|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1717 | VNG2306 | NP1406A | Hut2252 | rrnAC2582 | Hmu2981 | hla0585 | HQ1040A | HVO_2972 | Hbo1558 |
1289 | VNG2306 | 1717 | 1036 | 1059 | 1104 | 1059 | 1073 | 1105 | 1157 | 1161 |
1277 | NP1406A | 1036 | 1804 | 1191 | 1152 | 1170 | 1061 | 1080 | 1127 | 1118 |
1379 | Hut2252 | 1059 | 1191 | 1772 | 1340 | 1370 | 1085 | 1020 | 1135 | 1128 |
1372 | rrnAC2582 | 1104 | 1152 | 1340 | 2212 | 1385 | 1109 | 1052 | 1114 | 1162 |
1382 | Hmu2981 | 1059 | 1170 | 1370 | 1385 | 1809 | 1143 | 1058 | 1110 | 1130 |
1257 | hla0585 | 1073 | 1061 | 1085 | 1109 | 1143 | 1724 | 1121 | 1152 | 1196 |
1288 | HQ1040A | 1105 | 1080 | 1020 | 1052 | 1058 | 1121 | 1740 | 1216 | 1315 |
1320 | HVO_2972 | 1157 | 1127 | 1135 | 1114 | 1110 | 1152 | 1216 | 1756 | 1319 |
1364 | Hbo1558 | 1161 | 1118 | 1128 | 1162 | 1130 | 1196 | 1315 | 1319 | 1727 |
299 symbols consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111131 VNG2306 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP1406A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MD Hut2252 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2582 MRHLYSDIKGWGGGSRESITAAATAETFNPTEQQSGVYRWTAHCSRSRGCHRPIYYTMAD Hmu2981 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MED hla0585 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1040A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2972 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1558 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus MEESVSGFKVRGGWGDVVEHGERITRALREAAADE--D-----DAFEEWDEWRPKSHERL #oth 12..11..152.2.221.......23..1132424432411112.152111....11..1 VNG2306 :::::A:::Q::T::::::::::::T:::::G:::AFA::::::::A:::D::::::::I NP1406A I::::::::A::::::I:::::::::::::LD:E:DH:V::DG::L:::::::::AD::: Hut2252 :D::::::::H:::V:::::::::::::::L:::HDV:T::::::L::F::::::::::: rrnAC2582 I::::::::TK:::V::::::::::Q::KDI:SG:TV:E::::::LS:F::::::::::: Hmu2981 I::::::::R::::VN::::::::VQ::::L:T::RV:QPVDG::L::F::::::::::: hla0585 ::::I:::::::D:::I:::::::AL::::TGT:D::-::::::::Y:F:D::::::::I HQ1040A :Q::::::E:::T::::::::::::::::D:DI:G::-:::::E::D::N:::::::::: HVO_2972 ::::I::::R::T:DE:::::::::::::D:DV:S::-:::::A::DD:::::::::::: Hbo1558 :::::::::I::T::::::::::::::::D:GVES::-::::::::KQ:::::::A:::: consensus DEDVNEKTAEQASVDEGKGEKAGKDPDEDLQTAGEKLSDSYENLDEGD--EAVERWGESI #oth 211.12...3..113..2..21.15122..21...2.23..2412222433.114.32.2 VNG2306 GDE::::::D::::A::::::::ASA:::::K:::Q::A:::K:GD::GGD:::K:QS:L NP1406A G:::SR::::::::G::E::::::::::::K:::::::::::S:E:PG:::::DE:R::: Hut2252 :::::::::Q::RL:::::::K:::::D::R::::::A::::::::P::::::DA::::: rrnAC2582 :::::::::D::::::::::Q:::G:::::::::::::E:::::::P:::::M:::S::V Hmu2981 ::::::::::::R:::::::Q::::::D::R::::::A::::::::P:::::::S::::L hla0585 ::::S:::::::::G::E::Q:::T:GG:::::::::TE:::KVE:N:TES:M:S::::: HQ1040A G:::SQ:::A::::S:::::R:::A::::::::::M:::::DHVEA:ESDS:::::SD:L HVO_2972 G::::::::Q::::G::E::::::T:ND::K:::::::R:::RVE:::NEG:::S:QD:: Hbo1558 S::::::::A::::S::Q::::::E:N:::::::::::E::QKV::::NDG:::::S::: consensus DYVARAADSAGRKALRKVEDTVYRNVMTQIAPYYFDNELVSANIQRVG-GDAAEEFVFEV #oth 21.1....1.2.1.1.3..13..22...131......3.1...22236133553411..1 VNG2306 :H:K::::T:::::I:::::A:::::::R::::::::A:::::::::R:--SQ::::::: NP1406A N:::::::::T::::::::GS::::::::MS::::::::::::LT:GD:-S::DDYI::: Hut2252 ::::::::::::::I:A:::K::::::::V:::::::D:I:::LR::E:-:EDP:Y:::: rrnAC2582 ::::::::::S::::::::::::::::::::::::::D:I:::LR::::DEERP:Y:::: Hmu2981 ::::::::::S:::::T::::::K:::::::::::::A:::::L:::N:::DRP:Y:::I hla0585 GH::::::::S:::::::::::::K::::M:::::::::::::V:E::R:ENG:T::::: HQ1040A G:::::::::::R:::R::::::QR::::L:::::::T:I:::::KTTR::::VA:I::: HVO_2972 N::::::::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::::RASGD:R::::: Hbo1558 G:::::::::::::::::::::::K::::L:::::::::::::::KSAR:EDEVT:I::: consensus NVNDDDLKSRVSNRLADFEDEVDRWHVDTEKETEAAEAAEGVEPPEEDEE---SDSTTN #oth .1...1..54.134.42134422...1212141342111..112254454432324231 VNG2306 :I:::::::A:QDH:SS::-AL::::::::R::DV:::::::D::KQR:D:::AK:::: NP1406A :I::::::I::::K:::YQTS:E::::::P:D:DI:::V::H:::QDEPTDGG::PKRT Hut2252 ::::::::I::::K:::::QQ:::::I:AP:::D:SA:::::DV:P::H:W::T::D:T rrnAC2582 ::::::::M::::K:::::QA::::::::::V:::V::::::DAV:TGD::::T:AK:: Hmu2981 ::::::::E:::::::::DSD::::::N::::V:::AT:::::VS::ETGDEET:AK:: hla0585 :::::E::DE::DI:::Y:S:I:::::EA::R:KDVA::::::::A:EGG:::P:::MT HQ1040A :I:::E::TA:::::T:YD:::T::::::K:Q::T::::::::::TSTTNP::PK::N: HVO_2972 :::::E:::M::ET:R::K::I::::I::P::::V:::V::::V:TT:::HR::NW::: Hbo1558 :I:::::::K::R::GEYD::::::::::::::TT::::::::A:PS:PD::::NF:::