbo2377	NP2026A	rrnAC0052
1260	hla0939	2052	851	898	853	1042	1044	1063	1058	1002
1141	HQ3013A	851	1922	917	793	935	1008	1069	947	994
1221	Hmu1280	898	917	1926	948	1070	938	1035	1167	1154
1134	VNG1431	853	793	948	1666	903	866	966	961	997
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1343	HVO_2478	1044	1008	938	866	1053	1959	1218	1155	1091
1380	Hbo2377	1063	1069	1035	966	1036	1218	1894	1142	1219
1399	NP2026A	1058	947	1167	961	1130	1155	1142	1893	1228
1416	rrnAC0052	1002	994	1154	997	1155	1091	1219	1228	1845

284 symbols
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hla0939         :VTASGDESPP:FLVA:::::A:::D:::::::::D::I:::::V:PAS:::::D:::A:
HQ3013A         ::::::::::T::::::::::::::T::ENG:SD:::::I:::S::TV::D:::Q:::::
Hmu1280         VSPDRGGAL:D:P::::::::RS::E::EGGG:F::C::::::::::A::R:::SM::E:
VNG1431         ::::::::--------------------MS:GE:::GV::::::I:E:::E::::M::::
Hut1454         :VSGVEPLP:E::::A::::::S:VE::K:TI::V:::::::L:I:E:::::::KM:E::
HVO_2478        :::::::::::::::V::::::S:::::D:::::::::::::V:::E:AQ::::D:::A:
Hbo2377         ::::::::::D::::::::::::::::::Q:ES:::M::::::S:::RS:K:::E:::A:
NP2026A         :::::::::::::L:V::::::S::D::A:::::V:C:::::L:I:AE::R::A::A:E:
rrnAC0052       ::::::::::E::::::::::::::S::::VES:V:C::::::::::R::E::::MT:::

consensus       DRSEFLPADPVAFVDRQLDALAD---APIRPAVNVRSATLEPVRRAAAVCADRDAILEIN
#oth            1.4...131.3112361.451321114335213...12333.2242134.1422.23.2.
hla0939         ::::::::::L:WI::E::Q:SE::::::::G:::::::V::::E::::::E:::VC:V:
HQ3013A         G:C::::S::I::ITTE:::::::::VA:T:G:::::T:P::::V:GRH::KYN::::::
Hmu1280         ::T::::S::L:::Q:::R:MEE:::L:::AG::::::A:A:IED::GR:Q:H:::::::
VNG1431         ::E:::::::::W::D::SE:D:::::FL:::::::AVR:G:L:DV:::::AH:::::V:
Hut1454         ::E:::::N:F::A:E::NR::::::E:LVAGL:::::SR::LE:I:ES:::HG::C:L:
HVO_2478        G:::::AD:::G::AA:::S:DEFGGEDRFV:::::ATSPD:I:AV:::::::G:GV:::
Hbo2377         ::N::::E::F:::ASE::T:::::::D:DA:M::::::VG::::::RI::::N::::V:
NP2026A         ::T::::D::I::I:K::A:::G:::T:V:::F::::::VD:IVE:::::::::::V:L:
rrnAC0052       :::::::D:::::::D::A:::::::::LC::F:::::::G::E::::::QRH:::I:::

consensus       AHCRQDEMCAAGAGETLLRDPD-RLAEQVAAAADTGATVSVKVRAEIDGVDLPALAAAIA
#oth            .....2.1132.1.12..425212.2331312334..3111.1.1123..3143313322
hla0939         :::::S:LR:V:C::S::::I::::::Y:::V:E::::T:::::::VP::::V:VTD:V:
HQ3013A         :::::::::TV:::::::Q:NESQ:R:LIK:GRAG::M:::::::G::::::T:I:RT::
Hmu1280         :::::A:::E::::QA::DR:E:K:CR::E::TA::::::::::::V:::E::T:::KLE
VNG1431         :::::::L:D::::::::::TS:::C:::R::S:E::A:::::::GVQ::H::V::Q::E
Hut1454         :::::::::ET::::A::AE::::::K::ET:::A:::::::::T:::::::L:V:RR:E
HVO_2478        :::::::L::V:C:::::::S:::::AY:::::ES::S:GA::::::::::H:N:::TL:
Hbo2377         :::::::L::V:C:::::::T::::C:Y::::::E::::::::::::E::S:ETT:DRV:
NP2026A         :::::S:::::::::S::K:D::::C:::R::::::::::::::T:V:::::::::::LS
rrnAC0052       :::::::::::::::S:::E::::::AF:E:::S::::::::G:::L:::S:::V:Q::E

consensus       DAGADALHVDAMDSEGVVADVADA----------TDLFVVANNGVRGRETVREYLAYGAD
#oth            2..1333......116214323322111111111351121...1..243224..341...
hla0939         :::::W::::::::::I:DELTAGRATDETGSPRD::T:I:::::::::::A::A:::::
HQ3013A         :::GEII::::::T:VSIKQI:T:A:::::::::PE::II:::::::H:S::::YG::::
Hmu1280         R:::::V::::::::H::GEI::::::::::::::G:::I:::E::DA:SAH::FR::::
VNG1431         R:::A:I:::::::RR::R::::::::::::::::A::::::::::T:DD:F:::S::::
Hut1454         A:::::V::::::::::::EIVA::::::::::::::::I::::::D:::::::::C:::
HVO_2478        :::::W:::::::::A:I::::A:A:::::::::P:::L:::::::::::AT:::D::::
Hbo2377         ::::SI:::::::::E:I:::S:-::::::::::SS:::::::E:::EAS:::::G::::
NP2026A         A:::SV:::::::::H::GA:TE:A:::::::::PNA:::::::::D:K:T::::D::::
rrnAC0052       :::G:VF::::::::S:I:::::::::::::::::::::::::::::TA:T::::S::::

consensus       AVSVGRPSDDPAVLRRVRAAVDEWFE-------S---SEVSP--
#oth            ...1..1.33144243126.253124123445435664335311
hla0939         ::::::::ER::S:S:IAD::SA:R:GELPEESEASLP:AQ:::
HQ3013A         :::I::::TNRH:R:Q::C:AEDI:::::TSNTDMQR:HIQQ::
Hmu1280         ::::::A::::D::AA::R:TH:::Q:::::::-:::TGAK:::
VNG1431         ::::::::R::ERV:A:Y:::K::LL:::::::-:::-----::
Hut1454         :::::::::R::::K:::N:TEG::::::::SAETATR:ATQ::
HVO_2478        :::::::::N:R::::::T:::D::AGREDAAE:GDE::::A::
Hbo2377         ::::::::T::R::::::::::D::D::DETGA:GEI:::G:::
NP2026A         ::::::::::::L:A:::R::::::D::::::::QRQT:::ADG
rrnAC0052       ::::::A::K:ET:DT::E:TV:::A:::::::-::::::::::